Your SlideShare is downloading. ×
0
Dimitri Brosens & Bart Goossens
Informatie & Datacentrum INBO
OMGAAN MET ONDERZOEKSDATA: INBO
2
Beheer van onderzoeksinformatie: PURE
PURE is een CRIS systeem
Persoonlijk overzicht
Onderzoeksoutput (publicaties, pres...
3
Beheer van onderzoeksinformatie: PURE
4
Beheer van onderzoeksinformatie: PURE
Grafiek van relaties
5
Beheer van ruwe data: Welke data
INBO onderzoeksdata
Observaties
Human observation &
Machine observation
Remote sensing
...
6
Beheer van ruwe data: Welke data
INBO onderzoeksdata
Verzameld materiaal
Roadkill & Afvangsten & Bevissing
Analyse data ...
7
INBO Referentiedata
Checklists
Referentielijsten naar voorkomen species in een bepaald
geografisch gebied
Rode lijsten
R...
8
Beheer onderzoeksdata
Observaties
Human observation
 NBN datamodel (Recorder6)
 SQL databank (Microsoft SQL server)
 ...
9
Vegetatieopnames
INBOveg
Webapplicatie met achterliggende databank
https://data.inbo.be/inboveg/ViewHome.form
Verzamel...
10
Labo data (Analyse, laboresultaten…)
–e-DNA
–Haarstalen
–Swabstalen
– Faeces
–Bodemstalen
- Waterstalen
 Laboratory in...
11
Beheer referentiedata
Checklists
Rode lijsten
Taxonomische lijsten
 INBO NAMESERVER (SQL server)
Geografische GIS data...
SD 5: Het INBO beheert gegevens en maakt ze toegankelijk.
Het INBO fungeert als draaischijf voor het gegevensbeheer. Daarb...
13
Data Publiceren
Onderzoeksinformatie
 Pure Portal (webservices)
Biodiversiteitsdata
• Primary Occurrence data & Checkl...
14
Data Publiceren
Andere manieren
• Dryad Data Digital Repository
• Flexibel ivm het data formaat
• Past in de “manuscrip...
15
Data Publiceren
Data policy
Voorgestelde richtlijnen
1 Alle data verzameld in opdracht van het (EV) INBO kunnen in prin...
INBO als data Publisher
INBO is data publisher in het GBIF netwerk
Publiceren via ITP van Darwin Core Archives
Ondersteuni...
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×

Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

210

Published on

Published in: Data & Analytics
0 Comments
0 Likes
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

No Downloads
Views
Total Views
210
On Slideshare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
0
Actions
Shares
0
Downloads
1
Comments
0
Likes
0
Embeds 0
No embeds

No notes for slide

Transcript of "Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)"

  1. 1. Dimitri Brosens & Bart Goossens Informatie & Datacentrum INBO OMGAAN MET ONDERZOEKSDATA: INBO
  2. 2. 2 Beheer van onderzoeksinformatie: PURE PURE is een CRIS systeem Persoonlijk overzicht Onderzoeksoutput (publicaties, presentaties, ….) Dienstverlening Projecten Activiteiten Adviseringsdocumenten Personeel en expertise Datasets
  3. 3. 3 Beheer van onderzoeksinformatie: PURE
  4. 4. 4 Beheer van onderzoeksinformatie: PURE Grafiek van relaties
  5. 5. 5 Beheer van ruwe data: Welke data INBO onderzoeksdata Observaties Human observation & Machine observation Remote sensing Vegetatieopnames INBOveg
  6. 6. 6 Beheer van ruwe data: Welke data INBO onderzoeksdata Verzameld materiaal Roadkill & Afvangsten & Bevissing Analyse data (DNA sequenties…) –e-DNA –Haarstalen –Swabstalen – Faeces –Bodemstalen - Waterstalen
  7. 7. 7 INBO Referentiedata Checklists Referentielijsten naar voorkomen species in een bepaald geografisch gebied Rode lijsten Rode lijst van de Zoogdieren Referentielijsten naar status en voorkomen in een bepaald geografisch gebied Geografische GIS data GIS (Kaartlagen) “Taxonomische lijsten” Catalogue of LIFE … Beheer van ruwe data: Welke data
  8. 8. 8 Beheer onderzoeksdata Observaties Human observation  NBN datamodel (Recorder6)  SQL databank (Microsoft SQL server)  Werkblad & Access (  ) Machine observation   Lifewatch applicaties   SQL databank   DATA warehouse Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer
  9. 9. 9 Vegetatieopnames INBOveg Webapplicatie met achterliggende databank https://data.inbo.be/inboveg/ViewHome.form Verzameld materiaal Roadkill & Afvangsten & Bevissing -> SQL databank (Microsoft server) Werkblad & Access () Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer
  10. 10. 10 Labo data (Analyse, laboresultaten…) –e-DNA –Haarstalen –Swabstalen – Faeces –Bodemstalen - Waterstalen  Laboratory information management system (LIMS) Beheer van ruwe data: Centraal data beheer
  11. 11. 11 Beheer referentiedata Checklists Rode lijsten Taxonomische lijsten  INBO NAMESERVER (SQL server) Geografische GIS data  GIS data server (GIS team) Beheer van ruwe data: Centraal data beheer
  12. 12. SD 5: Het INBO beheert gegevens en maakt ze toegankelijk. Het INBO fungeert als draaischijf voor het gegevensbeheer. Daarbij zoekt het INBO naar geschikte manieren om aan gegevensverzameling te doen en om gegevens te ontsluiten en toegankelijk te maken. 12 Beheer van ruwe data: Data Publiceren
  13. 13. 13 Data Publiceren Onderzoeksinformatie  Pure Portal (webservices) Biodiversiteitsdata • Primary Occurrence data & Checklists • Standaardiseren • Darwin Core • Metadata optimaliseren • EML • Publiceren • IPT (integrated publishing toolkit) • Darwin Core Archives
  14. 14. 14 Data Publiceren Andere manieren • Dryad Data Digital Repository • Flexibel ivm het data formaat • Past in de “manuscript indienen“workflow • Gegevens particulier beschikbaar tijdens de peer review • Toestaan van beperkte embargo tijd • Gegevens zijn gekoppeld van en naar gespecialiseerde data repositories (vb. GBIF of GenBank ) . • Wijst Digital Object Identifiers ( DOI ) aan gegevens • Bevordert de zichtbaarheid van gegevens • Data gepubliceerd onder CC0, geen wettelijke belemmering om data te hergebruiken • Inhoud wordt actief beheerd . • Datafiles kunnen bijgewerkt worden indien nodig • Bewaring van de data op lange termijn ... • Webservices • Pure webservices • GBIF webservices • In volle ontwikkeling
  15. 15. 15 Data Publiceren Data policy Voorgestelde richtlijnen 1 Alle data verzameld in opdracht van het (EV) INBO kunnen in principe ontsloten worden, met toepassing van de uitzonderingsgronden zoals bepaald in het decreet betreffende openbaarheid van bestuur (2004-03-26, Artikel 15). 2 Data die geassocieerd zijn met een wetenschappelijk artikel worden ontsloten bij publicatie. 3 Ruwe data worden ontsloten indien technisch haalbaar. Onderzoekers kunnen gebruik maken van een embargo tot 18 maanden na het verzamelen. Sommige projecten kunnen een versnelde (= geen embargo) of verplichte data- ontsluiting vereisen. 4 Data worden steeds ontsloten als open data, zoals gedefinieerd door de Open Knowledge Foundation.
  16. 16. INBO als data Publisher INBO is data publisher in het GBIF netwerk Publiceren via ITP van Darwin Core Archives Ondersteuning door het Belgisch Biodiversiteitsplatform (GBIF node) • Belgische GBIF Data Publishers 16
  1. A particular slide catching your eye?

    Clipping is a handy way to collect important slides you want to go back to later.

×