Este documento fornece um resumo sobre o PubMed, uma base de dados bibliográfica especializada em ciências da saúde mantida pela Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA. O documento explica que o PubMed contém mais de 20 milhões de registos bibliográficos da literatura biomédica indexada na MEDLINE, revistas científicas e livros eletrónicos. Além disso, descreve as principais funcionalidades do PubMed, como a pesquisa básica e avançada, o uso do tesauro MeSH para pesquisas
2. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
Sumário
◌ O que é?
◌ Conteúdos
◌ Funcionalidades
◌ A Medline
◌ O thesaurus MeSH
◌ O acesso
◌ A pesquisa
◌ Subscrição de Feeds RSS
◌ Exportação para o EndNote
◌ Exercícios
3. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
O que é?
A PubMed é uma base de dados de bibliografia especializada, com mais de 20 milhões de
registos de literatura biomédica, MEDLINE, revistas científicas e livros electrónicos. Abrange
as áreas da medicina, enfermagem, veterinária, entre outras áreas relacionadas com as
ciências da saúde. Tem também um conjunto de links de endereços electrónicos
seleccionados e com relevância para a área, incluindo recursos de biologia molecular.
Produzida pela National Library of Medicine (http://www.nlm.nih.gov/) dos Estados Unidos,
em conjunto com editores de literatura biomédica, começa por ser uma inteface de acesso à
Medline, incluindo também a Oldmedline e citações avulsas. Contém registos desde 1865 e
faz ligação a todos os artigos que estejam em Open Access disponibilizados no arquivo
PubMedCentral (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/) assim como às revistas subscritas em
formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B‐on (com acesso ua.pt).
4. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Conteúdos MeSH Thesaurus
› A MEDLINE, a OLDMEDLINE e citações avulsas;
› A OLDMEDLINE contém artigos anteriores a 1966 (1865 a 1965) de cerca de 80 países;
› Possibilidade de pesquisa em várias publicações, que podem ir dos artigos científicos aos
pré‐prints e livros;
› São também incluídas desde logo na PubMed as citações in‐process e as citações
fornecidas pelos editores;
5. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
Conteúdos
› As citações avulsas compreendem as citações out‐of‐scope (por exemplo, de artigos sobre
geofísica, arqueologia, astronomia) de alguns periódicos indexados na MEDLINE, cujos
artigos relacionados com as ciências da saúde já são indexados. Incluem também citações
que precedem o ano a partir do qual um dado periódico passou a ser integrado na
MEDLINE (catalogação retrospectiva) e citações de outros periódicos não incluídos na
MEDLINE, mas que submetem o seu texto integral à PubMedCentral e são avaliados
positivamente pela NLM;
› As citações in‐process fornecem a citação básica e, na maior parte dos casos, o resumo do
artigo, antes mesmo da introdução dos assuntos (termos MeSH).
Estes registos são acrescentados diariamente e contêm a indicação [PubMed – in process].
À medida que os dados vão sendo acrescentados e os registos ficam completos, passam a
conter a indicação [PubMed – indexed for MEDLINE];
6. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
Conteúdos
› Clinical trials:
Estudos biomédicos ou investigação relacionada com áreas da saúde, aplicados em seres
humanos e que seguem protocolos pré‐definidos.
“Research studies that involve patients. Each study is designed to find
better ways to prevent, detect, diagnose, or treat diseases and to
answer scientific questions.”
School of Medicine | University of Southern California
http://www.usc.edu/schools/medicine/departments/surgery/divisions/colorectal/about/index.html
7. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
Funcionalidades
› Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.;
› Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not)
e termo composto ou pesquisa por frase (“ “);
› Acesso ao texto integral de algumas publicações subscritas pela UA ou que fazem
parte da B‐on – Biblioteca do Conhecimento Online (desde que no dominio
ua.pt);
8. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
Funcionalidades
› Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre;
› Possibilidade de pesquisa em outras bases de dados e clinical trials;
› Thesaurus MeSH;
› Subscrição de feeds RSS;
› Exportação para EndNote;
› Espaço pessoal.
9. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
A Medline
› A Medline é uma base de dados da National Library of Medicine e que resulta da PubMed.
› Inclui apenas artigos científicos com peer‐review nas áreas da biomedicina. As referências
nela incluídas passam por um processo de análise e indexação mais consistente e todos os
registos contêm descritores do thesaurus Mesh.
› Abrange menos publicações do que a PubMed, mas as que reúne são da máxima
pertinência.
› Está acessível para a UA, através da plataforma ISI Web of Knowledge
http://isiknowledge.com/MEDLINE
10. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
O thesaurus MeSH
Vocabulário controlado da PubMed|Medline
O MeSH (Medical Subject Headings) é o vocabulário controlado que é utilizado para indexar os
artigos da PubMed e da Medline. A terminologia controlada que é usada no thesaurus MeSH
dá a possibilidade de recuperar informação sobre um determinado assunto de uma forma
sistemática, eliminando os registos que não são pertinentes para aquele tópico.
É uma óptima ferramenta de apoio para a realização de pesquisas na PubMed e Medline pois
diminui ou limita o ruído, proporcionando maior precisão.
12. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
A pesquisa
◌ Pesquisa básica
◌ Pesquisa avançada
◌ Pesquisa por assunto
◌ Pesquisa por autor
◌ Pesquisa por título de revista
◌ Pesquisa de uma referência em particular
◌ Operadores boleanos
◌ Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico
◌ O texto integral dos artigos
13. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
A pesquisa básica MeSH Thesaurus
3 4
1
2
1 Certifique‐se que está na base PubMed 3 Estabeleça limites à sua pesquisa (opcional)
2 Coloque os termos no campo de pesquisa 4 Se não obtiver resultados na pesquisa básica, opte pela
pesquisa avançada
14. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
A pesquisa avançada MeSH Thesaurus
5 6
3
1
2 4
1 Coloque os termos de pesquisa 4 Adicione os termos à caixa de pesquisa “search box”
2 Seleccione o campo a pesquisar (opcional) 5 Verifique se a pesquisa está de acordo com o pretendido
3 Seleccione um dos operadores boleanos 6 Estabeleça limites à sua pesquisa (opcional)
(aplica‐se quando há vários termos a combinar)
15. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Pesquisa por assunto MeSH Thesaurus
Identifique os termos do assunto a pesquisar
› Os termos devem ser em língua inglesa;
› Deve ter em conta os sinónimos, o plural, o singular e as abreviaturas;
Exemplo:
O tratamento com
Metotrexato nas crianças
com artrite juvenil
ideopática poliarticular.
As palavras chave são:
Methotrexate
e
Polyarticular juvenile
idiopathic arthritis
16. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Pesquisa por assunto MeSH Thesaurus
Ao colocar os termos na caixa de pesquisa, analise as sugestões de termos apresentadas,
estas dão indicações dos termos mais correctos a usar.
17. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH)
MeSH Thesaurus
Em caso de dificuldade na identificação do termo use o thesaurus MeSH.
O MeSH está acessível através do link http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh
3
1
2
1 Coloque o termo de pesquisa
2 Seleccione um dos termos propostos (opcional)
3 Inicia a sua pesquisa em “Search”
18. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH)
MeSH Thesaurus
Em caso de dificuldade na identificação do termo use o thesaurus MeSH.
1
1 Seleccionar o termo de assunto
20. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH)
4
1
2
3
6 5
4 Valide o termo
1 Termo de assunto já seleccionado
5 Para juntar mais termos à pesquisa seleccione
2 Termos a adicionar à pesquisa (opcional) um dos operadores boleanos (opcional)
3 Adicione os termos à caixa da pesquisa “Add to search buider” 6 Lance a sua pesquisa na PubMed
21. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
Pesquisa por assunto : quando usar e quando não usar o
MeSH…
Use o MeSH quando: Não use o MeSH quando:
› pretende efectuar uma pesquisa exaustiva › pretende informação sobre um conceito
e precisa sobre um determinado tópico (os médico novo ou emergente, para o qual ainda
documentos ainda não indexados não serão não existe um termo MeSH.
apresentados).
› necessita de efectuar uma pesquisa › quer obter registos de artigos publicados
elaborada, combinando vários aspectos de recentemente. Uma pesquisa por termo
diferentes tópicos ou assuntos. MeSH não consegue recuperar citações com a
indicação «Pubmed – in process», às quais
ainda não foram associados termos MeSH.
› quer encontrar rapidamente um aspecto › suspeita de que há pouca informação
específico de um tópico genérico. publicada relativa ao tópico que lhe interessa.
22. Abril 2011
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Informação em ciências da saúde
PubMed
Pesquisa por autor MeSH Thesaurus
Digite na caixa de pesquisa, o último nome do autor, mais as iniciais sem pontuação.
Na pesquisa avançada, no “search builder”, coloque o nome do autor e seccione a opção
autor do menu “All fields”.
Exemplo:
5
DePinho RA
DePinho R 4
6
1 3
2
23. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Pesquisa por título de revista MeSH Thesaurus
Através da pesquisa do título completo, da abreviatura ou do ISSN de uma revista, a PubMed
apresenta uma relação de todos os artigos nela publicados, desde que indexados na base de
dados.
Na pesquisa avançada, no “search builder”, coloque o título da revista e seccione a opção
autor do menu “journal”.
Exemplo:
5
Lancet
4
6
1 3
2
24. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Pesquisa por título de revista MeSH Thesaurus
Para obter informações sobre uma revista, aceda à NLM Catalog: Journals referenced in the
NCBI Databases ‐ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nlmcatalog/journals
Exemplo:
Lancet
2
1
3 4
1 Digite o título da revista 3 Seleccione a revisa
2 “Search” 4 Dados estruturados da publicação
25. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
Pesquisa de uma referência em particular
Localização de um artigo através de informações bibliográficas já existentes.
Quando já tem o título da revista, volume, número e páginas, use o Single Citation Matcher
para localizar o artigo ‐ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/citmatch.
Exemplo:
Moniz, E. (1950). [Contribution of the 1
Portuguese school to the development of
neurosurgery]. Minerva Med, 41(35), 47‐49.
1 Preencha os campos de acordo com a referência 2
2 Inicie a pesquisa com “Go” 3
3 Consulte o registo do artigo na PubMed
26. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Os operadores boleanos na pesquisa MeSH Thesaurus
A pesquisa booleana permite a combinação de diferentes termos numa única pesquisa,
através do uso dos operadores and, or, not.
and Psychology and forensics
Resultados PubMed ‐ 5184
or Psychology or forensics
Resultados PubMed ‐ 910388
not Psychology not forensics
Resultados PubMed ‐ 824935
27. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico
MeSH Thesaurus
Após a pesquisa, a PubMed apresenta uma lista com vários resultados (20 por página),
ordenados cronológicamente e que podem ser de registos de artigos científicos ou capítulos
de livros.
Título
Não está indexado com descritores MeSH
Autores
Em processo de indexação. Ainda não está na Medline
Título da revista
Na Medline
28. Abril 2011
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PubMed
Informação em ciências da saúde
Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico
Link para o texto integral
Volume e número
Ano de publicação Páginas
Capítulo de livro
29. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico
MeSH Thesaurus
Os registos bibliográficos são apresentados de uma forma estruturada – título, autor(es),
afiliação, resumo/abstract, revista, ano de publicação, volume, número e páginas, link para o
texto integral, editor, os termos de assunto do thesaurus MeSH, entre outros.
30. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico
MeSH Thesaurus
Ligações ao texto
Tipo de publicação / integral
artigo de uma revistas
Termos de assunto
indexados com base
no MeSH
Os termos de
assunto com * são
considerados os
mais relevantes do
artigo
31. Abril 2011
Bibliotecas da Universidade de Aveiro
PubMed
Informação em ciências da saúde
PubMed
O texto integral dos artigos MeSH Thesaurus
No registo completo do artigo, a existência do icon de “free‐text article” ou ”full‐ text
article” dá acesso ao texto integral, caso seja uma revista disponível em acesso livre ou uma
publicação subscrita em formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B‐on.
36. PubMed
Informação em ciências da saúde
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