Bases de Datos en Taxonomía y
Colecciones Científicas
L.C.A. José Arturo Guerra Cantú
Taxonomía, colecciones científicas e informática
“Se de cuenta o no todo biólogo
(aún el que trabaja en el nivel
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La importancia de la taxonomía se debe a que brinda
una estructura ordenada de información sobre los
organismos vivos
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Las colecciones científicas
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Los museos y herbarios son centros de información
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Colecciones Científicas y crisis de la biodiversidad
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Principales fuentes de datos biológicos en la actualidad
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Bases de datos curatoriales
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La mayor parte de esa información se obtiene de colecciones
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Dificultades y perspectivas
• Insatisfacción, escepticismo a banco de datos computarizados
Dificultades:
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Biológica. Ed. Fondo de Cultur...
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La importancia de la taxonomía se debe a que brinda una estructura ordenada de información sobre los organismos vivos.

Las colecciones son el respaldo, la memoria y, de cierta manera, la culminación del esfuerzo que ha hecho el hombre por conocer y organizar su conocimiento de los organismos que lo acompañan poblando la tierra.

Si el objetivo de las colecciones biológicas es representar la diversidad, se puede valorar la tarea que enfrentan los centros que guardan estos materiales; parece más evidente que es indispensable recurrir a las computadoras para manipular adecuadamente esas inmensas cantidades de datos.

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Bases de datos en taxonomía y colecciones científicas

  1. 1. Bases de Datos en Taxonomía y Colecciones Científicas L.C.A. José Arturo Guerra Cantú
  2. 2. Taxonomía, colecciones científicas e informática “Se de cuenta o no todo biólogo (aún el que trabaja en el nivel molecular) trabaja con especies o partes de especies y sus hallazgos pueden ser influidos por la elección de una especie en particular. La comunicación de sus resultados dependerá de la correcta identificación de la especie involucrada y, de esta manera, de su taxonomía”Ernest Mayr (1957)
  3. 3. La importancia de la taxonomía se debe a que brinda una estructura ordenada de información sobre los organismos vivos Legado de Linneo, sentado las bases teóricas y prácticas para la formación de colecciones botánicas, junto con su sistema de clasificación y de nomenclatura
  4. 4. Las colecciones científicas (herbarios y museos) son la base principal del trabajo taxonómico Principal objetivo: Representación de la diversidad biológica por medio de especímenes
  5. 5. Las colecciones son el respaldo, la memoria y, de cierta manera, la culminación del esfuerzo que ha hecho el hombre por conocer y organizar su conocimiento de los organismos que lo acompañan poblando la tierra. << No cambiará su importancia, cambiará la forma de registrar, consultar y comunicar la información taxonómica >>
  6. 6. Los museos y herbarios son centros de información Catálogos y BibliografíaEspecímenes Datos: Nombres científicos Esquemas de clasificación de los organismos de la colección Ejemplares Morfología y características de taxa Distribución o localización de los mismos Otros datos (según el fin): Descriptivos (citoquímicos, bioquímicos, sonidos grabados) Descriptivos de su entorno (geograficos, ecológicos, climatológicos) Forma de utilizar (Farmacológicos, gastronómicos, religiosos)
  7. 7. Colecciones Científicas y crisis de la biodiversidad Sistemática, Levantar un inventario de la diversidad biológica (Colecciones). Colecciones  Mostrarán especies que existieron de manera incompleta EXTINCIÓN Necesidad de que la sistemática adecúe y mejore sus procedimientos de trabajo para ayudar a dar respuestas a los desafíos del deterioro ecológico.
  8. 8. Magnitudes de la información sobre la diversidad biológica Los herbarios tienen una tradición más acendrada que los museos zoológicos como centros de acopio de ejemplares biológicos.
  9. 9. Herbarios más grandes y estimación de la cantidad de ejemplares que poseen (Radford et al., 1974) Siglas Núm. De especímenes Kew, Inglaterra K 7 000 000 París, Francia P 5 000 000 Ginebra, Suiza G 4 000 000 Lyon, Francia LY 3 800 000 Nueva York, EUA NY 3 000 000 Chicago, EUA F 2 350 000
  10. 10. Herbarios con más de 50 000 ejemplares y con sistema de información automatizada (Pankhurst, 1984) Colección País Núm. De especímenes Fecha apox. De inicio Notre Dame EUA 65 000 1968 Smithsonian Institution EUA 53 000 (algas) 70 000 (tipos) 1969 Flora de Veracruz México 60 000 1970 Brisbane Australia 360 000 1973 Bogotá Colombia 120 000 1974 Pretoria Sudáfrica 620 000 1974 Programa Flora Brasil 220 000 1976 UNAM México 60 000 1982
  11. 11. Si el objetivo de las colecciones biológicas es representar la diversidad, se puede valorar la tarea que enfrentan los centros que guardan estos materiales; parece más evidente que es indispensable recurrir a las computadoras para manipular adecuadamente esas inmensas cantidades de datos
  12. 12. El papel de las computadoras en las colecciones • Informática: disciplina que se encarga de lo relacionado con el manejo automatizado de la información • Deficiencia por la carencia de suficiente personal especializado en análisis de sistemas, programadores de computadoras, administradores de bases de datos y responsables del sistema
  13. 13. Bases de Datos Sistema de mantenimiento de registros basados en computadores, es decir, un sistema cuyo propósito general es registrar y mantener la información
  14. 14. Principales fuentes de datos biológicos en la actualidad
  15. 15. Base de datos taxonómicas Una base de datos de la mayor importancia para la taxonomía es la nomenclatura, las reglas de denominación de las especies están claramente establecidas, y son independientes de los diversos criterios de delimitación de las especies. EUA (1996) Canadá México Otros Sistema Integrado de Información Taxonómica Elaborar una base de datos completa y accesible de información taxonómica para cada una de las especies y de los taxones reconocidos, incluyendo tanto el lugar en el sistema jerárquico de la clasificación científica , como las referencias a las autoridades en la materia que lo han situado en su posición taxonómica
  16. 16. Bases de datos curatoriales <<Información relacionada con los especímenes>> En los últimos 20 años se ha incrementado el uso de las bases de datos curatoriales para estimar la riqueza de especies y los cambios en la biodiversidad, así como otros aspectos de análisis espacial. También contienen información cronológica que puede utilizarse para reconstruir la historia del conocimiento de la biodiversidad. Datos geográficos y biogeograficos
  17. 17. La mayor parte de esa información se obtiene de colecciones biológicas, que contienen los datos del colector, el sitio, la fecha de la recolección, y otros datos que no se encuentran en los registros de especies descritas en la bibliografía Es por esto que los museos se convierten en centros privilegiados para la investigación y planeación de estrategias de conservación y las bases de datos procedentes de esas fuentes proporcionan información completa para análisis espaciales y temporales de la diversidad biológica Según el fin: Biosistemática y control biológico de artrópodos Base de datos: Colección Internacional de Artrópodos de la Soya (ISAC) Base de datos de artrópodos inmigrantes del hemisferio occidental Sistema de Información de Investigación de Pesticidas (PRIS)
  18. 18. Dificultades y perspectivas • Insatisfacción, escepticismo a banco de datos computarizados Dificultades: Datos de etiquetas (Especímenes antiguos) Grupos Taxonómicos no han sido trabajados en décadas Organización de museos o herbarios Resistencia a la cooperación internacional entre las instituciones más importantes Infraestructura de equipo y telecomunicaciones De mantenerse las tendencias actuales se agudizará la problemática Somos responsables de llegar a acuerdos…
  19. 19. Literatura consultada • Llorente B., J e Isolanda Luna Vega (Compiladores). 1994. Taxonomía Biológica. Ed. Fondo de Cultura Económica. Pp. 259-275 • Oñate-Ocaña, Leonor; Llorente-Bousquets, Jorge. 2010. "El uso de bases de datos curatoriales para reconstruir la historia del conocimiento taxonómico: un ejemplo con papiliónidas y piéridas mexicanas (Insecta: Lepidoptera)". Revista Mexicana de Biodiversidad, num. Sin mes, pp. 343- 362. • http://www.itis.gov
  20. 20. Porsuatención ¡Gracias!
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