Model of management and sharing distributed information of pollinators using biodiversity portals

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Model of management and sharing distributed information of pollinators using biodiversity portals

  1. 1. Model of management andsharing distributed information ofpollinators using biodiversityportalsPablo Salvanha (USP, São Paulo, Brazil) – salvanha@usp.brLeandro Halle Najm (USP, São Paulo, Brazil) –hallenajm@usp.brPedro Luiz P. Correa (USP, São Paulo, Brazil) -pedro.correa@usp.brAntonio Mauro Saraiva (USP, São Paulo, Brazil) –saraiva@usp.br
  2. 2. Agenda Introdução Portais de Biodiversidade ◦ Portal IABIN Ferramenta de Coleta - Specify Modelo DarwinCore Modelo de Interação Conclusão Referencias Bibliográficas
  3. 3. Introdução Importância do estudo; Cenário atual para armazenamento de dados de biodiversidade; Informatização e distribuição da informação Controle e replicação; Armazenamento distribuído / centralizado;
  4. 4. Portais de Biodiversidade GBIF (Global BiodiversityInformationFacility) IABIN (Inter AmericanBiodiversityInformation Network) NBII (NationalBiologicalInformationInfrastru cture) WebBee (Rede de Informações sobre Diversidade Brasileira em Abelhas)
  5. 5. Portal IABIN
  6. 6. Ferramenta de Coleta -Specify Facilidade na utilização; Personalização da interface e dados de entrada; Suporte aos protocolos atuais; Padronização no gerenciamento de coleções;
  7. 7. Ferramenta de Coleta -Specify
  8. 8. Modelo DarwinCore Singularidade da informação; Padronização dos campos a serem distribuídos; Protocolos de acoplamento (DiGIR / TAPIR) Compatibilidade com atuais portais de biodiversidade (GBIF, IABIN, ...)
  9. 9. Modelo DarwinCore
  10. 10. Modelo de Interação Complemento ao cenário atual; Compatibilidade com os atuais protocolos; Suporte aos dados de interação; Checagem da integridade entre as ligações dos dados;
  11. 11. Processo de Harvest
  12. 12. Implementação Adaptação do software de coleta (Specify); Uso do protocolo TAPIR para o modelo DarwinCore e para o modelo de interação; Alteração no processo de Harvest para suporte ao modelo de interação; ◦ Checagem da integridade das informações Alteração na camada de apresentação do portal para exibição e consulta de dados de interação;
  13. 13. Conclusão Compatibilidade com as aplicações que utilizam somente modelo DarwinCore; Informatização no processo de coleta usando ferramenta adaptativa e gratuita; Fácil adequação para fornecimento de dados de interação; Distribuição de informação de polinizadores em portais, facilitando
  14. 14. Referências Bibliográficas J.L. Schnase, J. Cushing, and J.A. Smith, Biodiversity and ecosystem informatics,” J. Intell. Inf. Syst. 29, 1, August 2007. J. Soberon: “Linking biodiversity information sources,” Tree Elsevier Science, vol. 14, n.7, p.291, 7 July 1999. Specify, http://www.specifysoftware.org/Specify/specify N.A. Van House: Trust and epistemic communities in biodiversity data sharing,” 2nd ACM/IEEE-CS Joint Conference on Digital Libraries.Portland, Oregon, USA, July 2002. P.L.P. Corrêa, A.M. Saraiva, C.E.Cugnasca, andA.R.Hirakawa: “Uma arquitetura de sistemas voltada para a integração de bases de dados distribuídas de biodiversidade,” Revista Brasileira de Agroinformática, São Paulo, v. 6, n. 1, p. 1-20, 2004. IABIN, http://www.iabin.net DarwincoreSchema, http://www.tdwg.org/activities/darwincore/ DiGIRProtocol, www.digir.net GBIF, http://www.gbif.org Tapir Protocol, http://www.tdwg.org/activities/tapir/ R. Sundaravadivelu, R.J. White, A.C. Jones, and W.A Gray: “Web based middleware framework for interoperability between heterogeneous, distributed biodiversity data resources,” 25th Conference on IASTED international Multi-Conference: Software Engineering.Innsbruck, Austria, February 2007. TDWG, www.digir.net PlinianCoreschema, http://www.pliniancore.org/ Interaction Extension, http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/InteractionExtension E.A.J.Cartolano, A.M. Saraiva, P.L.P. Corrêa, T.C. Giannini, and R. Giovanni: “Uma proposta de esquema de dados de relacionamento entre espécimes,” XXXIII Conferencia Latinoamericana de Informática – CLEI, San Jose 2007. M. T. Özsu, P. Valduriez: “Distributed Database Systems,” Prentice Hall. 22-23, 1999. Pollination Extension, http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/PollinationExtension

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