1. Rの基礎いろいろ
2013.10.13
TOKYO.R JOSHIBU #2

2. Rとわたし
• はじめてRに触れたのは、大学のときの授業。
• 仕事でR使用中。主にデータ処理やグラフ作成など。
• Rを使ってモデリングとかシュミレーションしたい。
（今後仕事で必要になるので…）
• 現在、ちょっとずつ統計を勉強中。

3. 今日やること
前置きが長くなってすいません…
（本当は）CodeIQ に出題されてた
Rの問題をやる予定でした…。。
URL: https://codeiq.jp/
ただ、〆切が結構先なので
別の内容にしました。

4. irisデータを
使ってプロットす
る

5. irisデータとは…
• Rには１００以上のデータセットが付属。
• iris データは、３品種のあやめのがく片や花びらの長さや幅
などのデータから成り立っている。
• Fisher の研究でも使われたデータ。
• Rのデータセットについて詳しく説明されているサイト様。
http://d.hatena.ne.jp/hoxo_m/20120214/p1

6. iris データをみる
• コマンド実行するとデータが一気に表示されるはず。
• このデータの内容、もうちょっと簡単にみたいんだけど？
• そんなときは、str() を使う。
$ iris

7. str()でデータの内容をみる
$ str（iris）
> str(iris)
'data.frame': 150 obs. of 5 variables:
$ Sepal.Length: num 5.1 4.9 4.7 4.6 5 5.4 4.6 5 4.4 4.9 ...
$ Sepal.Width : num 3.5 3 3.2 3.1 3.6 3.9 3.4 3.4 2.9 3.1 ...
$ Petal.Length: num 1.4 1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5 ...
$ Petal.Width : num 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.4 0.3 0.2 0.2 0.1 ...
$ Species : Factor w/ 3 levels "setosa","versicolor",..: 1 1 1 1 1
1 1 1 1 1 ...
データ構造
• もうちょっと詳しくみたい、そんなときはsummary() !
行数、列数
データの特徴

8. summary() で特徴（要約等計量）を
みる
$ summary（iris）
> summary(iris)
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
Min. :4.300 Min. :2.000 Min. :1.000 Min. :0.100
1st Qu.:5.100 1st Qu.:2.800 1st Qu.:1.600 1st Qu.:0.300
Median :5.800 Median :3.000 Median :4.350 Median :1.300
Mean :5.843 Mean :3.057 Mean :3.758 Mean :1.199
3rd Qu.:6.400 3rd Qu.:3.300 3rd Qu.:5.100 3rd Qu.:1.800
Max. :7.900 Max. :4.400 Max. :6.900 Max. :2.500
Species
setosa :50
versicolor:50
virginica :50
Min.: 最小値
1st Qu.:第一四分位数
Median: 中央値
Mean: 平均値
3rd Qu.: 第三四分位数
Max.: 最大値
これはFactor型なので
品種ごとの行数が表
示

9. データにアクセス
• 部分データを取得したい場合には、c関数を使う
$ iris[1:30, 1:2]
行アクセス 列アクセス
$ iris$Sepal.Length
データフレーム＄変数
名

10. 変数名を取得する
$ colnames(iris)
$ rownames(iris)
行名取得
列名取得

11. とりあえず、plot()
$ plot(iris[,1], iris[,2])

12. Ｘ軸, Ｙ軸のラベルを変更
$ plot(iris[,1], iris[,2], xlab=“Sepal.Length”,
ylab=“Sepal.Width”)

13. 色をつける
$ plot(iris[,1], iris[,2], xlab=“Sepal.Length”, ylab=“Sepal.Wi
dth”, col=“blue”)

14. 軸の長さを指定する
$ plot(iris[,1], iris[,2], xlab=“Sepal.Length”,
ylab=“Sepal.Width”, col=“blue”, xlim=c(0,8), ylim=c(0,8))

15. プロットマーカー変更
$ plot(iris[,1], iris[,2], xlab=“Sepal.Length”, ylab=“Sepal.Width”,
col=“blue”, xlim=c(0,8), ylim=c(0,8), pch=20)

16. プロットマーカー一覧
• pch＝値 で点をプロットする文字を指定できる

17. 品種ごとにマーカーの色を変更
$ plot(iris$Sepal.Length, iris$Sepal.Width,
xlab="Sepal.Length", ylab="Sepal.Width",
col=c(1:length(unique(iris$Species))), ylim=c(2,6),
pch=20)
３でもいい

18. 品種ごとにマーカーの色を変更

19. 凡例を追加する
$ plot(iris$Sepal.Length, iris$Sepal.Width,
xlab="Sepal.Length", ylab="Sepal.Width",
col=c(1:length(unique(iris$Species))), ylim=c(2,6),
pch=20)
$ legend("topright", legend=unique(iris$Species),
col=c(1:length(unique(iris$Species))),pch=20)

20. 凡例を追加する

21. グラフに文字を書き込む
• そのまえに、Sepal.Length とSepal.Width の相関係数を求め
る
（書き込むデータを用意するため）
• text() を使って求めた相関係数をグラフに書き込む
$ r <- cor(iris$Sepal.Length, iris$Sepal.Width)
$ r
[1] -0.1175698

22. グラフに文字を書き込む
$ plot(iris$Sepal.Length, iris$Sepal.Width, xlab="Sepal.Le
ngth", ylab="Sepal.Width", col=“blue”, ylim=c(2,6), pch=2
0)
$ text(7, 5, label=r, srt=0, cex=0.8)

23. グラフに文字を書き込む

24. plot() ではものたりない場合…
• ggplot()
• パッケージをインストールする必要がある
$ install.packages(ggplot2)
$ library(ggplot2)
• 書き方になれないとかなり使いにくい…

25. ggplot() で描写してみるとこんな感
じ
$ ggplot(iris[,1:2], aes(Sepal.Length,
Sepal.Width))+geom_point()
• こんなかんじで描写
• 場合によっては、ggplot()
使ったほうが楽に描写で
きるものもある
（例：積み上げグラフと
か）

26. わからないときは…
• R−tips
http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r.html
• RjpWiki
http://www.okada.jp.org/Rwiki/
• seekR
http://seekr.jp/
• ひたすらググる、もしくは人に聞く

27. ご清聴ありがとうございま
した
至らない点が多々あったと思いますが、
最後までお付き合いしていただきありがとうございました。
今後もどうぞよろしくお願いします。
E-mail: mf.0833 <at> gmail.com