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    Bioinfo - Grad - Aula 5 Bioinfo - Grad - Aula 5 Presentation Transcript

    • + Bioinformática Anotação funcional de genomas Gabriel da Rocha Fernandes Universidade Católica de Brasília gabrielf@ucb.br - fernandes.gabriel@gmail.com
    • + Após a montagem... 2 nOs contigs são apenas uma sequência de nucleotídeos. nEncontrar informação biológica dentro dos contigs. nGenes nIntrons/Exons nPromotores
    • + Predição gênica 3 nIdenticar genes. nATG + ORF + Stop condon na mesma fase de leitura. nPredição ab initio, redes neurais... nIdentificação de introns e exons. nLocalização dos genes dentro do contexto dos contigs.
    • + GeneMark 4 nUsa a informação de codon usage para fazer a predição.
    • + Promotores nIdentifica padrões de sequência de promotores. nhttp://pepper.molgenrug.nl/ 5
    • + Arquivo GFF nGeneral Feature Format nIndica as posições no contig de cada item identificado. 6
    • + No GenBank file 7
    • + No EMBL 8
    • + Visualização nArtemis - Sanger Institute 9