A PUBMED PESQUISA NA BASE DE DADOS E ACESSO AO TEXTO INTEGRAL DE PERIÓDICOS NA ÁREA DA SAÚDE 18/03/2009 Formadora: Maria Filipa Torres

1.1 O que é a PubMed? A PubMed é um interface de acesso à Medline produzido e disponibilizado pela National Library of Medicine; www.pubmed.org

A PubMed é um interface de acesso à Medline produzido e disponibilizado pela National Library of Medicine;

www.pubmed.org

1.1 O que é a PubMed? A PubMed inclui: A OLDMEDLINE que contém artigos anteriores a 1966; Citações avulsas; Citações in-process (fornecem a citação básica e, na maior parte dos casos, o resumo do artigo, antes mesmo da introdução dos assuntos – termos MeSH); A MEDLINE (National Literature, Analysis, and Retrieval System Online).

A PubMed inclui:

A OLDMEDLINE que contém artigos anteriores a 1966;

Citações avulsas;

Citações in-process (fornecem a citação básica e, na maior parte dos casos, o resumo do artigo, antes mesmo da introdução dos assuntos – termos MeSH);

A MEDLINE (National Literature, Analysis, and Retrieval System Online).

1.1 O que é a PubMed? A Medline: É uma base de dados, produzida pela National Library of Medicine (NLM), dos Estados Unidos, contendo referências bibliográficas de artigos de mais de 5000 periódicos científicos na área da saúde (medicina, enfermagem, medicina veterinária, sistemas de saúde, ciências pré-clínicas, etc.), a nível mundial.

A Medline:

É uma base de dados, produzida pela National Library of Medicine (NLM), dos Estados Unidos, contendo referências bibliográficas de artigos de mais de 5000 periódicos científicos na área da saúde (medicina, enfermagem, medicina veterinária, sistemas de saúde, ciências pré-clínicas, etc.), a nível mundial.

1.1 O que é a PubMed? A Medline: É uma base de dados de referência e não uma base de dados em texto integral; Num grande número de casos são disponibilizados os links para o texto integral (o acesso aos artigos por vezes é gratuito e outras vezes é pago).

A Medline:

É uma base de dados de referência e não uma base de dados em texto integral;

Num grande número de casos são disponibilizados os links para o texto integral (o acesso aos artigos por vezes é gratuito e outras vezes é pago).

1.1 O que é a PubMed? Acesso: Gratuito; Sem necessidade de qualquer registo ou subscrição pessoal.

Acesso:

Gratuito;

Sem necessidade de qualquer registo ou subscrição pessoal.

1.2 Google VS PubMed A PubMed é uma base de dados de elevada qualidade, com conteúdos controlados, tem um produtor que é fiável, possui um interface amigável, o acesso é gratuito.

A PubMed é uma base de dados de elevada qualidade, com conteúdos controlados, tem um produtor que é fiável, possui um interface amigável, o acesso é gratuito.

1.2 Google VS PubMed O google não possui controlo sobre os conteúdos da World Wide Web, nem há intervenção humana de selecção baseada na qualidade dos conteúdos; No extremo oposto, os conteúdos da PubMed são controlados e organizados por especialistas, que lêem, classificam e descrevem cada um dos registos, de forma a tornar mais fácil e eficiente a sualocalização.

O google não possui controlo sobre os conteúdos da World Wide Web, nem há intervenção humana de selecção baseada na qualidade dos conteúdos;

No extremo oposto, os conteúdos da PubMed são controlados e organizados por especialistas, que lêem, classificam e descrevem cada um dos registos, de forma a tornar mais fácil e eficiente a sualocalização.

1.2 Google VS PubMed

1.3 Pesquisa simples na PubMed No formulário de pesquisa, escrevemos a palavra cuja a ocorrência pretendemos procurar e clicamos no botão “Go”.

No formulário de pesquisa, escrevemos a palavra cuja a ocorrência pretendemos procurar e clicamos no botão “Go”.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Abre-se uma janela com os resultados da pesquisa que acabamos de efectuar; Os registos surgem em formato resumido: autores, título, fonte.

Abre-se uma janela com os resultados da pesquisa que acabamos de efectuar;

Os registos surgem em formato resumido: autores, título, fonte.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Para vermos mais informação sobre um registo, clicamos sobre o título do artigo.

Para vermos mais informação sobre um registo, clicamos sobre o título do artigo.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Temos agora o registo num formato mais detalhado. Resumo; Afiliação.

Temos agora o registo num formato mais detalhado.

Resumo;

Afiliação.

1.3 Pesquisa simples na PubMed No formulário de pesquisa, escrevemos a palavra cuja a ocorrência pretendemos procurar e clicamos no botão “Go”.

No formulário de pesquisa, escrevemos a palavra cuja a ocorrência pretendemos procurar e clicamos no botão “Go”.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Esta janela dá-nos várias informações: O número de registos que correspondem à pesquisa (neste caso, 204 registos); O número de registos mostrados por página (neste caso, 20 registos).

Esta janela dá-nos várias informações:

O número de registos que correspondem à pesquisa (neste caso, 204 registos);

O número de registos mostrados por página (neste caso, 20 registos).

1.3 Pesquisa simples na PubMed Alterar o número de registos por página Navegar para os registos nas páginas seguintes

1.3 Pesquisa simples na PubMed Por omissão, os registos surgem por ordem cronológica inversa, de acordo com a data de introdução na base de dados, isto é, os mais recentes no início. Podemos alterar a ordem de apresentação

Por omissão, os registos surgem por ordem cronológica inversa, de acordo com a data de introdução na base de dados, isto é, os mais recentes no início.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Há vários outros formatos para visualização de registos, a que podemos aceder a partir da caixa “Display”.

Há vários outros formatos para visualização de registos, a que podemos aceder a partir da caixa “Display”.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Importa destacar dois formatos: o formato “Citation” e o formato “Medline”.

Importa destacar dois formatos: o formato “Citation” e o formato “Medline”.

1.3 Pesquisa simples na PubMed O formato “Citation” contém, além dos dados já presentes no formato “Abstract”, também os termos de indexação escolhidos para representar os assuntos do documento.

O formato “Citation” contém, além dos dados já presentes no formato “Abstract”, também os termos de indexação escolhidos para representar os assuntos do documento.

1.3 Pesquisa simples na PubMed O formato “Medline” é o formato completo do registo, onde é possível visualizar todos os campos que o constituem.

O formato “Medline” é o formato completo do registo, onde é possível visualizar todos os campos que o constituem.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Para além de visualizar os registos no ecrã, podemos também: visualizá-los sem imagens; guardá-los num ficheiro de texto; imprimi-los; enviá-los para o clipboard ; adicioná-los a uma colecção; enviá-los por email ; criar um RSS feed ; encomendar artigos.

Para além de visualizar os registos no ecrã, podemos também:

visualizá-los sem imagens;

guardá-los num ficheiro de texto;

imprimi-los;

enviá-los para o clipboard ;

adicioná-los a uma colecção;

enviá-los por email ;

criar um RSS feed ;

encomendar artigos.

1.3 Pesquisa simples na PubMed

1.3 Pesquisa simples na PubMed Enviar registos para o clipboard: À medida que vamos fazendo pesquisas e vendo registos, podemos querer assinalá-los e guardá-los numa pesquisa temporária (clipboard).

Enviar registos para o clipboard:

À medida que vamos fazendo pesquisas e vendo registos, podemos querer assinalá-los e guardá-los numa pesquisa temporária (clipboard).

1.3 Pesquisa simples na PubMed Devemos começar por marcar cada um dos registos que pretendemos guardar, colocando um visto do lado esquerdo do título.

Devemos começar por marcar cada um dos registos que pretendemos guardar, colocando um visto do lado esquerdo do título.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Em seguida, na caixa “Send to”, seleccionamos a opção “Clipboard”.

Em seguida, na caixa “Send to”, seleccionamos a opção “Clipboard”.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Somos avisados de que os registos foram adicionados ao clipboard.

Somos avisados de que os registos foram adicionados ao clipboard.

1.3 Pesquisa simples na PubMed O clipboard apenas mantém os registos durante uma sessão de pesquisa, até um máximo de oito horas e apenas guarda até um máximo de 500 registos .

O clipboard apenas mantém os registos durante uma sessão de pesquisa, até um máximo de oito horas e apenas guarda até um máximo de 500 registos .

1.3 Pesquisa simples na PubMed Os registos adicionados ao clipboard passam a ser exibidos com os seus números de ordem a verde.

Os registos adicionados ao clipboard passam a ser exibidos com os seus números de ordem a verde.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Para ver os registos que temos no clipboard , vamos ao separador “Clipboard”, logo abaixo da caixa de pesquisa.

Para ver os registos que temos no clipboard , vamos ao separador “Clipboard”, logo abaixo da caixa de pesquisa.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Abre-se uma nova página, apenas com os registos guardados.

Abre-se uma nova página, apenas com os registos guardados.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Enviar registos para uma colecção : À medida que vamos efectuando pesquisas e vendo registos, podemos querer marcá-los numa colecção; Esta é uma forma duradoura de guardar registos, contrariamente a apenas enviá-los temporariamente para o clipboard.

Enviar registos para uma colecção :

À medida que vamos efectuando pesquisas e vendo registos, podemos querer marcá-los numa colecção;

Esta é uma forma duradoura de guardar registos, contrariamente a apenas enviá-los temporariamente para o clipboard.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Marcamos os registos que pretendemos guardar e, na caixa “Send to” seleccionamos a opção “Collections”.

Marcamos os registos que pretendemos guardar e, na caixa “Send to” seleccionamos a opção “Collections”.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Notemos que esta função só fica activa se tivermos uma conta MyNCBI.

Notemos que esta função só fica activa se tivermos uma conta MyNCBI.

1.3 Pesquisa simples na PubMed A PubMed não é uma base de dados de texto integral, contudo muitas vezes tem o link para os artigos. Alguns que conseguimos obter porque: são gratuitos; outros porque são assinados pela Faculdade. E a outros não conseguimos aceder.

A PubMed não é uma base de dados de texto integral, contudo muitas vezes tem o link para os artigos.

Alguns que conseguimos obter porque:

são gratuitos;

outros porque são assinados pela Faculdade.

E a outros não conseguimos aceder.

1.3 Pesquisa simples na PubMed Artigos em livre acesso.

Artigos em livre acesso.

1.3 Pesquisa simples na PubMed É muito frequente a informação sobre a disponibilidade do texto integral estar errada ou desactualizada na PubMed: Falta de link para a versão electrónica do documento; Falta de link para a versão electrónica gratuita; Links errados ou desactualizados.

É muito frequente a informação sobre a disponibilidade do texto integral estar errada ou desactualizada na PubMed:

Falta de link para a versão electrónica do documento;

Falta de link para a versão electrónica gratuita;

Links errados ou desactualizados.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Por vezes, o conceito que queremos pesquisar é expresso por mais do que uma palavra: Acute mountain sickness; Health planning.

Por vezes, o conceito que queremos pesquisar é expresso por mais do que uma palavra:

Acute mountain sickness;

Health planning.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Podemos simplesmente colocar as palavras na caixa de pesquisa e clicar em “Go”.

Podemos simplesmente colocar as palavras na caixa de pesquisa e clicar em “Go”.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Recebemos a resposta de que há 999 artigos na PubMed que correspondem à nossa pesquisa.

Recebemos a resposta de que há 999 artigos na PubMed que correspondem à nossa pesquisa.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Há, porém, aqui uma margem de erro; Ao pesquisar acute mountain sickness, o sistema procura todas as ocorrências de acute, mountain e de sickness, em qualquer ponto do registo, mesmo que surjam separadas.

Há, porém, aqui uma margem de erro;

Ao pesquisar acute mountain sickness, o sistema procura todas as ocorrências de acute, mountain e de sickness, em qualquer ponto do registo, mesmo que surjam separadas.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Para pesquisar a expressão acute mountain sickness, esta deve ser colocada entre aspas.

Para pesquisar a expressão acute mountain sickness, esta deve ser colocada entre aspas.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Deste modo, já só aparecem 708 registos (eliminados quase 200 não pertinentes).

Deste modo, já só aparecem 708 registos (eliminados quase 200 não pertinentes).

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Por vezes, queremos pesquisar temas que necessitam de alguma complexidade: Tuberculose em Portugal; Gravidez na adolescência; Diabetes em crianças.

Por vezes, queremos pesquisar temas que necessitam de alguma complexidade:

Tuberculose em Portugal;

Gravidez na adolescência;

Diabetes em crianças.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Os operadores booleanos AND, OR e NOT podem ser usados para combinar termos de pesquisa na PubMed, para estas pesquisas mais complexas.

Os operadores booleanos AND, OR e NOT podem ser usados para combinar termos de pesquisa na PubMed, para estas pesquisas mais complexas.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos O operador AND Assim, usaremos: Tuberculosis AND Portugal; Pregnancy AND adolescents; Diabetes AND children.

O operador AND

Assim, usaremos:

Tuberculosis AND Portugal;

Pregnancy AND adolescents;

Diabetes AND children.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos O operador AND Ao pesquisar tuberculosis AND Portugal, eis o que acontece: O operador AND faz a intersecção entre os conjuntos: devolve todos os registos que contêm ambos os termos, independentemente da sua proximidade ou adjacência.

O operador AND

Ao pesquisar tuberculosis AND Portugal, eis o que acontece:

O operador AND faz a intersecção entre os conjuntos: devolve todos os registos que contêm ambos os termos, independentemente da sua proximidade ou adjacência.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos O operador OR Por vezes, interessa-nos obter informação sobre qualquer um de dois termos; O operador OR faz a união entre os conjuntos, devolve todos os registos que contêm pelo menos um dos termos da pesquisa; Ex. Portugal OR Spain.

O operador OR

Por vezes, interessa-nos obter informação sobre qualquer um de dois termos;

O operador OR faz a união entre os conjuntos, devolve todos os registos que contêm pelo menos um dos termos da pesquisa;

Ex. Portugal OR Spain.

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos O operador OR Outras vezes, o mesmo conceito que pretendemos pesquisar pode estar expresso nos documentos por diferentes palavras. Ex. Therapy OR Therapeutics OR Treatment

O operador OR

Outras vezes, o mesmo conceito que pretendemos pesquisar pode estar expresso nos documentos por diferentes palavras.

Ex. Therapy OR Therapeutics OR Treatment

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos O operador NOT O operador NOT usa-se para fazer a exclusão de um termo na pesquisa, não recuperando os registos que contêm esse termo. Ex.Manchester NOT United

O operador NOT

O operador NOT usa-se para fazer a exclusão de um termo na pesquisa, não recuperando os registos que contêm esse termo.

Ex.Manchester NOT United

1.4 Pesquisa com vários termos e uso de operadores booleanos Outros operadores: a truncatura Se colocarmos um asterisco no final do termo de pesquisa, serão recuperados todos os registos que contêm palavras começadas por esses caracteres. Child* recupera: Child; Children; Childhood; ………

Outros operadores: a truncatura

Se colocarmos um asterisco no final do termo de pesquisa, serão recuperados todos os registos que contêm palavras começadas por esses caracteres.

Child* recupera:

Child;

Children;

Childhood;

………

1.4 Estabelecimento de limites à pesquisa Há vários limites à pesquisa que podem ser efectuados: Por data de publicação; Por data de entrada na base de dados; Por tipo de documento; Por grupo etário; Por género (masculino/feminino); Por idioma; Por campo da base de dados; etc.…

Há vários limites à pesquisa que podem ser efectuados:

Por data de publicação;

Por data de entrada na base de dados;

Por tipo de documento;

Por grupo etário;

Por género (masculino/feminino);

Por idioma;

Por campo da base de dados;

etc.…

1.5 Pesquisa por Thesaurus (MeSH Database) Chama-se MeSH (Medical Subject Headings) ao vocabulário controlado que é utilizado para indexar os artigos; A terminologia MeSH fornece um modo consistente de recuperar informação sempre que diferentes termos são usados para o mesmo conceito.

Chama-se MeSH (Medical Subject Headings) ao vocabulário controlado que é utilizado para indexar os artigos;

A terminologia MeSH fornece um modo consistente de recuperar informação sempre que diferentes termos são usados para o mesmo conceito.

1.6 Registo no MyNCBI O MyNCBI é uma área central onde se podem personalizar os serviços da NCBI; Devemos criar uma conta pessoal, que nos permitirá: Guardar pesquisas; Criar alertas para novo conteúdo; … Fonte: Dr. Manuel Montenegro, Biblioteca Virtual da Universidade do Porto

O MyNCBI é uma área central onde se podem personalizar os serviços da NCBI;

Devemos criar uma conta pessoal, que nos permitirá:

Guardar pesquisas;

Criar alertas para novo conteúdo;

…