物種學名與地理空間資訊處理
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物種學名與地理空間資訊處理 物種學名與地理空間資訊處理 Presentation Transcript

  • 公⺠民科學⽰示範網站及資料庫系統 教育訓練 ! 物種學名與 地理空間資訊處理 鄧東波 ! 中央研究院資訊科學研究所 地理資訊研究 ! Nov. 28 2013
  • 公⺠民科學 (Citizen Science) • 公⺠民科學(Citizen Science)是⼀一種協同合作⽅方式科學活動, 通常在科學家規劃之下,讓⼀一般⼤大眾有系統地參與科學研 究案中的全部或其中⼀一部分,這些參與所涵蓋的範圍包含 探索問題、發展科學技術、收集與分析資料等。 • 這個類型的科學計劃之核⼼心價值在於科學知識的協同合作, ⽽而研究與知識⽣生產過程中,是不被少數⼈人或專家所把持, ⽽而是在公⺠民參與研究過程中,將成果和經驗分享於公⺠民。 • 事實上,公⺠民科學並⾮非是新興的概念,早在1900年,奧杜 邦協會 (National Audubon Society) 在北美進⾏行聖誕節⿃鳥類 調查 (Christmas Bird Count),即開啟最早的且具規模的公 ⺠民科學計畫,之後,這個計畫並每年舉⾏行,其成果形成重 要的⿃鳥類調查資源。
  • 擴展公⺠民科學計畫的要素 • Silvertown(2009)認為有三個主要因素: • ⼀一、能夠使⽤用已存在且容易取得的⼯工具來分享公⺠民科學 計畫的相關訊息及其成果於普羅⼤大眾,降低參與的技術 性⾨門檻; • ⼆二、能夠將參與者所貢獻的資料、技術、計算資源、勞 ⼒力、甚⾄至⾦金錢,進化成真實的科學成果,使參與者感受 到貢獻所帶來效益; • 三、公⺠民科學計畫能接受公眾課責(public accountability),科學研究計畫的資⾦金來多數來⾃自於政府 資助,⽽而公部⾨門的資⾦金事實上是納稅⼈人的錢,若要⽤用納 稅⼈人的錢繼續做研究,公開成果且取得公眾認同是最好 的做法。
  • 不同型態的 公⺠民科學計畫平台 使⽤用者容易提供資料 Roadkill Taiwan 可以確保資料品質
  • eBird的資料收集⽅方式
  • iNaturalist.org 的資料收集⽅方式
  • 網路科技⾰革新 • 網路技術的⾰革新使得網路上的內容不只是由網⾴頁擁有者 提供 • 網路內容的形成經常是協同合作的⽅方式所構成。社群媒 體(Social Media)為⼈人們在網路世界彼此溝通的⼯工具之⼀一, 如Facebook、Twitter、Flickr、Plurk、Foursquare...等, • 使⽤用者可撰寫簡短的⽂文字訊息,混雜照⽚片、網址、地圖 或地理座標,以分享他/她的⽣生活⼤大⼩小事或周遭所⾒見所聞 於社交網絡中,使⽤用者在閱讀網路上的資訊,同時,使 ⽤用者也扮演資料提供者的⾓角⾊色 • 社群媒體是否可以成為公⺠民科學計畫的資料收集⼯工具?
  • 社群媒體中的賞⿃鳥資料(1) Geotagged Species: Little Egret Location: Ueno park, Tokyo, Japan
  • 社群媒體中的賞⿃鳥資料(2) Species: Great white egret Location: London wetland centre
  • Location: Zhong-Du brick kiln Species: Spotted Munia (Lonchura punctulata)
  • 常⾒見⿃鳥類的資料多 如⽩白鷺鷥(Egret)
  • 珍稀⿃鳥類的資料少 如⼋八⾊色⿃鳥 (Fairy Pitta) • People post
  • 語意含糊的問題 Fairy Pitta 可以是⼀一個韓國歌星
  • 只有吸引⼈人的才會被報導
  • 櫻花照⽚片空間分佈
  • 使⽤用社群媒體為 公⺠民科學資料提供平台優缺點 • 優點 可及性⾼高,容易提供資 料 • • • • • • 參與者和資料的成⻑⾧長皆 快速 互動性好,容易與其它 ⼈人分享成果 容易形成同儕競爭,使 資料提供更為有趣 參與者不⽤用再熟悉新的 應⽤用程式或資料平台的 介⾯面 缺點 • • • • 資料品質和內容都難以 掌握 需要投⼊入⼤大量⼯工作在資 料品質處理 資料容易被社群媒體所 限制 社群媒體的平台若有任 何變動,都可能影響到 後端資料管理和處理
  • http://www.facebook.com/groups/roadkilled/
  • http://www.facebook.com/groups/enjoymoths/
  • ⼀一筆提供到 Facebook上的⽣生態資料
  • 多樣化的空間指涉 (georeference)
  • 容易處理的地理資訊(1) 經緯度座標 公路⾥里程
  • 容易處理的地理資訊(2)
  • 容易處理的地理資訊(3) 公路⾥里程 國道省道之公程⾥里程資 料⼰己經是Open Data
  • 容易處理的地理資訊(4) 電⼒力座標 電⼒力座標有公開的⽅方 法,轉換成TM2 67
  • 有點難處理的地理資訊(1) Google Map的連結
  • 有點難處理的地理資訊(2) 特⽴立獨⾏行的座標格式
  • 有點難處理的地理資訊(3) 尺度⼤大且模糊的地名 只有公路沒有⾥里程
  • 有點難處理的地理資訊(4) 地名簡寫
  • 有點難處理的地理資訊(5) 本來的地名資料庫中沒有這個地名
  • 很難處理的地理資訊(1) 嵌在照⽚片中的座標資訊
  • 簡化或⼝口語化的 物種名
  • ⼝口語中的物種名 楊⽟玉祥 @_@ 我覺得: 這是⼀一隻顏⾊色不太明顯的擬⻱⿔龜耶…⼀一 時想不出其他可能性,是眼拙了嗎? Jie Fang Cheng 我覺得不是茶斑也不是梭德, 牠們應該不會這麼肥⼤大。 梁智盛 不是茶斑也不是梭德 我也覺得是擬⻱⿔龜 ! 如果可以截圖再上傳說不定會好⼀一點 邱柏愷 是擬⻱⿔龜殼花!
  • 處理Facebook上資料的⼯工作流程 Information Extraction Information Reuse
  • 中⽂文物種俗名的簡名及其問 題 曙鳳蝶(Atrophaneura Horishana) (1) ⽟玉帶鳳蝶 (Papilio Polytes) 琉璃紋鳳蝶(Papilio Hermosanus) Adjective 曙鳳 ⽟玉帶 琉璃 Noun 細紋 (pronounced Si-Wen, meaning “fine veined” (2) 細紋⿈黃鉤蛾 細紋蠍蛉 細紋新蠍蛉 ...15 species names with prefix name “細紋”
  • 辨識物種名的 ⽅方法 Confidence value =
  • 如何決定⼀一個thread中的物種名 • • 這個回應被按了多少 “讚”? • • 物種名出現在整個thread的次數? 回應的這個⼈人的“聲望”⾼高低(由過 去的記錄所得)? 物種名出現在回應的位置?經驗法 則,愈晚回覆的通常愈是正確的物 種名
  • 地名縮寫的問題 The Endemic Species Research Institute 特有⽣生物研究保育中⼼心 Te-You-Sheng-Wu-Yan-Jiou-Bao-Yu-Jhong-Sin shorten to 特⽣生中⼼心 Te-Sheng-Jhong-Sin • 地名資料庫中的地名是 完整全名 • 沒有特定規則 • 超過4個字以上容易產 ⽣生縮寫
  • 辨識縮寫地名的⽅方法
  • 結構化的資訊
  • FB Crowdsourcing Toolkit
  • 基於結構化的資訊發展內容 管理系統(CMS) http://roadkilled.biota.biodiv.tw http://enjoymoths.biodiv.tw/
  • 表格
  • 地圖
  • 圖庫
  • ⽣生物分類的瀏覽
  • 原始碼(Source Code) https://github.com/roadkilltaiwan
  • Thank you for your attentions! ! Questions? ! dongpo@iis.sinica.edu.tw www.slideshare.net/dongpo/