Curso realizado na UFPA em 08/06/2013.

1. WEKA - Basics
Docente: Prof. Dr. Ádamo Lima de Santana
Discente: Lilian de Jesus Chaves Dias
Abril – 2013

2. Agenda
Ê Introdução;
Ê Conceitos Básicos;
Ê Suporte;
Ê Aplicações;
Ê GUI – Explorer;
Ê API.

3. Introdução
Sobre o WEKA

4. Sobre
o
WEKA
Ê Projeto acadêmico de 1990;
Ê Coleção de Algoritmos de Aprendizado de Máquina;
Ê Aplicação a Mineração de Dados;
Ê Standalone ou API;
Ê WEKA – Waikato Environment for Knowledge Analysis;
Ê Grupo de Aprendizado de Máquina da Universidade de
Waikato, Nova Zelândia;
Ê Associate Professor Eibe Frank, Dr. Mark Hall, Professor
Ian Witten.

5. Baixando
Ê Site Oficial:
http://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/
index.html
Ê Versão estável: 3-6-9;
Ê Versão Desenvolvimento: 3-7-9;
Ê Windows, Mac OS X e Linux;
Ê GPLv2.

6. Conceitos Básicos
Elementos da Base, Tipo de Arquivos

7. Elementos
da
Base

8. Tipo
de
Arquivos
Ê ARFF (Attribute-Relation FileFormat);
Ê Header + Data;
Ê @attribute <attribute-name> <datatype>:
Ê Numérico, nominal, string,data e
relacional.

9. Comentário
Atributos
Atributo Nominal
Dados
Nome da base

10. Suporte
Comunidade, tutoriais, arquivos, documentação

11. Suporte
Ê Comunidade ativa - pentaho;
Ê Apresentações e vídeos;
Ê Manual;
Ê Documentação Online;
Ê Wiki;
Ê Hows-To.

12. Suporte

13. Aplicações
Simple CLI, Visualization, Tools, Experimenter,
Knowledge Flow

14. Ferramenta - GUI

15. Simple
CLI

16. Ferramenta - GUI

17. Visualization
-­‐
Plot

18. Visualization
-­‐
ROC

19. Ferramenta - GUI

20. Tools
–
Arff
Viewer

21. Ferramenta - GUI

22. Experimenter

32. Ferramenta - GUI

33. Knowledge
Flow

34. Explorer - GUI
Pré-processamento, Classificador

35. GUI

36. Demonstração GUI
Ê Configurações do arquivo:
Ê Instâncias;
Ê Atributos;
Ê Classificadores:
Ê Configurações.

37. API
Manipulação de dados e classificadores

38. Biblioteca
Ê Classpath = weka.jar
Ê Código-fonte = weka-src.jar
Ê Javadoc = <caminho da versão do weka>/doc

39. Manipulação de Dados
Ê Criação de conjunto de dados na memória;
Ê Formatar a base e adicionar valores:
Ê weka.core.Instances;
Ê weka.core.Attribute.

40. Formatando
o
dataset
procedimento para
atributos nominais
procedimento para
atributos numéricos
procedimento para
adicionar os atributos
Nome da relação Reserva de memória

41. Adicionando valores
Ê Adição de linha por linha:
Ê weka.core.Instance;
Atributos
numéricos
Peso padrão de uma instância

42. Principais
Métodos
Ê Instances:
Ê toSummaryString();
Ê numInstances();
Ê numAttributes();
Ê numClasses();
Ê meanOrMode(Attribute att) | meanOrMode(int attIndex);
Ê attributeToDoubleArray(int index);
Ê instance(int index);
Ê attribute(int index);
Ê delete(int index);
Ê sort(Attribute att);
Ê swap(int i, int j);
Ê testCV(int numFolds, int numFold);
Ê trainCV(int numFolds, int numFold).

43. Principais
Métodos
Ê Instance:
Ê attribute(int index);
Ê setValue(int attIndex, double value);
Ê stringValue(int attIndex);
Ê value(int attIndex);
Ê toString();
Ê toString(int attIndex);
Ê numAttributes();
Ê numValues().

44. Principais
Métodos
Ê Attribute:
Ê isNominal();
Ê isNumeric();
Ê isString();
Ê isInRange(double value);
Ê name();
Ê toString();
Ê type();
Ê value(int valIndex);

45. Imprimindo valores da base
Informações gerais sobre a base.
Valores de cada linha.

46. Persistindo a base
Ê weka.core.converters.ConverterUtils.DataSink;
Ê Pasta do projeto;

47. Carrega base existente na memória
Deve ser um arquivo válido

48. Exercitando…
Ê Criar uma base com 4 atributos e 150 instancias:
Ê Att 1 – Numérico – de 10~37;
Ê Att2 – Nominal – V ou F;
Ê Att3 – Numérico – de 20 ~ 200;
Ê Att4 – Nominal – Bom, Médio, Ruim (Classe);
Ê Imprimir sumário da base.
Ê Persistir base em Files/minhaPrimeiraBase.arff

49. Exercitando…
Ê Ler base hepatitis.arff;
Ê Imprimir relatório da base;
Ê Mostrar quantidade de cada valor nominal do atributo
SEX, HISTOLOGY e ANOREXIA;

50. Classificadores

51. Classificadores
Ê Tarefa de Classificação;
Ê weka.classifiers;
Ê Batch-trainable – a base inteira é treinada de uma vez;
Ê Incrementais – atualizam o modelo interno on-the-go;

52. Classificadores - Batch
Ê Configurar as opções;
Ê Treinar as instancias;
Base de treino

53. Classificadores - Incremental
Ê Implementam a interface UpdateableClassifier;
Ê Inicializar o modelo;
Ê Atualizar linha à linha – updateClassifier(Instance);
weka.core.converters
Lê
a
estrutura
e
cria
instâncias
vazias

54. Avaliação
Ê Qualidade da performance do modelo do classificador
gerado a partir dos dados;
Ê Coss-validation – Utiliza uma base e gera avaliações
realísticas;
Ê Teste dedicado.

55. Avaliação – Cross-validation
Ê Classificador “destreinado”;
Ê Única base de dados;
Classificador Fold
Base Seed
Base

56. Avaliação – Train/test
Treino
Teste

57. Estatísticas
Ê toMatrixString – imprime a matriz de confusão;
Ê toClassDetailsString – imprime as taxas de VP/FP,
precisão, recall, AUC (por classe);
Ê toCumulativeMarginDistributionString – imprime as
margens de distribuição acumuladas;

58. Outros métodos estatísticos
Ê Atributo classe nominal
Ê correct();
Ê pctCorrect() | pctIncorrect();
Ê areaUnderROC(int) – para classe específica;
Ê Atributo classe numérico
Ê correlationCoefficient();
Ê Geral
Ê meanAbsoluteError();
Ê numInstances();

59. Exemplo de Implementação

60. Exercitando…
Ê Ler o arquivo hepatitis.arff;
Ê Imprimir configurações da base;
Ê Implementar uma MLP:
Ê Auto-build;
Ê Learning rate = 0.5;
Ê Momentum = 0.5;
Ê TrainingTime = 1000;
Ê Hidden Layers = 2 com 3 neurônios cada;
Ê Classe a atributos normalizados;
Ê Cross-validation;
Ê Imprimir estatísticas:
Ê Acurácia, matriz de confusão e detalhes por classe.
Ê Salvar como nova base .arff

61. Ê Ler o arquivo iris.arff;
Ê 3 classificadores:
Ê PART;
Ê 5-NN;
Ê Naïve Bayes;
Ê Relatório com:
Ê Acurácia;
Ê RMSE.
Exercitando…

62. Visualização

63. Visualização
–
Curva
ROC
Ê Curvas de Características de Operação do Receptor
( do inglês Receiver Operating Characteristic);
Ê Avaliação de modelos de classificação;
Ê Taxa de verdadeiros positivos e taxa de falsos positivos;
Ê weka.gui.visualize;
Ê Base usada: colic.arff.

64. Exemplo
–
Curva
ROC
ROC para determinado
label de classe
Container para o ROC
Painel para o container
JFrame

65. Exemplo – Curva ROC – Classe 0

66. Exemplo – Curva ROC – Classe 1

67. Visualização
–
Gráfico
de
Árvores
Ê Visualização dos gráficos internos do modelo gerado;
Ê Árvores de Decisão;
Ê Rede Bayesiana;
Ê weka.core.treevisualizer;

68. Visualização
–
Gráfico
de
Árvores

69. Visualização
–
Gráfico
de
Árvores

70. Referências
Ê Witten, I.H. and Frank, E. (2005) Data Mining: Practical
machine learn- ing tools and techniques. 2nd edition Morgan
Kaufmann, San Francisco.
Ê WekaWiki – http://weka.wikispaces.com/
Ê Weka Examples – A collection of example classes, as part of
an ANT project, included in the WEKA snapshots (available
for download on the homepage) or directly from subversion
https://svn.scms.waikato.ac.nz/svn/weka/branches/stable-3-6/
wekaexamples/
Ê Bouckaert et al. (2013) Weka Manual for Version 3-6-9. The
University of Waikato, Hamilton, Nova Zelândia.

71. Obrigada.

72. WEKA - Basics
Docente: Prof. Dr. Ádamo Lima de Santana
Discente: Lilian de Jesus Chaves Dias
Abril – 2013