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Laura Montoya Trejos
Felipe Hernández Restrepo
Teacher Lina Martínez
Medicine Faculty
III Semester
STAPHYLOCOCCUS
Are
microorganisms
that are present
in the mucous
and skin of
humans which
includes 35
species and 17
subspecies.

Grow easily on most
bacteriological
media, crop growth
is better in the
middle mannitol salt
and blood agar
STAPHYLOCOCCUS AUREUS

Is resistant to penicillin, and this
has become a major challenge for
the medical community.
 Staphylococcus aureus can kill
heart failure due to endocarditis
MICROBIOTA
It can be defined as microorganisms
that are often found in various parts
of the body, associated with normal
tissues skin and mucosa of the
human body in healthy individuals

These help in the digestion of food,
produce vitamins and protect against
colonization by other microorganisms
which may be pathogenic
ELECTROPHORESIS

Is called electrophoresis technique whereby the biomolecules in solution
are separated when they are subjected to an electric field.
The separation is given by the electric charge and the molecular weight
PCR

The objetive of this
technique is the
amplification of genes
or DNA fragments or
indirectly through
RNA, present in
diverse mixtures of
different sourses
GENERAL OBJECTIVE
Theaim of thiswork was to
optimize the study of
Staphylococcus species
diversity in human breast
milk and neonate stool.
MATERIALES Y METODOS
CEPAS BACTERIANAS

Un total de 47 cepas de estafilococos se

incluyeron en el estudio

40 aislamientos de la Autoridad de salud
Fracesa

7 cepas tipo de Staphylococcus
obtenidos de la colección Checa de
Microorganismos.
MATERIALES Y METODOS
PACIENTES

2

1

El banco de leche materna
proporciona 22 alícuotas de
las muestras de leche
pasteurizada de diferentes
madres

Treinta muestras de heces fueron recolectadas
de 3 niños que habían sido admitidos en la
unidad de cuidado intensivo neonatal del
Hospital de la Universidad de Montpellier.
MATERIALES Y METODOS
EXTRACCION DEL DNA

• Se extrajo el ADN de las bacterias
aisladas de heces y muestras de
leche
• Se hicieron algunas modificaciones
en los protocolos publicados
previamente para optimizar la
extracción de ADN de las heces y
la leche
FUNDAMENTO DE LA
EXTRACCION DEL DNA
EXTRACCION DEL ADN
1. Lisis celular
2. Precipitación de proteínas
3. Precipitación de DNA
4. Almacenamiento

Precipitación del RNA
(RNAsa)
MATERIALES Y METODOS
PCR

FUNDAMENTO PCR
1. Desnaturalización del DNA para dar hebras sencillas
2. Hibridación especifica de la hebra sencilla con un
oligonucleotido
3. Replicación de la hebra sencilla por una DNA polimerasa a
partir del olignonucleotido anterior como cebador

Se realizo esto para amplificar el gen tuf, se hizo por medio de 3 pares de primers
MATERIALES Y METODOS
ELECTROFORESIS

Es unatécnica mediante la cual se
separan las biomoléculas en disolución
cuando se ven sometidas a un campo
eléctrico.

Electroforesis en gel de gradiente de
temperatura utiliza ya sea una
temperatura o gradiente químico
para desnaturalizar la muestra
cuando se mueve a través de un gel
para separar acidosnucleicos
MATERIALES Y METODOS
ELECTROFORESIS

En un gradiente con
temperatura las hebras de
ADN comenzaran a
separarse y la velocidad
con la que se mueven
comienza a disminuir

TGGE no sólo separa las
moléculas , pero da
información adicional
acerca de comportamiento
de fusión y la estabilidad

TGGE proporciona un
metodo secuencia
dependiente - tamaño
independiente, para
separar moléculas de ADN
.
MATERIALES Y METODOS
FRLP
Los RFLP son marcadores genéticos del
ADN y se pueden encontrar en regiones
que codifican proteínas o exones, en los
intrones o en el ADN que separa un gen
de otro.

La técnica RFLP se usa como marcador
para identificar grupos particulares de
personas con riesgo a contraer ciertas
enfermedades genéticas, en ciencia
forense, en pruebas de paternidad.
MATERIALES Y METODOS
SECUENCIACION

Es un conjunto de métodos
para la determinación del
orden de
los nucleótidos (A, C, G y T) en
un oligonucleótido de ADN.

Este método es útil en el estudio de
la investigación básica de los
procesos biológicos fundamentales, y
en la ciencia forense.
El ADN de un
individuo se
extrae y se
purifica.

El ADN
purificado
puede ser
amplificado
usando la
PCR

Las enzimas
reconocen
secuencias cortas
específicas en el
ADN donde cortan
formando
fragmentos de
distintas
longitudes.

luego tratado con
enzimas de
restricción
específicas para
producir
fragmentos de ADN
de diferentes
longitudes.

Los
fragmentos
de restricción
se separan
mediante elec
troforesis

Esto proporciona
un patrón de
bandas que es
único para un
ADN en
particular
RESULTADOS
•De las 18 solo se discriminaron 15 bandas.
Se discriminaron con RFLP:
•S. Haemolyticus (182 y 139pb) - S. Scheiferi (no)
(Bmpl)
•S. Cohnni (160 y 161pb) – S. Capitis (no) (Folk)
•S. Caprae (140, 114, 53,13pb) – S. Lugdunensis
(140 y 180pb) (Acul)
DISCUSSION
AUTHOR

WHAT HE SAID

YES/NO

Ghebremedhin, B

16SrRNA
gene
isinsufficienttoidentifyStaph
ylococcusspecies
and
providesidentificationonlytot
hegenuslevelorfor
a
groupofspecies in thegenus.

YES

Dahllöf, Drancourt and
Raoult

TherpoB
gene,
proposedforcommunityanal
yses,
has
classicallybeenusedfortheid
entificationofstaphylococcib
ecauseitis
more
discriminativethenthe 16S
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gene
amongstaphylococci.

NO
1. Thisresearchshowedthatifallthehospitals in
theworldmakethisexamtoalloftheneonates,
wecouldpreventthepropagationoftheagent.
2. Thetuf-PCR TTGE examisveryeffective and fasterthanthe culture,
whichfacilitatestheattention in thehospitals.
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Seminario Biología Molecular

  • 1. Laura Montoya Trejos Felipe Hernández Restrepo Teacher Lina Martínez Medicine Faculty III Semester
  • 2. STAPHYLOCOCCUS Are microorganisms that are present in the mucous and skin of humans which includes 35 species and 17 subspecies. Grow easily on most bacteriological media, crop growth is better in the middle mannitol salt and blood agar
  • 3. STAPHYLOCOCCUS AUREUS Is resistant to penicillin, and this has become a major challenge for the medical community.  Staphylococcus aureus can kill heart failure due to endocarditis
  • 4. MICROBIOTA It can be defined as microorganisms that are often found in various parts of the body, associated with normal tissues skin and mucosa of the human body in healthy individuals These help in the digestion of food, produce vitamins and protect against colonization by other microorganisms which may be pathogenic
  • 5. ELECTROPHORESIS Is called electrophoresis technique whereby the biomolecules in solution are separated when they are subjected to an electric field. The separation is given by the electric charge and the molecular weight
  • 6. PCR The objetive of this technique is the amplification of genes or DNA fragments or indirectly through RNA, present in diverse mixtures of different sourses
  • 7. GENERAL OBJECTIVE Theaim of thiswork was to optimize the study of Staphylococcus species diversity in human breast milk and neonate stool.
  • 8. MATERIALES Y METODOS CEPAS BACTERIANAS Un total de 47 cepas de estafilococos se incluyeron en el estudio 40 aislamientos de la Autoridad de salud Fracesa 7 cepas tipo de Staphylococcus obtenidos de la colección Checa de Microorganismos.
  • 9. MATERIALES Y METODOS PACIENTES 2 1 El banco de leche materna proporciona 22 alícuotas de las muestras de leche pasteurizada de diferentes madres Treinta muestras de heces fueron recolectadas de 3 niños que habían sido admitidos en la unidad de cuidado intensivo neonatal del Hospital de la Universidad de Montpellier.
  • 10. MATERIALES Y METODOS EXTRACCION DEL DNA • Se extrajo el ADN de las bacterias aisladas de heces y muestras de leche • Se hicieron algunas modificaciones en los protocolos publicados previamente para optimizar la extracción de ADN de las heces y la leche
  • 11. FUNDAMENTO DE LA EXTRACCION DEL DNA EXTRACCION DEL ADN 1. Lisis celular 2. Precipitación de proteínas 3. Precipitación de DNA 4. Almacenamiento Precipitación del RNA (RNAsa)
  • 12. MATERIALES Y METODOS PCR FUNDAMENTO PCR 1. Desnaturalización del DNA para dar hebras sencillas 2. Hibridación especifica de la hebra sencilla con un oligonucleotido 3. Replicación de la hebra sencilla por una DNA polimerasa a partir del olignonucleotido anterior como cebador Se realizo esto para amplificar el gen tuf, se hizo por medio de 3 pares de primers
  • 13. MATERIALES Y METODOS ELECTROFORESIS Es unatécnica mediante la cual se separan las biomoléculas en disolución cuando se ven sometidas a un campo eléctrico. Electroforesis en gel de gradiente de temperatura utiliza ya sea una temperatura o gradiente químico para desnaturalizar la muestra cuando se mueve a través de un gel para separar acidosnucleicos
  • 14. MATERIALES Y METODOS ELECTROFORESIS En un gradiente con temperatura las hebras de ADN comenzaran a separarse y la velocidad con la que se mueven comienza a disminuir TGGE no sólo separa las moléculas , pero da información adicional acerca de comportamiento de fusión y la estabilidad TGGE proporciona un metodo secuencia dependiente - tamaño independiente, para separar moléculas de ADN .
  • 15. MATERIALES Y METODOS FRLP Los RFLP son marcadores genéticos del ADN y se pueden encontrar en regiones que codifican proteínas o exones, en los intrones o en el ADN que separa un gen de otro. La técnica RFLP se usa como marcador para identificar grupos particulares de personas con riesgo a contraer ciertas enfermedades genéticas, en ciencia forense, en pruebas de paternidad.
  • 16. MATERIALES Y METODOS SECUENCIACION Es un conjunto de métodos para la determinación del orden de los nucleótidos (A, C, G y T) en un oligonucleótido de ADN. Este método es útil en el estudio de la investigación básica de los procesos biológicos fundamentales, y en la ciencia forense.
  • 17. El ADN de un individuo se extrae y se purifica. El ADN purificado puede ser amplificado usando la PCR Las enzimas reconocen secuencias cortas específicas en el ADN donde cortan formando fragmentos de distintas longitudes. luego tratado con enzimas de restricción específicas para producir fragmentos de ADN de diferentes longitudes. Los fragmentos de restricción se separan mediante elec troforesis Esto proporciona un patrón de bandas que es único para un ADN en particular
  • 19.
  • 20. •De las 18 solo se discriminaron 15 bandas. Se discriminaron con RFLP: •S. Haemolyticus (182 y 139pb) - S. Scheiferi (no) (Bmpl) •S. Cohnni (160 y 161pb) – S. Capitis (no) (Folk) •S. Caprae (140, 114, 53,13pb) – S. Lugdunensis (140 y 180pb) (Acul)
  • 21.
  • 23. AUTHOR WHAT HE SAID YES/NO Ghebremedhin, B 16SrRNA gene isinsufficienttoidentifyStaph ylococcusspecies and providesidentificationonlytot hegenuslevelorfor a groupofspecies in thegenus. YES Dahllöf, Drancourt and Raoult TherpoB gene, proposedforcommunityanal yses, has classicallybeenusedfortheid entificationofstaphylococcib ecauseitis more discriminativethenthe 16S rRNA gene amongstaphylococci. NO
  • 24. 1. Thisresearchshowedthatifallthehospitals in theworldmakethisexamtoalloftheneonates, wecouldpreventthepropagationoftheagent. 2. Thetuf-PCR TTGE examisveryeffective and fasterthanthe culture, whichfacilitatestheattention in thehospitals. 3. However culture itsveryimportantbecauseitallowedustoiddentificateotherspeciesthatthe PCR didnotiddentificate. 4. The diagnosis isveryimportantbecauseitcouldsavethebaby’slife and makehimnottosuffertheconsequensesofhavingtheagentinsideofhim.
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