Presentación6 Herramienta ELCmapas

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Primer Taller para el Fortalecimiento de las Capacidades en Programas Nacionales de Conservación y Utilización de Recursos Fitogenéticos de América Latina, Bogotá 19 al 22 de Marzo de 2013. Programa …

Primer Taller para el Fortalecimiento de las Capacidades en Programas Nacionales de Conservación y Utilización de Recursos Fitogenéticos de América Latina, Bogotá 19 al 22 de Marzo de 2013. Programa CAPFITOGEN. Tratado Internacional sobre los Recursos Fitogenéticos para la Alimentación y la Agricultura, FAO, descargar en http://www.planttreaty.org/capfitogen

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  • 1. HerramientaELCmapasCreación de mapas de caracterización ecogeográfica del territorioMauricio Parra Quijano, PhDPrograma CAPFITOGEN
  • 2. Herramientas CAPFITOGEN • GEOQUAL • ELCmapas • Representa • ECOGEO • Colnucleo • DIVmapas • FIGS_R • Colecta Optimizada
  • 3. Como se hace un mapa ELC? Selección de las variables Variables Bioclimáticas Variables Geofísicas Variables Edáficas Análisis de Análisis de Análisis de Agrupamientos agrupamientos Agrupamientos Determinación Determinación Determinación Número óptimo Número óptimo Número óptimo grupos grupos grupos Combinación (N bioclimáticos*N geofísicos*N edáficos) Categorías MAPA Descripción Categorías por variables originales
  • 4. Selección de las variables Búsquedas bibliográficas sobre factores preponderantes en la adaptación de una especie objetivo Conocimiento experto • Los expertos y conocedores de una especie son una valiosa fuente de información • Las encuestas son un medio eficiente para recabar información de conocimiento experto (internet/correo electrónico, encuentros, talleres, etc.) • Se hacen listas de variables por componente, con detalles sobre la naturaleza de las variables (explicación de códigos, unidades de la variable, fuente, etc.) y se pide asignar un valor en base a la importancia que tendría la variable en la adaptación de la especie.
  • 5. Selección de las variables Depuración: • Redundancia? Correlación? Colinealidad? x1 x2 x1 x1 x1 • Análisis de correlaciones bivariadas, PCA, factor de inflación de la varianza VIF (comparación de las relaciones lineales entre variables – solo en regresión) • Significancia. A través de un análisis de regresión múltiple contando con una variable dependiente (que nos de una idea de adaptación).
  • 6. Iniciando ELCmapas • La instalación es idéntica al caso de GEOQUAL, seguir los mismos pasos • Si ya se ha instalado previamente GEOQUAL, sólo es necesario activar Tomcat haciendo click sobre startup.bat que está en “bin”, de la carpeta de “elcmapas”: x64 [letra de la USB]:elcmapasInstalarPreviax64tomcat_x64apache-tomcat-7-0- 35_x64bin X86 [letra de la USB]: elcmapasInstalarPreviax86tomcat_x86apache-tomcat-7- 0-35_x86bin • Activando el Tomcat de ELCmapas se activa también GEOQUAL, no lo contrario. •Abrir Mozilla Firefox y escribir http://localhost:8080/elcmapas
  • 7. ELCmapas[Letra USB]:/elcmapas 
  • 8. ELCmapas 5x5  
  • 9. ELCmapasEliminaciónde celdas duplicado [Letra de USB]:/Resultados NOTA: El proceso puede llegar a tardar varias horas en producir resultados, dependiendo de lo exigente de la configuración de la herramienta (alta resolución, tamaño del país, método de agrupamiento, etc.). También pueden aparecer errores en al parte inferior (texto en color rojo) que pueden indicar la incapacidad del hardware para poder realizar el análisis («… no se puede cargar un vector de tamaño x Mb…»).
  • 10. Elbow vs Medoides Parámetros ELBOW MEDOIDES Rapidez ++ + Grandes extensiones ++ □ Complejidad □ ++ Soporte bibliográfico + ++ Determinación objetiva del número de grupos por componente x x x NOTA: En el «número máximo de grupos» no seleccione menos de 3 (pueden salir errores cuando el método determina un número mayor al estipulado) o más de 8 (dificultad a la hora de interpretar resultados) agrupamientos por componente.
  • 11. Resultados ELCmapas • Los mapas: los abrimos con DIVA-GIS
  • 12. Resultados ELCmapas • Las tablas: “ELC_mapa_[nombre país].txt” : tabla con tantas filas como celdas con valores ELC_CAT, de los grupos de cada componente que originan ELC_CAT y de las variables originales (más X e Y) “numero_categorias_[nombre país].txt”: recuento de categorías obtenidas “EstadistDescript_[nombre país].txt”: estadísticos descriptivos por categoría ecogeográfica del mapa (ELC_CAT) para las variables ecogeográficas consideradas a la hora de hacer el mapa
  • 13. FIN