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VPH: Genómica, proteómica y diagnóstico Erwin Chiquete Biología Molecular en Medicina Biología  Molecular  en  Medicina  • O.P.D. Hospital Civil de Guadalajara • C.U.C.S.
Objetivos ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Importancia En el mundo, hasta el  60 % de los adultos  puede presentar alguna de las formas de  infección por VPH . La infección por VPH es subclínica en la mayoría de los casos.
En E.U.A. el 75 % de las mujeres tiene infección genital por VPH. El  VPH  está asociado a  más del 95% de los casos de CACU  en el mundo. Importancia
El VPH pertenece a la familia de los  papovarirus , del género  papilomavirus . Los papilomavirus infectan a una gran variedad de especies de mamíferos incluyendo al hombre. El virus
El virus Origina distintas enfermedades en el humano, dependiendo del tipo de VPH, del tejido y del sistema inmune del hospedero.
El virus El VPH se clasifica en  genotipos , o simplemente tipos, según la secuencia de su material genético. A la fecha se han descrito  más de 100 genotipos , de los cuáles menos de la mitad son muy prevalentes.
El virus VPH Piel Mucosas Alto riesgo Bajo riesgo
El virus Alto riesgo :  16 ,  18 ,  31 ,  33 , 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59 y 68. Bajo riesgo : 6, 11, 42, 43 y 44.
El virus 6, 11 Verrugas laríngeas 16, 18, 31, 33, 35 Carcinoma cervical 5, 8 Epidermodisplasia verruciforme 6, 11, 16, 18, 31 Verrugas genitales 1, 2 , 4, 10 Verrugas cutáneas Genotipos más relacionados Enfermedad
Genómica  y  Proteómica
[object Object],[object Object],Virión: 55 nm El virus
El genoma del VPH Su genoma es  DNA de doble cadena  y  circular  con casi  8 000 nucleótidos . Codifica para 8 proteínas. Este DNA se hace lineal y se puede integrar al genoma humano.
El proteoma del VHC E6 E7 E1 L2 L1 E5 E2 E4 ORF 3 2 1 2 000 4 000 6 000 nt
El genoma del VPH Replicación Proteínas transformantes Replicación  y transcripción Proteína  secundaria  de la cápside Proteína  principal  de la cápside Región reguladora
El ciclo de vida del VPH El VPH es  epiteliotrópico  por naturaleza y su ciclo de vida está íntimamente relacionado a la diferenciación de las células escamosas. Su receptor en la célula hospedera es la proteína de adhesión llamada   -Integrina 6 .
Erwin El ciclo de vida del VPH 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ NH 2 COOH
El ciclo de vida del VPH El VPH  infecta a las capas celulares basales  del epitelio escamoso, no a las superficiales. Una vez que infecta a la célula hospedera, el VPH permanece con muy poca actividad, hasta llegar a las capas superficiales del epitelio (por proliferación celular), donde comienza su replicación activa.
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],El ciclo de vida del VPH
Una segunda forma de infección (llamada  no-permisiva ) se refiere a aquella en la que la replicación viral no ocurre. El DNA viral persiste así en forma latente como un elemento extracromosómico (episomal) o bien se integra al azar en el genoma humano (los cromosomas). El ciclo de vida del VPH
Es esta forma de infección la que origina el fenómeno de iniciación en la transformación neoplásica, debido a que el genoma del VPH se “rompe” en los sitios que corresponden al gen E2 y a veces E1. El ciclo de vida del VPH
Cuando se rompe el gen  E2  se  pierde su función . Por desgracia, una función de la proteína E2 es la de reprimir a  E6  y  E7 , que son las proteínas que originan la transformación neoplásica. El ciclo de vida del VPH
VPH  y  neoplasia
VPH y neoplasia En 1976, Harald zur Hausen propuso que ciertos papilomavirus podrían estar implicados en el origen del cáncer cérvico-uterino.
VPH y neoplasia Actualmente se sabe que el VPH está implicado en más del 95% de los casos de CaCU. Su implicación es menor en los casos menos graves (NIC I a III).
VPH y neoplasia ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
VPH y neoplasia ,[object Object],2.  Células estables. 3.  Células permanentes. Ciclo celular normal
VPH y neoplasia Ciclo celular normal El término ciclo celular se refiere a todas las  etapas  por  las  que  pasa  una  célula entre una división y la siguiente. ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
VPH y neoplasia Ciclo celular normal
VPH y neoplasia Ciclo celular normal INICIO G 1 G 2 S M S G 1 G 2 M Cinasa (Cdk) Ciclina G 1 Ciclinas G 1 Cinasa (Cdk) Ciclina M Ciclinas mitóticas
VPH y neoplasia Ciclo celular normal
VPH y neoplasia Ciclo celular normal Existen  puntos de verificación  o “ check points ” que son momentos  en los  que la célula tiene la oportunidad de  detener su  avance continuo,  si es que no se llenan ciertas condiciones.
VPH y neoplasia Ciclo celular normal Si  la  célula  no  puede  reparar  el  daño  al  DNA  entonces “se  suicida”,  es  decir,  se  desencadena  la  maquinaria enzimática que  la  lleva  a  apoptosis .
VPH y neoplasia Ciclo celular normal El VPH expresa las  oncoproteínas  llamadas E6  y  E7   que  estimulan  la  progresión  en  el  ciclo celular e inhiben su  detención,  de  esta manera inmortalizan a las células huéspedes, estableciendo  una  alta  probabilidad  de generar  una  neoplasia.
VPH y neoplasia degradación Erwin 5’ 3’ 5’ 3’ E6 E7 p53 E6 pRB E7
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
VPH y neoplasia Infección por VPH Persistencia del DNA viral Integración al genoma humano y alteración de la proliferación celular Mutaciones en genes celulares Nuevas mutaciones Infección subclínica NIC I NIC II NIC III Ca invasor
VPH y neoplasia Sólo el 10% de los casos de infección genital por VPH progresan hasta el CaCU. Toma 10 a 20 años para que la lesión NIC I progrese hasta CaCU con fenotipo invasor. Lo anterior sugiere que el VPH no es el único factor en el desarrollo del cáncer.
VPH y neoplasia El VPH parece ser un factor necesario, mas no suficiente para que se desarrolle el CaCU. Otros factores ambientales y propios del hospedero son también necesarios.
VPH y neoplasia ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
VPH y neoplasia ,[object Object],[object Object],[object Object]
Diagnóstico
Diagnóstico ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Diagnóstico ,[object Object],[object Object],[object Object]
Diagnóstico 3.  Detección del ADN del VPH (técnica directa).
Diagnóstico No existe un método de cultivo del VPH eficiente, debido al alto tropismo específico del virus por células escamosas. Por lo tanto, el cultivo del VPH no es una herramienta útil para diagnóstico (aunque sí para investigación).
Diagnóstico Colpocitología ,[object Object],[object Object],[object Object]
Diagnóstico Histopatología ,[object Object],[object Object],[object Object]
Diagnóstico Serología ,[object Object],[object Object],[object Object]
Diagnóstico Pruebas moleculares ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Diagnóstico Pruebas moleculares ,[object Object],[object Object],[object Object]
Diagnóstico Captura de híbridos El método de captura de híbridos detecta la presencia de VPH de bajo o alto riesgo, sin hacer distinción de genotipos. Su sensibilidad ha sido cuestionada, pero en algunos países goza de gran auge.
Diagnóstico PCR El método de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés) es el más sensible y específico y permite cuantificar el ADN VPH (carga viral). No obstante exige cuidados técnicos especiales.
Diagnóstico 50 µl 50 µl Toma de muestra Extracción de DNA DNA molde PCR Taq pol  1U dNTPs  75  M Amortiguador 1x C12Mg 1.5 mM Indicadores DS7 y DS8 PCR “Nested” DNA molde Taq pol 1U dNTPs  75  M Amortiguador 1x C12Mg 1.5 mM Indicadores M1 y M2 Electroforesis 1 Hold 3  Tmp 40  Ciclos 2 Holds 94.0 96.0 60.0 72.0 72.0 0.30 0.30 0.30 5.00 7.00 4.0 C Minutos PCR
Diagnóstico Hibridación in situ El método de hibridación in situ detecta al ADN VPH incluido en las células, por lo que da una apreciación “más real” de los eventos patológicos. Es cara y técnicamente demandante.
Diagnóstico Hibridación in situ Positiva Negativa
Diagnóstico Hibridación in situ Positiva Negativa
Diagnóstico ,[object Object],[object Object],2. Confirmación de la infección y determinación de genotipos Colposcopía diagnóstica y terapéutica >30 años de edad
Diagnóstico La determinación del ADN del VPH tiene sensibilidad que supera en un  10% a 20%  a la colpocitología (pero con menos especificidad). Debido al alto valor predictivo negativo de combinar colpocitología y ADN VPH, si una mujer es  negativa a   ambos  puede requerir de una  nueva revisión cada 2 – 3 años .
Conclusiones ,[object Object],[object Object],[object Object]
Conclusiones ,[object Object]
Gracias

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Erwin. vph genómica, proteómica y dx

  • 1. VPH: Genómica, proteómica y diagnóstico Erwin Chiquete Biología Molecular en Medicina Biología Molecular en Medicina • O.P.D. Hospital Civil de Guadalajara • C.U.C.S.
  • 2.
  • 3. Importancia En el mundo, hasta el 60 % de los adultos puede presentar alguna de las formas de infección por VPH . La infección por VPH es subclínica en la mayoría de los casos.
  • 4. En E.U.A. el 75 % de las mujeres tiene infección genital por VPH. El VPH está asociado a más del 95% de los casos de CACU en el mundo. Importancia
  • 5. El VPH pertenece a la familia de los papovarirus , del género papilomavirus . Los papilomavirus infectan a una gran variedad de especies de mamíferos incluyendo al hombre. El virus
  • 6. El virus Origina distintas enfermedades en el humano, dependiendo del tipo de VPH, del tejido y del sistema inmune del hospedero.
  • 7. El virus El VPH se clasifica en genotipos , o simplemente tipos, según la secuencia de su material genético. A la fecha se han descrito más de 100 genotipos , de los cuáles menos de la mitad son muy prevalentes.
  • 8. El virus VPH Piel Mucosas Alto riesgo Bajo riesgo
  • 9. El virus Alto riesgo : 16 , 18 , 31 , 33 , 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59 y 68. Bajo riesgo : 6, 11, 42, 43 y 44.
  • 10. El virus 6, 11 Verrugas laríngeas 16, 18, 31, 33, 35 Carcinoma cervical 5, 8 Epidermodisplasia verruciforme 6, 11, 16, 18, 31 Verrugas genitales 1, 2 , 4, 10 Verrugas cutáneas Genotipos más relacionados Enfermedad
  • 11. Genómica y Proteómica
  • 12.
  • 13. El genoma del VPH Su genoma es DNA de doble cadena y circular con casi 8 000 nucleótidos . Codifica para 8 proteínas. Este DNA se hace lineal y se puede integrar al genoma humano.
  • 14. El proteoma del VHC E6 E7 E1 L2 L1 E5 E2 E4 ORF 3 2 1 2 000 4 000 6 000 nt
  • 15. El genoma del VPH Replicación Proteínas transformantes Replicación y transcripción Proteína secundaria de la cápside Proteína principal de la cápside Región reguladora
  • 16. El ciclo de vida del VPH El VPH es epiteliotrópico por naturaleza y su ciclo de vida está íntimamente relacionado a la diferenciación de las células escamosas. Su receptor en la célula hospedera es la proteína de adhesión llamada  -Integrina 6 .
  • 17. Erwin El ciclo de vida del VPH 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ NH 2 COOH
  • 18. El ciclo de vida del VPH El VPH infecta a las capas celulares basales del epitelio escamoso, no a las superficiales. Una vez que infecta a la célula hospedera, el VPH permanece con muy poca actividad, hasta llegar a las capas superficiales del epitelio (por proliferación celular), donde comienza su replicación activa.
  • 19.
  • 20. Una segunda forma de infección (llamada no-permisiva ) se refiere a aquella en la que la replicación viral no ocurre. El DNA viral persiste así en forma latente como un elemento extracromosómico (episomal) o bien se integra al azar en el genoma humano (los cromosomas). El ciclo de vida del VPH
  • 21. Es esta forma de infección la que origina el fenómeno de iniciación en la transformación neoplásica, debido a que el genoma del VPH se “rompe” en los sitios que corresponden al gen E2 y a veces E1. El ciclo de vida del VPH
  • 22. Cuando se rompe el gen E2 se pierde su función . Por desgracia, una función de la proteína E2 es la de reprimir a E6 y E7 , que son las proteínas que originan la transformación neoplásica. El ciclo de vida del VPH
  • 23. VPH y neoplasia
  • 24. VPH y neoplasia En 1976, Harald zur Hausen propuso que ciertos papilomavirus podrían estar implicados en el origen del cáncer cérvico-uterino.
  • 25. VPH y neoplasia Actualmente se sabe que el VPH está implicado en más del 95% de los casos de CaCU. Su implicación es menor en los casos menos graves (NIC I a III).
  • 26.
  • 27.
  • 28.
  • 29. VPH y neoplasia Ciclo celular normal
  • 30. VPH y neoplasia Ciclo celular normal INICIO G 1 G 2 S M S G 1 G 2 M Cinasa (Cdk) Ciclina G 1 Ciclinas G 1 Cinasa (Cdk) Ciclina M Ciclinas mitóticas
  • 31. VPH y neoplasia Ciclo celular normal
  • 32. VPH y neoplasia Ciclo celular normal Existen puntos de verificación o “ check points ” que son momentos en los que la célula tiene la oportunidad de detener su avance continuo, si es que no se llenan ciertas condiciones.
  • 33. VPH y neoplasia Ciclo celular normal Si la célula no puede reparar el daño al DNA entonces “se suicida”, es decir, se desencadena la maquinaria enzimática que la lleva a apoptosis .
  • 34. VPH y neoplasia Ciclo celular normal El VPH expresa las oncoproteínas llamadas E6 y E7 que estimulan la progresión en el ciclo celular e inhiben su detención, de esta manera inmortalizan a las células huéspedes, estableciendo una alta probabilidad de generar una neoplasia.
  • 35. VPH y neoplasia degradación Erwin 5’ 3’ 5’ 3’ E6 E7 p53 E6 pRB E7
  • 36.
  • 37. VPH y neoplasia Infección por VPH Persistencia del DNA viral Integración al genoma humano y alteración de la proliferación celular Mutaciones en genes celulares Nuevas mutaciones Infección subclínica NIC I NIC II NIC III Ca invasor
  • 38. VPH y neoplasia Sólo el 10% de los casos de infección genital por VPH progresan hasta el CaCU. Toma 10 a 20 años para que la lesión NIC I progrese hasta CaCU con fenotipo invasor. Lo anterior sugiere que el VPH no es el único factor en el desarrollo del cáncer.
  • 39. VPH y neoplasia El VPH parece ser un factor necesario, mas no suficiente para que se desarrolle el CaCU. Otros factores ambientales y propios del hospedero son también necesarios.
  • 40.
  • 41.
  • 43.
  • 44.
  • 45. Diagnóstico 3. Detección del ADN del VPH (técnica directa).
  • 46. Diagnóstico No existe un método de cultivo del VPH eficiente, debido al alto tropismo específico del virus por células escamosas. Por lo tanto, el cultivo del VPH no es una herramienta útil para diagnóstico (aunque sí para investigación).
  • 47.
  • 48.
  • 49.
  • 50.
  • 51.
  • 52. Diagnóstico Captura de híbridos El método de captura de híbridos detecta la presencia de VPH de bajo o alto riesgo, sin hacer distinción de genotipos. Su sensibilidad ha sido cuestionada, pero en algunos países goza de gran auge.
  • 53. Diagnóstico PCR El método de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés) es el más sensible y específico y permite cuantificar el ADN VPH (carga viral). No obstante exige cuidados técnicos especiales.
  • 54. Diagnóstico 50 µl 50 µl Toma de muestra Extracción de DNA DNA molde PCR Taq pol 1U dNTPs 75  M Amortiguador 1x C12Mg 1.5 mM Indicadores DS7 y DS8 PCR “Nested” DNA molde Taq pol 1U dNTPs 75  M Amortiguador 1x C12Mg 1.5 mM Indicadores M1 y M2 Electroforesis 1 Hold 3 Tmp 40 Ciclos 2 Holds 94.0 96.0 60.0 72.0 72.0 0.30 0.30 0.30 5.00 7.00 4.0 C Minutos PCR
  • 55. Diagnóstico Hibridación in situ El método de hibridación in situ detecta al ADN VPH incluido en las células, por lo que da una apreciación “más real” de los eventos patológicos. Es cara y técnicamente demandante.
  • 56. Diagnóstico Hibridación in situ Positiva Negativa
  • 57. Diagnóstico Hibridación in situ Positiva Negativa
  • 58.
  • 59. Diagnóstico La determinación del ADN del VPH tiene sensibilidad que supera en un 10% a 20% a la colpocitología (pero con menos especificidad). Debido al alto valor predictivo negativo de combinar colpocitología y ADN VPH, si una mujer es negativa a ambos puede requerir de una nueva revisión cada 2 – 3 años .
  • 60.
  • 61.