Search

ITU Talk - 2009

Loading...

Flash Player 9 (or above) is needed to view presentations.
We have detected that you do not have it on your computer. To install it, go here.

0 comments

Post a comment

    Post a comment
    Embed Video
    Edit your comment Cancel

    Notes on slide 1

    Stress = 0.155

    Favorites, Groups & Events

    ITU Talk - 2009 - Presentation Transcript

      • Yerel bariyerler, genetik karışma ve kıtalararası izolasyon
      • İnsan populasyon tarihine çok katmanlı bir yaklaşım
    2. Özet – Karmaşık sistemler
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    3. Genetik Bilgi - Çeşitlilik
      • W ikimedia
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      AAGAGGGTGGAGCCACC CT CATCAAGCAGTGACTTTTTGTGACTTTTGGGAGAGCTGACCTTTT GTGACTTTTGGGAGAGCTGCCAAAAGTGAAACTTAGTG CC TCAGACAAGCAGGGGCAAGTCTGCTAAGGAAGCTGTGGCCAGA A GCACAGATCAGGTACTGCCGCCCACTCTGTCCACTGGGCCCTCTGCTGCCACTTCCTGCCTGGCAGC CCTTCTGTGCCTCAGCCCTGGCCTCCCGCTGCCCCAGCCCCAGC
    4. Ölçek meselesi
      • NASA – Global Satellite Images
      • Gokcumen, Personal Photograph Archive
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    5. Yeni A çılımlar
      • W ikimedia
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Eğer ki genomların arasındaki farklar sadece tek nükleotid değişiklikleri olsaydı, bir kr o mozomdaki çeşitlilik bu şekilde görünürdü. Ancak bugün biliyoruz ki, genomların arasında kopya numarası değişiklikleri var ve çeşitlilik aslında aşağıdaki gibi görünüyor.
    6. İnsan!
      • Photographs: Anthropological Institute, University of Zürich and Gokcumen Graph : Green et al 2008. Cell
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    7. Genetik Çeşitlilik
      • Cover of Newsweek, Jan 11, 1988
      • Cover of Sc ience Magazine, 21 December 2008
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    8. Genetik Çeşitliliğin anlamı
      • Akey J. M. Genome Res. 2009;19:711-722
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Genom genelinde etkili Güçler Belli Bölgelerde Etkili Güçler Göçler, izolasyon, vb. Adaptasyon, hastalıklar, vb.
    9. İnsan Genetik Çeşitliliği
      • Ingman, M., Kaessmann, H., Pääbo, S. & Gyllensten, U. (2000) Mitochondrial genome variation and the origin of modern humans. Nature 408: 708-713
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      M.Ö. 100 .000 M . Ö . 10 0.000-50.000 M . Ö . 50.000 M . Ö . 50.000 Günümüz
    10. Afrika’dan başlayan bir yolculuk
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      M.Ö. 100 .000 M . Ö . 10 0.000-50.000 M . Ö . 50.000 M . Ö . 50.000 - Günümüz
    11. Hastal ıklar ve Adaptasyonlar
      • Vo igt et al. 2005
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    12. Genet ik Hastal ıklar : Angelman
      • Giovanni Francesco Caroto - Castelvecchio Museum, Verona, Italy. C irca 15.yy.
      • Delach et al. 1994
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Normal Genetik materyal kaybı
    13. Genetik Adaptasyonlar : Am ilez
      • Perry et al. 2007. Nature Genet ics.
      • Protein Yap pısı: Wikimedia
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    14. Ölçek Meselesi
      • Jakobsson et al. 2008
      • Gokcumen et al. 2008
      • Gokcumen et al. Sub
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Kıtalararası Izolasyon Kıtalar içinde karışım Yerel Bariyerler
    15. Kıtalarası İzolasyon
      • Jakobsson et al. 2008
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      K=2 K=5 K=6 K=4 K=3 N üfus Africa Europe Asia Oceania America Kıtaya özgü genetik çeşitlilik Africa Eurasia
    16. İzolasyonun boyutu
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Jakobsson et al. 2008 0.91 0.01 0.05 0.06 0.75 97.14 98.05
    17. Kıtalar içindeki karışma
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Tishkoff et al., 2009 Afrika Topluluklarının birbirleri ve diğer dünya toplulukları ile karşılaştırılması (Veri:Autosomal-STRs, PCA)
      • Nievergelt et al 2007
      Kıtalar içindeki karmaşık yapı
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Nükleotid farklılıklarına göre insan topluluklarının genetik ağacı (Veri: Otozomal SNP, Neighbor Joining) (A) K ıtalara Göre Renklendirilmiş ( B ) Populasyonlara göre renklendirilmiş
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      J Novembre et al. 2008 Nature, Gokcumen et al. 2008 AJPA, Comas et al. 2004 AJHG
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Gokcumen et al. 2008 AJPA, Comas et al. 2004 AJHG C* C1 C4a C4b C5 Other
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Photo : Gokcumen
    22. Medyatik kafa karışıklıkları
      • Hürriyet – 23 Ekim 2007
      • Milliyet – 17 Mayıs 2005
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    23. Yeni Açılımlar
      • Gokcumen et al. 2009
      • K im et al. 2009
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      Yapısal Varyasyon Yeni Jenerasyon Sekans
    24. Yapısal Çeşitlilik
      • Feuk et al. Nature Reviews Genetics 7 , 85 – 97 (February 2006)
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    25. Kopya Sayısı Çeşitliliği
      • Gokcumen and Lee (2009). Methods.
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    26. Kopya Sayısı Çeşitliliği
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      • Gokcumen and Lee (2009). Methods.
    27. Yapısal Çeşitlilik
      • Redon et al. (2006)
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    28. Yapısal Çeşitlilik
      • Redon et al. (2006)
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      İki insan arasındaki genetik fark = % 0.1 %0.8
    29. Yeni Jenerasyon Sekans
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      DNA Parçalama Kimyasal Adaptörler Yüzeye Bağlama Sekans
    30. Bir Kore vatanda şının Genomu
      • Kim et al. 2009
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    31. Erişilebilir tutarlar
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      İlk insan genomu : $ 500 .000.000 İlk Jenerasyon ile şu anda bir genomu sekanslamak: $ 10 .000.000 Yeni Jenerasyon teknoloji ile bir genomu sekanslamak: $ 30.000 Datalar ın analizi için haftalarca gece gündüz uğraşmak: “ Priceless”
    32. Yeni Jenerasyon Sekans
      • Modified from the HapMap website
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
      5 1000 2010 2009
    33. Hem aynıyız hem farklı!
      • Graph: Clark Gagneux et al. 1999; Photographs and Map: Gokcumen et al 2008. Atlas
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    34. Değişen zamanlar!
      • Nazi dönemi ötenazi propagandası – Wikimedia
      • Agilent CGH array – www.agilent.com
      • Özet
      • Genet ik B ilgi
        • Çeşitlilik
        • Afrika
        • Hastalıklar ve A d aptasyon
      • Ölçek Meselesi
        • Dünya
        • Kıtalar
        • Yerel
        • Popüler yanlış anlamalar
      • Yeni Açılımlar
        • Yapısal Varyasyon
        • Yeni jenerasyon sekans
        • İnsan
    35. Teşekkürler http://gokcumen.wordpress.com/

    + gokcumengokcumen, 3 months ago

    custom

    188 views, 0 favs, 1 embeds more stats

    More info about this document

    © All Rights Reserved

    Go to text version

    • Total Views 188
      • 154 on SlideShare
      • 34 from embeds
    • Comments 0
    • Favorites 0
    • Downloads 0
    Most viewed embeds
    • 34 views on http://gokcumen.wordpress.com

    more

    All embeds
    • 34 views on http://gokcumen.wordpress.com

    less

    Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
    Flag as inappropriate

    Select your reason for flagging this presentation as inappropriate. If needed, use the feedback form to let us know more details.

    Cancel
    File a copyright complaint
    Having problems? Go to our helpdesk?

    Categories

    -->
    Search
    RSS Feed
    What's new?

    © 2009 SlideShare Inc. All Rights Reserved