Guía uso Pubmed
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  • 1. Guía de uso avanzado Duración del tutorial: 30’ 22/11/2010
  • 2. ¿Qué es?● PUBMED permite el acceso gratuito a bases de dades bibliográficas de ciencias de la salud como MEDLINE, de la National Library of Medicine de MEDLINE los Estados Unidos.● MEDLINE está formado por unos 17 millones de referencias de artículos de revistas publicadas desde 1948 hasta la actualidad, el 92% en inglés.● My NCBI Permite personalizar el uso de PUBMED grabando perfiles de interés y agregar alertas a nuestro correo-e para seguir temas actuales.
  • 3. Búsqueda simple
  • 4. Autocompletado Cuando escribimos en el cuadro de búsqueda el sistema nos sugiere múltiples propostas de autoescritura. Elegimos la que más se ajusta con el puntero.
  • 5. Búsqueda simple de un tema / 1Introducimos el térrmino o la frase en el cuadro de búsqueda y presionamos SEARCH
  • 6. Búsqueda simple de un tema / 2PubMed traducirá de forma automática nuestro planteamiento en losdescriptores por los cuales se indizaría formalmente el artículo y enotras etiquetas, en todos los sinónimos asociados (Entry termmappings), los autores, los títulos de las revistas, etc.
  • 7. Búsqueda simple de un tema / 3 El botón URL nos permite generar un localizador de internet para poder guardarlo y reproducir una búsqueda idéntica en el futuro: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22[MeSH%20Terms]%20OR %20%22silicosis%22[All%20Fields]%29%20AND%20%28%22lung%20neoplasms%22[MeSH%20Terms] %20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22neoplasms%22[All%20Fields]%29%20OR %20%22lung%20neoplasms%22[All%20Fields]%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND %20%22cancer%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung%20cancer%22[All%20Fields] %29&cmd=DetailsSearch
  • 8. Búsqueda simple de un tema / 4Podemos usar operadores lógicos (AND, OR, NOT), en mayúscules siempre, para orientar la búsqueda:percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)
  • 9. Búsqueda con límites / 1 PubMed prevé la búsqueda de artículos usando límites que son muy habituales.
  • 10. Búsqueda con límites / 2 La búsqueda de artículos puede limitarse a un género, una lengua, una franja de edat, un sector de publicaciones, una especie, etc. En esta búsqueda con límites buscamos el término gonarthrosis en las revistas Core (son 120 revistas del total, unas 5.500)
  • 11. Búsqueda avanzada
  • 12. Campos de Pubmed Los registros de Pubmed están formados por unos campos característicos que son directamente interrogables. Campos característicos de PubMed
  • 13. Búsqueda avanzada • Búsqueda por autores, revistas, etc. (campos concretos) concretos • Búsqueda a través de los descriptores MeSH (Medical Me Subject Headings)
  • 14. Search Builder / 1 En la ventana de Search builder podemos obtener con el desplegable todos los nombres de los campos y consultar el Index de cada campo.
  • 15. Search Builder / 2 El Index se abre por la palabra o frase más aproximada a la frase que escribimos en el Search Builder
  • 16. Search Builder / 3 Tal y como vamos encontrando etiquetas con el Search Builder y el índice las podemos ir incorporando con el botón en la ventana de búsqueda (Search Box), donde se combinan:
  • 17. Resultados
  • 18. Medical Subject Headings (MeSH) / 1Me MeSH Una búsqueda a través de los descriptores MeSH nos permite capturar información de manera: b) más consistente, c) más metódica; y, d) más rigurosa.
  • 19. Medical Subject Headings (MeSH) / 2Me MeSH 1) Introducimos el término pathologic fracture en el cuadro de interrogación, 2) MeSH traduce automáticamente pathologic fracture al descriptor Fractures, spontaneous, 3) Nos permite limitar la búsqueda p.e. a los artícules enfocados en la rehabilitación, i 4) Ambos elementos se combinan en el menú desplegable por la opción “Search Box with AND”
  • 20. Resultados
  • 21. Visualizaciónde resultados
  • 22. Visualización de resultados / 1 Artículos del dominio públic (2)
  • 23. Visualización de resultats / 2 El Hospital está subscrito Se obtiene el texto completo clicando el logo del Hospital
  • 24. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=ieshvadhlib Este enlace para acceder a Pubmed nos identifica como usuarios de la Biblioteca. Biblioteca Cuando vemos un registro de Pubmed nos indica si tenemos acceso mostrando el logo del Hospital.
  • 25. Visualización de resultados / 3 Texto complet Vista “Abstract” Captura de registros
  • 26. My NCBI
  • 27. ¿Qué es My NCBI? NCBI El instrumento My NCBI en PubMed permite registrarse y así retener la información recogida por un usuario y sus preferencias.
  • 28. Registro en My NCBI Podemos abrir gratuitamente una cuenta en My NCBI o bien usar p.e. la de Google o Gmail
  • 29. Función Collections / 1 Cuando queremos guardar un conjunto de registros bibliográficos en PubMed podemos hacerlo con la función Clipboard, que solo nos deja retener hasta 500 registros i solo se conservan si no estamos inactivos 8 horas seguidas. La función Collections es por el contrario para usuarios que se han registrado a My NCBI y permite conservar hasta 5000 registros indefinidamente, y además compartirlos.
  • 30. Función Collections / 2 Podemos compartir una colección de registros configurándola como “pública” y proporcionando la URL o enlace directo a colaboradores nuestros.
  • 31. Función Save search / 1 Tener una cuenta en My NCBI también nos permite grabar una búsqueda (su estrategia) para poderla ejecutar en el futuro.
  • 32. Función Save search / 2 La función Save Search genera un formulario donde podemos inscribir nuestras preferencias para recibir continuadamente los resultados que se vayan incorporando a PubMed sobre nuestro tema en un correu-e personal.
  • 33. Función My Bibliography /1 Por último, otra función de My NCBI útil es My Bibliography, diseñada específicamente para Bibliography guardar registros de un autor y editarlos en listas
  • 34. Función My Bibliography /2 Botones de edición de My Bibliography
  • 35. Capturade registros
  • 36. Podemos capturar los resultados de la búsqueda,sea a partir de la lista total, sea haciendo unaselección de la lista marcando los botones deselección
  • 37. Cuando enviamos registros a una direcciónde correu-e no podemos enviar más de200 registros por mensaje, pero se puedenenviar fraccionados.
  • 38. Importar registros a
  • 39. Podemos importar un archivo extraído de Pubmed Con el registro o registros seleccionados desplegamos SEND TO, escogemos la opción FILE y el formato MEDLINE TO
  • 40. Desde el submenú IMPORT REFERENCES de EndNoteWebpodemos subir el archivo generado por la búsquedaanterior (pubmed_result.txt) aplicando el filtre PUBMED(NLM)
  • 41. Registro en la listaRegistro en detalle
  • 42. Guia d’us completa de EndnoteWeb
  • 43. Importar registros a
  • 44. El icono de documento en la barra de las direcciones nos indica que Zotero ha detectado los “metadatos” de un artículo en Pubmed
  • 45. 3 2• Abrimos Zotero activando su botón en la barra.• En la columna izquierda activamos la carpeta donde queremos grabar un registro.• Clicamos el icono que aparece en la barra de direcciones para incorporarlo. 1
  • 46. Guía de uso completa de Zotero
  • 47. Otras funciones
  • 48. Enlace permanente a un artículo Una forma de crear un enlace permanente a un registro es con un URL que contenga la expresión http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ y el número PMID. P.e.: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894
  • 49. Función ImagesEn octubre de 2010PubMed ha incorporadoimágenes en losartículos que pertenecena las publicaciones dePubmed Central, de libreacceso
  • 50. Agregadores RSSPubMed ofrece diversos canales RSS para obtenerfácilmente informació continuada sobre un tema, etc. Más información en la Guía de uso de RSS
  • 51. Elaborado por: Marta-R. Domínguez Senra (mrdoming@vhebron.net)