• Share
  • Email
  • Embed
  • Like
  • Save
  • Private Content
Bioinfo - Grad - Aula 6
 

Bioinfo - Grad - Aula 6

on

  • 635 views

 

Statistics

Views

Total Views
635
Views on SlideShare
72
Embed Views
563

Actions

Likes
0
Downloads
2
Comments
0

3 Embeds 563

http://www.lab-bioinfo.com 543
http://ucb.lab-bioinfo.com 14
http://10.150.3.54 6

Accessibility

Categories

Upload Details

Uploaded via as Adobe PDF

Usage Rights

© All Rights Reserved

Report content

Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
  • Full Name Full Name Comment goes here.
    Are you sure you want to
    Your message goes here
    Processing…
Post Comment
Edit your comment

    Bioinfo - Grad - Aula 6 Bioinfo - Grad - Aula 6 Presentation Transcript

    • + Bioinformática Análise Funcional Gabriel da Rocha Fernandes Universidade Católica de Brasília gabrielf@ucb.br - fernandes.gabriel@gmail.com
    • + Objetivos 2 nIdentificar as funções dos genes. nCaracterizar os processos celulares. nMapear em vias metabólicas. nElucidar o funcionamento do organismo.
    • + Ferramentas nFerramenta de alinhamento: n BLAST n HMMER nBase de dados: n COG n KEGG Orthology n PFam n Gene Ontology 3
    • + Dicas nProcurar por Hits que tenham descrição clara. n Evitar: hypothetical protein, putative.. nBuscar em várias bases de dados. n Aumentar a quantidade de entradas anotadas. n Hits não identificados em uma base podem ser anotados por outra. nObservar a cobertura do alinhamento. n BLAST faz alinhamento local. n Não classificar uma proteína como um todo baseado apenas em alinhamento a um unico domínio. 4
    • + Processo 5 27 0! ! Predição dos genes! 27 0! ! BLAST! Base de dados!
    • + Blast2GO 6
    • + KEGG Mapper 7
    • + iPath npathways.embl.de 8
    • + Pfam 9