Curso microbiología
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Curso microbiología Curso microbiología Presentation Transcript

  • CURSO DEMICROBIOLOGÍAUNIVERSIDAD TÉCNICA DEL NORTE UTN
  • DESARROLLO HISTORICO
  • DESARROLLO HISTÓRICO El hombre utiliza a los microorganismos desde los inicios de la civilización, en actividades cotidianas como:1. Preparación del pan2. Preparación del vino y vinagre3. Preparación de cerveza.4. Obtención de etanol.No conoce sobre la existencia de microorganismos
  • DESARROLLO HISTÓRICO Construcción de lentes en la antigua Babilonia. Varrón Reatino, afirma que en los lugares pantanosos, se originan pequeños animalitos que no se ven a simple vista, se difunden por el aire y se infiltran en el organismo humano a través de la boca y fosas nasales provocando graves enfermedades.
  • DESARROLLO HISTÓRICO Siglo XI (Persia), existía la práctica de frotarse la piel con polvos de costras variólicas. Girolano Francostoro (siglo XVI), explica la aparición de enfermedades como resultado de la acción de diminutos embriones invisibles de orígen animal. Eusebio Valli de Lucca, se inoculó pus de bubón de peste y de la pústula de la viruela
  • DESARROLLO HISTÓRICO (Antony van Leeuwenhoek, 1632— 1723), descubrió bajo la lente de su microscopio rudimentario, seres diminutos. Solo en 1776 pudo observar por primera ves a las bacterias. 1635—1703 Robert Hooke, descubre las primeras células en cortes de corcho.
  • DESARROLLO HISTÓRICO Carlos Linneo (XVIII), no se atrevió a clasificar a los microorganismos en su sistema del mundo vegetal y los apartó en un grupo llamado “caos”. Lázaro Spalanzani y Martín Terejovski, confirmaron el hecho de que los microorganismos no se desarrollan en medios estériles, sino, en medio propicios.
  • DESARROLLO HISTÓRICO En el Cáucaso a las niñas se les pinchaba con agujas humedecidas en líquido de úlceras variólicas. En el siglo XIX, se realizan una serie de experimentros con los microorganismos. Pasteur, ayuda a solucionar el problema de los vinicultores. Desarrolla el método de pasteurización.
  • Aportes de Pasteur Inicio real de la Microbiología. 1857, Describe el proceso de la fermentación. 1860, Desecha la teoría de la Generación espontánea. 1865, Resuelbe el problema de la acilación del vino y cerveza. 1868, Estudio de las enfermedades del gusano de seda. Fin de las Epizootias
  • DESARROLLO HISTÓRICO 1881, Desarrollo de las vacunas preventivas, contra el ántrax, rabia, el cólera y viruela. Estableció las bases de la Inmunología. (J. В. Demazier, 1783—1862), Describe la estructura de levaduras que proliferan sonre la cerveza.
  • DESARROLLO HISTÓRICO R. Koch, 1843—1910, descubre el agente causante de la tuberculosis y de el cólera. 1845—1916 , Mechnikov, establece las bases de la Microbiología médica.Teoría fagocitaria de la inmunidad 1856—1953 Vinogradski, introdujo el principio microecológico en la investigación de microorganismos. Aisló Clostridium pasteurianum bacteria fijadora de N2
  • DESARROLLO HISTÓRICO М. Beijerinck, 1851—1931, aisló Azotobacter chroococcum .Estudió el proceso de la denitrificación, reducción de sulfatos 1892 . Ivanovskiy, descubre los virus (VMT)
  • Microbiología del siglo XX А. Kluyver 1888—1956 , С. van Niel, 1897–1985 desarrollo de la Teoría de la unidad bioquímica de la vida.
  • Ubicación de los microroganismos enel sistema del mundo vivo Е. Haeckel, 1834—1919, propone ubicar a los microroganismos en un nuevo reino llamado Protista. R. Stanier, 1916—1982 y С. van Niel, establecieron las diferrencias entre células eucariotas y procariotas.
  • Los microorganismos como células PROCARIOTAS
  • Diferencias entre procariotas y ecuariotasCaracte Célula procariota Célula eucariota rísticaOrganiz Nucleoideo (ADN no Núcleo (ADN seprado delación separado del citoplasma por citoplasma por una membrana),del una membrana), compuesto que continen más de unmaterial de un solo cromosoma. La cromosoma, división del núcleogenético mistosis está asudente mediante mitosis.Localiza En nucleoides, plásmidos, no En el núcleo y en algunosción del seprados por una membrana organelosADN elemental
  • Diferencias entre procariotas y ecuariotasCaracterística Procariota EucariotaOrganelos Ausentes PoseencitoplasmáticosRibosomas en Tipo 70S Tipo 80Sel citoplasmaMovimiento Ausente Se observa concitoplasmático frecuencia
  • Diferencias entre procariotas y ecuariotasCaracterística Procariota EucariotaPared celular En la mayoría No hay poseen peptidoglicanos. peptidoglicanosFlagelos Formado por Tipo 80SCada unidades una dispone de proteicas microtúbulos dispuestas en dispuestos en 9- espiral 9-2 grupos.
  • Sistemática R. Whittaker , propuso un sistema donde todos los seres vivos que poseen estructura celular están distribuidos en cinco reinos. Los procariotas organizados en dos reinos, Monera y Protista. Los eucariotas en tres: Plantae, Fungi y Animalia.
  • RASGOS DE LOS PROCARIOTAS Sus membrana plasmáticas carecen de esteroles, salvo los micoplasmas (pero en este caso los esteroles proceden del hospedador eucariótico al que parasitan), algunas especies de cianobacterias y de bacterias melitotrofas. La movilidad no es universal, pero muchas bacterias se mueven en medios acuáticos debido a unas estructuras llamadas flagelos, que nada tienen que ver con los flagelos eucarióticos.
  • RASGOS DE LOS PROCARIOTAS Las eubacterias (dominio Bacteria) poseen, salvo los micoplasmas, una pared celular a base de una peptidoglucano (una macromolécula que no existe en eucariotas). Muchas arqueas (dominio Archaea) poseen pared celular, diferente a las del dominio Bacteria.
  • TamañoEucariotas Tamaño lineal enunicelulares μmDiatomeas 100ProtistassuperioresAlgas verdes 2-10ChlorellaLevaduras 6-10Saccharomyces
  • TamañoOrganismos Tamaño lineal enprocariotas μmAchromatium 5-33х15-100oxaliferumBeggiatoa alba 2-10х1-50Cristispira pectinis 1,5х36-72Macromonas mobilis 6-14х10-30Thiovulum majus 5-25Spirochaeta plicatilis 0,2-0,7х80-250
  • TamañoOrganismos Tamaño lineal enprocariotas μmBacillus subtilis 0,7-0,8x2-3Escherichia coli 0,3-1х1-6Staphylococcus 0,5-1,0aureusThiobacillus 0,5х1-3thioparusRickettsia prowazeki 0,3-0,6x0,8-2Mycoplasma 0,1х0,25mycoides
  • TamañoVirus Tamaño lineal en μmMosaico del tabaco 0,02x0,3Antrax bobino 0,26Gripe 0,1Fago T2 0,06x0,2OX174 0,025Satélite viral 0,018
  • Tamaño Losmás pequeños de los organismos procariotas estudiados son los micoplasmas 0,1–0,15 μm, que contienen cerca de 1200 moléculas de proteínas que realizan más de 100 reacciones fermentativas que garantizan la capacidad vital del microorganismo.
  • Tamaño El tamaño de la mayoría de los virus se encuentra entre 16-200 nm, son visibles solo con el microscopio electrónico. El tamaño de los organismos está estrechamente ligado con su estructura, el límite inferior está ligado al espacio necesario para el empaquetamiento del sistema que garantiza la existencia independiente del organisnos.
  • Tamaño El límite superior está determinado por la relación entre la superficie corporal y el volúmen. Al incrementarse el tamaño celular la superficie incrementa al cuadrado, mientras que el volumen al cubo. En los microorganismos la relación superficie volúmen es grande, razón por la que su metabolismo en relación a la unidad de masa, es considerablemente mayor al de los macroorganismos.
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA tipo de componente Porcentaje sobre peso seco proteína 55.0 ARN 20.5 ADN 3.1 Lípidos 9.1 Lipopolisacárido 3.4 Peptidoglucano 2.5 Glucógeno 2.5 total macromoléculas: 96.1 Pequeñas moléculas 2.9 orgánicas: Iones inorgánicos: 1.0
  • Particularidades Las macromoléculas constituyen la porción mayoritaria de la masa celular (96%); Las proteínas representan más de la mitad de esta cantidad; Las bacterias poseen una proporción de ARN superior a la de los eucariotas; La mayor parte de los compuestos son semejantes a los de eucariotas, pero encontramos dos que son exclusivas de los procariotas: lipopolisacárido (exclusivo de Gram-negativas); peptidoglucano (presente en eubacterias Gram-positivas y Gram- negativas.
  • MICROORGANISMOS Y ORIGEN DE LA VIDA
  • CAP. IINOMENCLATURA Y CALSIFICACIÓN
  • Estructura de la célula Procariota Variedades morfológicas: Basado en, forma y tamaño celular, división celular, inclusiones citoplasmáticas, estructura de la pared celular. Tipo de formas diferenciadas que aparecen en el ciclo vital
  • VARIEDADES MORFOLÓGICAS Morfología bacterianaEsféricas Bastonadas Curvas Filiformes Micrococos Bacterias Vibriones SulfobacteriasDiplococos Bacilos Espirilos Ferrobacterias Sarcinas Clostridioss Espiroquetas Rikettsias EstreptococosTetracocoss Estafilococos
  • VARIEDADES Variedades fisiológicas: Modos de obtener energía, fuentes de nutrientes, relación frente al oxígeno molecular y factores del medio ambiente como: luz, pH, temperatura, humedad. También los mecanismos genéticos de su evolución
  • Micrococos Son bacterias saprofitas aeróbicas, gram positivas, que habitan en el agua, el aire y el suelo. Soportan elevadas concentraciones salinas y son pigmentadas. Son células aisladas pertenecientes a:1. Micrococus luteus.2. M. roseus.3. M. varians
  • Sarcinas Sus células se dividen en tres planos perpendiculares, formando paquetes de 8 células. Son anaerobios estrictos, con alta resistencia a la acidez. Están presentes en el barro, heces y contenidos estomacales
  • Estreptococos Contiene especies homofermentativas, con hábitats muy diversos. Algunas especies son patógenas (caries). Otras son de utilidad en la industria de los lácteos. Son bacterias gram positivas
  • Formas de organismos procariotas Las formas bacterianas pueden ser: Esféricas, cilindricas o espirales. Existen formas individuales, filamentosas o colonias. Las formas esféricas se llaman cocos, despues de la división pueden permanecer unidos, si la división ocurre en un solo plano forman Diplococos, Estreptococos; si lo hacen en varios planos forman Sarcinas
  • Colonias bacterianas
  • Formas de organismos procariotas Bacterias de forma cilindrica, se llaman bacilos, si forman cadenas, se denominan estreptobacilos ( 1-5). Bacterias espirales se llaman espirilos (varias vueltas de espiral) y Vibriones si tienen forma de bacilos curvos ( 6-8). Procariotas de forma anular, cerrada o abierta en dependencia de la estapa de desarrollo (9).
  • Formas de organismos procariotas
  • Bacillus turingiensis
  • Bacterias No forman esporas, este es el caso de:1. La Tifoidea,2. Paratifoidea.3. Disentría.4. Tuberculosis.Pueden ser: diplobacterias y estreptobacterias.
  • Bacilos Son microorganismos que poseen un amplio metabolismo que forman esporas, tales como:1. Bacilos del Heno.2. Carbunco.3. Tétanos.4. B. thuringiensisPueden ser diplobacilos y estreptobacilos
  • Clostridios Bacterias Gram negativas, esporuladas, con bajo contenido de CG. Carecen de sistema citocrómicos. La energía la obtienen de la fosforilación del sustrato. Son anaerobios de suelos. Ejemplo el Clostridium botulinum
  • Rickettsias Organismos que por su tamaño se hallan entre los virus y bacterias. Son parásitos obligados, poco peligrosos. Existen 50 especies, que habitan en el tubo digestivo, glándulas salivales, de piojos chinches y garrapatas. Son causantes del tifus y de la fiebre manchada.
  • Medio de cultivo Sistema dinámico donde la materia viva interactúa con un componente abiótico que presenta alta actividad biológica (nutrientes: C- N-P, en forma de proteínas, hidratos de carbono, lípidos y un componente mineral integrado por Na, K, y microelementos), bajo condiciones controladas, que garantizan un equilibrio en la interacción.
  • MEDIOS DE CULTIVO Los nutrientes que requieren los microorganismos son: agua, carbohidratos, nitrógeno, fósforo, azufre, calcio, cobre, etc. También es necesario brindarle las condiciones ambientales adecuadas de luz, temperatura, oxigenación, humedad, etc. Las bacterias crecen a 37ºC y un pH de 6.5-7.5 y los hongos a 27°C y un pH de 4.5-6. Para cultivar a los microorganismos es necesario el uso de medios de cultivo.
  • Clasificación 1.Por su consistencia:a. Líquidos: también se llaman caldos de cultivo, no contienen agar y se preparan en matraces pequeños.b. Semisólidos: contienen 0.5% de agar y se preparan en matraces pequeños.c. Sólidos: contienen de 1.5 a 2% de agar y se preparan en cajas petri (placa)o en tubos de ensayo.
  • Medios de cultivo  Recipientes con medios de cultivo
  • Clasificación2.Porsucomposición:a. Definido: se conoce su composición exacta, se utiliza cuando ya se conocen los microorganismos que se van a cultivar.b. Complejo: no se conoce su composición, pueden tener sangre, leche, extracto de levadura o carne; se utiliza cuando no se conocen a los microorganismos o no se conocen sus requerimientos nutricionales.c. Mínimo: es un medio definido que proporciona solo los nutrientes necesarios.
  • Clasificación3.Por su función:a. Selectivos: promueve o inhibe el crecimiento de los microorganismos.b. Diferenciales: permiten distinguir entre diferentes tipos de microorganismos.c. De enriquecimiento: contiene factores de crecimiento, un nutriente esencial que el microorganismo no puede sintetizar.
  • Clasificación
  • Tipos de medios de cultivo Los medios de cultivo pueden ser: Generales y selectivos. Los medios de cultivo generales, se emplean para garantizar el crecimiento masivo de la gran mayoría de microorganismos presentes en una muestra, indistintamente de su morfología y fisiología. Estos cultivos se emplean para conocer la diversidad microbiana existente en una muestra objeto de estudio. Medios de cultivo selectivos, son medios especializados cuya composición garantiza el crecimiento de una sola especie de microorganismos, por disponibilidad o ausencia de un cierto componente específico que determina su capacidad metabólica característica.
  • Características Alta asimilación de sus componentes (nutrientes semi digeridos, procesados). Relación de macro y micronutrientes balanceada. Propiedades físico- químicas ideales para garantizar el crecimiento microbiano. (conductividad eléctrica, pH, salinidad, temperatura, consistencia, humedad) Disponibilidad de estimulantes de crecimiento. Pureza y asepsia. Elevado costo Limitada disponibilidad.
  • Preparación de medios La base para su elaboración es un medio deshidratado, un medio que está en polvo al cual hay que disolver en agua y esterilizar.
  • Preparación 1. Pesar los medios de cultivo Bacterias: 23 g de agar nutritivo para un litro de agua destilada Hongos: agar, dextrosa y papa y extracto de levadura para un litro de agua destilada. 2. Colocar el medio de cultivo en polvo en un matraz erlenmeyer y agregar agua destilada. 3. Calentar en la parrilla de agitación hasta que el medio este totalmente cristalino.
  • Preparación 4. Retirar de la parrilla y colocar un tapón hecho con algodón en vuelto en gasas. El tapón debe quedar fijo pero no apretado. 5. Colocar el medio en la autoclave y esterilizar a 121°C durante 20 minutos.
  • Preparación6. Pasados los 20 minutos sacar el medio de cultivo y dejar enfriar solo un poco. OJO: en el caso del medio de cultivo para hongos dejar enfriar hasta los 45°C y agregar el antibiótico, es decir la gentamicina (ampolleta). De la gentamicina necesitamos 1ml para un litro de medio.
  • Preparación A manera de ejemplo citamos el medio de cultivo para bacterias reductoras de Fe y Mn: (NH4)2SO4----------1,5g K2HPO4--------------0,05g KCl---------------------0,05g MgSO4.7H2O-------0,05g Ca(NO3)2.4H2O--- 0,01g H20 destilada------- 1000ml. Después de la esterilización el medio se deja enfriar 2-3 días, para la saturación con CO2 y oxígeno.
  • Preparación7. Vaciar el medio de cultivo en cajas petri dentro de un campo estéril. En cada caja vaciar aproximadamente 30ml.
  • Distribución del medio
  • Esterilización Otra de las técnicas empleadas en microbiología es la esterilización. Esterilizar es eliminar todos los microorganismos presentes en nuestro material. Todos los aparatos, superficies y materiales utilizados para cultivar deben ser esterilizados. Para la esterilización se pueden emplear los siguientes métodos y/o agentes:1.Métodosfísicos:a. Calor húmedo: autoclave
  • Esterilización  Equipos empleados
  • Esterilización  Para la esterilización se pueden emplear los siguientes métodos y /o agentes: 1. Métodos físicos: b. Calor seco: estufa y flameado a la llama
  • Esterilización  Para la esterilización se pueden emplear los siguientes métodos y /o agentes: 1. Métodos físicos: c. Rayos ultravioleta d. Filtración
  • Esterilización  2. Métodos químicos: a. Hipoclorito de sodio, cloro comercial al 10% b. Alcohol etílico al 70% c. Cloruro de benzalconio
  • Siembra mediante diluciones Para la siembra mediante diluciones, se toman 100g del sustrato contaminado y se disuelven en 1000 ml de agua destilada. Se agita profusamente y de la solución materna, se toma con ayuda de una pipeta estéril un ml, que se transfiere a un tubo de ensayo que contiene 9 ml de agua tridestilada. Luego de mezclar por inversiones sucesivas el tubo de ensayo tapado, se toma de él 1ml y se transfiere al siguiente tubo que contiene 9ml, La operación se repite hasta el sexto tubo.
  • Siembra Se pesan 100g del sustrato contaminado y se disuelven en 1000 ml de agua destilada. Se agita profusamente y deja reposar por uno 20 minutos. A continuación se soma una micro gota de la solución con ayuda de una aza de siembra. Para facilitar la toma, inicialmente se flamea el aza en el mechero bunsen y se pone en contacto con el medio de cultivo sólido de la caja petri elegida para la siembra. Esta operación hace factible la adhesión de una gota al aza microbiológica.
  • Siembra mediante diluciones Los tubos deben rotularse con 10-1. 10-2, 10-3, 10-4, 10-5 y 10-6. Parra la siembra se debe considerar solamente las tres últimas diluciones Independientemente del valor obtenido del conteo de UFCs, todos los resultados deben expresarse en valores de 10-6, para facilitar los cálculos de cinética y porque solo valores con dicho exponente garantizan una tasa de degradación efectiva.
  • Siembra mediante diluciones
  • Técnica de siembra
  • Siembra en caja y en tubo
  • Forma de crecimientoEn medio sólido b) en medio líquido.1.- Aeróbicos, 2.- Microaerófilas, 3.- Anaerobios facultativos, 4.- Anaerobios
  • Dinámica de crecimiento en gelatina 1.- En forma de cráter, 2.- En forma de tubérculo, 3.- En forma de embudo, 4.- En capas, 5.- En forma de burbujas. 1,3 y 5 la lisis generada por aeróbicos, 4 generado por anaerobios facultativos y 6 por anaerobios.
  • Incubación La incubación de las siembras, para la gran mayoría de microorganismos empleados en biorremediación transcurre bajo 37°C, pudiendo en dependencia del tipo de microorganismo a aislar, variar en un amplio rango que va de -8 a +57°C. Las bacterias sicrotolerantes se incuban a temperaturas inferiores a 0°C, mientras que los microorganismos termófilos bajo temperaturas superiores a los 45°C. Para fines prácticos el tiempo de incubación es de 24 horas (para la gran mayoría de sepas). Cuando se está definiendo la cinética del proceso, el primer conteo se efectúa a las 4 horas de incubación.
  • Identificación La identificación microbiana es quizá la etapa de mayor responsabilidad de una investigación, razón por la que se requiere de la participación de un microbiólogo experimentado, que conozca la fisiología microbiana, las técnicas de identificación y las particularidades de cultivos específicos. La identificación completa de cepas microbianas se logra mediante análisis físicos, químicos y genéticos.
  • Identificación morfológica La identificación morfológica se puede efectuar a simple vista o con ayuda de un microscopio. A simple vista o con ayuda de una lupa se pueden observar detalles de la morfología de las colonias, que sirven para su identificación. Entre los aspectos que se pueden explorar físicamente están: Forma de la colonia. Color de la colonia. Olor Apariencia de la superficie Perfil de la colonia
  • Perfil de colonias1.- angulada, 2.- en forma de cráter, 3.- Ondulada, 4.-Sumergida, 5.- Plana, 6.- Convexa, 7.- En forma de gota, 8.- Cónica
  • Perfil de colonias1.- Lisa, 2.- Ondulada, 3.- Dentada, 4.- De empalizada, 5.- Irregular, 6.- De pestañas, 7.- Filamentosa, 8.- Pilosa, 9.- Ramificada
  • Formas de colonias a) Redondas, b)redondas con extremos ondulados,c)Redonda con anillo interior, d) Rizoides, e,f) con extremo rizoide, g) amiboidea, h) filamentosa, i) Arrugada (Plisada), j) irregular, k) concéntrica, l) compleja.
  • Formas de los bordes1.- Regular (uniforme), 2.- Levemente granulada, 3.- Fuertemente granulada, 4.- Rugosa, 5.- fibrosa.
  • Identificación microscópica Para la identificación de la morfología de las bacterias aisladas, es necesario preparar fijados con ayuda de sustancias colorantes que resaltan las estructuras celulares, permitiendo ver su forma, tamaño y propiedades estructurales. Entre las pruebas típicas está la tinción Gram, la misma que permite diferenciar morfológicamente a los microorganismos en
  • Formas microscópicas1.- Diplococos, 2.- Estreptococos, 3.- Tetracocos y sarcinas, 4.- Estafilococos y micrococos. 1.- Pseudomona aeruginosa, 2.- Bacillus mycoides, 3.- Bacillus megaterium, 4.- Cytophaga sp.
  • Formas microscópicas Células curvas: 1.- Vibriones, 2.- Espirilos, 3.- Espiroquetas . Bacterias que forman prolongaciones.1.- Caulobacter, 2.- Hyphomicrobium, 3.- Ancalomicrobium, 4.- Gallionella.
  • HongosConidióforos y conidios de hongos imperfectos.1.- Trichoderma,2.-Cladosporium,3.- Altenaria,4.- Fusarium,5.- Stachybotris,6.- Stemphylium,7.- Verticillium,8.- Oospora,9.- Cephalosporium,10.- Botrytis,11.- Phoma,12.- Mycogone, a) Conidios.
  • Hongosa)Aspergillus, b) Penicillium: 1.- Micela vegetativa, 2.- Conidióforo, 3.- Sterigmas, 4.- Conidios.
  • BIOQUÍMICA La identificación bioquímica, permite comprobar la disponibilidad o no de un sistema fermentativo específico en la sepa analizada, que le permite al microorganismos emplear ciertas sustancias en calidad de fuente de carbono o nutrientes. Entre las pruebas bioquímicas más empleadas podemos citar: Prueba de la gelatina (capacidad de romper enlaces peptídicos). Prueba de nitratos (capacidad de metabolizar nitratos). Prueba de oxidasas (oxigenasas, peroxidasas) Generación de pigmentos.
  • Pruebas bioquímicas
  • GENÉTICA La identificación genética de las sepas, es una prueba concluyente que permite establecer con absoluta certeza, el género, familia, especie y subespecie. La secuenciación de ADN microbiano, permite identificar especies nuevas, de gran utilidad en biotecnología ambiental, sobre las cuales se ejerce derechos de propiedad intelectual.
  • GENÉTICA La identificación de bacterias por métodos moleculares se realiza por establecer la secuencia de nucleótidos de algún gen marcador de una especie que está dentro de una muestra ambiental con varios genomas. A la fecha el gen más utilizado es el que codifica para el ARN de la subunidad pequeña del ribosoma es decir el gel ARN ribosomal 16S.
  • GENÉTICA Este gen tiene muchas ventajas a comparación de otros como son:1. Se encuentra presente en cualquier eubacteria,2. Tiene diferentes regiones que son comunes para un phylum o inclusive para todo el reino eubacteria y otras que son exclusivas de cada género y especie.Por lo tanto al amplificar el o los genes ARN ribosomales 16S de una muestra ambiental por medio de la reacción de polimerización en cadena (PCR) y la posterior secuenciación de cada producto se obtiene la composición de especies de una muestra ambiental.
  • ESTRUCTURA
  • CELULA BACTERIANA
  • Estructura general cápsula o capa mucilaginosa capa S paracristalina vaina botones de anclaje pared celular Protoplasto
  • Protoplasto membrana citoplásmica (que puede tener o no invaginaciones) citoplasma, que incluye: genóforo, constituido por un cromosoma en algunas especies, uno o varios plásmidos (elementos genéticos extracromosómicos) ribosomas inclusiones orgánulos Flagelos Fimbrias (= pelos)
  • UBICACIÓN DE LOS MICROORGANISMOS EN EL MUNDO VIVO Existen dos tipos de organización celular, la procariótica y la eucariótica. Dentro de los seres vivos con organización procariótica, existen dos grandes “dominios” o “imperios”: Bacteria (las eubacterias o bacterias “clásicas”) y Archaea (antes llamadas arqueobacterias) A su vez, el dominio eucariótico comprende numerosas líneas filogenéticas, muchas de ellas de microorganismos. Los mismos Protozoos es un grupo muy heterogéneo, que comprende líneas filogenéticas diversas y a veces muy separadas en el tiempo evolutivo.
  • Citoplasma Es un sistema disperso formado por:1. Coloides2. Agua3. Proteínas4. Hidratos de carbono5. Lípidos
  • CITOPLASMA BACTERIANO El citoplasma bacteriano es la masa de materia viva delimitada por la membrana citoplásmica. En su interior se albergan: cuerpos nucleares (nucleoide); plásmidos (no en todas las cepas bacterianas); ribosomas; inclusiones (no en todas); orgánulos (no en todas).
  • CITOPLASMA BACTERIANO Al igual que en los demás seres vivos, el citoplasma es un sistema coloidal cuya fase dispersante es agua junto con diversas sustancias en solución (citosol), y cuya fase dispersa está constituida por macromoléculas y conjuntos supramoleculares (partículas submicroscópicas). La viscosidad es mayor que la del citoplasma eucariótico, estando desprovisto de corrientes citoplásmicas.
  • EL NUCLEOIDE El ADN es el material genético de los procariotas, al igual que del resto de seres vivos (celulares). Está contenido en una región concreta del citoplasma, denominada nucleoide, no delimitado por membrana. El genoma es el conjunto de genes y secuencias de ADN de un organismo. En el caso de bacterias, el elemento obligatorio del genoma es el cromosoma, aunque es frecuente encontrar unidades de replicación autónomas llamadas plásmidos.
  • Electron micrograph of thenucleoid
  • Localizacióndel nucleoide
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA, ESTRUCTURA Y ORGANIZACIÓN DEL CROMOSOMA Los cromosomas aislados muestran una composición de un 60% de ADN, 30% de ARN y 10% de proteínas. En la mayor parte de las bacterias este ADN constituye un solo cromosoma circular, cerrado covalentemente (ADN c.c.c.). Existen algunas excepciones, en el sentido de que podemos encontrar cromosomas lineares o incluso más de un grupo de ligamiento (más de un cromosoma):
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA, ESTRUCTURA Y ORGANIZACIÓN DEL CROMOSOMA En el género Borrelia el cromosoma es lineal con los extremos cerrados covalentemente (es decir, los extremos forman una especie de bucle de horquilla); En bacterias del género Streptomyces también poseen un cromosoma lineal, pero sus extremos contienen secuencias cortas repetidas y están acomplejados con proteínas, lo que recuerda de algún modo los telómeros eucariotas;
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA, ESTRUCTURA Y ORGANIZACIÓN DEL CROMOSOMAAlgunas bacterias parecen poseer dos o más cromosomas: Rhodobacter sphaeroides, Vibrio, Leptospira y Brucella presentan dos cromosomas circulares Sinorhizobium melitoti presenta tres cromosomas circulares Distintas cepas de Burkholderia cepacia presentan entre 2 y 4 cromosomas Agrobacterium tumefaciens cuenta con un cromosoma lineal y otro circular.
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA, ESTRUCTURA Y ORGANIZACIÓN DEL CROMOSOMA Las bacterias son organismos haploides: poseen un solo cromosoma. Sin embargo, cuando las células bacterianas se encuentran en crecimiento activo, y debido al desfase de la división celular respecto de la replicación, cada individuo puede albergar varias copias de ese cromosoma. Por ejemplo, E. coli puede llegar a 10 copias. Azotobacter puede llegar hasta las 100 copias al final de la fase de crecimiento exponencia, la bacteria gigante Epulopiscium, que aumenta el número de copias a 10.000 veces!).
  • Tamaño de los cromosomas Una bacteria típica, como Escherichia coli posee un cromosoma con 4.700 pares de kilobases (kb). Pero los rangos de tamaño oscilan entre las 700 kb de Mycoplasma genitalium (una bacteria carente de pared y parásita) y las más de 12 000 kb de ciertas bacterias capaces de diferenciación celular y fenómenos de multicelularidad (cianobacterias, actinomicetos).
  • PLÁSMIDOS Se definen como elementos genéticos extracromosómicos con capacidad de replicación autónoma (es decir, constituyen replicones propios). Todos los plásmidos bacterianos estudiados son de ADN de cadena doble. La inmensa mayoría son circulares cerrados covalentemente (c.c.c.) y superenrollados (aunque en Borrelia y algunos Actinomicetos existen plásmidos lineares). Algunos plásmidos poseen, además, la capacidad de integrarse reversiblemente en el cromosoma bacteriano: en esta situación se replican junto con el cromosoma (bajo el control de éste), y reciben el nombre de episomas.
  • PLÁSMIDOS Cada tipo de plásmido tiene un número medio de copias por célula característico. Por regla general, los grandes plásmidos tienen una o dos copias por célula (plásmidos con control estricto de la replicación), mientras que los pequeños suelen estar presentes como varias copias (>10), denominándose plásmidos de control relajado.
  • Tipos de plásmidos plásmidos conjugativos (autotransmisibles), que son aquellos que se transfieren entre cepas por medio de fenómenos de conjugación. Plásmidos que no sólo se transfieren entre cepas de la misma especie, sino que son capaces de hacerlo entre especies y géneros muy diversos, se denominan plásmidos promiscuos o de amplio espectro de hospedadores, permitiendo transferencia horizontal de información genética entre grupos bacterianos filogenéticamente alejados.
  • Tipos de plásmidos plásmidos no conjugativos, carentes de esta propiedad de conjugación. Dentro de esta categoría existe un subgrupo, el de los plásmidos movilizables: son aquellos no autotransmisibles que pueden ser transferidos por la acción de un plásmido conjugativo coexistente en la misma bacteria.
  • FENOTIPOS DETERMINADOS POR LOS PLÁSMIDOS Resistencia a antibióticos (plásmidos R) Resistencia a metales pesados (por ejemplo, resistencia a mercurio). Plásmidos de virulencia: producción de toxinas, factores de penetración en tejidos, adherencia a tejidos del hospedador, etc., en ciertas bacterias patógenas. Producción de bacteriocinas (proteínas tóxicas producidas por bacterias que matan a otras de la misma especie).
  • FENOTIPOS DETERMINADOS POR LOS PLÁSMIDOS Producción de sideróforos (quelatos para secuestrar iones Fe3+). Utilización de determinados azúcares. Utilización de hidrocarburos, incluyendo algunos cíclicos recalcitrantes (degradación de tolueno, xileno, alcanfor, etc.) en Pseudomonas. Inducción de tumores en plantas (plásmido Ti de Agrobacterium tumefaciens) Interacciones simbióticas y fijación de nitrógeno en ciertos Rhizobium.
  • RIBOSOMAS El ribosoma está compuesto de un 63% de ARN (que a su vez representa más del 90% del ARN total de la bacteria) y un 37% de proteínas. El ribosoma eubacteriano posee un coeficiente de sedimentación de 70S, frente al de 80S de los ribosomas citoplásmicos eucarióticos. Bajando la concentración de iones Mg++ cada ribosoma se disocia en sus dos subunidades: la pequeña (30S) y la grande (50S). In vivo esta disociación ocurre cada vez que se completa la síntesis de una molécula de proteína, para volver a unirse las dos subunidades al inicio del mensaje de otro gen.
  • Subunidad pequeña (30S) Contiene un solo tipo de ARN: el ARNr 16S, con una característica estructura secundaria con zonas de emparejamiento intracatenario (de cadena doble) y bucles. Posee 21 tipos de proteínas, denominadas S1, S2 ... S21. Las posiciones relativas de algunas de estas proteínas han podido ser “cartografiadas” en el conjunto de la estructura de la subunidad 30S.
  • Subunidad grande (50S) Posee dos tipos de ARN: ARNr 23S y ARNr 5S, cada uno con su correspondiente y peculiar estructura secundaria Contiene 32 tipos de proteínas diferentes, denominadas L1 ... L32. La L7 y la L12 tienen la misma secuencia, pero la L7 está modificada químicamente en su extremo amino por unión con un radical acetilo. Con excepción de L7/L12, que están presentes en 4 copias cada una, las demás aportan una sola molécula cada una a la subunidad grande.
  • INCLUSIONES DE RESERVA Son acúmulos de sustancias orgánicas o inorgánicas, rodeadas o no de una envuelta limitante de naturaleza proteínica, que se originan dentro del citoplasma bajo determinadas condiciones de crecimiento. Constituyen reservas de fuentes de C o N (inclusiones orgánicas) y de P o S (inclusiones inorgánicas).
  • INCLUSIONESCITOPLASMÁTICAS
  • Inclusiones orgánicas:1. inclusiones polisacarídicas2. gránulos de poli-ß-hidroxibutírico (o, en general de poli-ß- hidroxialcanoatos)3. inclusiones de hidrocarburos4. gránulos de cianoficina
  • Inclusiones inorgánicasa) gránulos de polifosfatob) glóbulos de azufre
  • INCLUSIONES POLISACARÍDICAS Son acumulaciones de α(14) glucanos, con ramificaciones en α(16), principalmente almidón o glucógeno (según especies), que se depositan de modo más o menos uniforme por todo el citoplasma cuando determinadas bacterias crecen en medios con limitación de fuente de N
  • INCLUSIONES POLISACARÍDICAS Estas inclusiones actúan, pues, como sistemas de almacenamiento de carbono osmóticamente inertes (la célula puede albergar grandes cantidades de glucosa que, si estuvieran como moléculas libres dentro del citoplasma, podrían tener efectos osmóticos muy negativos).
  • INCLUSIONES POLISACARÍDICAS Para observarlas se recurre a la tinción con una solución de I2 + IK (como el lugol) glucógeno: aparece de color pardo- rojizo; almidón (amilopectina): color azul
  • GRÁNULOS DE POLI-ß-HIDROXIBUTÍRICO (PHB) Y DE POLI-HIDROXIALCANOATOS Los gránulos de poli-β-hidroxibutírico son acúmulos del poliéster del ácido ß- hidroxibutírico (= 3-hidroxibutírico), rodeados de una envuelta proteínica, y que al igual que en el caso anterior, se producen en ciertas bacterias como reserva osmóticamente inerte de C en condiciones de hambre de N. En las especies de Bacillus constituye la fuente de carbono y energía al inicio de la esporulación. Una función semejante parece implicada a la hora del enquistamiento de Azotobacter.
  • GRÁNULOS DE POLI-ß-HIDROXIBUTÍRICO (PHB) Y DE POLI-HIDROXIALCANOATOS Una célula puede contener de 8 a 12 de estos gránulos, que miden unos 0.2-0.7 µm de diámetro, y que van provistos de una envuelta proteica de unos 3-4 nm de grosor. Pueden llegar a representar el 80% en peso de la célula. A diferencia de los acúmulos de polisacáridos, los gránulos de PHB son visibles a microscopio óptico en fresco, debido a su elevado índice de refringencia. Se tiñen bien mediante Negro-Sudán.
  • INCLUSIONES DE HIDROCARBUROS Son acúmulos de reserva (con envuelta proteinica) de los hidrocarburos que determinadas bacterias (especialmente Actinomicetos y relacionados) usan como fuente de C.
  • GRÁNULOS DE CIANOFICINA Muchas cianobacterias (Oxifotobacterias) acumulan grandes gránulos refringentes de reservas nitrogenadas cuando se acercan a la fase estacionaria de crecimiento. Estos gránulos de cianoficina son acúmulos de un copolímero de arginina y aspártico.
  • GRÁNULOS DE POLIFOSFATOS Se denominan también gránulos de volutina o metacromáticos. El nombre de “metacromáticos” alude al efecto metacromático (cambio de color): cuando se tiñen con los colorantes básicos azul de toluidina o azul de metileno envejecido, se colorean de rojo. A microscopio electrónico aparecen muy densos a los electrones.
  • GRÁNULOS DE POLIFOSFATOS Son acúmulos de polifosfato, polímeros lineales del ortofosfato, de longitud variable (por término medio, unas 500 unidades), que representan un modo osmóticamente inerte de almacenar fosfato,la parte central de estos gránulos constituye un núcleo formado por lípidos y proteínas. En algunos casos pueden constituir una fuente de energía, en sustitución del ATP (¿se trata en este caso de una especie de “fósil bioquímico?”).
  • GLÓBULOS DE AZUFRE Las inclusiones de S aparecen en dos grupos de bacterias que usan sulfuro de hidrógeno (SH2): Las bacterias purpúreas del azufre (que usan el SH2 como donador de electrones para la fotosíntesis); Bacterias filamentosas no fotosintéticas como Beggiatoa, Thiomargarita o Thiothrix, que lo usan como donador de electrones para sus oxidaciones.
  • GLÓBULOS DE AZUFRE En ambos casos, el sulfuro de hidrógeno es oxidado a azufre elemental (S0), que en el citoplasma se acumula como glóbulos muy refringentes y rodeados de envuelta proteínica. Estos glóbulos son transitorios, ya que el S0 se reutiliza por oxidación hasta sulfato, cuando en el medio se agota el sulfuro.
  • GLOBULOS DE SULFURO
  • OTRAS INCLUSIONES INCLUSIONES DE SALES MINERALES Acúmulos grandes, densos y refringentes de sales insolubles de calcio (sobre todo carbonatos) que aparecen en algunas bacterias (como Achromatium), cuyo papel parece consistir en mantenerlas en el fondo de los lagos y ríos.
  • OTRAS INCLUSIONES FICOBILISOMAS Son estructuras supramacromoleculares, en forma de cilindros o bastones, adosadas a la superficie de la membrana tilacoidal de las Cianobacterias, confiriendo a ésta un típico aspecto “granuloso” en las micrografías electrónicas. , cromoproteínas que sirven como “antenas” para la captación de luz en la fotosíntesis de estos procariotas. Los grupos cromóforos son: ficocianinas, aloficocianinas y ficoeritrina
  • ORGÁNULOS PROCARIÓTICOS CITOPLÁSMICOS En algunos grupos bacterianos se pueden encontrar orgánulos citoplásmicos no rodeados por unidad de membrana (o sea, sin bicapa lipídica). Muchos de ellos presentan envueltas basadas en subunidades de proteínas:
  • ORGÁNULOS PROCARIÓTICOS CITOPLÁSMICOS carboxisomas vacuolasde gas clorosomas magnetosomas.
  • CARBOXISOMAS (= CUERPOS POLIÉDRICOS) Estructuras presentes en bacterias fotoautotrofas (Cianobacterias y ciertas bacterias purpúreas) y quimioautotrofas (nitrificantes, Thiobacillus), de apariencia poliédrica con tendencia a esférica. Su diámetro oscila entre 50 y 500 nm, y están rodeadas de envuelta monocapa proteinica de unos 3,5 nm. El interior tiene aspecto granular, debido a la acumulación de la enzima ribulosa-bifosfato- carboxilasa (RuBisCo, la carboxidismutasa, el enzima clave en el ciclo de Calvin de asimilación de CO2).
  • VACUOLAS DE GAS Son orgánulos muy refringentes al microscopio óptico, que al electrónico muestran una estructura a base de agrupaciones regulares de vesículas de gas. Cada vesícula tiene una forma de cilindro bicónico (200-1000 nm de longitud y unos 70 nm de diámetro), rodeado de una monocapa de unidades globulares de proteína ensambladas helicoidalmente que dan un aspecto a bandas (“costillas”).
  • VACUOLAS DE GAS Esta envuelta es impermeable al agua, pero permeable a los gases, por lo que la composición y concentración del gas dentro de la vesícula depende de las que existan en el medio. Conforme se sintetizan y ensamblan las vesículas, el agua va siendo eliminada del interior.
  • VACUOLAS DE GAS Lafunción de estas vacuolas es mantener un grado de flotabilidad óptimo en los hábitats acuáticos a las bacterias que las poseen, permitiéndoles alcanzar la profundidad adecuada para su modo de vida (según los casos, para obtener una intensidad adecuada de luz, concentración óptima de oxígeno o de otros nutrientes).
  • CLOROSOMAS Son vesículas oblongas situadas por debajo de la membrana citoplásmica, que contienen los pigmentos antena de las bacterias fotosintéticas verdes (antigua familia Chlorobiaceae). Son invisibles a microscopía óptica; miden 100-150 nm de longitud y unos 50 nm de anchura, estando rodeadas de una monocapa de proteínas. Se disponen por debajo de la membrana citoplásmica, sin estar en continuidad con ella, aunque en muchos casos aparecen conectadas a través de un pedúnculo de naturaleza no lipídica.
  • MAGNETOSOMAS Son orgánulos sensores del campo magnético terrestre, que aparecen en ciertas bacterias acuáticas flageladas microaerófilas o anaerobias (p. ej., en Aquaspirillum magnetotacticum). Consisten en cristales homogéneos de magnetita (Fe3O4), de formas cubo- octaédricas o de prisma hexagonal delimitados por una envuelta proteínica.
  • LA ENDOSPORA BACTERIANA Y LA ESPORULACIÓN Los géneros Bacillus, Clostridium, Sporosarcina y Thermoactinomyces), disponen de una notable estrategia adaptativa cuando se ven sometidas a privación de nutrientes en su medio ambiente: si los niveles de fuentes de C, N, o P caen por debajo de un umbral. Entonces, la célula se implica en una serie de complejos cambios genéticos, metabólicos, estructurales, etc. (proceso de esporulación o esporogénesis).
  • LA ENDOSPORA BACTERIANA Y LA ESPORULACIÓN La célula-madre (o sea, la célula vegetativa original que generó la endospora) finalmente se autolisa, liberando la espora, que es capaz de permanecer en estado criptobiótico, durmiente, varios decenios, -incluso siglos. Las esporas son fácilmente diseminadas por el aire; cuando caen en medios ricos en nutrientes, se desencadena su germinación, se reinicia la actividad metabólica, de modo que cada espora genera una nueva célula vegetativa, capaz de divisón binaria, etc.
  • ENDOSPORA Las endosporas son formas de reposo (y no formas reproductivas), que representan una etapa del ciclo de vida de ciertas bacterias, y que se caracterizan por una estructura peculiar, diferenciada respecto de las células vegetativas, por un estado metabólico prácticamente detenido, y por una elevada resistencia a agentes agresivos ambientales.
  • TIPOS DE ESPORAS Al microscopio óptico, en fresco (sin teñir), aparecen como cuerpos esféricos, ovoides e incluso en algunas especies, cilíndricos, muy refringentes, libres, o aún incluidos en la célula vegetativa (célula madre). El tamaño relativo de la espora, y su situación en el esporangio, son criterios taxonómicos importantes en las bacterias esporulantes.
  • Tipos de esporas Según que el diámetro de la espora sea o no mayor que el de la célula vegetativa:1. Esporas deformantes2. Esporas no deformantes
  • Tipos de esporas Según la localización de la espora dentro del esporangio:1. Terminal2. Subterminal3. Central
  • Tipos de esporas Los esporangios deformantes de Clostridium son característicos:1. en forma de cerilla o palillo de tambor (plectridios)2. en huso (clostridios)
  • Tipos CENTRALES SUBTERMINALES TERMINALES
  • Tinción: No se tiñen por los colorantes normales. Hay que forzar por calor y/o mordientes (por ejemplo, tras teñir reforzadamente con fuchsina, resisten decoloración por alcohol-ClH). Otra tinción muy empleada es la reforzada con verde de malaquita (que es la que el alumno realiza en nuestras prácticas de laboratorio).
  • ESTRUCTURA Y COMPOSICION QUIMICA DE LA ENDOSPORA Partes que comprende la endospora: Protoplasto o núcleo (“core”, en inglés), con la membrana citoplásmica de la espora (membrana esporal interna). Pared de la espora (= Germen de la pared de la futura célula vegetativa) Corteza o córtex, rodeado externamente de la membrana esporal externa. Cubierta Exosporio
  • Estructura de una espora
  • Endospora de Bacillus subtilis
  • PROTOPLASTO O NÚCLEO El citoplasma de la espora está muy deshidratado. Sus componentes están inmovilizados en una matriz de quelatos de iones Ca++ y ácido dipicolínico. El citoplasma de la espora contiene altas concentraciones de ion Ca++ (1-3% del peso seco de la espora), y de ácido dipicolínico (DPA) (10% en peso); ambos están formando un quelato, llamado dipicolinato cálcico (DPC), una sustancia exclusiva de las esporas bacterianas.
  • PROTOPLASTO O NÚCLEOEl protoplasto contiene un cromosoma completo, condensado, y todos los componentes indispensables para reiniciar el crecimiento vegetativo cuando la espora germine, pero carece de muchos componentes típicos de la célula vegetativa:Rodeando al protoplasto está la membrana citoplásmica (membrana interna de la espora), una bicapa lipídica carente de fluidez, posiblemente como resultado de su estructura policristalina.
  • PARED DE LA ESPORA Situación: inmediatamente por encima de la membrana interna de la espora. Composición: a base de un peptidoglucano (PG) similar al de la célula vegetativa, con sus característicos enlaces entre los tetrapéptidos. Funciones: al germinar la espora, dará lugar a la pared celular de la nueva célula vegetativa, confiriéndole, mientras tanto, resistencia osmótica. Origen: se sintetiza a partir de la prespora, atravesando los precursores la membrana interior que hemos citado arriba.
  • CORTEZA O CÓRTEX Composición: un peptidoglucano (PG) especial, diferente en composición al PG de la célula vegetativa: 30% del NAM tiene tetrapéptidos normales, pero el grado de entrecruzamiento es muy bajo (6%). 15% del NAM tiene solo la L-ala inicial, en lugar de tetrapétido. 55% de una modificación del ácido murámico (lactama del ácido murámico), producida por condensación del -COOH lactilo con el -NH2, para formar la lactama correspondiente).
  • CORTEZA O CÓRTEX Origen:Se sintetiza a partir de la célula madre, con sus intermediarios ensamblados a nivel de la membrana externa que rodea a la corteza.
  • CORTEZA O CÓRTEX Propiedades de la corteza 1) Tiene un bajo grado de puentes entre tetrapéptidos (sólo un 6%). Ello condiciona: a) una estructura más laxa, que es la base de su apariencia de gel. b) su rápida autolisis, durante la germinación de la espora. 2) La lactama del murámico condiciona una gran resistencia a la lisozima.
  • CUBIERTAS Composición y estructura: la composición depende de las especies, pero en general, a base de una o varias proteínas de tipo queratina, todas muy ricas en cisteína y en aminoácidos hidrófobos, y que llegan a constituir el 60% en peso seco de la espora.
  • CUBIERTAS Propiedades: son muy insolubles e impermeables, e impiden la entrada de numerosos agentes químicos, incluyendo sustancias tóxicas. La abundancia de puentes S-S las hace muy compactas y muy estables químicamente.
  • EXOSPORIO Composición química: mezcla de proteínas, polisacáridos complejos, y lípidos. Propiedades: muy resistente a enzimas proteolíticas, lo que sugiere (pero no prueba directamente) que el exosporio puede representar algún papel como barrera de defensa externa de la espora.
  • ESPORULACIÓN Para que se produzca la esporulación, se necesitan dos condiciones previas: 1) Los cultivos bacterianos han de estar en buenas condiciones; 2) Cuando cesa el crecimiento exponencial, la mayoría de las células entran en esporulación, en un lapso de tiempo relativamente breve (5,5-8 horas en Bacillus subtilis) casi todo el cultivo aparece en forma de esporas, habiendo desaparecido las células vegetativas..
  • ESPORULACIÓN Ladivisión celular típica de la fase de crecimiento exponencial y la esporulación son procesos mutuamente excluyentes
  • FASES DE LAESPORULACIÓN
  • PROPIEDADES BIOLÓGICAS DE LAS ESPORAS Las endosporas son células en estado de dormancia, con una bajísima tasa metabólica (hipometabolia, la menor que existe en el mundo vivo), y capaces de conservar su vitalidad durante larguísimos períodos. Son muy resistentes a la acción de diversos agentes químicos (octanol, cloroformo) y físicos (altas temperaturas, congelación, desecación, radiaciones).
  • PROPIEDADES BIOLÓGICAS DE LAS ESPORAS 1) Hipometabolia: Poseen la más baja tasa respiratoria de todos los seres vivos. Por ello son capaces de sobrevivir en ausencia de nutrientes durante largos períodos de tiempo. 2) Dormancia: Esta propiedad se refiere al hecho de que la espora tiene una gran inercia a los sustratos exógenos. Como veremos, la espora sólo perderá la dormancia cuando se haya activado para la germinación.
  • PROPIEDADES BIOLÓGICAS DE LAS ESPORAS 3) Resistencia al calor: Las esporas de ciertas especies resisten el calor húmedo de 120oC durante 10 min, lo cual condiciona los parámetros para esterilizar materiales. La resistencia al calor seco, es decir, en ausencia de vapor de agua, se debe a las proteínas SASP, que protegen al ADN de los daños oxidativos de este tipo de calor). 4) Deshidratación: El muy bajo contenido en agua de la espora (0.3 g de agua/g de peso seco frente a los 3-4 g de agua/g de peso seco de la célula vegetativa) hace que la espora sea muy refráctil al microscopio óptico en fresco.
  • PROPIEDADES BIOLÓGICAS DE LAS ESPORAS 5) Resistencia a los rayos UV: Parece que depende de varios componentes: a) absorción de luz UV por las cubiertas; b) por el DPC; c) pero cada vez está más claro que las proteínas SASP tienen un papel central en esta resistencia a los UV, las SAPS de tipo α/β acomplejan al ADN y favorecen su configuración de tipo A, lo cual a su vez provoca un cambio en su fotoquímica. d) cambio en la fotoquímica del ADN de la espora
  • PROPIEDADES BIOLÓGICAS DE LAS ESPORAS 6) resistencia a agentes químicos: La resistencia de la endospora a agentes como octanol, cloroformo, etc. se debe a la impermeabilidad de las cubiertas, gracias a su gran grosor y su peculiar composición a base de proteínas ricas en aminoácidos hidrófobos y con abundantes puentes disulfuro (cistinas). La resistencia a la lisozima se debe por un lado a la propia impermeabilidad de las cubiertas, y a la resistencia de la corteza.
  • GERMINACIÓN DE LA ENDOSPORA 1. preactivación 2. activación 3. iniciación (o germinación en sentido estricto) 4. crecimiento ulterior (entrada en fase vegetativa)
  • PREACTIVACIÓN Antes de que la espora esté en condiciones de germinar se requiere que sus cubiertas se alteren. En la naturaleza esto ocurre por erosión por envejecimiento progresivo. Artificialmente, en laboratorio, se puede recurrir a algún procedimiento para alterar esas cubiertas:
  • Procedimientos Tratando las esporas a altas temperaturas, pero inferiores a su inactivación (100oC durante unos minutos); Por radiaciones ionizantes; Por pH bajos; Por tratamiento con sustancias que posean grupos -SH libres (p. ej., mercaptoetanol).
  • ACTIVACIÓN Laactivación es una etapa aún reversible, desencadenada por un agente químico externo (germinante) presente en el medio. Este agente es variable según las especies
  • Agentes activantes iones inorgánicos (Mn2+, Mg2+); L-alanina en B. subtilis; glucosa u otros azúcares; adenina u otras bases nitrogenadas.
  • INICIACIÓN O GERMINACIÓN EN SENTIDO ESTRICTO En esta etapa la germinación se hace ya irreversible, y se rompe definitivamente el estado de dormancia, si bien el metabolismo es endógeno (no depende todavía de sustancias externas). Los principales acontecimientos bioquímicos son:
  • ACONTECIMIENTOS Se pierde DPA, lo que supone pérdida de Ca++; Este Ca++ pasa al córtex, donde neutraliza las cargas negativas  se favorece la rehidratación del protoplasto y su hinchamiento, El 3-fosfoglicérico (3-PG) se convierte en 2- PG, y éste en PEP, que a su vez dona su fosfato de alta energía para producir ATP;
  • ACONTECIMIENTOS Las pequeñas proteínas SASPs se hidrolizan por una proteasa específica que hasta ese momento estaba inactiva. De este modo los aminoácidos constituyentes de las SASPs se reutilizan para la síntesis de nuevas proteínas por parte de la pequeña dotación de ribosomas y demás moléculas accesorias; La ARN polimerasa comienza a sintetizar ARN (comienza la transcripción de genes vegetativos).
  • TERMINACIÓN Y CRECIMIENTO ULTERIOR Aparece ya el metabolismo exógeno, de modo que la espora puede tomar nutrientes del exterior y metabolizarlos. Los eventos bioquímicos y estructurales más notorios son:
  • EVENTOS Se sintetiza ADN; El protoplasto crece aún más; La pared de la espora sirve como cebador (germen) para la producción de la pared de la célula vegetativa naciente. La célula vegetativa sale por rotura de las cubiertas, que puede ser de tipo polar o ecuatorial.
  • EXOSPORAS Determinadas bacterias (Methylosinum, Rhodomicrobium) forman esporas reproductivas por gemaciones sucesivas al final de sus prostecas. Estas exosporas poseen una envuelta a base de pared rodeada de una cápsula o cubierta gruesa.
  • DIFERENCIACIONES EN ACTINOMICETOS Los actinomicetos constituyen un grupo amplio y complejo de bacterias Gram positivas con tendencia a un tipo de crecimiento micelial y un estilo de vida similar a los hongos. Muchos de los taxones de Actinomicetos y bacterias relacionadas poseen células diferenciadas de tipo reproductivo, genéricamente conocidas como esporas.
  • Género Actinoplanes Las especies de este género producen micelios vegetativos de sustrato (subterráneos). Algunos de estos micelios generan hifas verticales que sobresalen a la superficie. El extremo de cada una de estas hifas se diferencia para constituir un saco llamado esporangio, que se fragmenta en un conjunto de esporas móviles (flageladas) llamadas zigosporas o esporangiosporas.
  • Género Streptomyces Forma un micelio de sustrato ramificado, interrumpido de vez en cuando por pared transversal. Cuando hay limitación de nutrientes se comienza a formar un micelio aéreo a partir de ramificaciones de las hifas subterráneas. En los extremos de algunas de estas hifas aéreas las células se diferencian en cadenas de esporas. Durante la formación de estos micelios aéreos y de las esporas la población de micelios subterráneos sufre una lisis masiva.
  • Propiedades de las esporas de los estreptomicetos La pared celular de la espora es más gruesa que la de la célula vegetativa; No hay cambio cualitativo en el peptidoglucano; No hay córtex ni cubiertas son muy hidrofóbicas: se resisten a ser suspendidas en agua. Esto parece que se debe a una vaina que rodea a la pared celular, compuesta a base de túbulos auto- ensamblables.
  • Propiedades de las esporas de los estreptomicetos Resisten más al calor y a la desecación en comparación a las células vegetativas, pero menos que las endosporas. Son metabólicamente durmientes (células en reposo).
  • QUISTES BACTERIANOS Son células que se producen en algunas especies por engrosamiento de la pared celular de la célula vegetativa, por deposición de nuevos materiales externamente a la membrana citoplásmica, al mismo tiempo que se acumulan materiales de reserva en el citoplasma. Poseen metabolismo endógeno, y resisten al calor, a la desecación y a agentes químicos más que la correspondiente célula vegetativa (pero menos que las endosporas).
  • EJEMPLOS Quistes de Azotobacter y Bdellovibrio. Microquistes de Mixobacterias, llamados mixosporas: sus envueltas constan de una corteza, rodeada de cubiertas (interna y externa). Estas cubiertas se componen de una glucoproteína muy rica en polisacáridos.
  • DIFERENCIACIONES EN CIANOBACTERIAS En las cianobacterias filamentosas (que forman tricomas) se pueden observar dos tipos principales de células diferenciadas a partir de las vegetativas: heteroquistes y acinetos.
  • HETEROQUISTES Son células de término, sin función reproductiva, especializadas en la fijación de nitrógeno molecular (N2), de mayor tamaño que las células vegetativas.
  • HETEROQUISTESCOMPOSICIÓN Por fuera de la pared celular (que es de tipo Gram-negativo), existen tres cubiertas: Una capa laminada interna a base de glucolípidos exclusivos de cianobacterias; Una capa homogénea central a base de polisacáridos; Una capa fibrosa externa, también polisacarídica, pero menos compactada.
  • HETEROQUISTES Estas tres capas evitan la difusión del O2 al interior del heteroquiste, lo que representa uno de los mecanismos para la protección de la nitrogenasa (complejo enzimático que reduce el N2 a NH4+, y que es muy sensible al oxígeno).
  • ACINETOS Son formas de reposo que se originan a partir de células vegetativas, por acumulación de nuevas capas de materiales polisacarídicos por fuera de la pared celular, y por formación de acúmulos de reserva en el citoplasma. Resisten más que las células vegetativas los períodos de desecación y de congelación, pero no al calor.
  • ACINETOS Cuando las condiciones ambientales mejoran, se producen sucesivas divisiones transversales en el acineto, que finalmente se convierte en un filamento más corto y menos grueso que los tricomas, llamado hormogonio.
  • Estructuras de la cubierta Fimbrias y pelos Capas S Cápsulas Capas mucosas
  • Fimbrias De estructura similar a los flagelos, pero no son móviles. Las fimbrias son más cortas y mucho más numerosas, son de naturaleza proteica. Favorecen la fijación bacteriana. Forman películas o biofilms sobre superficies líquidas.
  • Pelos o pili Son similares a las fimbrias, pero más largas, son pocas. Actúan como receptores específicos, para algunos tipos de virus. Participan en el proceso de conjugación. Facilitan la fijación bacteriana.
  • Pili y Fimbriae
  • Capas S Son capas de proteínas en posición bidimensional. Presentes en casi todas las bacteria y universales en Archaea. Tiene apariencia cristalina y adopta disposiciones de simetría variadas como: hexagonal, tetragonal, o trimérica, en dependencia del número de las unidades que lo forman.
  • Capas S Son una barrera permeable que permite el paso de sustancias de bajo peso molecular. En bacterias patógenas, actúan como elementos de protección frente a mecanismos de defenza del hospedador.
  • Cápsulas Muchos microorganismos secretan materiales viscosos, compuestos de polisacáridos (glicocálix) y proteínas. Su composición varía en cada organismo y puede ser rígida o flexible, fina o gruesa. Polisacáridos de gluc, fruct, gal, y ácido glucurónico (Str. pneumoniae). Ácido poliglutámico (B. antracis)
  • Funciones Fijación bacteriana. Reconocimiento de puntos de ingreso al hospedador. Resistir la acción de células fagocitarias y del sistema inmunitario. Retención de agua
  • Capsula entorno a la célula deKlebsiella planticola
  • Microcápsulas Se forman en estafilococos, streptococos y cianofitos, cuando los cultivos son ricos en hidratos de carbono. Pueden formarse dentro del organismo como en Str. Pneumoniae y Clostridium perfrigens. Las cápsulas comunes que rodean a varias células se denominan zoogleas
  • Estructura ENDOPLASMA ECTOPLASMA CAPSULA MUSILAGINOSA
  • MEMBRANACITOPLÁSMICA
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA La membrana citoplásmica bacteriana es la estructura de tipo bicapa proteo- lipídica que delimita al protoplasto. Su proporción proteínas: lípidos es superior a la de las membranas celulares eucarióticas, llegando a alcanzar valores relativos de 80:20.
  • Modelo de membrana
  • CARENCIA, EN GENERAL, DE ESTEROLES Las membranas procarióticas, a diferencia de las de eucariotas, carecen de esteroles (con las salvedades de Cianobacterias, ciertas bacterias metilotrofas; además, los micoplasmas presentan colesterol, pero lo “secuestran” de las células eucarióticas a las que parasitan). Pero en cambio, en muchas bacterias existe una peculiar clase de compuestos policíclicos, denominados hopanoides (triterpenoides pentacíclicos) que parecen condicionar parte de la rigidez de las membranas citoplásmicas.
  • HOPANOIDES Los hopanoides se sintetizan a partir del mismo tipo de precursores que los esteroles. (Por cierto, como dato curioso diremos que los sedimentos de combustibles fósiles como el petróleo presentan cantidades gigantescas de hopanoides, lo que confirma el papel que tuvieron las bacterias en su formación).
  • LÍPIDOS Abundan los fosfolípidos del ácido fosfatidico.1. Fosfatidiletanolamina2. Fosfatidilglicerol3. CardiolipinaEn bacterias Gram-positivas, además se encuentran glucolípidos y glucofosfolípidos.
  • LIPIDOS
  • Membrana de Archaea Los lípidos de Archaea poseen enlaces éter entre el glicerol y las cadenas laterales hidrofóbicas. Carecen de ácidos grasos, poseen unidades repetitivas de isopreno (5 “C”). Cadenas laterales de fitano (4 unidades de isopreno)
  • Enlace éter
  • ACIDOS GRASOS 1) saturados, como p. ej.: a) palmítico (16:0) b) mirístico (14:0) c) de cadena ramificada (muy frecuentes en muchas bacterias Gram-positivas) 2) monoinsaturados (sobre todo en Gram- negativas), como p. ej.: a) palmitoleico (cis-9, 16:1) b) cis-vaccénico (cis-11, 18:1)
  • ACIDOS GRASOS En Arqueas, en lugar de los habituales lípidos a base de ésteres de ácidos grasos con glicerol, existen lípidos a base de éteres de alcoholes de cadena larga con glicerol (p. ej., difitanil-glicerol-diéteres). Los alcoholes suelen ser derivados poliisoprenoides. Este tipo de membranas son más rígidas que las de eubacterias. Incluso existen arqueas con membranas a partir de tetrafitanil-diglicerol-tetraétereres, que consituyen bicapas monomoleculares.
  • PROTEÍNAS Constituyen la mayor parte de la membrana bacteriana (hasta el 80% en peso seco). Existe una gran variedad de tipos de proteínas en una misma bacteria (hasta 200), pero la composición y proporción concreta varía según las condiciones de cultivo. Según su localización en la membrana, y su grado de unión con la porción lipídica, se distingue entre:
  • PROTEÍNAS Proteínas integrales de membrana (=endoproteínas): son proteínas estrechamente unidas a la membrana, por lo general atravesadas en plena bicapa lipídica. Las proteínas integrales pueden desplazarse lateralmente en la bicapa lipídica, pero no son capaces de rotar, por lo que siempre presentan una determinada orientación o polaridad. Algunas presentan hidratos de carbono que sobresalen hacia la superficie externa (glucoproteínas).
  • PROTEÍNAS Proteínas periféricas (= epiproteínas): unidas a la superficie de la membrana, de forma más débil, por lo que son más fáciles de extraer y purificar. Incluso algunas establecen contactos sólo transitorios con la membrana
  • Estructura Consiste en una bicapa lipídica, con los grupos polares (hidrófilos) hacia afuera, y las cadenas hidrofóbicas de ácidos grasos (o, en el caso de Arqueobacterias, de alcoholes) hacia adentro, ajustándose al modelo de mosaico fluido de Singer y Nicholson. Inmersas en esta bicapa se encuentran las abundantes proteínas, que pueden moverse lateralmente en el mosaico de moléculas de lípidos, igualmente dotados de una rápida movilidad.
  • Estructura La membrana citoplásmica es asimétrica (aunque no tanto como la membrana externa de Gram- negativas). Esto se traduce en el hecho de que muchos de los procesos que tienen lugar en la membrana sean vectoriales (tengan una dirección determinada).
  • FUNCIONES DE LA MEMBRANA CITOPLASMICA La membrana citoplásmica de los procariotas es una notable estructura multifuncional (como uno podría esperar de la constatación del gran número de tipos de proteínas), siendo el sitio donde se producen muchos procesos metabólicos complejos, en un grado desconocido en el resto del mundo vivo.
  • FUNCIONES Barrera osmótica (que mantiene constante el medio interno), impidiendo el paso libre de sales y de compuestos orgánicos polares Es el límite metabólicamente activo de la célula: establece la frontera entre el protoplasto y el medio externo, impidiendo la pérdida de metabolitos y macromoléculas del protoplasto. Permite selectivamente el paso de sustancias entre el exterior y el interior (y viceversa).
  • FUNCIONES Interviene,además, en procesos bioenergéticos (fotosíntesis, respiración) Participa en la biosíntesis de componentes de membrana, de pared y de cápsulas, En la secreción de proteínas.
  • TRANSPORTE DE NUTRIENTES Tradicionalmente se viene considerando tres métodos principales de transporte de sustancias a través de la membrana:1. transporte pasivo inespecífico (= difusión simple);2. transporte pasivo específico (= difusión facilitada);3. transporte activo.
  • TRANSPORTE PASIVO INESPECÍFICO O DIFUSIÓN SIMPLE Este transporte consiste en la difusión pasiva de ciertas sustancias para las que la membrana es impermeable, debido a la diferencia de concentración (∆C) a ambos lados de dicha membrana (la sustancia tiene mayor concentración fuera que dentro de la célula). Aparte de esta diferencia de concentración, en la difusión pasiva influyen:1. la constante de permeabilidad (P), es decir, el grado de permeabilidad de la membrana a la sustancia en cuestión;
  • TRANSPORTE PASIVO INESPECÍFICO O DIFUSIÓN SIMPLE1. El área o superficie total (A) a través de la que se produce el transporte.2. Las membranas citoplásmicas son impermeables en sí mismas a la mayor parte de las moléculas. Sólo se da en el caso de O2, CO2, NH3, agua y otras pequeñas sustancias polares no ionizadas.3. La difusión simple se produce por el paso de estas sustancias a través de poros inespecíficos de la membrana citoplásmica.
  • TRANSPORTE PASIVO ESPECÍFICO O DIFUSIÓN FACILITADA Es un proceso que permite el paso de compuestos por difusión a través de transportadores estereoespecíficos y (al igual que en el caso anterior) sobre la base de un gradiente de concentración (en la dirección termodinámicamente favorable). El transportador suele ser una proteína integral de membrana (permeasa o facilitador), cuya conformación determina un canal interior, y por el cual un determinado sustrato puede alcanzar el interior, sin gasto de energía.
  • TRANSPORTE PASIVO ESPECÍFICO O DIFUSIÓN FACILITADA Cuando el soluto se une a la parte de la permeasa que da al exterior, esta proteína sufre un cambio conformacional que libera la molécula en el interior. Como al entrar la molécula, enseguida entra en el metabolismo y desaparece como tal, esto basta para mantener el gradiente de concentración que permite esta difusión. La difusión facilitada exhibe propiedades similares a las de las reacciones enzimáticas:
  • Propiedades Especificidad de sustrato: cada permeasa transporte un solo tipo de sustratos químicamente parecidos. Cinética de saturación de tipo Michaelis- Menten, es decir, la velocidad de transporte aumenta con la concentración de sustrato, hasta un valor límite (Vmax) por encima del cual ulteriores aumentos del soluto no aumentan dicha velocidad (debido a que todas las porinas disponibles están ya totalmente ocupadas).
  • TRANSPORTE PASIVO ESPECÍFICO O DIFUSIÓN FACILITADA Aunque este sistema de transporte es muy común en eucariotas, es muy raro encontrarlo en bacterias. La explicación evolutiva es que los procariotas suelen vivir en ambientes con pocas concentraciones de nutrientes, y por lo tanto no es frecuente que se den gradientes adecuados. Una de las pocas excepciones la constituye el glicerol, que es transportado por difusión facilitada en una amplia gama de bacterias, tanto Gram- positivas como Gram-negativas
  • TRANSPORTE PASIVO ESPECÍFICO O DIFUSIÓN FACILITADA
  • TRANSPORTE ACTIVO Consiste en el transporte de sustancias en contra de un gradiente de concentración, lo que requiere un gasto energético. En la mayor parte de los casos este transporte activo (que supone un trabajo osmótico) se realiza a expensas de un gradiente de H+ (potencial electroquímico de protones) previamente creado a ambos lados de la membrana, por procesos de respiración y fotosíntesis;por hidrólisis de ATP.
  • TRANSPORTE ACTIVO Lossistemas de transporte activo son los más abundantes entre las bacterias, y se han seleccionado evolutivamente debido a que en sus medios naturales la mayoría de los procariotas se encuentran de forma permanente o transitoria con una baja concentración de nutrientes.
  • TIPOS DE TRANSPORTE ACTIVO Transporte activo ligado a simporte de protones; Transporte activo ligado a simporte de iones Na+ Transporte activo dirigido por ATP Transporte acoplado a translocación de grupos.
  • TRANSPORTE ACTIVO LIGADO A SIMPORTE DE PROTONES El simporte se puede definir como el transporte simultáneo de dos sustratos en la misma dirección, por un mismo transportador sencillo. En el caso del transporte activo ligado a simporte de protones, lo que ocurre es que uno de los sustratos (H+) ha creado previamente un gradiente de concentración, cuya disipación es aprovechada por el otro sustrato para entrar con él. Este otro sustrato puede ser:
  • TRANSPORTE ACTIVO LIGADO A SIMPORTE DE PROTONES Una molécula de carga negativa: en este caso, su simporte ligado a protones tiende a disipar sólo el gradiente de concentración. Ejemplos: transporte de iones fosfato, de glutamato, etc. Una molécula neutra: en este caso, su simporte tiende a disipar no sólo el gradiente de concentración, sino también el gradiente eléctrico. Ejemplo: en Escherichia coli, la lactosa usa una ß-galactósido-permeasa.
  • TRANSPORTE ACTIVO LIGADO A SIMPORTE DE IONES SODIO Se puede considerar una versión modificada del anterior: algunas sustancias no son transportadas activamente de forma directa por el potencial electroquímico de protones, sino indirectamente, a través de un gradiente de Na+ que a su vez se origina a expensas de dicha fuerza protón-motriz (fpm). El sustrato entra por una permeasa, junto con iones Na+, pero a su vez este sodio se recicla por un sistema de antiporte, a expensas de la disipación del potencial de protones.
  • TRANSPORTE ACTIVO DIRIGIDO POR ATP El tipo de transporte se denomina de transportadores ABC o ATPasas de tráfico, y se conocen muchos ejemplos en eubacterias y arqueas. En enterobacterias (como E. coli). Se trata de un sistema de varios componentes, en el que existen proteínas periplásmicas que captan el sustrato con gran afinidad, y lo llevan hasta unas proteínas de membrana, las cuales acoplan el paso de dicho sustrato hasta el citoplasma (sin alteralo químicamente) con la hidrólisis de ATP.
  • Elementos de este tipo de sistema Porinas u otras proteínas de membrana externa para lograr la difusión del sustrato desde el medio hasta el espacio periplásmico. Proteína(s) solubles de espacio periplásmico que se unen al sustrato con gran afinidad. Un heterodímero formado por dos proteínas integrales de membrana (cada una de ellas posee 5 o 6 trechos en α-hélice que atraviesan la membrana citoplásmica), que son la permeasa propiamente dicha del sistema (el canal por donde pasa el sustrato).
  • Elementos de este tipo de sistema Dos proteínas periféricas de membrana citoplásmica, adosadas al lado citoplásmico, que incluyen el módulo conservado ABC que acopla la hidrólisis de ATP con el transporte unidireccional del sustrato a través de la membrana.
  • Modelo del mecanismo de este sistema
  • EJEMPLOS Existenmuchos ejemplos de transportadores procarióticos de tipo ABC, y cada uno de ellos está especializado en transportar un sustrato específico o varios sustratos parecidos. Ejemplo de sustratos transportados de esta forma:
  • EJEMPLOS Monosacáridos como arabinosa, galactosa, maltosa, ribosa, xilosa, etc. Oligosacáridos Iones orgánicos e inorgánico Aminoácidos como histidina, glicina, leucina, etc. Oligopéptidos Algunas vitaminas y metales. Sideróforos con hierro
  • TRANSPORTE ACOPLADO A TRANSLOCACION DE GRUPOS Es un sistema de transporte que acopla la entrada del sustrato con su modificación química por unión covalente con un grupo químico. Estrictamente hablando, no es un transporte activo, porque no funciona en contra de un gradiente de concentración, pero se considera de hecho como activo, ya que la concentración del sustrato modificado dentro de la célula supera con creces a la del sustrato sin modificar en el exterior.
  • EJEMPLOS En E. coli el sistema PTS permite el transporte de glucosa, manosa, fructosa y los polioles sorbitol y manitol. Entrada de ácidos grasos mediante un sistema de transferencia de Coenzima A, que los transforma en acil-CoA. Entrada de purinas y pirimidinas, mediante un sistema de fosforribosil-transferasas
  • TRANSPORTE DE HIERRO El hierro es un cofactor de muchas enzimas y citocromos, por lo que las bacterias necesitan captarlo. La captación de hierro se complica porque el ión férrico (Fe3+) es muy insoluble. Además, las bacterias que viven dentro de animales superiores tienen un problema: en los fluidos y tejidos de sus patrones el hierro libre es muy poco abundante (el hierro suele estar acomplejado con proteínas), por lo que se vuelve vital aprovisionarse con este elemento de alguna manera.
  • TRANSPORTE DE HIERRO Muchas bacterias secretan unas moléculas de bajo peso molecular llamadas en general sideróforos, que son capaces de formar quelatos (complejos) con el hierro férrico. Por ejemplo, Escherichia coli secreta un sideróforo llamado enterobactina.
  • ESTRUCTURAS MEMBRANOSAS INTRACITOPLÁSMICAS
  • MESOSOMAS Son estructuras membranosas intracitoplásmicas que se observan en la mayor parte de las bacterias, constituidas por invaginaciones de la membrana citoplásmica
  • Estructura y composición Los mesosomas más característicos y patentes son los de bacterias Gram-positivas. Su aspecto es el de repetidas invaginaciones de la membrana: una invaginación primaria en forma de sáculo irregular, de la que surge una invaginación secundaria, llamada túbulo mesosómico, que rellena el hueco de la invaginación primaria. El túbulo mesosómico suele consistir en un conjunto de pequeñas vesículas arrosariadas, o túbulos, conectados entre sí, a veces con aspecto de cebolla.
  • Funciones transporte de electrones, síntesis de componentes de las envueltas.... Probable papel en la síntesis del septo transversal, quizá regulando las autolisinas implicadas en la división celular-
  • Funciones Puntos de anclaje del cromosoma bacteriano (y quizá de algunos plásmidos), actuando en la segregación de los cromosomas hijos a las células hermanas (y en el caso de las bacterias esporuladas, en la segregación de los cromosomas a los compartimentos de la célula madre (esporangio) y de la preespora. Zonas de secreción de ciertas exoenzimas (p. ej., penicilinasa en Bacillus).
  • OTRAS INVAGINACIONES En muchas bacterias quimiolitoautrofas (especialmente las nitrificantes) existen invaginaciones de la membrana (a menudo denominadas citomembranas) que permiten una mayor superficie para la realización de sus actividades respiratorias. Sus formas y disposiciones son igualmente muy variadas. En Azotobacter, una bacteria aerobia fijadora de nitrógeno atmosférico, y que presenta una altísima tasa respiratoria, se pueden detectar también invaginaciones de membrana que aumentan la superficie disponible para sus intensos procesos de oxidación.
  • TILACOIDES Son sacos membranosos aplastados presentes en las cianobacterias, que no están en continuidad con la membrana citoplásmica; en su cara externa se disponen filas de ficobilisomas. El conjunto de membrana tilacoidal + ficobilisomas es el responsable de la fotosíntesis oxigénica en este grupo de procariotas.
  • PARED CELULAR
  • INTRODUCCIÓN La mayor parte de los procariotas posee una pared celular (P.C.) rígida rodeando al protoplasto. Las excepciones son los micoplasmas (dentro del dominio Bacteria) y algunas arqueas, como Thermoplasma. Al microscopio electrónico se puede observar como una capa en íntimo contacto con la membrana citoplásmica, con un espesor que oscila entre 10 y 80 nm (según especies) -frente a los 8 nm de la membrana celular- , y con una estructura más o menos compleja, según los tipos bacterianos.
  • PAREDES DE LAS EUBACTERIAS Consistenen un esqueleto macromolecular rígido, llamado peptidoglucano (= mucopéptido o mureína), que en Gram-positivas se encuentra inmerso en una matriz aniónica de polímeros azucarados; y en Gram-negativas está rodeada por una membrana externa, e inmersa en un espacio periplásmico.
  • Funciones Crecimiento División celular. Protección contra factores ambientales desfavorables. Determina la forma celular. Virulencia. Defenza contra la Lisosima y penicillina
  • PARED CELULAR
  • Prueba de Gram Cristal violeta Yodo Formación de un complejo coloreado Tratamiento con alcohol, las células mantienen la coloración o la pierden El complejo se forma en el protoplasma, sin embargo su retención depende de la composición de la pared celular.
  • Reacción de Gramm
  • BACTERIA GRAMPOSITIVA
  • BACTERIA GRAM NEGATIVASerratia marcescens
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA Y ESTRUCTURA Enlas bacterias Gram-positivas el peptidoglucano representa el componente mayoritario de la pared celular (50-80% en peso), mientras que en Gram-negativas supone sólo del 1 al 10%.
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA Y ESTRUCTURA BÁSICAS DEL PEPTIDOGLUCANO La unidad disacarídica repetitiva: es N- acetilglucosamina (NAG) unida por enlace ß(14) a N-acetilmurámico (NAM). Las distintas unidades disacarídicas se van uniendo entre sí por enlaces ß(14) entre el NAM de una unidad y la NAG de la siguiente. Este enlace es susceptible a la rotura catalizada por el enzima lisozima. El número de repeticiones (n) puede oscilar entre 10 y 100.
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA Y ESTRUCTURA BÁSICAS DEL PEPTIDOGLUCANO La cadena tetrapeptídica: Desde el grupo carboxilo de cada ácido NAM, y mediante un enlace amido, se encuentra unido el tetrapéptido. Un tetrapéptido típico de muchas bacterias es: L-alanina---D-glutámico---meso- diaminopimélico---D-alanina
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA Y ESTRUCTURA BÁSICAS DEL PEPTIDOGLUCANO
  • COMPOSICIÓN QUÍMICA Y ESTRUCTURA BÁSICAS DEL PEPTIDOGLUCANO La estructura global: Las distintas cadenas polisacarídicas, con sus respectivos tetrapéptidos, se unen entre sí por medio de puentes o enlaces peptídicos, entre un aminoácido de una cadena y otro aminoácido de una cadena adyacente (la D-ala terminal). De este modo, la estructura global es una sola macromolécula gigante que envuelve al protoplasto, formando un sáculo rígido, a modo de tejido continuo, que tiene el volumen y la forma de la bacteria respectiva.
  • Estructura global
  • EL PEPTIDOGLUCANO DE BACTERIAS GRAM-POSITIVAS Esmás variado que el de Gram- negativas, sobre todo en función de ciertas variantes en la composición del tetrapéptido y del tipo de enlaces entre los tetrapéptidos.
  • EL PEPTIDOGLUCANO DE BACTERIAS GRAM-POSITIVASVariantes en composición del tetrapéptido: En bacterias Corineformes:1. el grupo -CO- en α del D-glu (2) puede estar amidado o unido a una glicina (Gly);2. el aa (1) puede ser Gly o L-Ser, en lugar de la L-ala;3. el hidroxilo en 6 del NAM puede estar acetilado, lo que hace que el PG de estas bacterias sea resistente a la lisozima.
  • Pared celular gram positiva Á. tecóicoÁ. lipotecóico
  • Pared celular en Archaea Poseen paredes con pseudopeptidoglicano, formado por:1. N-acetilglucosamina y2. Ácido N- acetiltalosaminurónico.3. Presenta enlaces glicosídicos β-1,3 en vez de β-1,4
  • Pared celular en Archaea Otras poseen polisacáridos, glicoproteínas o proteínas (methanosarcina). Polisacáridos de glucosa, ácido glucurónico, galactosamina y acetato. Proteínas paracristalinas con simetría hexagonal, capas S.
  • Pared celular de Archaea
  • Pared celular Gram -A más del peptidoglicano (10%), poseen una capa de lipopolisacáridos (bicapa lipídica), que contiene polisacáridos y protínas (LPS), conocido también como membrana externa. Es relativamente permeable debido a la presencia de las porinas, que actúan como canales para sustancias hidrofílicas de bajo peso molecular.
  • Composición de LPS Consta de dos porciones:1. El núcleo del lipopolisacárido, compuesto de Cetodesoxioctonato, heptosas, gluc, gal y N- acetilglucosamina2. Polisacárido O específico, que consta de gal, gluc, ramn y manosa, así como dideoxiazúcares
  • Composición de LPS La parte lipídica se conoce como lípido A y está formado por ácidos grasos y el disacárido de N- acetilglucosamina fosfato, unidos mediante enlace aminoéster. Los ácidos grasos son: Capróico, laurico, mirístico, palmítico y esteárico
  • Membrana externa Es tóxica para la mayoría de los animales, como por ejemplo: Salmonella, Shigella y Escherichia. La toxicidad está ligada al lipopolisacárido (lípido A)
  • ESTRUCTURA DE LPS
  • Porinas Existe porinas específica e inespecíficas (llenas de agua). Son proteínas que poseen tres unidades idénticas (proteínas transmembranales), que se asocian formando poros de 1 nm de diámetro. Retiene algunas enzimas que se hallan fuera de la membrana plasmática.
  • ESTRUCTURA DE PORINA
  • Periplasma Espacio ubicado entre la membrana plasmática y la superficie interna de la membrana externa (12-15 nm). Tiene consistencia gelatinosa por su abundante contenido de proteínas.
  • Pared celular Gram negativaLipopolisacári dos Lip. Prot Brown
  • EL PEPTIDOGLUCANO DE BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS En la mayor parte de Gram-negativas el peptidoglucano corresponde a la composición descrita. Sin embargo, en las espiroquetas, el diaminoácido en posición 3, en vez de ser meso-DAP, está sustituido por la L-ornitina (que también es un diaminoácido).
  • EL PEPTIDOGLUCANO DE BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS Elresultado es una capa simple de PG (de 1 nm de espesor), a modo de malla floja, y con grandes poros. Ello explica el comportamiento de las bacterias Gram-negativas en la tinción de Gram, que tiñe a estas bacterias de rojo.
  • VARIANTES Muchas bacterias Gram-positivas carecen de meso-DAP (3), y en su lugar puede existir: LL-DAP L-diaminobutírico (DAB) L-lisina L-homoserina L-ornitina
  • Movimiento bacteriano Muchas bacterias son móviles gracias a la disponibilidad de flagelos. Son apéndices largos y finos (20 nm), vistos solo al microscopio electrónico. Según su disposición puede ser: Monotricos, amfitricos, lofotricos y peritricos
  • TIPOS CELULARES FLAGELADOS
  • Estructura Su forma es helicoidal. Consta de : Cuerpo basal, Gancho y Filamento Filamento. Está compuesto de proteína llamada Flagelina ( en Archaea existen varios tipos de flagelinas). En la base está dispuesto el gancho, que une al filamento con la parte motora. El motor anclado en la membrana citoplasmática y en la pared celular.Tiene un eje central y un sistema de anillos.
  • Estructura En las bacterias G-, existe un anillo anclado a la capa de lipopolisacárido y otra en la capa de peptidoglicano. En las bacterias G+, solo existen anillos internos y un par de proteínas Mot, que controlan al motor y las proteínas Fli, que actúan como conmutador del motor
  • Composición Flagelina Lisina Ácido aspartico Ácido glutámico. Alanina
  • ESTRUCTURA DE LOS FLAGELOS
  • Movimiento flagelar Los flagelos presentan algunos tipos de movimiento (50 µm/s):1. Rotación (consumen 1000 protones)2. Ondulación.3. Impulsión.4. PénduloSe estudian por el método de la gota aplastada o suspendida
  • Movimiento por deslizamiento Muchos procariotas a pesar de carecer de flagelos, se mueven por deslizamiento (10µm/s), este es el caso de células filamentosas o bacilares. El proceso requiere contacto entre células y una superficie sólida. Se produce por dos posibles mecanismos:1. Secreción mucosa2. Proteínas de la superficie.
  • Respuestas sensoriales Losmovimientos celulares suponen ventajas evolutivas. Las bacterias se encuentran con frecuencia en medios con gradientes físicos y químicos, en consecuencia con ellos, las bacterias han desarrollado respuestas positivas o negativas (movimientos dirigidos) denominadas Taxias.
  • Taxismos Quimiotaxis. Es la respuesta a la acción de agentes químicos, gracias a la participación de quimioreceptores Fototaxis. Es la respuesta a la acción de la luz, gracias a fotoreceptores de la membrana plasmática. Aerotaxia. Es la respuesta a la la presencia de oxígeno.
  • Taxismos Osmotaxis. Respuesta a los cambios de la fuerza iónica del medio
  • VIRUS YVIRIONESCURSO DEMICROBIOLOGIAUDLA
  • VIRUS Son elementos genéticos que pueden replicarse independientemente de los cromosomas de una célula. Son microorganismos que se hallan en los límites entre lo vivo e inerte, que solo pueden existir asociados a un organismo vivo al cual parasitan
  • VIRUS CARACTERÍSTICAS Aprovechan de la maquinaria genética de la célula hospedadora. Son parásitos obligados de plantas animales y el hombre. Tiene una forma extracelular que les capacita para ser transmitidos de un hospedador a otros.
  • VIRUS CARACTERÍSTICAS Son complejos nucleoprotéicos, donde el material genético AND o ARN, se encuentran dentro de la cápside formada por proteínas y lípidos organisados en capsómeros. Su replicación intracelular es destructiva. Son herramientas para la genética microbiana e ingeniería genética.
  • Estados virales Extracelular.- son partículas que contienen ácido nucleico rodeado de una proteína, asociados a otros componentes macromoleculares en dependencia del tipo de virus. En este estado se llama Virión , es metabólicamente inerte y carece de funciones respiratorias y biosintéticas.
  • Estado extracelular Esla estructura mediante la cual, el genoma del virus se transporta, desde la célula donde se ha producido hasta otra célula a la cual invade.
  • Estado intracelular Estado durante el cual tiene lugar la replicación viral, donde se producen copias del genoma virico y se sintetizan los componentes de la cubierta viral. El proceso de ingreso de un virus a una célula se denomina Infección. La célula que es infectada, se denomina hospedador.
  • Genomas víricos Los virus contienen o bien AND o ARN, de cadena sencilla o doble. También existen virus que contienen ambos tipos de material genético, en distintos estadios de su ciclo reproductivo; este es el caso de los retrovirus (ARN en el virión y ADN en la replicación) y del virus de la hepatitis B (ADN en el virión y ARN en la replicación).
  • Clasificación En función del tipo de material genético. En función de los hospedadores. En función de niveles taxonómicos gerárquicos: orden, familia, genero y especie. Según el número de filamentos de material genético.
  • Clasificación Según la masa molecular relativa. Según el mecanismo de reproducción. Según su morfología
  • Tamaño El tamaño de los virus varía ampliamente de especie a especie. Poliovirus 28 nm., y 200 nm., virus de la viruela. Los genomas son más pequeños que la mayoría de las células. Así el más grande es de 670 kilopares de bases (Bacteriófago G)
  • Determinación del tamaño Filtración Ultracentrifugación Difusión Fotografía
  • EstructuraA mas del material genético, poseen un número específico de unidades proteicas llamadas capsomeros, que se disponen siguiendo un modelo preciso y repetitivo en torno al genoma. Algunos poseen un solo tipo de proteína, otros poseen varios tipos de proteínas.
  • Estructura Algunos virus poseen envolturas lipoproteicas (glicoproteínas). Estas membranas interaccionan con la célula hospedadora, es la responsable de:1. Especificidad de la infección2. Penetración viral
  • Estructura
  • Estructura
  • Capsómeros Son unidades protéicas que forman la cubierta, con capacidad de autoensamblaje. Este proceso es mediado por Chaperones. El complejo ácido nucléico y proteína se denomina nuecleocápsida vírica
  • Capsómeros virales
  • Subunidades del capsómero
  • Simetría viral La simetría hace referencia a la manera como las unidades proteicas se ordenan en la cubierta vírica. Se reconocen tres tipos de simetría que corresponden a dos formas: cilindrica y esférica. Los alargados poseen simetría Helicoidal, como VMT.
  • Simetría viral Los virus esféricos tienen simetría icosaédrica, posee 20 caras. Los virus con simetría combinada, poseen una nuecleocáside con simetría cúbica y el nucleoproteido dispuesto en espiral.
  • Simetría viral
  • Enzimas en viriones Participan en el proceso de infección celular (lisozima). Polimerasas de ácidos nucleicos Transcriptasa inversa (retrovirus) Enzimas que ayudan a la liberación de los virus de las células hospedadoras. Neuraminidasas, que rompen proteínas y glicolípidos del tejido conectivo.
  • Replicación vírica El virus debe inducir a la célula hospedadora a sintetizar todos los componentes necesarios para fabricar más virus. El proceso ocurre en cinco etapas:1. Fijación2. Penetración
  • Replicación vírica3. Síntesis de ácido nucleico y proteína.4. Ensamblaje5. Liberación
  • FIJACIÓN La interacción es altamente específica. Una o más proteínas superficiales del virus interaccionan con receptores de la superficie celular. Los receptores determinan qué células son susceptibles de ser infectadas. (ácido siálico, que es reconocido por el virus de la gripe)
  • FIJACIÓN En ausencia de receptores el virus no puede adsorberse y no puede infectar. Si el receptor se altera el hospedaor puede hacerse resistente a la infección
  • PENETRACIÓN La unión del virus a la célula genera cambios en el virus o en la célula, que permiten el ingreso del genoma vírico a la célula. Los virus animales son decapsidados en la membrana plasmática. Otros ingresan íntegramente en la célula por endocitosis.
  • PENETRACIÓN Estos virus son decapsidados en el citoplasma celular. Los mecanismos más complejos se presentan en virus que infectan bacterias (T4 en E.coli)
  • Bacteriofagos
  • Bacteriofagos El virión tiene una cabeza, en cuyo interior se encuentra el ADN plegado y una larga cola en cuyo extremo hay una serie de fibras de cola. Las fibras fijan al virión a la pared celular. Estas ser retraen y la cola contacta con la pared celular
  • Bacteriofagos Elvirion inyecta lisozima que perfora la pared celular. La vaina d ela cola se contrae y el ADN del virus ingresa en la célula bacteriana. La cápside se queda en el exterior de la célula.
  • MECANISMO DE REPRODUCCIÓN
  • MECANISMO DE REPRODUCCIÓN
  • Ciclo lisogénico Seriede etapas tras la infección del virus que conduce aun estado (lisogenia) en el que el genoma vírico se replica como un profago junto con el genoma del hospedador.
  • Ciclo lítico Serie de etapas que tras la infección del virus que conducen a la replicación vírica y destrucción (lisis) de la célula hospedadora.
  • ¿Lisis o lisogenia? Virus como el bacteriofago lambda tiene interruptores genéticos que definen seguir el ciclo lítico o el ciclo lisogénico. Para la lisogenia deben ocurrir dos procesos: Impedirse la producción de proteínas tardías y la integración de una copia de lambda en el genoma del hospedador.
  • Características del genoma deretrovirus Contienen dos moléculas identicas de ARN monocatenario. El proceso de replicación vírica se reduce a:1. Entrada2. Decapsidación del virión.3. Transcripción inversa
  • Características del genoma deretrovirus4. Integración5. Transcripción.6. Encapsidación.7. Gemación.
  • Viroides y priones Viroides.- Son pequeñas moléculas de ARN monocatenario circular. Son causa de enfermedades en plantas. La forma extracelular es el ARN desnudo sin cápside, es totalmente dependiente de la función del hospedador para su replicación. Se consideran intrones fugados.
  • Viroides y priones Priones.- A diferencia de los anteriores poseen una forma extracelular distintiva compuesta exclusivamente de proteína, la misma que es infecciosa, para animales (prurito lumbar de las obejas “scrapie”, encefalopatía espongiforme bovina BSE, y el Kuruen el hombre.
  • ECOSISTEMAS MICROBIANOSCURSO DEMICROBIOLOGIA UDLA
  • POBLACIONES Y COMUNIDADES En un sistema microbiano, el crecimiento celular forma poblaciones. Las poblaciones metabólicamente relacionadas se denominan gremios y los conjuntos de agrupaciones interaccionan formando comunidades microbianas, que a su vez interaccionan con comunidades de macroorganismos y el ambiente, todo lo cual se definie como Ecosistema.
  • FUENTES DE ENERGÍA La energía entra en los ecosistemas en forma de luz solar, carbono orgánico y sustancias inorgánicas reducidas. El mecanismo de incorporación de la energía solar es la fotosíntesis, realizada por los organismos llamados fotoautotrofos, que constituyen la base de la cadena alimenticia.
  • FUENTES DE ENERGÍA La materia inorgánica reducida se incorpora como fuente de energía mediante los organismos quimioautotrofos (quimiolitotrofos), que utilizan la energía de donantes de electrones como el H2, Fe2+, S0 ó NH3; para su crecimiento y reproducción.
  • FUENTES DE ENERGÍA Elcarbono orgánico es metabolizado por los organismos quimioorganotrofos, que lo asimilan de los productores primarios como fototrofos y quimiolitotrofos.
  • AMBIENTES MICROBIANOS Los hábitat naturales de los microorganismos son diversos. Abarca condiciones ambientales extremas, desde zonas de hielos perpétuos hasta fuentes termales, desde profundidades terrestres hasta la estratósfera; en el interior de seres vivos hasta la superficie corporal de macroorganismos.
  • Microorganismos y microambiente Nicho ecológico, Es la función que cumple el microroganismo en el ecosistema. Las diferencias entre cantidad calidad de recursos y de condiciones físicoquímicas de un hábitat definen a un nicho. Para cada microorganismo existe al menos un nicho.
  • Microorganismos y microambiente El microambiente puede ser generado en un grano de suelo, donde los microroganismos anaerobios habitan el interior de la partícula y los aeróbicos, la superficie. Esto indica que a lo largo de una dimensión espacial pequeña existen varios nichos.
  • Microorganismos y microambiente En un microambiente las condiciones físicoquímicas pueden cambiar rápidamente en el tiempo y espacio (variaciones de pH, temperatura, etc.). Los microambientes contribuyen al incremento de la diversidad microbiana en un espacio reducido.
  • COMPETENCIA Y COOPERACION MICROBIANAS. Los microorganismos compiten por:1. Espacio.2. Nutrientes. Depende de la tasa de incorporación de nutrientes. Tasas metabólicas. Velocidad de crecimiento
  • COMPETENCIA Y COOPERACION MICROBIANAS Existe también el metabolismo complementario, como es el caso de las bacterias nitrosificantes y las nitrificantes, que se combinan para oxidar el NH3→NO2- a NO3-. Estoes, los mircoorganismos trabajan en posta.
  • AMBIENTES TERRESTRES Los microorganismos participan en:1. Formación del suelo2. Metabolismo vegetal,3. Autodepuración de los suelos.4. Reciclado de materia orgánica.
  • FORMACIÓN DEL SUELO Los suelos son el resultado de una combinación de procesos físicos, químicos y biológicos. Los líquenes, musgos y algas(autotrofos), permanecen en estado de vida latente en la roca seca y se desarrollan cuando esta adquiere humedad.
  • FORMACIÓN DEL SUELO Sucrecimiento permite la proliferación de bacterias quimioorganotrofas y hongos, cuya respiración produce CO 2, que a su vez se convierte en H2CO3, que es un agente de disolución de rocas (calizas).
  • FORMACIÓN DEL SUELO Las variaciones diarias y nocturnas de temperatura también contribuyen a la meteorización de las rocas y a la formacion de los suelos. Las raíces vegetales al penetrar el suelo contribuyen a su meteorización, sus excreciones permiten el desarrollo de la Rizosfera
  • FORMACIÓN DEL SUELO Los restos vegetales son fuente de nutrientes para un crecimiento microbiano más profuso. Las sales minerales se solubilizan y lixivian al interior, el suelo se hace más profundo. Los invertebrados del suelo contribuyen a su aireación y meteorización, permitiendo la conformación de los perfiles edáficos típicos. El proceso de formación de suelos dura cientos de años.
  • EL SUELO COMO HÁBITAT MICROBIANO El crecimiento bacteriano más importante tiene lugar en la superficie (rizosfera). Un factor determinante para el crecimiento bacteriano es la disponibilidad de agua; que existe de dos formas en el suelo: Agua de absorción en la superficie. Agua libre en forma de láminas entre las partículas del suelo.
  • EL SUELO COMO HÁBITAT MICROBIANO Lapoblación de microroganismos superficiales está comuyesta por organismos aeróbicos, saprofitos (hongos y bacterias), así como microinvertebrados, insectos, annélidos.
  • EL SUELO COMO HÁBITAT MICROBIANO Ensuelos profundos podemos encontrar a organismos aeróbicos facultativos y anaeróbicos facultativos, quiene mineralizan compuestos orgánicos y liberan productos a las aguas subterráneas.
  • COMPONENTES DEL SUELO CUARZO METRIA AIRE ORGÁNICA ARCILLA AGUA MICROCOLONIA
  • Microflora del suelo Generan procesos de : Metanogénesis. (metanobacterias)4H2 + CO2 → CH4 + 2H2O Acetogénesis.(cetobacterias)4H2 + 2 HCO3- + H+ → CH3COO- + 4H2O Reducción de sulfato.(sulfobacterias)4H2 + SO42- + H+ → HS- +4H2O
  • Microflora del suelo Producción inorgánica de H2:FeO + H2O → H2 + FeO2Especies bacterianas y fúngicas: Pseudomonas. Bacillus Antramonas. Cocos gram (+) y gram (-) Penicillum, Aspergillum Mucor.
  • AMBIENTES DE AGUA DULCE En las zonas óxicas proliferan las cianobacterias y algas; en las zonas anóxicas habitan las bacterias fototróficas anoxigénicas. Las algas flotantes constituyen el fitoplancton. Las adheridas al fondo o a los lados del lecho, son algas Bénticas.
  • AMBIENTES DE AGUA DULCE La actividad microbiológica de un sistema acuático depende de la producción primaria a cargo de los organismos fototróficos. Un factor limitante es el oxígeno, cuya concentración disminiye con la profundidad y la temperatura. También depende del contenido de materia orgánica y de la capacidad de intercambio entre las capas superficiales y profundas (estratificación).
  • Fauna de agua dulce
  • AMBIENTES RÍOS. Ambientes que requieren grandes cantidades de oxígeno, por que en ella, se depositan grandes cantidades de materia organica en forma natural o por la acción de las actividades humanas (eutrofización). La turbulencia de los ríos contribuye a su oxigenación
  • AMBIENTES Ladisminución del oxígeno en las aguas produce condiciones anóxicas y la muerte de peces, la proliferación de bacterias anóxicas y la generación de malos olores causados por: H2S, CH4, NH3 y Mercaptanos. Seincrementa el DBO5, y el pH se hace ácido.
  • AMBIENTES MARINOS Difieren en mucho de los ambientes de agua dulce en:1. Salinidad.2. Temperatura media.3. Estado nutricional que es limitante, especialmente en relación al N, P, y Fe.
  • PRODUCCIÓN PRIMARIA Se produce a mar abierto, en la superficie y a profundidades considerables, por los proclorofitos (Prochlorococcus), parientes de las cianobacterias (Trichodesmium), que participa en el ciclo del nitrógeno. Eucariotas autotrofos de aguas costeras (Ostreococcus), alga de unos 0,7 mm.
  • PRODUCCIÓN PRIMARIA La zona próxima a la costa es más fértil que el mar abierto, existe mayor biodiversidad microbiana y de animales superiores que se alimentan de estos. A mar abieto se hallan poblaciones de 105 y 106 células por unidad de volumen.
  • PRODUCCIÓN PRIMARIA Los eucariotas se hallan en cantidades de 104/ml. Otro género representativo del mar es Archea, Halobacterium (posee bacteriorodopsina como pigmento fotosintético). Habita las zonas superficiales hasta zonas profundas (5000m.), donde existen 4x103 células.
  • Fauna marina
  • Microbiología de aguas profundas La luz solar penetra hasta un máximo de 300m en el mar abierto. La parte iluminada se llama Fótica. Por debajo de esta hasta unos 1000m se produce una intensa actividad biológica por acción de organismos quimiorganotróficos, a temperaturas de 2 ó 3 °C.
  • Microbiología de aguas profundas Las bacterias soportan grandes presiones (300 atm.). Bacterias que habitan a 4000- 6000 m. soportan presiones de 500 atm. De profundidades mayores a 10000m, se han obtenido bacterias que soportan 700-800 atm.
  • FUENTES HIDROTERMALES En fuentes hidrotermales submarinas de 6- 23°C y 270-280°C, son ricas en microorganismos y gusanos túbicos, mejillones gigantes (20-25 cm). Reducen H2S, Mn2+, H2 y CO. Los más representativos son:1. Thiobacillus2. Thiomicrospira3. Thiothrix y4. Beggiatoa
  • CICLOS BIOGEOQUÍMICOS CARBONO, NITROGENO, FÓSFORO, AZUFRE, AGUA
  • CICLO DEL CARBONO Losdos procesos básicos de la vida que participan en el ciclo del carbono- oxígeno son la respiración y la fotosíntesis. Tanto las plantas como los animales respiran. Sólo las plantas verdes fotosintetizan
  • CICLO DEL CARBONO Durante la respiración celular, la glucosa se oxida y el bióxido de carbono es puesto en libertad. Durante la fotosíntesis, las plantas verdes utilizan agua, bióxido de carbono y energía del Sol para hacer oxígeno, glucosa y agua.
  • CICLO DEL CARBONO Cuando mueren las plantas y los animales, aquellos compuestos orgánicos de los que están hechos sus cuerpos, son liberados por los microorganismos. Uno de los productos finales que se forma es el bióxido de carbono.
  • CICLO DEL CARBONO Otra fuente de bióxido de carbono en las sociedades modernas se forma al quemar los combustibles fósiles. Los compuestos de carbono de muchas plantas y animales muy antiguos fueron almacenados en forma de carbón y de petróleo, al ser quemados estos combustibles, el bióxido de carbono es liberado en la atmósfera. Así, el carbón realiza un círculo completo, de CO2 de la atmósfera a glucosa, y a CO2 de nuevo.
  • CICLO DEL CARBONO CO2Actividades Atmosférico humanas Plantas Animales y CO2 microorganismos terrestres disuelto Plantas Animales acuáticas y acuáticos algasCombustible Humus s fósiles ROCA CORTEZA TERRESTRE
  • CICLO DEL NITRÓGENO Nuestra atmósfera está formada de un 78% de nitrógeno por volumen. A pesar de esta abundancia, el nitrógeno en ocasiones es un factor limitante para el crecimiento de las plantas. La razón de esto es que, aunque las plantas deben tener nitrógeno para manufacturar sus proteínas estructurales y sus enzimas, no pueden cambiar el elemento nitrógeno en los compuestos que necesita.
  • CICLO DEL NITRÓGENO El nitrógeno debe estar presente en forma de compuestos como los nitratos antes de que las plantas lo puedan absorber y usar. Las bacterias simbióticas como la Rhizobium y algunas bacterias azul verdosas, pueden cambiar el nitrógeno atmosférico en compuestos de amonio (NH4).
  • CICLO DEL NITRÓGENO La Rhizobium vive en las raíces de las leguminosas, que incluyen plantas como el trébol y la alfalfa. Las bacterias usan el azúcar producida por las leguminosas y a su vez ayudan a las plantas dando los compuestos de nitrógeno que ellas pueden utilizar. Este proceso se denomina fijación de nitrógeno.
  • CICLO DEL NITRÓGENO Existen otras fuentes naturales de nitratos:1. Tormentas atmosféricas.2. Erosión de ciertas rocas que son ricas en nitratos.3. Ciertas bacterias nitrificantes químico- sintéticas convierten el amonio en nitritos y nitratos mediante el proceso denominado nitrificación.
  • CICLO DEL NITRÓGENO Cuando los animales comen proteínas vegetales, pueden utilizar los aminoácidos para hacer sus propias proteínas. Sus desechos regresan el nitrógeno al suelo en forma de urea y otros compuestos que se convierten en amoniaco.
  • CICLO DEL NITRÓGENO Algunas bacterias logran que el nitrógeno regrese a la atmósfera metabolizando el amoniaco presente en el suelo. Este proceso se llama desnitrificación. Las bacterias que causan la liberación del nitrógeno libre del suelo son anaerobias. Son más abundantes en el suelo denso y saturado de agua.
  • CICLO DEL NITRÓGENO Los procesos a los que se somete el nitrógeno son:1. Denitrificación, a cargo de Bacillus y pseudomonas.2. Amonificación, a cargo de Clostridium y Acetobacter (de N2 a amoníaco).3. Nitración a cargo de Nitrobacter (de nitrito a nitrato)4. Nitrosación a cargo de Nitrosomonas ( de amoníaco a nitrito)
  • CICLO DEL NITRÓGENO Nitrificación NO2- N2 Fijación de N2 NH2NO3-1 Óxico NH3 NH2 Anóxico Amonificació n Fijación de NO N2O N2 NO2- N2 Denitrificación
  • CICLO DEL AZUFRE El azufre presenta varios estados de oxidación, en los que participan reacciones químicas y microorganismos: Sulfhidrilo. R-SH. Sulfuro, HS-. Azufre elemental S°. Sulfato, SO42- La mayor parte del azufre se encuentra en sedimentos y rocas en forma de sales de sulfato.
  • CICLO DEL AZUFRE Como minerales de sulfuro (pirita FeS2). El mar es el reservorio más importante. El H2S se forma por reducción bacteriana (sulfato reductoras) del sulfato, por emisiones volcánicas. El H2S, se transforma por acción de bacterias a S° en condiciones anóxicas. El S° se oxida por Thiobacillus a SO42-
  • CICLO DEL AZUFRE Además de copmpuestos inorgánicos existen formas orgánicas de azufre, volátiles de olor desagradable (mercaptanos), como el dimetilsulfuro, que se origina en fondos marinos como resultado de la degradación del propionato de dimetilsulfonio, que regula la presión osmótica en las algas marinas.(45 millones ton/año).
  • CICLO DEL AZUFRE Otros son: Metanosulfonato, que se oxida produciendo metano y ácido sulfhídrico, o como donante de electrones en la fijación fotosintética del CO2. Tambien como donador de electrones para algunos quimioorganotrofos y quimiolitotrofos. Dimetildisulfuro. Disulfuro de carbono.
  • CICLO DEL AZUFRE Las fuentes de azufre son:1. Aspersión marina como sulfatos.2. Volcanes activos, como SO2 y H2S.3. Cienegas y pantanos, como SO2 y H2S.4. Procesos industriales (industria petroquímica).
  • CICLO DEL AZUFRE Oxidación quimiolitotrófica S° Óxico HS-. AnóxicoSO42- H2 S HS-. S°
  • CICLO DEL FÓSFORO Inicia en la roca fosforada de los lechos marinos (Halofano), la misma que se diluye liberando PO43-, que es asimilado por las plantas, que son consumidas por los animales. Sus restos y deyecciones, son fijados y pasan a la roca fosforada. De la roca fosforada o de restos y deyecciones, el PO43- pasa a las aguas continentales.
  • CICLO DEL FÓSFORO De las aguas, pasan al fitoplancton, de allí al zooplancton, que es consumido por los peces, estos son cazados por las aves marinas, quienes depositan guano, que sirve de abono, que retorna al suelo los fosfatos, para su fijación en la roca halofana.
  • CICLO DEL FÓSFORO El fósforo es sometido a los siguientes procesos:1. Mineralización2. Almacenamiento3. Recambiuo en el humus4. Fijación química en el suelo