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Comment mesurer la
  biodiversité ?
  Emmanuelle Porcher
 Muséum national d’Histoire
        naturelle




                  29 novembre 2010 - Marseille
La biodiversité comme                  Biosphère

un continuum                            Biomes

                                       Paysages
« La variabilité des organismes
vivants de toute origine y compris,   Ecosystèmes
entre autres, les écosystèmes
terrestres, marins et autres            Guildes

écosystèmes aquatiques et les
                                      Communautés
complexes écologiques dont ils
font partie ;                           Espèces
Cela comprend la diversité au sein
                                      Populations
des espèces et entre espèces ainsi
que celle des écosystèmes. »           Individus

                                        Organes

                                        Cellules

                                       Molécules
Aller au-delà du comptage d’espèces


   “L’espèce comme maître étalon, niveau fondamental de la biodiversité”
                                                             Gilles Escarguel



   “I will not consider bacteria because the species concept does not apply to
   them”
                                                               Robert M. May
Pourquoi mesurer la biodiversité ?
 Valeur d’existence          Services écosystémiques
   Intrinsèque                 Comment la biodiversité
                               fournit-elle ces services ?
   Obligation éthique de
   protection : chaque
   espèce (voire individu)
   est le produit d’une
   histoire évolutive très
   longue et a une valeur
   en elle-même

   Valeur pour les
   générations futures
      Legs
Systématique et « patrimoine »
Temps


                                                      48%
               48%                                  Téléostéens


              Tétrapodes




                           Diversité structurelle et historique

                                             Guillaume Lecointre
Biodiversité et fonctionnement des
écosystèmes
 Prairies expérimentales de Cedar creek, Minnesota




                                            Tilman et al. 1996, 1997
Mesurer les processus plutôt qu’un état
figé
                      Genre Bursera, Mexique




                                Becerra & Venable 2008
Mesure de la diversité génétique
             Matière première pour l’émergence de nouvelles espèces
                  Exemple : Centaurea en Europe

                                                                                                 5
                                                                         L
                                                                     R
                                                                                  C. maculosa    4

                                                                                  françaises
C. m. subalbida                                                                                  3

                    L                                      C. vallesiaca
               N2000
                                                                                                 2



                                                                                                 1
C. m. albida
                  R                  L
                                 N2000                   C. m. maculosa                          0
                                                                             L   -2      -1           0      1        2
                                                                      N2000

                                                                                                 -1
                                                                                 C. corymbosa
C. exarata              C. corymbosa     C. filiformis       C. subtilis
                                                                                                          C. m. maculosa
                                                                                                 -2
                                                                                                          italiennes


                                                                                                Thèse de Coralie Beltrame
Le constat : « Érosion » / « Crise » de la
biodiversité
 Comment le mesure-t-on ?
    Indicateurs de biodiversité = Résumé d’une information complexe qui
    permet à différents acteurs de dialoguer




                                                                   Indicateurs




                                                                       …



    Double exigence
       Scientifique : Robustesse des indicateurs
            Renseignent aussi sur les causes et les conséquences
       Sociétale : compréhensibles et utilisables par tous les acteurs
Des indices pour renseigner des
indicateurs
 Pour intégrer les différences entre espèces dans la mesure
 de la biodiversité
    Indice de Rao (1982)                          1 N N
                                               Q = ∑∑ pi p j dij 2
                  dij                             2 i =1 j =i
              Dissimilarité                                                     ≈ Variance
             entre espèces

                                                                           Dγ
  Espèce i                    Espèce j                Dβ

 Indice décomposable                                          Communauté 1
                                                              Zones protégées
                                                                 1985
                                                                         Dα
                                            Communauté 2
                                            Zones cultivées
                                                   1995

                                                                 2005
                                                              Communauté 3
                                                              Zones urbaines
                                         Zones protégées ≠= Dα ≠ 2005 ? ≠ Zones urbaines ?
                                                    1985 γ≠Zones + Dβ
                                                      D 1995 cultivées
Tension entre les différents facettes de la
biodiversité
 Ex : communautés d’oiseaux




                                 Devictor et al. 2010
Pour mesurer toutes les facettes de la
biodiversité
 Besoin d’informations sur :
   Les espèces, leur distribution spatiale et
   temporelle

   Les caractéristiques historiques,
   morphologiques et fonctionnelles des espèces
     Traits morphologiques
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  • 1. Comment mesurer la biodiversité ? Emmanuelle Porcher Muséum national d’Histoire naturelle 29 novembre 2010 - Marseille
  • 2. La biodiversité comme Biosphère un continuum Biomes Paysages « La variabilité des organismes vivants de toute origine y compris, Ecosystèmes entre autres, les écosystèmes terrestres, marins et autres Guildes écosystèmes aquatiques et les Communautés complexes écologiques dont ils font partie ; Espèces Cela comprend la diversité au sein Populations des espèces et entre espèces ainsi que celle des écosystèmes. » Individus Organes Cellules Molécules
  • 3. Aller au-delà du comptage d’espèces “L’espèce comme maître étalon, niveau fondamental de la biodiversité” Gilles Escarguel “I will not consider bacteria because the species concept does not apply to them” Robert M. May
  • 4. Pourquoi mesurer la biodiversité ? Valeur d’existence Services écosystémiques Intrinsèque Comment la biodiversité fournit-elle ces services ? Obligation éthique de protection : chaque espèce (voire individu) est le produit d’une histoire évolutive très longue et a une valeur en elle-même Valeur pour les générations futures Legs
  • 5. Systématique et « patrimoine » Temps 48% 48% Téléostéens Tétrapodes Diversité structurelle et historique Guillaume Lecointre
  • 6. Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes Prairies expérimentales de Cedar creek, Minnesota Tilman et al. 1996, 1997
  • 7. Mesurer les processus plutôt qu’un état figé Genre Bursera, Mexique Becerra & Venable 2008
  • 8. Mesure de la diversité génétique Matière première pour l’émergence de nouvelles espèces Exemple : Centaurea en Europe 5 L R C. maculosa 4 françaises C. m. subalbida 3 L C. vallesiaca N2000 2 1 C. m. albida R L N2000 C. m. maculosa 0 L -2 -1 0 1 2 N2000 -1 C. corymbosa C. exarata C. corymbosa C. filiformis C. subtilis C. m. maculosa -2 italiennes Thèse de Coralie Beltrame
  • 9. Le constat : « Érosion » / « Crise » de la biodiversité Comment le mesure-t-on ? Indicateurs de biodiversité = Résumé d’une information complexe qui permet à différents acteurs de dialoguer Indicateurs … Double exigence Scientifique : Robustesse des indicateurs Renseignent aussi sur les causes et les conséquences Sociétale : compréhensibles et utilisables par tous les acteurs
  • 10. Des indices pour renseigner des indicateurs Pour intégrer les différences entre espèces dans la mesure de la biodiversité Indice de Rao (1982) 1 N N Q = ∑∑ pi p j dij 2 dij 2 i =1 j =i Dissimilarité ≈ Variance entre espèces Dγ Espèce i Espèce j Dβ Indice décomposable Communauté 1 Zones protégées 1985 Dα Communauté 2 Zones cultivées 1995 2005 Communauté 3 Zones urbaines Zones protégées ≠= Dα ≠ 2005 ? ≠ Zones urbaines ? 1985 γ≠Zones + Dβ D 1995 cultivées
  • 11. Tension entre les différents facettes de la biodiversité Ex : communautés d’oiseaux Devictor et al. 2010
  • 12. Pour mesurer toutes les facettes de la biodiversité Besoin d’informations sur : Les espèces, leur distribution spatiale et temporelle Les caractéristiques historiques, morphologiques et fonctionnelles des espèces Traits morphologiques Traits fonctionnels Diversité génétique Phylogénies Etc…