Introduction to PANGAEA & EURO-BASIN Data Management, by Janine Felden
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×

Like this? Share it with your network

Share

Introduction to PANGAEA & EURO-BASIN Data Management, by Janine Felden

  • 804 views
Uploaded on

Key lecture for the EURO-BASIN Training Workshop on Introduction to Statistical Modelling for Habitat Model Development, 26-28 Oct, AZTI-Tecnalia, Pasaia, Spain (www.euro-basin.eu)

Key lecture for the EURO-BASIN Training Workshop on Introduction to Statistical Modelling for Habitat Model Development, 26-28 Oct, AZTI-Tecnalia, Pasaia, Spain (www.euro-basin.eu)

More in: Education , Technology
  • Full Name Full Name Comment goes here.
    Are you sure you want to
    Your message goes here
    Be the first to comment
No Downloads

Views

Total Views
804
On Slideshare
804
From Embeds
0
Number of Embeds
0

Actions

Shares
Downloads
3
Comments
0
Likes
1

Embeds 0

No embeds

Report content

Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
    No notes for slide

Transcript

  • 1. Data Management and Integration  within EUROBASIN Janine Felden & Stéphane Pesant Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 2. Who I am.......• Master Marine Microbiology • PhD: quantification benthic biogeochemical processes and in situ  flux measurements in cold seep ecosystems (chemosynthetic  environments) • PostDoc:  – data manager in the EU Project HERMIONE (Hotspot Ecosystem Research and Mans  Impact On European Seas) & benthic activity of arctic deep sea sediment• NOW: data curator in EUROBASIN (WP1)  – to support project partners during data submission and mining to and  from PANGAEA  © MARUM, Bremen Data Management & Integration – Janine Felden © MARUM, Bremen © MARUM, Bremen Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011 © MARUM, Bremen
  • 3. EUROBASIN WP 1  Objectives:• Develop methods to consolidate and integrate long‐term  observations from European and international databases• Assemble historical data, new field observations and experimental results into comprehensive datasets for modelling and prediction of the Atlantic Ocean ecosystem and related services. work with PANGAEA as database  Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 4. ©http://libraryjumpers.webs.com/ What is PANGAEA? (...is a data library for earth system research.) Rijksmuseum Research  Library, AmsterdamData are stored georeferenced in space and time in a relational database and a tape archive.The data content is accessible on the Internet via a search engine, a data warehouse and web services.The system is open to any scientist or project to archive and publish data. Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 5. Data submission viaOnline ticket system (JIRA Client): Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 6. Data Publication PANGAEA provide• free and Open Access or Restricted Access (password) to data,  according to data policy  Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 7. Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 8. Data PublicationData Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 9. Data Publication ‐ PANGAEA provide‐• free and Open Access or Restricted Access (password) to data,  according to data policy • free and Open Access to metadata• Persistent and web‐resolvable Digital Object Identifiers (DOI) Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 10. Data Publication ‐ DOI Model ‐• Each data point is fully citable with a persistent identifier (DOI)• Cross‐reference with journal articles• Pre‐publication, peer‐review process• Thomson Reuters and Elsevier will soon launch Data Citation  Impact Factors based on data DOI• Creative Commons Attribution license which requires that  datasets are cited when data are used & re‐used Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 11. Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 12. Data PublicationData Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 13. PANGAEA Data Mining• Google‐like & advanced metadata discovery (public) Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 14. PANGAEA SearchData Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 15. PANGAEA Data Mining• Google‐like & advanced metadata discovery (public)• Data Warehouse for mass extraction (EuroBASIN partners) Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 16. Data WarehouseData Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 17. Data WarehouseData Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 18. Data WarehouseData Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 19. Data WarehouseData Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 20. PANGAEA Data Mining• Google‐like & advanced metadata discovery (public)• Data Warehouse for mass extraction (EuroBASIN partners)• Web‐services linking data publications and journal  publications, e.g. Elsevier, Copernicus, AGU and Springer Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 21. Link to publisherData Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011
  • 22. Sum up• PANGAEA offers various tools and support for data submission  and data mining• PANGAEA data publications provide benefits for the authors  and scientific community  (e.g.DOI, permanent data storage) ! PANGAEA data quantity & quality depends on the  data that are provided by the scientist !Thus:• support the work of EUROBASIN WP1! • for any data work including worries and ideas contact us  (Stéphane Pesant (spesant@marum.de)  or me (jfelden@mpi‐bremen.de))  Data Management & Integration – Janine Felden Statistical  Modeling Workshop,  26. – 28.10.2011