Formation Gephi : Le logiciel Gephi

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  • 1. -1- une Une unapplication communauté consortium
  • 2. Like photoshop tm for graphsGephi is an interactive visualization and exploration platformfor all kinds of networks and complex systems, dynamic and hierarchical graphs.
  • 3. 100.000 10 ANS 1.000téléchargements d’existence Membres d’une communauté sur facebook Duke Award, JavaOne 2010 (Mathieu Bastian
  • 4. un consortium • donner à la communauté une strucutre légale • fournir une infrastructure de recherche • fournir des solutions légales pour exploiter Gephi Objectif : Un effort de R&D pour construire des parts réutilisable et générique de gephi https://consortium.gephi.org/
  • 5. -2-Ressources
  • 6. Tutoriel pour gephi http://gephi.org/users/http://gephi.org/tutorials/gephi-tutorial-quick_start.pdf
  • 7. le GEXFhttp://gexf.net/format/
  • 8. marketplacehttps://marketplace.gephi.org/
  • 9. -3-Une pierre angulaire dans le cycle de production des cartographies
  • 10. GEPHI : un élément central dans le cycle de production de la cartographie Techniquement, la cartographie de l’information repose sur la maîtrise des différentes étapes de la chaîne de production • Curation, Enrichissement des données • Visualisation de graphes • Spatialisation, hiérarchisation, groupement • Finalisation cartographique anayse des cartographie système données graphes interfaced’information ajout de Patterns à explorer Vues méta-données ou Nouvelles métrique complémentaires de descripteurs aux à intégrer à produire données natives
  • 11. Les structures de graphes : un moyen puissant de croiser des données excel, Table 2 net Gephi Sigma Jsou autre tableur ou autre plateforme Comment les produire ? • manuellement à partir de GEPHI • automatiquement à partir de scripts/A.P.I. • le plus souvent, à partir de fichier Excel ou de CSV, d’où l’intérêt de Table2Net
  • 12. -4-Une opération centrale : transformerdes liste ou des tables de données en structures de graphs
  • 13. Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes : Accéder à Table2Net : 1 http://webatlas.fr/table2net/ 2 Charger un fichier de type «CSV» Sélectionner les options de 3 construction d’un graphe 4 Télécharger le fichier au format GEXF
  • 14. Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes : Accéder à Table2Net : 1 http://webatlas.fr/table2net/ 2 Charger un fichier de type «CSV» Sélectionner les options de 3 construction d’un graphe 4 Télécharger le fichier au format GEXF
  • 15. Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes : Accéder à Table2Net : 1 http://webatlas.fr/table2net/ 2 Charger un fichier de type «CSV» Sélectionner les options de 3 construction d’un graphe 4 Télécharger le fichier au format GEXF
  • 16. Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes : Accéder à Table2Net : 1 http://webatlas.fr/table2net/ 2 Charger un fichier de type «CSV» Sélectionner les options de 3 construction d’un graphe 4 Télécharger le fichier au format GEXF
  • 17. -5-Visualiser et mesurer les données
  • 18. Saillances (hiérarchies) composants(typologies et classifications)1 ORGANISATION (Géographies et complémentarités)2345 focus (localisation et contextualisation)
  • 19. Spatialiser les données : les principaux algorithmesMode aléatoire Fruchterman Reingold OpenOrdVue circulaire Radias axis Force Atlas 2
  • 20. Hiérarchiser et analyser les donnéesForce Atlas 2 hierarchie hierarchie hierarchie (taille et degrés) (degrés colorés) (centralité)
  • 21. Grouper et hiérarchiser les données Montparnasse Montparnasse Perpetue Perpetue Gueulemer Gueulemer Marguerite Simplice Claquesous Brujon Simplice Marguerite Claquesous Brujon Babet Boulatruelle Babet Boulatruelle Fantine Fantine Zephine Thenardier Zephine Thenardier Javert Javert Fauchelevent MmeThenardier Anzelma Fauchelevent MmeThenardier Anzelma Eponine Eponine Cosette Pontmercy Cosette Pontmercy MlleGillenormand MlleGillenormand Marius Gillenormand MmePontmercy Marius Gillenormand MmePontmercy Enjolras Enjolras Courfeyrac Courfeyrac Combeferre Prouvaire Combeferre Prouvaire Bossuet Bossuet Joly Joly Grantaire Grantaire MmeHucheloup MmeHucheloupCouleurs hierarchie labels hierarchie(classes) (degrés, noeuds) (degrés, labels)
  • 22. Grouper et hiérarchiser les donnéesLes cinq collèges détection statistique les porteurs de projets des communcautés (en rouge) Variation des couleurs en fonction des partitions
  • 23. Plusieurs espaces de travailsélection nouvel espace de travail spacialisation (zone) (radiale)
  • 24. GeoLayout / Géo-référencementProjet VisIR, 2010pôle de compétitivité Images et Réseaux,
  • 25. Le géo-référencementMigrations des dossiers patients entre structures hospitalières à l’échelle des Etats-Unis (2011).
  • 26. Le géo-référencement
  • 27. Le géo-référencementhttp://gephi.org/2010/map-geocoded-data-with-gephi/
  • 28. Time-line et structure de donnéeshttp://fr.slideshare.net/Eldarion/ic05-cours-4 http://gexf.net/format/dynamics.html
  • 29. Les métriquesTaille et couleur en fonction du score de PageRank
  • 30. Filtrer les donnéesFiltrage en fonction du nombre de liens par noeud
  • 31. Les exports (SVG, PNG, GEXF...)