2 1. programa general y literatura

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2 1. programa general y literatura

  1. 1. MODULO 2.2. INTRODUCCION A LA BIOLOGIA DE ORGANISMOS FUNGOSOS Dra. María de Jesús Yáñez Morales: Tutor Noviembre, 2013 yanezmj@colpos.mx. Ofna. 118, Lab. 128 CP-Montecilllo: 595-95-20200, ext. 1663 PROGRAMA GLOBAL: Principal objetivo: Biología (Sistemática), Método Científico, Diagnóstico LIBRO GUIA: Crous, P.W., Verkley, G.J.M., Groenewald, J.Z. & Samson, R.A. 2009. Fungal Biodiversity. CBS. Laboratory manual series. CBS - KNAW - Fungal Biodiversity Centre. Utrecht, The Netherlands. 269 pp. OTRAS REFERENCIAS EN: CBS-Fungal Biodiversity Centre http://www.cbs.knaw.nl/ http://studiesinmycology.org/content/by/year APS: http://www.apsnet.org/apsstore/shopapspress/Pages/default.aspx www.mycolog.com Etc. -OBJETIVOS GENERALES DEL CURSO: 1. Introducción al estudio científico de los organismos fungosos 2. Identificar las estructuras morfológicas que integran el ciclo biológico de los organismos fungosos facultativos, biotróficos y saprofíticos. 3. Adquirir el conocimiento básico para el manejo de claves taxonómicas 4. Adquirir parte del conocimiento básico que integra el “diagnóstico” fitopatológico de organismos fungosos. CAPITULO I. Generalidades e Introducción -OBJETIVO ESPECIFICO: Ubicarse en la biodiversidad/diversidad taxonómica de organismos fungosos Aplicación de la Sistemática y sus subdisciplinas Literatura de consulta: 1. Agrios, G.N. 2005. Plant Pathology. 5th. Ed. Academic Press Inc. USA. 635 p. 2. Kendrick, B. 2000. The Fifth Kingdom. Second Ed. Mycologue Publications. Waterloo, Ontario. Canada. 374 p. 3. Kendrick, B. 2012. The Fifth Kingdom. www.mycolog.com 1
  2. 2. 4. Kirk, P.M., Cannon, P.F., David, J.C. and Stalpers, J.A. 2008. Dictionary of the Fungi. CAB International. Oxon, UK. 655 p. 5. Oliver, R., and Schweizer, M. 1999. Molecular Fungal Biology. Cambridge University Press. UK. 377 p. 6. Redfern, R. 2002. Orígenes. La Evolución de los Continentes, Los Océanos y la Vida en Nuestro Planeta. Ediciones Paidós Ibérica. Ed. Paidós. Barcelona. Buenos Aires. Italia. 360 p. 7. Ulloa, M., y Hanlin, R.T. 2006. Nuevo Diccionario Ilustrado de Micología. APS Press. The American Phytopathological Society. St. Paul, Minnesota. USA 672 p. 8. www.cornell.edu (biodiversidad de hongos), etc. 9. www.mycobank.org/Biolomics.aspx?Table=Mycobank 10. www.cbs.knaw.nl/ CAPITULO II. Reino de los Hongos Verdaderos Eumycota: “ANAMORFOS” One fungus one name, one fungus what name? one fungus which gene? http://www.cbs.knaw.nl/index.php/news/98-news-extra/104-cbs-springsymposium-one-fungus-which-genes-2 -OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1. Definir a los hongos verdaderos 2. Identificar las estructuras morfológicas vegetativas y “asexuales” de anamorfos. 3. Ubicar los anamorfos dentro de los organismos fungosos 4. Analizar su biología e importancia económica y científica en agricultura (ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes). Literatura de consulta: Alexopoulos, C.J., Mims, C.W., and Blackwell, M. 1996. Introductory Mycology. Fourth Ed. John Wiley & Sons, Inc. USA. 869 p. Barnett, H. L. and Hunter, B.B. 1998. Illustrated Genera of Imperfect Fungi. APS Press. The American Phytopathology Society. St. Paul, Minnesota. USA. 218 p. Boerema, G.H., Gruyter, J., Noordeloos, M.E., and Hamers, M.E.C. 2004. Phoma Identification Manual. CABI Publishing. CAB International. UK. 470 p. 2
  3. 3. Borkovich, K., and Ebbole, D.J. (eds). 2010. Cellular and Molecular Biology of Filamentous Fungi. American Society for Microbiology Press. USA. 788 p. Cole, G.T., and Samson, R.A. 1979. Patterns of Development in Conidial Fungi. I. Imperfect Fungi. Pitman Publishing. USA. Toronto, CA. 190 p. Crous, P.W. and Braun, U. 2003. Mycosphaerella and its anamorphs. 1. Names published in Cercospora and Passalora. CBS Biodiversity Series 1. Centraalbureau voor Schimmelcultures. Utrecht, The Netherlands. 571 p. Deacon, J. 2006. Fungal Biology. Fourth Ed. Blackwell Publishing. England. UK. 371 p. Ellis, M.B. 1971. Dematiaceous Hyphomycetes. CAB International. Kew, Surrey, England. 608 p. Ellis, M.B. 1976. More Dematiaceous Hyphomycetes. CAB International. Kew, Surrey, England. 512 p. McNeill, J., Barrie, F. R., et al. (Eds.). 2006. International Code of Botanical Nomenclature (ICBN) (Vienna Code). Seventeenth International Botanical Congress Vienna, Austria, July 2005. 568 p. DESDE International Botanical Congress in Melbourne, Australia in July 2011, Cambió a: International Code of Nomenclature for algae, fungi and plants Griffin, D.H. 1994. Fungal Physiology. Second Ed. Wiley-Liss. New York, NY. USA. 458 p. Noyd, R.K. 2000. Mycology Reference Cards. American Phytopathology Society. St. Paul, Minnesota. USA. 10 p. Seifert, K., Morgan-Jones, G., Gams, W. and Kendrick, B. 2011. The Genera of Hyphomycetes. CBS Biodiversity Series 9. 997 p. Simmons, E.M. 2007. ALTERNARIA. An Identification Manual. CBS. Fungal Biodiversity Centre. Utrecht, the Netherlands. 773 p. Sutton, B.C. 1980. The Coelomycetes. Fungi Imperfecti with Pycnidia Acervuli and Stromata. Commonwealth Mycological Institute. Kew, Surrey, England. 696 p. CAPITULO III. Reino Eumycota Phylum Ascomycota: “Holomorfos” = anamorfo + “teleomorfo” Ahora: One fungus one name 3
  4. 4. -OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1. Identificar las estructuras morfológicas “sexuales” de teleomorfos. 2. Clasificar taxonómicamente los tipos de ascoma. 3. Analizar la biología del holomorfo, y su importancia económica y científica en Agricultura (ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes). “Tema” de estudio Bases Biológicas Taphrinomyctes Saccharomycetes “Subtemas” Reproducción Sexual. El Holomorfo. Ciclos biológicos. Morfología. Ascas desnudas. Taphrina deformans Ascas desnudas. Levaduras. Ascomycetes Leotiomycetidae ¡!! (chaesmothecia: cenicilla) Eurotiomycetidae y Onygenales (cleistotecios) Sordariomycetidae (peritecios) Dothideomycetidae (pseudotecios) Leotiomycetidae, Pezizomycetidae (apotecios) Lecanoromycetidae (líquenes): apotecios, etc. Laboulbeniomycetidae (peritecios) Entomopatógenos Control Biológico Literatura de consulta: Ainsworth, G. C., Sparrow, F.K., and Sussman, A.S. (eds.). 1973. The Fungi. An Advanced Treatise. Vol. IVA. Academic Press. New York – London. 621 p. Dennis, R.W.G. 1978. British Ascomycetes. J. Cramer. Vaduz. Germany. 585 p. Domsch, K.H., Gams, W., and Anderson, T.H. 1980. Compendium of Soil Fungi. Academic Press. New York, London, England. 859 p. Vol. 2. Domsch, K.H., Gams, W. and Anderson, T.H. 2007. Compendium of Soil Fungi. Second Edition. Academic Press. New York, London, England. 672 pp. Hanlin, R.T. 1992. Illustrated Genera of Ascomycetes. Vol. I. The American Phytopathology Society. St. Paul, Minnesota. USA. 263 p. Hanlin, R.T. 1998. Combined Keys to Illustrated Genera of Ascomycetes. Volumens I & II. APS Press. USA. 113 p. 4
  5. 5. Hanlin, R.T. 1998. Illustrated Genera of Ascomycetes. Vol. II. APS Press. USA. 268 p. Reynolds, D.R., and Taylor, J.W. 1993. The Fungal Holomorph: Mitotic, Meiotic and Pleomorphic Speciation in Fungal Systematics. CAB International. UK. 375 p. Sivanesan, A. 1984. The Bitunicate Ascomycetes and their Anamorphs. J. Cramer. Germany. 701 p. Wingfield, M.J., Seifert, K.A., and Webber, J.F. 1999. Ceratocystis and Ophiostoma. Taxonomy, Ecology, and Pathogenicity. APS Press. The American Phytopatological Society. St. Paul, Minnesota. USA. 293 p. Phylum Basidiomycota Reproducción sexual (con o sin basidiocarpo) -OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1. Identificar las estructuras morfológicas del basidiocarpo 2. Clasificar taxonómicamente los tipos de basidios. 3. Analizar la biología, ecología, e importancia económica y científica en agricultura (ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes). “Tema” de estudio “Subtemas” Agaricomycotina Bases biológicas (holomorfo). Dacrymycetes, Tremellomycetes, Agaricomycetes Glomeromycota Endo y Ectomicorrizas (asexual) Ascomycetes y Agaricomycetes (sexual) Pucciniomycetes Royas Ustilaginomycotina Carbones Otros Phyla de hongos verdaderos: Zygomycota ¡!! Mohos y pudriciones suaves Esporas con un flagelo posterior: Chytridiomycota y Blastocladiomycota 5
  6. 6. Literatura de consulta: Ainsworth, G.C., Sparrow, F.K., and Sussman, A.S. (eds.). 1973. The Fungi. An Advanced Treatise. Vol. IVB. Academic Press. New York – London. 504 p. Cummins, G.B., and Hiratsuka, Y. 2003. Illustrated Genera of Rust Fungi. APS Press. The American Phytopathology Society St. Paul, Minnesota. USA. 225 p. Fischer, G.W., and Holton, Ch.S. 1957. Biology and Control of the Smut Fungi. The Ronal Press Co. NY. USA. Herrera, T., y Ulloa, M. 1998. El Reino de los Hongos. Universidad Nacional Autónoma de México. Fondo de Cultura Económica. México. 552 p. Sneh, B., Burpee, L., and Ogoshi, A. 1991. Identification of Rhizoctonia Species. APS Press. St. Paul, Minnesota. USA. 135 p. Vánky, K. 2002. Illustrated Genera of Smut Fungi. APS Press. The American Phytopathology Society. St. Paul, Minnesota. USA. 238 p. Vánky, K. 2012. Smut Fungi of the World. APS Press. The American Phytopathology Society. St. Paul, Minnesota. USA. 1458 p. CAPITULO IV. Reino de los Hongos Inferiores -OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1. Comparar la unidad del talo “amoeba” con la célula de otros organismos fungosos. 2. Identificar las estructuras morfológicas de reproducción asexual y sexual. 3. Analizar la biología, ecología, e importancia económica y científica en agricultura (ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes). . “Tema” de estudio “Subtemas” Myxogastromycetidae Hongos mucilaginosos. Plasmodiophoridae Biotróficos endoparásitos. Literatura de consulta: 6
  7. 7. Herrera, T., y Ulloa, M. 1998. El Reino de los Hongos. Universidad Nacional Autónoma de México. Fondo de Cultura Económica. México. 552 p. Stephenson, S.L., and Stempen, H. 1994. Myxomycetes. A Handbook of Slime Molds. Timber Press. Portland, Oregon. USA. 183 p. www.eumycetozoa.com www.mycolog.com www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=taxonomy CAPITULO V. Stramenopiles: OOMYCETES -OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1. Identificar las estructuras morfológicas vegetativas, asexuales, y sexuales. 2. Analizar la filogenia del reino, y evolución de especies. 3. Analizar su biología e importancia económica y científica en agricultura (ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes). “Tema” de estudio “Subtemas” Bases Biológicas Reproducción. Ciclos biológicos. Morfología. Pythiales Pythium spp. Peronosporales Phytophthora spp. Peronosporales Cenicillas (vellosa) Literatura de consulta: Dick, M.W. 2001. Straminipilous Fungi. Kluwer Academic Publishers. The Netherlands. 670 p. Erwin, D.C., and Ribeiro, O.K. 1996. Phytophthora Diseases Worldwide. APS Press. USA. 562 p. Gallegly, M. E. and Hong, Ch. 2008. Phytophthora: Identifying Species by Morphology and DNA Fingerprints. APS Press. USA. 168 pp. Spencer, D.M. 1981. The Downy Mildews. Academic Press Inc. New York, NY. USA. 636 pp. 7
  8. 8. Spencer-Phillips, P. and Jeger, M. 2004. Advances in Downy Mildew Research. Volume 2. Kluwer Academic Publishers. Dordrecht, The Netherlands. 296 pp. Spencer, D.M. 2006, 2008. The Downy Mildews. Streets, R.B. 1972. The Diagnosis of Plant Diseases. The University of Arizona Press. Tucson, Arizona. 11.11 p. Ristaino, J.B. 2011. Key for Identification of Common Phytophthora Species. APS Press. USA. CD. van der Plaats-Niterink, J. 1981. Monograph of the genus Pythium. Studies in Mycology. No. 21. Centraalbureau voor Schimmelcultures, Baarn. Netherlands. www.biolib.cz/en/taxon/id104800/ http://pythium.plantbiology.msu.edu/ CAPITULO VI. DNA Código de Barras (caracterización molecular) one fungus which gene? http://www.cbs.knaw.nl/index.php/news/98-news-extra/104-cbs-springsymposium-one-fungus-which-genes-2 -OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1. Usar la biología molecular en taxonomía de hongos 2. Identificar hongos por análisis filogenéticos: “concepto de especie filogenética” 3. Secuenciación (en dos direcciones) de un gene hasta multilocus análisis Análisis básico: PCR-ITS de genes rRNA. Regiones Internas ITS1, ITS2 Etc., etc. Literatura de consulta de aplicaciones y conceptos básicos: Ahrens, U., and Seemüller, E. 1992. Detection of DNA of plant pathogenic mycoplasmalike organisms by polimerasa chain reaction that amplifies a sequence of the 16S rRNA gene. Phytopathology 82: 828-832. 8
  9. 9. Crous, P.W., Verkley, G.J.M., Groenewald, J.Z. & Samson, R.A. 2009. Fungal Biodiversity. CBS. Laboratory manual series. CBS - KNAW - Fungal Biodiversity Centre. Utrecht, The Netherlands. 269 pp. DNA Barcode of Life. www.barcoding.si.edu http://www.boldsystems.org./views/login.php www.ncbi.nlm.nih.gov/ White, T. J., Bruns, T., Lee, S., and Taylor, J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: PCR Protocols: A guide to Methods and Applications. MA Innis, DH Gelfand, JJ Sninsky, and TJ White (eds.). Academic Press, St. Diego, CA. USA. p 315-322. Etc., etc. ********************************* F I N ******************************* 9

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