Bioinfo - Grad - Aula 5

717
-1

Published on

0 Comments
0 Likes
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

No Downloads
Views
Total Views
717
On Slideshare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
4
Actions
Shares
0
Downloads
2
Comments
0
Likes
0
Embeds 0
No embeds

No notes for slide

Bioinfo - Grad - Aula 5

  1. 1. + Bioinformática Anotação funcional de genomas Gabriel da Rocha Fernandes Universidade Católica de Brasília gabrielf@ucb.br - fernandes.gabriel@gmail.com
  2. 2. + Após a montagem... 2 nOs contigs são apenas uma sequência de nucleotídeos. nEncontrar informação biológica dentro dos contigs. nGenes nIntrons/Exons nPromotores
  3. 3. + Predição gênica 3 nIdenticar genes. nATG + ORF + Stop condon na mesma fase de leitura. nPredição ab initio, redes neurais... nIdentificação de introns e exons. nLocalização dos genes dentro do contexto dos contigs.
  4. 4. + GeneMark 4 nUsa a informação de codon usage para fazer a predição.
  5. 5. + Promotores nIdentifica padrões de sequência de promotores. nhttp://pepper.molgenrug.nl/ 5
  6. 6. + Arquivo GFF nGeneral Feature Format nIndica as posições no contig de cada item identificado. 6
  7. 7. + No GenBank file 7
  8. 8. + No EMBL 8
  9. 9. + Visualização nArtemis - Sanger Institute 9

×