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Mendeley : gestion de références bibliographiques
                  et collaboration entre chercheurs




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Plan

●   Les logiciels de gestion de références
bibliographiques
●   Installation de Mendeley
●   Gérer sa bibliothèque d...
Trop de références bibliographiques




                                  sur une idée originale de Valentin Vivier




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Gérer sa bibliographie
● S'organiser
● Capitaliser

● Privilégier le fond sur la forme

● Partager des références, collabo...
Des outils dédiés




    Formation Mendeley   Alain Marois - 27/04/2010
Besoins classiques...et émergents




                                  sur une idée originale de Martin Fenner

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Mendeley 1/2
● Logiciel à installer + service en ligne
 (http://www.mendeley.com)
● Windows + Mac + Linux

● Modèle de Las...
Mendeley 2/2




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Installation de Mendeley




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Téléchargement : option 1




Par défaut, téléchargement suite à l'initialisation d'un compte




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Téléchargement : option 2



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Installation : les plugins Word et OpenOffice
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Vue d'ensemble de l'interface « Desktop »
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Créer sa bibliothèque de références




            Formation Mendeley    Alain Marois - 27/04/2010
Ajouter des références : via Mendeley Desktop



  Différentes stratégies :
  ●   Ajout d'un document ou d'un répertoire d...
Ajouter des références : utiliser l'import web
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    Un simple lien placé dans la barre d'adresse
    permet d'importer ...
Import web : installation et compatibilité
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Synchronisation de sa bibliothèque de références


 Synchronisez votre bibliothèque Mendeley
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Si vous disposez d'un lot de fichiers PDF
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Si vous venez de EndNote
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Gérer sa bibliothèque de références




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Des fonctions de gestion simples et utiles
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Recherche incrémentielle et suggestion de recherche
                                  Recherche dans les références et
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Utilisation avancée du moteur de recherche


                                            champs:terme à recherche




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PDF : lecteur intégré + et recherche de mots-clés
                                Outils d'exploitation avancée : notes,
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PDF : surlignez et annotez vos documents




Annotation (avec auteur et date)                                           No...
Classez et renommez automatiquement vos fichiers
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PDF : surlignez, annotez, ajoutez des notes




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Prenez soin de vos métadonnées : homogénéisation
     des noms de journaux, auteurs, tag, etc.



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Citer en utilisant ses références




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Citer dans Word et OpenOffice 1/2
          Cliquer sur « Insert Citation dans la
          barre d'outil Mendeley de Word...
Citer dans Word et OpenOffice 2/2
          Cliquer sur « Send Citation to Word »


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                      ...
Éditer une bibliographie dans Word ou OpenOffice
                   Cliquer sur « insert Bibliography »



               ...
Produire une simple liste de références formatées

         Sélectionnez des références                                  L...
Un vaste choix de styles bibliographiques


Ooo : « Choose Citation Style »
                                              ...
Utiliser LaTeX / BibTeX : options de
  synchronisation de la bibliothèque de références

Tools > Options > BibTeX
        ...
Partager, collaborer, s'intégrer à une communauté
        en gérant son identité numérique




                   Formatio...
Rendre une collection publique
Les critères de publication des collections sont paramétrables
pour chacune d'entre elles i...
Créer une collection partagée pour collaborer




     Une collection partagée entre membres n'est
     visible uniquement...
Compléter son profil et sa liste de publications :
     l'identité numérique du chercheur

                               ...
Mendeley : un réseau social pour les chercheurs ?



              “   We define social network sites as web-
            ...
Paramétrer la confidentialité de son profil



Se tenir informé




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Valoriser son travail bibliographique et son expertise




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Trouver de l'aide




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Mendeley : participer, suivre l'évolution

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Statistiques et sérendipité

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Ressources

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Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0

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Support de formation accompagnant un atelier en présentiel de présentation de Mendeley. Public : chercheurs, doctorants, enseignants dans le supérieur

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  1. 1. Mendeley : gestion de références bibliographiques et collaboration entre chercheurs ©Club photo et Maxime Storn Alain Marois – Bibliothèque de l'Ecole Centrale de Lyon alain.marois@ec-lyon.fr / www.twitter.com/amarois
  2. 2. Plan ● Les logiciels de gestion de références bibliographiques ● Installation de Mendeley ● Gérer sa bibliothèque de références ● Citer en utilisant ses références ● Partager, collaborer, gérer son identité numérique Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  3. 3. Trop de références bibliographiques sur une idée originale de Valentin Vivier Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  4. 4. Gérer sa bibliographie ● S'organiser ● Capitaliser ● Privilégier le fond sur la forme ● Partager des références, collaborer ● Découvrir de nouveaux travaux ? Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  5. 5. Des outils dédiés Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  6. 6. Besoins classiques...et émergents sur une idée originale de Martin Fenner Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  7. 7. Mendeley 1/2 ● Logiciel à installer + service en ligne (http://www.mendeley.com) ● Windows + Mac + Linux ● Modèle de Last.fm (partage de musique) ● Version beta, gratuit, mais... ●...business model en évolution, mais... ●... « what is free now will remain free » ● Société basée à Londres Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  8. 8. Mendeley 2/2 Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  9. 9. Installation de Mendeley Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  10. 10. Téléchargement : option 1 Par défaut, téléchargement suite à l'initialisation d'un compte Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  11. 11. Téléchargement : option 2 Il est aussi possible d'installer l'outil sans créer de compte à priori Mendeley est disponible sur de nombreuses plateformes Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  12. 12. Installation : les plugins Word et OpenOffice 1 2 3 4 Compatibilité OpenOffice Compatibilité word 2003 - 2007 Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  13. 13. Vue d'ensemble de l'interface « Desktop » Barre d'outils Moteur de recherche Collections, collections partagées, corbeille Liste des références Filtres (auteurs, journaux, tag, mots clés auteur Détails, tag et annotations, références citées Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  14. 14. Créer sa bibliothèque de références Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  15. 15. Ajouter des références : via Mendeley Desktop Différentes stratégies : ● Ajout d'un document ou d'un répertoire de documents ● « Watch a folder », pour l'import automatique de PDF ● Ajout de références au format EndNote, BibTeX, RIS, etc. Ajout par « glisser-déposer » de fichiers PDF... ...et Mendeley extraira les descriptions du document PDF automatiquement Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  16. 16. Ajouter des références : utiliser l'import web 1 Un simple lien placé dans la barre d'adresse permet d'importer directement des résultats de recherche à partir des sites compatibles 2 Choisir les références dans la fenêtre dédiée, annoter, ajouter des tag Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  17. 17. Import web : installation et compatibilité http://www.mendeley.com/import Compatible avec Firefox, Chrome, Safari, Internet Explorer... Les principales sources d'information scientifique Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  18. 18. Synchronisation de sa bibliothèque de références Synchronisez votre bibliothèque Mendeley Dekstop avec votre compte en ligne Gestion et édition en ligne de vos références Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  19. 19. Si vous disposez d'un lot de fichiers PDF 1 Indiquez le dossier à importer contenant les PDF 3 Mendeley va chercher les informations décrivant les documents dans les bases de données 2 d'information scientifique L'importation se déroule automatiquement et les références correspondant aux documents PDF apparaissent Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  20. 20. Si vous venez de EndNote 1 Sélectionner les références à exporter Exporter en Xml, ou .txt avec le style RefMan(RIS) 2 Dans Mendeley, choisir le format d'import RIS ou EndNote Xml suivant le format d'export EndNote De la même manière, Mendeley peut importer des listes de références aux formats BibTeX, Zotero.sqlite, OVID,... Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  21. 21. Gérer sa bibliothèque de références Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  22. 22. Des fonctions de gestion simples et utiles Collection créées par défaut : ●Toutes les références ●Ajouts récents Triez rapidement vos listes en ●Mes favoris cliquant sur les en-têtes de colonne ●Références à vérifier ●Mes publications ●Publications non classées Affichez le PDF attaché à la référence pour lecture Créez vos propres collections Les références peuvent être marquées comme « à lire », « lues », « favorites » Filtrez vos listes de références de façon aisée Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  23. 23. Recherche incrémentielle et suggestion de recherche Recherche dans les références et les PDF de toutes les collections Suggestion de termes au court de la frappe Mise à jour de la liste de Mise en contexte et surlignage résultat au cour de la frappe des termes recherchés Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  24. 24. Utilisation avancée du moteur de recherche champs:terme à recherche Exemples : ● author:harnad ● keyword:Bacteria ● publication:nature ● tag:tools ● title:« open access » Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  25. 25. PDF : lecteur intégré + et recherche de mots-clés Outils d'exploitation avancée : notes, surlignage manuel, lecture plein écran, etc. Ouverture des PDF dans des onglet dédiés Surlignage du terme recherché dans le PDF Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  26. 26. PDF : surlignez et annotez vos documents Annotation (avec auteur et date) Notes générales Listes des annotations avec leurs liens pour une navigation aisée Passage surligné manuellement Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  27. 27. Classez et renommez automatiquement vos fichiers Tools > Option > File Organizer L'outil de gestion des fichiers et ses options Classement et nommage paramétrables Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  28. 28. PDF : surlignez, annotez, ajoutez des notes PDF (et autres fichiers) joints renommés Fichiers organisés automatiquement en arborescence Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  29. 29. Prenez soin de vos métadonnées : homogénéisation des noms de journaux, auteurs, tag, etc. 2 Mendeley modifie automatiquement les références en conséquence 1 Les entrées d'index peuvent être glissée-déposée les unes sur les autres pour homogénéiser leurs valeurs Passage surligné manuellement Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  30. 30. Citer en utilisant ses références Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  31. 31. Citer dans Word et OpenOffice 1/2 Cliquer sur « Insert Citation dans la barre d'outil Mendeley de Word 2 1 Placer son curseur à l'emplacement de l'appel de citation dans votre texte 3 Dans Mendeley, choisir la référence à citer Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  32. 32. Citer dans Word et OpenOffice 2/2 Cliquer sur « Send Citation to Word » 4 5 L'appel de citation est intégré au format choisi à l'emplacement du curseur Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  33. 33. Éditer une bibliographie dans Word ou OpenOffice Cliquer sur « insert Bibliography » 2 Choisir un style bibliographique Finaliser son texte avec Vous pouvez changer le style : tous les appels de citation le document se met à jour 1 Positionner son curseur à l'endroit où doit figurer la bibliographie 3 La bibliographie est générée automatiquement Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  34. 34. Produire une simple liste de références formatées Sélectionnez des références La liste est au format sélectionné Déplacez les dans votre document (« drag & drop ») Cela fonctionne aussi par copier-coller Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  35. 35. Un vaste choix de styles bibliographiques Ooo : « Choose Citation Style » Word : « Other citations from Mendeley » Recherchez et sélectionnez un style Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  36. 36. Utiliser LaTeX / BibTeX : options de synchronisation de la bibliothèque de références Tools > Options > BibTeX Prise en compte de caractères spéciaux Mise à jour automatique du fichier .bib Un ou plusieurs fichiers. On peut imaginer le mettre sur un dossier Clés BibTeX éditables si besoin partagé... référence par référence Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  37. 37. Partager, collaborer, s'intégrer à une communauté en gérant son identité numérique Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  38. 38. Rendre une collection publique Les critères de publication des collections sont paramétrables pour chacune d'entre elles indépendamment des autres Rendez vos collections publiques via « Edit Settings » D'autres usagers pourront s'abonner à vos collections publiques. Vos modifications seront répercutées dans les Mendeley Desktop des autres membres abonnées. Les membres abonnées à une collection sont visibles, ainsi que l'auteur d'une collection Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  39. 39. Créer une collection partagée pour collaborer Une collection partagée entre membres n'est visible uniquement que par ses membres. Vous pouvez inviter vos contacts à partager une collection que vous avez créée. Les références sont alors visibles et modifiables par tous les membres partageant la collection. Les fichiers PDF peuvent être mis en commun et annotés collaborativement. Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  40. 40. Compléter son profil et sa liste de publications : l'identité numérique du chercheur Liste des publications du chercheur, mise à jour via une collection Mendeley CV du chercheur Statistiques sur ce chercheur Contacts du chercheur Contacter ce chercheur Collections publiques du chercheur Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  41. 41. Mendeley : un réseau social pour les chercheurs ? “ We define social network sites as web- based services that allow individuals to (1) construct a public or semi-public profile within a bounded system, (2) articulate a list of other users with whom they share a connection, and (3) view and traverse their list of connections and those made by others within the system. ” Boyd, D.M., et N.B. Ellison. Social network sites: Definition, history, and scholarship. Journal of Computer-Mediated Communication 13, 2007, 210-230. Available from world wide web: <http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html>. Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  42. 42. Paramétrer la confidentialité de son profil Se tenir informé Plusieurs niveaux de confidentialité Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  43. 43. Valoriser son travail bibliographique et son expertise Créer par simple copier-coller une liste de publication mise à jour automatiquement Inclure un bouton vers son profil dans votre signature de courriel ou sur son blog de chercheur Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  44. 44. Trouver de l'aide Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  45. 45. Mendeley : participer, suivre l'évolution Suggérez Suivre les mises à jour Votez Etat Commentez Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  46. 46. Statistiques et sérendipité Données globales Articles les plus lus Données par disciplines > Auteurs les plus lus Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  47. 47. Questions ? Alain Marois 04.72.18.64.50 alain.marois@ec-lyon.fr Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
  48. 48. Ressources ● Hull, Duncan, Defrosting the Digital Library: A survey of bibliographic tools for the next generation web. [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web : <http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web>. Hull, Duncan, Steve R Pettifer, et Douglas B Kell. Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web. PLoS ● Comput Biol 4, Octobre 2008, e1000204+. Disponible sur le world wide web : <http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204> ● Mendeley Teaching Presentation [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web : <http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation> ● Reiswig, Jennifer. Mendeley. 98, Avril 2010, 193-194. PubMed Central Link. [cité 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web : <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/> ● Readwriteweb, Curt Hopkins Of. Mendeley Throws Open the Doors to Academic Data. The New York Times Avril 2010. [cité 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web : <http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html> ● Henning, Victor, et Jan Reichelt. Mendeley - A Last.fm For Research? Dans eScience, IEEE International Conference on, Vol. 0 of, 327- 328, [Los Alamitos, CA, USA]: IEEE Computer Society, 2008 Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
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