Rech doc msa 2009
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    Rech doc msa 2009 Rech doc msa 2009 Presentation Transcript

    • La recherche documentaire en médecine sur l’Internet Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6mai 2010 Seattle Library par fimoculous Licence CC - Paternité http://www.flickr.com/photos/fimoculous/54700092/
    • Programme de la formation Les moteurs de recherche – Google Langage, syntaxe, ressources. Exercices avec Google. Google Scholar : caractéristiques et exercices. Les répertoires médicaux – CISMeF Langage, syntaxe, ressources. Exercices avec le module Terminologie. Exercices avec le module de recherche avancée. MEDLINE/PubMed MEDLINE (banque de données) et PubMed (interface). Le langage MeSH – L’affiliation descripteur/qualificatif. Les champs – l’explosion – la pondération. La formulation des débutants (Limits) La formulation des experts (« linéaire ») Les filtres – le coffre-fort My NCBI Les utilitaires Les sites Internet « utiles » et « accessibles »
    • Google et Google Scholar Einstein Google Logo AT Google Kirkland par dannysullivan Licence CC - Paternité http://www.flickr.com/photos/dannysullivan/272645770/
    • Le langage des moteurs de recherche (et de Google) est le langage courant = votre langage Learning sign Language par daveynin LicenceCC - Paternité http://www.flickr.com/photos/daveynin/4469841629/
    • Les moteurs de recherche – Google – le langage Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Dans Google, comparer les réponses obtenues dans la première page de résultat avec les requêtes : Polyarthrite chronique évolutive Polyarthrite rhumatoïde Exercice
    • Les moteurs de recherche – Google – le langage Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Commentaires Chacune des 2 requêtes affiche des notices différentes. Un outil de recherche comme Google ne prend pas en compte les synonymies, mais uniquement une chaîne de caractères (y compris les fautes d’orthographe et les erreurs de saisie).
    • La syntaxe est élémentaire +++ et se résume à :  mettre des guillemets pour les mots composés  remplacer l’opérateur AND par un espace How to write Chinese Characters & Pinyin par Ivan Walsh Licence CC - Paternité http://www.flickr.com/photos/ivanwalsh/4185632019/
    • Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Exemples Réanimation « arrêt cardiaque » Recommandations « traitement de l’hépatite C » « Diagnostic clinique » appendicite « Hémorragie méningée » « examen TDM »
    • Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe – exemple Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Rechercher des documents sur le traitement de l’insuffisance cardiaque par les bêta-bloquants Exercice
    • Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe – exemple Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010
      • Commentaire
      • Vous obtenez un résultat différent si :
      • les guillemets de sont pas mis en place ;
      • bêta-bloquant est au singulier ou au pluriel
      Bêta-bloquants « insuffisance cardiaque »
    • Documents de la Toile et articles de la presse CIMG2977 par David Boyle Licence CC – Paternité http://www.flickr.com/photos/beglen/151943525 /
    • Analyser la première page de résultat de la requête bêta-bloquants « insuffisance cardiaque ». Distinguer parmi les résultats les documents et les articles . Les moteurs de recherche – Google – les ressources Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Exercice
    • Les moteurs de recherche – Google – les ressources Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Commentaire Google recense principalement des documents de la Toile et plus rarement des articles de la presse médicale. Ces derniers sont plus volontiers hébergés dans les banques de données bibliographiques type Google Scholar ou MEDLINE.
    • Les moteurs de recherche – Google – exercices Rechercher des documents sur le traitement chirurgical du syndrome du canal carpien. Exercice Philippe Eveillard INMA Tours 5 et 6 mai 2010
    • Les moteurs de recherche – Google – exercices Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Commentaires Les résultats diffèrent selon la formulation de la requête : « traitement chirurgical » « syndrome du canal carpien » « traitement chirurgical du syndrome du canal carpien » « traitement chirurgical » « canal carpien » Chirurgie « canal carpien » « chirurgie du canal carpien »
    • Exercice Rechercher des documents sur l’inertie clinique dans la prise en charge du diabète de type 2
    • Les moteurs de recherche – Google – exercices Philippe Eveillard INMA Tours 5 et 6 mai 2010 Commentaires L’interrogation de Google sur un thème médical est d’autant plus performante et adéquate qu’elle est faite dans un langage médical. « inertie clinique » « diabète de type 2 »
    • Exercice Rechercher des documents sur les types d’organisation des soins primaires
    • Les moteurs de recherche – Google – exercices Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Commentaires Dans Google, les requêtes médico-administratives ou médico-économiques obtiennent plus souvent des réponses satisfaisantes que les requêtes spécifiquement médicales « types d’organisation » « soins primaires »
    • Les moteurs de recherche – Google Scholar – définition Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Google Scholar est l’interface de recherche d’une banque de données bibliographiques dont le « fonds » reste indéfini. Documents +++ Articles+ Google Articles+++ Livres + Google Scholar
    • Les moteurs de recherche – Google Scholar – utile ? Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Utile ? OUI, sous réserve :  de l’utiliser comme un « coup de sonde » sur un thème  de sélectionner les articles récents. En termes de « précision de la requête », Google Scholar est nettement moins performant que MEDLINE (PubMed)
    •  
    • Comparer les résultats obtenus en interrogeant CISMeF avec : PR , Polyarthrite rhumatoïde , Polyarthrite chronique évolutive Sign Language par Alex E. Proimos Licence CC – Paternité http://www.flickr.com/photos/proimos/4234921250/
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Langage de CISMeF = langage MeSH Polyarthrite rhumatoïde est un mot clé ( descripteur ) du langage MeSH (en version française). Il a pour synonyme PR et polyarthrite rhumatoïde. Une requête dans CISMeF donne sensiblement les mêmes résultats quand un descripteur ou ses synonymes sont utilisés.
      • Les termes (descripteurs) du langage MeSH appartiennent à un thésaurus dont les particularités sont
      • d’avoir une structure arborescente (les termes ont entre eux des relations hiérarchiques)
      • de rassembler des termes non ambigus (un descripteur = un concept et un seul)
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 La structure arborescente du MeSH
      • Dans le module terminologie de CISMeF : - entrer « asthme » dans la fenêtre recherche
      • cliquer sur OK
      • sélectionner l’onglet « navigation », ce qui affiche le descripteur asthme dans son arborescence.
      « asthme » dans la fenêtre « recherche » L’arborescence du descripteur avec ses relations hiérarchiques (de niveau supérieur et de niveau inférieur)
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 La traduction du langage courant en langage MeSH (VF) 1. Entrer le mot clé « décomposé » (bloquant pour bêta bloquant) dans la fenêtre 2. Ne pas cocher la case « sans troncature 3. Sélectionner le « bon » descripteur dans le cadre « réponse » Confirmation de la sélection
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage - exercices Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Exercices de traduction langage courant – langage MeSH (VF)
      • Traduire :
      • embolie pulmonaire
      • maladie de Kahler
      • ostéochondrite de hanche
      • vitesse de sédimentation
      • anti-TNF alpha
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage - exercices Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Corrigé des exercices de traduction langage courant – langage MeSH (VF)
      • embolie pulmonaire  embolie  embolie pulmonaire
      • maladie de Kahler  Kahler  myélome multiple
      • ostéochondrite de hanche  ostéochondrite  maladie de Legg-Calvé-Perthes
      • vitesse de sédimentation  sédimentation  vitesse sédimentation globulaire
      • anti-TNF alpha  TNF-alpha  Facteur de nécrose tumorale-alpha (pour « anti », ajouter un qualificatif… voir plus loin )
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 L’affiliation descripteur/qualificatif +++ Des qualificatifs peuvent s’affilier ( se marier ) aux descripteurs si (et seulement si) ils ont entre eux des «  affinités*  ». Qualificatif = terme qui précise le sens d’un descripteur. MeSH 2010 : 83 qualificatifs Exemples : Asthme/diagnostic Arthrose/complications Analgésiques/effets indésirables * Affinités Certains qualificatifs s’affilient : - aux maladies, - d’autres aux médicaments, - d’autres encore aux investigations diagnostiques ou aux protocoles thérapeutiques…
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 L’affiliation descripteur/qualificatif +++ Exemple : épidémiologie de la polyarthrite rhumatoïde 1. Entrée de polyarthrite dans la fenêtre 2. Sélection de polyarthrite rhumatoïde dans le cadre de réponse 3. Sélection de épidémiologie dans la page « accès aux ressources »
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation - exercices Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Exercices sur l’affiliation descripteur/qualificatif
      • Traduire en affiliation descripteur/qualificatif :
      • les complications de la sarcoïdose
      • la chirurgie du cancer du pancréas
      • le régime de la maladie de Crohn
      • les indications des bêta-bloquants
      • le diagnostic de l’asthme d’effort
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation - exercices Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Corrigé des exercices sur l’affiliation descripteur/qualificatif
      • les complications de la sarcoïdose  sarcoïdose  sarcoïdose  sarcoïdose/complications
      • la chirurgie du cancer du pancréas  pancréas  tumeurs du pancréas  tumeurs du pancréas/chirurgie
      • le régime de la maladie de Crohn  Crohn  maladie de Crohn  maladie de Crohn/diétothérapie
      • les indications des bêta-bloquants  bloquant  antagonistes beta-adrénergiques  antagonistes beta-adrénergiques/usage thérapeutique
      • le diagnostic de l’asthme d’effort  effort  asthme à l’effort  asthme à l’effort/diagnostic
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010  Simple si réduite à une affiliation descripteur/qualificatif : recours au module Terminologie exemples : complications de l’hépatite C ; contre-indications des anti-émétiques…  Plus complexe si l’équation comporte plusieurs membres : recours au module de recherche avancée exemples : traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguë ; indications des IEC dans l’hypertension… La requête dans CISMeF
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Le débit expiratoire de pointe dans le diagnostic de l’asthme de l’enfant La recherche se fait dans le module de recherche avancée
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Exercices sur les requêtes dans CISMeF
      • Rechercher :
      • les recommandations sur le traitement de la maladie de Parkinson
      • les causes rénales de l’hypertension artérielle
      • le traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguë
      • les effets secondaires des antiviraux dans le traitement de l’hépatite C
      • les aides financières pour les personnes handicapées
    • Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire Philippe Eveillard INMA - Tours 5 et 6 mai 2010 Corrigé des exercices sur les requêtes dans CISMeF
      • les recommandations sur le traitement de la maladie de Parkinson maladie de Parkinson – thérapie – recommandation pour la pratique clinique
      • les causes rénales de l’hypertension artérielle maladies du rein – étiologie - hypertension
      • le traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguë
      • otite moyenne suppurée – traitement médicamenteux - antibactériens
      • les effets secondaires des antiviraux dans le traitement de l’hépatite B
      • antiviraux – effets indésirables – hépatite B
      • Les aides financières pour les personnes handicapées aide financière – personnes handicapées
    • Utilité et « usability » Dusan ‘s User Interface Challenge par moggs oceanlane Licence CC – Paternité http://www.flickr.com/photos/moggsoceanlane/3008417302/
    • Usability– Administratif Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010 Recherche de la loi du mars 2002 relative aux droits des malades Les autres textes législatifs et réglementaires http://www.legifrance.gouv.fr/initRechTexte.do
    • Usability– Administratif Formulaires http://www.service-public.fr/formulaires/index.html Demande d'autorisation d'un traitement de recherche dans le domaine de la santé
    • Usability– Administratif Philippe Eveillard MSA 12 et 13 mai 2009 Rapports publics http://www.ladocumentationfrancaise.fr/rapports/index.shtml Recherche du rapport Legmann sur la médecine libérale. Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010
    • Usability– Administratif Philippe Eveillard MSA 12 et 13 mai 2009 Afficher la dernière circulaire en date Santé-solidarité http://www.circulaires.gouv.fr/index.php?action=rechercher&domaine=Santé,%20solidarité Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010
    • Usability– Administratif Philippe Eveillard MSA 12 et 13 mai 2009 Recherche d’un établissement pour personnes âgées dépendantes dans la région d’Egletons (Corrèze) Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010 Espace professionnels http://www.sanitaire-social.com/rech_pro_001.php
    • Usability– Médecine du travail Philippe Eveillard MSA 12 et 13 mai 2009 Recherche des maladies professionnelles dans le régime agricole pouvant être à l’origine d’une neuropathie périphérique. Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010 CRAMIF – site maladies professionnelles http://maladies-professionnelles.cramif.fr/maladies-professionnelles-reperer.php
    • Usability– Médecine du travail Philippe Eveillard MSA 12 et 13 mai 2009 Afficher la fiche du métier de bûcheron Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010 Fiches de métiers http://www.bossons-fute.fr/index.php?option=com_content&view=category&id=2&Itemid=3
    • Usability– Médecine du travail Philippe Eveillard MSA 12 et 13 mai 2009 Afficher la fiche « espaces verts » Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010 Métiers et activités http://www.travailler-mieux.gouv.fr/-Metiers-et-Activites-.html
    • Usability– Médecine Philippe Eveillard MSA 12 et 13 mai 2009 Afficher la fiche de la paraparésie spastique familiale Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010 Liste alphabétique des maladies rares http://www.orpha.net/consor/cgi-bin/Disease_Search_List.php?lng=FR
    • Usability– Médecine Philippe Eveillard MSA 12 et 13 mai 2009 Recherche des recommandations pour la pratique relatives à la toux prolongée de l’enfant Philippe Eveillard INMA – Tours 5 et 6 mai 2010 DReFC http://drefc.sfmg.org/