1. Introduction aux caractéristiques visuelles
identifiables à partir d’une trace biologique
Geneviève Blais
Supervisée par Dr Tatiana Scorza
2. Plan de l’exposé
Introduction
Différentes méthodes d’identification
Les STR (Single Tandem Repeat)
Obtention d’un profil génétique
Analyse d’un profil génétique
Les SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
Identification génétique par les SNP
Variations physiques possibles avec les SNP
Techniques de détection des SNP
4. Introduction (suite)
Polymorphisme de longueur: les STR
STR (Short Tandem Repeat)
2 à 5 nucléotides
5 à 50 répétitions
Obtention d’un profil
Banque nationale de données génétiques
Référence du suspect par mandat (sang ou salive)
Que faire lorsqu’un profil est nul ou partiel?
Nouvelle technologie: les SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
5. Introduction (suite)
Polymorphisme de séquence: les SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
BGA (Bio Geographical Ancestry): différencier l’ethnie
Africains
Américains
Asiatiques de l’Est
Européens
Études toujours en cours
Pigmentation des yeux
Pigmentation de la peau
Pigmentation des cheveux
But: Déterminer l’utilité d’une méthode complémentaire aux STR
avec l’éventuelle méthode discriminatoire avec les SNP
6. Les STR: obtention d’un profil
Prélèvement, extraction et
purification de la trace biologique
Amplification par PCR mulptiplex
avec la Taq polymérase
Choix de 13 STR
Électrophorèse capillaire (tension
de 1 kilovolt)
Transfert des bandes en pics par Coquoz, 2003
un logiciel informatique
7. Les STR: obtention d’un profil
STR = séquences répétées en
tandem, polymorphisme de
longueur
Différentes tailles de STR pour
différentes bandes de
migration
Coquoz, 2003
Quelle bande correspond à
quel STR?
Utilisation de 4 à 5 couleurs de
fluorochromes fixés aux
amorces
Analyse d’un profil génétique
Coquoz, 2003
8. Les STR: analyse d’un profil
Chaque ligne correspond à un
colorant fluorescent
Échelle de référence en rouge
Profil génétique d’une
suspecte
Chromosome X
Allèles des STR identifiés par
le nombre de répétitions
2 numéros pour le
génotype
15/17 pour vWA
16/16 pour D3S1358
Profil complet
Cas réel d’homicide, 2007, LSJML
9. Les SNP: identification par les SNP
En 2006, 5 millions de
caractérisés
Retrouvés environ toutes les
500 bases
Polymorphisme limité à 4
allèles
Pouvoir d’identification plus
élevé si 30 à 80 SNP à l’étude
Keyser et Petkovsi, 2006
Tests validés en sciences
judiciaires
Mini séquençage avec
ADNmt
Chromosome Y
Marqueurs pour cheveux roux
10. Les SNP: variations physiques possibles
Profil partiel ou nul
Méthode ultime: portrait robot avec l’ADN
Nouvelle technologie pratiquée (ADN non codante)
Orientation géo-génétique (BGA, Bio Geographical Ancestry)
Renseigne sur la région géographique d’appartenance
Autres études en cours (ADN codante)
Couleur de l’iris: SNP visés dans les gènes HERC2 et OCA2
Couleur de la peau: SNP visés dans les gènes OCA2 et TYR
11. Les SNP: techniques de détection des SNP
Analyse et lecture des SNP
complexe
Différentes méthodes utilisées
pour identifier les SNP
Puces à ADN
Électrophorèse
MALDI-TOF Sanger, UK
Puces à ADN (Illumina)
1 million de SNP par puce
30 millions de puits
Marqueurs par fluorescence
Recherches toujours en cours
pour l’identification par marqueurs
visuels
Illumina, USA
12. Conclusion
Méthode avec les STR
Établie, validée et fonctionelle en sciences judiciaires
Banque nationale de données génétiques établie
Permet l’analyse de plusieurs marqueurs à la fois
Échec possible lors de profils partiels ou nuls
Méthode avec les SNP
Utilisée aux États-Unis et en Europe
Complémentaire aux STR lors de profils partiels avec BGA
Coûts éventuels pour transférer les STR en SNP au niveau de la
Banque
Validation obligatoire pour utilisation des SNP en milieu judiciaire
Études éventuelles sur le rapprochement des amorces plus proche
de la séquence à isoler en PCR
13. Remerciements
Merci à:
Martine Lapointe, Spécialiste en ADN
François Julien, Spécialiste en ADN – Scènes de crimes
Références majeures:
Coquoz R. 2003. Preuves par l’ADN. La génétique au
service de la justice.
ScienceDirect
Pubmed