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La e-investigación en España
 

La e-investigación en España

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Balance sobre la aplicación de la tecnología del cloud computing en el ámbito de la ciencia ...

Balance sobre la aplicación de la tecnología del cloud computing en el ámbito de la ciencia

Ignacio Blanquer, Departamento de Sistemas Informáticos. Universidad Politécnica de Valencia.

Jornada 'El impacto de la Nube y el Big Data en la Ciencia'

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  • The first PRACE machine has been installed in Julich: JUGENE (IBM Blue Gene/P) - total of 72 racks with 294,912 processors, peak performance of 1 petaflop. Main memory 2 Gbytes/node. Can only store data for 90 days. PRACE expects to install another 4 machines (different suppliers/architectures) around Europe (roughly 1 per year) to ensure Europe has access to the latest HPC machines for the 5 years to come.http://www.prace-project.eu/hpc-access/page-7

La e-investigación en España La e-investigación en España Presentation Transcript

  • La e-Investigación en España Ignacio Blanquer - iblanque@dsic.upv.es Universidad Politécnica de Valencia 1
  • Presentación • Ignacio Blanquer es profesor titular de la Escuela Superior de Ingeniería Informática. • Pertenece al grupo de investigación en Grid y Computación de Altas Prestaciones, fundado por el profesor Vicente Hernández, desde hace casi 20 años. • Su principal actividad investigadora se ha concentrado en la aplicación de estas tecnologías en el ámbito de la salud. • Es además: – Investigador del Instituto de Instrumentación para Imagen Molecular (I3M). – Responsable de aplicaciones del proyecto VENUS-C y del área de aplicaciones de la Red Española de e-Ciencia. – Miembro de los grupos de investigación multidisciplinares 2 GIBI230 y HPC4NGS.
  • “Disclaimer” • Esta presentación pretende hacer un repaso inevitablemente incompleto de la actividad de e- Ciencia en España que se ha constatado a través de la Red Española de e-Ciencia. • La presentación contiene numerosas transparencias y datos producidos por otros investigadores españoles. • No obstante, las conclusiones y opiniones son enteramente personales. 3
  • Contenido • E-Ciencia y conceptos asociados • Panorama Europeo – Infraestructuras Computacionales: EGI, PRACE, GEANT, HelixNebula. – El futuro próximo: Horizonte 2020. • Posición Española – E-Infraestructuras: IBERGRID, RES, RedIRIS, Centros Autonómicos. – Usuarios: La Red de e-Ciencia. • Conclusiones. 4
  • El concepto de e-Ciencia Tres visiones 5
  • E-Science as “enhanced” ScienceEl Concepto de la e-Ciencia • "e-Science is about global collaboration in key areas of science, and the next generation of infrastructure that will enable it.“ • "e-Science will change the dynamic of the way science is undertaken.“ John Taylor Director General of Research Councils Office of Science and Technology 6
  • El cuarto paradigmaEl Concepto de la e-Ciencia • En el milenio pasado, la ciencia era empírica: – Descripción de fenómenos naturales. • Hace unos pocos siglos se inicia la aproximación teórica – Uso de modelos, fórmulas y generalizaciones. 2 . c2 • En las últimas décadas aparece la rama a 4 G a 3 a2 computacional – Simulación de fenómenos complejos • En la actualidad se centra en la exploración de los datos: (e-Ciencia) – Unificación de teoría, experimentación y simulación – Captura masiva de datos mediante instrumentos o generada mediante simulación y Procesada por computador. – Conocimiento e información almacenada digitalmente. – Científicos analizando bases de datos y ficheros en infraestructuras de datos. Jim Gray, National Research Council, http://sites.nationalacademies.org/NRC/index.htm; 7 Computer Science and Telecommunications Board, http://sites.nationalacademies.org/cstb/index.htm.
  • e-Ciencia como una nueva visión de la CienciaEl Concepto de la e-Ciencia Technology push Application pull networking value added of grids distributed collaborative instrumentation research (virtual computing communities) data curation… ••• 8 • Large challenges with large social impact • The famous “Data deluge” • Interdisciplinarity. • Virtual Research Communities. Source: Mario Campolargo, Former Head of Unit on e-Infrastructures, European Commission
  • Las e-InfraestructurasConceptos Asociados • Según el e-IRG: “The term e-Infrastructure refers to this new research environment in which all researchers - whether working in the context of their home institutions or in national or multinational scientific initiatives - have shared access to unique or distributed scientific facilities (including data, instruments, computing and communications), regardless of their type and location in the world.” • En este modelo encontramos sistemas para el descubrimiento de recursos, la gestión de datos distribuida, la monitorización de recursos y aplicaciones, la gestión eficiente de los recursos y la seguridad. 9
  • Las e-Infraestructuras Conceptos Asociados • Diferenciación de infraestructuras en e-ciencia Data H Capability computing P Petaflop Supercomputers C Data Grid of Supercomputers Data HCapacity computing T Grid of dedicated C clusters & computers Data Desktop Grids 10
  • MiddlewareConceptos Asociados • Conjunto de aplicaciones y servicios que permiten utilizar de forma coordinada y eficiente las e-Infraestructuras – Se sitúa entre el sistema operativo y las aplicaciones. • Federa identidades • Gestiona el acceso remoto • Equilibra la carga • Indexa los datos • Federa los recursos • Monitoriza el sistema • Virtualiza los recursos • Autoriza el acceso • Facilita la programación de aplicaciones 11
  • Science GatewaysConceptos Asociados • Las e-Infraestructuras a veces ofrecen interfaces complejos o poco amigables – La adaptación de las aplicaciones requiere un conocimiento de los recursos y del middleware. • Los Science Gateways facilitan el acceso y uso de las e-infraestructuras automatizando procesos y ofreciendo interfaces amigables – Como consecuencia se puede perder flexibilidad. 12
  • Organizaciones Virtuales - Virtual OrganizationsConceptos Asociados • Conjunto de usuarios de • Internacionales diferentes organizaciones – Atlas, biomed, embrace, compchem, reales que colaboran auger, planck,… – Técnicamente son listados de • Nacionales identificadores de usuarios y – ict.vo.ibergrid.eu, life.vo.ibergrid.eu, los roles asociados. earth.vo.ibergrid.eu,… • La pertenencia a una VO define a grosso modo los recursos a los que un usuario puede acceder. 13
  • Breve Análisis de la e-ciencia en Europa 14
  • La e-Ciencia como una apuesta internacionalSituación en Europa • El Consejo de Liubliana de 2008 definió una nueva visión del Espacio Europeo de Investigación (ERA - http://ec.europa.eu/research/era) basada en la libre circulación del conocimiento (la «quinta libertad»). • El informe Aho de mayo de 2008 subrayaba la importancia de desarrollar unas infraestructuras que permitan divulgar la ciencia por medios electrónicos (la e-ciencia). • Infraestructuras y retos científicos a gran escala que transcienden la capacidad individual de los países. • En 2008 se crea el e-IRG (e-Infrastructure Reflection Group - http://www.e-irg.eu), para crear un marco político, tecnológico y administrativo para el uso compartido y eficiente de infraestructuras electrónicas distribuidas en Europa – Recientemente publica la 4º versión de su roadmap. 15
  • Marco Estratégico – Hacia el Liderazgo Mundial en e-CienciaSituación en Europa • La “Communication from the European Commission on ICT Infrastructures for e- Science (COM (2009)” de la Unión Europea define un plan para alcanzar el liderazgo en e-Ciencia a través del desarrollo de un conjunto de e-Infraestructuras y su explotación para promover la innovación. – La inversión en infraestructuras electrónicas representa una oportunidad para fomentar el crecimiento y el empleo, así como para impulsar un nuevo renacimiento científico. – El crecimiento en el rendimiento de los equipos informáticos permite responder a las nuevas necesidades de modelización y simulación informáticas de ciertos sectores, tales como la investigación sobre el cambio climático o la asistencia sanitaria selectiva. • Sus conclusiones fueron: – GÉANT debe seguir aumentando su rendimiento, – Se anima a las empresas a que utilicen los Grids de e-ciencia europeos. – Impulso de las iniciativas Grid nacionales creadas por los estados miembros e interacción a nivel internacional. – Mejora del acceso a la información científica. – Nueva generación de servicios de supercomputación en la escala exa en 2020. – Impulsar la explotación de las infraestructuras por los Estados Miembros con el objetivo de alojar a las comunidades científicas virtuales mundiales. 16
  • Grid Computing – Iniciativa Europea de Grid (EGI)Situación en Europa • Participan 332 Organizaciones de 58 Países. • Alcanza los 320.000 Cores y 152 PBytes. – VOs para la Resolución de Grandes Problemas en las Áreas de Física de Altas Energías, Biocomputación, Geofísica, Astrofísica. • 1.700.000 trabajos diarios y 20.000 usuarios registrados. • España participa a través de la Iniciativa nacional de Grid. http://www.egi.eu 17
  • PRACE (Partnership for Advanced Computing in Europe)Situación en Europa • PRACE es una iniciativa dirigida a fortalecer el uso de infraestructuras de supercomputación para permitir alcanzar un impacto importante en la investigación básica y aplicada. • PRACE se estructura en varios niveles (tiers) siendo el tier 0 el que aporta los recursos de mayor envergadura. • En PRACE participan 25 países miembros y el tier 0 está formado por 4 países y seis equipos. – BSC (España), CINECA (Italia), GCS (Alemania) y GENCI (Francia). • Conjuntamente aportan una potencia sostenida de más de 11,5 Pflops y casi 1M de cores (943.616) con 6 computadores en las posiciones 5, 6, 7, 9, 11, 27 y 36 de la lista TOP500 (www.top500.org). 18
  • Redes de Comunicaciones - GEANTSituación en Europa • GÉANT es la red de investigación y educación paneuropea que conecta las redes nacionales europeas de investigación y educación (NRENs). • GÉANT une más de 40 millones de investigadores y estudiantes en Europa y permite el acceso de banda ancha a diferentes recursos singulares para física de altas energías, radio astronomía, biomedicina, cambio climático, observación de la tierra, arte, etc. • GÉANT está parcialmente fundada por la Comisión Europea. 19
  • Cloud computingSituación en Europa • El cloud computing se asocia más a un modelo de negocio en la provisión de recursos. • Con un impacto enorme en el sector industrial (especialmente PYMES), su aplicación científica está despegando con la inclusión de nuevos servicios. • Enfocado a la • Enfocado a la “gran ciencia” ”long-tail of scientists” − Consorcio entre grandes − Experiencia piloto en actores científicos y grandes el desarrollo de un stack de componentes para empresas para avanzar en la aplicaciones científicas en infraestructuras cloud provisión sostenible de recursos de públicas o privadas. computación en la nube. − 27 aplicaciones, 2 Millones de horas*core, − Tres casos de uso: Física de Altas Energías, componentes de código abierto para ejecución de Genómica y Observación de la Tierra. workflows, acceso a datos, contabilidad, seguridad. − En fase de definición y exploración. − Soportando los estándares industriales. 20
  • Un ecosistema de solucionesSituación en Europa Grids Supercomputers Entorno Colaborativo Escasos Recursos Distribuidos (político/sociológico) Redes de interconexión de baja latencia Commodity hardware Admisión bajo revisión científica Gestión de Datos Aplicaciones altamente acopladas Interfaces complejos Interfaces de acceso tradicionales No existe una única solución para todos Clouds los problemas Computación Voluntaria Gestión basada en la economía de escala Acceso simplificado a millones de CPUs Commodity hardware Problemas de latencia y transmisión de datos Virtualización para la previsión de servicios Entornos difícilmente controlables Detalles de la infraestructura física ocultos Implica una participación activa Interfaces simplificados Interfaces complejos La interoperabilidad entre las infraestructuras podrían permitir el desarrollo de aplicaciones heterogéneas que aprovechen lo mejor de cada una 21 Fuente: Ian Bird, CERN
  • El futuro: Horizonte2020Situación en Europa • Se espera un incremento del 46% del presupuesto (para 2014–20). • Las iniciativas “Horizon 2020”, “Digital Agenda for Europe” e “Innovation Union” proponen una actuación cohesionada: – alcanzar el liderazgo mundial en la e-ciencia; – consolidar infraestructuras electrónicas; – explotar estas infraestructuras electrónicas para impulsar la innovación. • Énfasis en servicios innovadores, “digital curation”, acceso abierto, interoperabilidad y un mayor enfoque centrado en el usuario – Mejora de la relación entre usuarios y proveedores de servicios – Apostar por el desarrollo de las e-infraestructuras de datos. – Impulsar el diálogo y transferencia tecnológica con industria (especialmente PYMES). – Extender el rol de las e-infraestructuras a nuevas comunidades y requerimientos. – Afrontar los problemas medioambientales de las infraestructuras. 22
  • La situación española de la e- ciencia 23
  • ES-NGI: Infraestructura Nacional de GridInfraestructuras Grid en España • ES-NGI es la Infraestructura Nacional de Grid en España (www.es- ngi.es). • La componen actualmente 28 centros, aportando 17.690 cores y con más de 100 usuarios registrados. • La NGI española opera desde 2010 – Misión • Dar soporte a los investigadores a través a infraestructuras de computación distribuídas, y que provea de acceso uniforme a recursos de computación, almacenamiento y datos. – Objetivo • Conectar a investigadores de todas las disciplinas con servicios ICT innovativos que les ayuden a llevar a cabo sus proyectos de investigación. – Promueve la internacionalización • Formando parte de una Federación Europea de recursos digitales, EGI. • Opera de forma federada con la iniciativa Portuguesa de Grid. 24
  • IBERGRIDInfraestructuras Grid en España • IBERGRID es la federación de las iniciativas de grid nacionales Española y Portuguesa. EN IBERGRID HAY MÁS DE 24,000 CORES DE EJECUCIÓN Y 20 PETABYTES DE ALMACENAMIENTO ONLINE DEDICADOS A DAR SOPORTE A COMUNIDADES DE USUARIOS EN EL GRID 25
  • Red IRISInfraestructuras Grid en España 26
  • ES-NGI, Utilización: Comunidades InternacionalesInfraestructuras Grid en España3000000 90000000 800000002500000 700000002000000 60000000 500000001500000 2011 2011 40000000 2012 20121000000 30000000 20000000500000 10000000 0 0 Fusion Biomed Quimica Ingenieria ATLAS CMS LHCb • 130 Millones de horas de CPU en el año 2011 – 13% en soporte a áreas de investigación ajenas al LHC • 177 Millones de horas de CPU en el año 2012 – 18% en soporte a áreas de investigación ajenas al LHC • Equivalente a 20,000 CPUs (KSI2K) constantemente ejecutando – 65% de la infraestructura está provista por centros Tier del LHC – 35% es infraestructura genérica. 27
  • Actividad no-LHC comparada con otras NGIs EuropeasInfraestructuras Grid en España 120 2 1.8 100 1.6 1.4Millones de horas 80 1.2 60 1 0.8 40 0.6 0.4 20 0.2 0 0 Actividad en términos absolutos Crecimiento 2011/2012 28
  • Actividad Internacional Infraestructuras Grid en España LIFE • Astrofísica:CHEM.IBERGRID AUGER, CTA, MAGIC y parte ICT.IBERGRID (1M) de PHYS.ibergrid MAGIC IFIC • Fusión: FUSION ENG.IBERGRID • Química: COMPCHEM COMPCHEM, CHEM.ibergrid FUSION • Biología: CTA BIOMED, LIFE.ibergrid VO.EDGES • Ingeniería: BIOMED ENG.ibergrid, ICT.ibergridPHYS.IBERGRID AUGER • Genéricos: PHYS.ibergrid, IFIC y EDGES 0 1000000 2000000 3000000 4000000 5000000 6000000 • TOTAL = 15 millones KSI2K 29
  • Interacción con la Red Española de e-CienciaInfraestructuras Grid en España • Canal de comunicación con los usuarios – El entorno de la Red de e-Ciencia es un Canal de información valioso entre la Infraestructura y sus potenciales usuarios. – Solamente en el UK existe un entorno similar. – Potencial para organizar reuniones con los usuarios • Comunicación con los usuarios – E-science network mailing list. – Más de 450 personas suscritas. 30
  • Acceso a la Infraestructura ES-NGIInfraestructuras Grid en España • Usuarios de colaboraciones en VOs internacionales – Acceso a través de su propio mecanismo de acceso a la VO • ATLAS, CMS, COMPCHEM, FUSION, BIOMED,… • Usuarios nacionales – Formulario de acceso a recursos con descripción de necesidades – Información en: http://www.es-ngi.es/usuarios_acceso_ngi.php – Acceso automático para proyectos de investigación financiados en convocatorias competitivas. • En otro caso, se evalúa según los recursos existentes – Con el objetivo de hacer seguimiento más que limitar el acceso de usuarios. 31
  • Estrategia para nuevos servicios de ES-NGIInfraestructuras Grid en España • Las infraestructuras distribuidas deben evolucionar: – Datos; Creación y Gestión de Bases de Datos de manera eficiente. – Acceso interactivo a recursos. – Inclusión de nuevas arquitecturas (GPUs). – Interoperación con otras plataformas digitales,…. • La tecnología Grid ha desarrollado un modelo de autenticación digital, organización de usuarios en VOs, gestión distribuida de datos, Monitorización global, etc… • La evolución implica nuevos modos de acceso a la infraestructura: – Utilización de la virtualización de servicios (software y hardware especializado) – Acceso a recursos necesita ser más ágil. – Ser capaces de desplegar nuevos servicios sobre infraestructuras en producción de manera no disruptiva. • El modo de producción Grid debe seguir. – Muchos usuarios sin embargo encuentran actualmente sus necesidades cubiertas. 32
  • La Red Española de Supercomputación y los Centros Autonómicos 33
  • Red Española de SupercomputaciónInfraestructuras Supercomputación en España • Compuesta por 8 centros y liderada por el BSC – MareNostrum, MinoTauro en el Centro de Supercomputación de Barcelona. – Magerit en el Centro de Supercomputación y Visualización de Madrid (CeSViMa - UPM) – LaPalma en el Instituto Astrofísico de Canarias (IAC) – Altamira en el Instituto de Física de Cantabria (IFCA). – Picasso en la Universidad de Málaga. – Tirant en la Universidad de Valencia. – Caesaraugusta en el Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos (BIFI) de la Universidad de Zaragoza. 34 – Atlante en el Instituto Canario de Tecnología (ICT).
  • BSC – Mare Nostrum IIIInfraestructuras Supercomputación en España • Potencia Pico de 1 Petaflops. • 48,448 cores Intel SandyBridge-EP E5-2670 a 2.6 GHz (3,028 nodos). • 94.625 TB de memoria principal (32 GB/nodo). • 1.9 PB de almacenamiento en disco. • 2 Redes de Interconexión: – Infiniband y Gigabit Ethernet. • Sistema Operativo: Linux – Distribuión SuSe. 35
  • El Resto de la RESInfraestructuras Supercomputación en España Altamira Caesaraugusta 3840 procesadores x86 512 procesadores PPC64 (Intel E5-2670) y 15TB de (IBM PowerPC 970) y 1TB de RAM con un rendimiento de RAM y com um rendimiento 74 TFlops de 3Tflops Marguerit2 3920 Procesadores PC64 Tirant (IBM POWER7) y 7840 GB 2048 procesadores PPC64 RAM, con un rendimiento (IBM PowerPC 970MP) de 72 Tflops y 4086 GB de RAM con un rendimiento de 13 TFlops Picasso Atlante 512 procesadores 336 procesadores PPC64 (IBM PowerPC PPC64 (IBM PowerPC 970) y 1TB de RAM y 970) y 672 GB Picasso un rendimiento de RAM, con un 512 procesadores PPC64 3Tflops rendimiento de 2 (IBM PowerPC 970) y 1TB Tflops. de RAM y com um rendimiento de 3Tflops 36
  • Centros Autonómicos de SupercomputaciónInfraestructuras Supercomputación en España • CESGA, Centro de Supercomputación de Galicia. – Finis Terrae: 2,580 Procesadores Itanium, con una Potencia Sostenida de 16 Tflop/s en 147 Nodos NUMA con 20 TB de Memoria Compartida. • CESCA, Centro de Supercomputación de Cataluña. – Diversos equipos hasta 5 Tflops. • FCSCL, Fundación Centro de Supercomputación de Castilla y León – Caléndula, 304 nodos blade bi Xeon Qcore y 33TF. • CénitS, Centro Extremeño de investigación, Innovación Tecnológica y Supercomputación – Lusitania, 128 procesadores Itanium dual-core. • FPCMUR, Fundación Parque Científico de Murcia – Ben Arabi, 192 nodos blade Xeon quad-core y 18 Tflops. 37
  • Participación Española en Proyectos de e- Infraestructuras en el 7PM 38
  • Participación Española en DCIs Europeos Call 7 Finalización Mayo 2015 Mayo 2013 Abril 2013 Junio 2012 Junio 2012 Junio 2012 Junio 2012 39
  • Participación Española en DCIs Europeos Call 9 BSC, UPVL Octubre 2013 C 1M€ Fecyt Junio 2014 5M€ BIFI Octubre 2014 4M€ BSC, RedIRI BSC Noviembre 2014 S Enero 2015 18,5M€ 16M€ UPM, BIFI BSC Febrero 2014 1M€ Septiembre 2013 35M€ UPM, CSIC, UCM Octubre 2014 UMA, IAC Noviembre 2013 1,1M€ 3,5M€ BSC RedIRIS Octubre 2014 Septiembre 2012 14M€ 0,4M€ Alba Octubre 2014 14M€ 40
  • La Red Española de e-Ciencia 41
  • Grupos Participantes en la Red Española de e-CienciaUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia • Más de 1000 Investigadores. • 101 Grupos de Investigación. • 76 Instituciones. • Estructura Dinámica – Inicialmente se Inscribieron 68 Grupos. Financiada por el anterior Ministerio de Ciencia e Innovación a través de las ayudas CAC-2007-52, ICTS-2008-12 e ICTS-2009-22 de las D.G. de Política Científica y el Programa Nacional de Infraestructuras Científico-Tecnológicas. 42
  • Incorporación de Nuevos Grupos a la RedUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia 101 Grupos de usuarios 76 Instituciones 1300 Usuarios mostraron su interés, avalando los grupos 455 Usuarios inscritos en la Red >50 Mensajes por mes en la lista 43
  • Distribución por Áreas de las Aplicaciones y PilotosUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia • Tras las dos llamadas, realizadas en octubre de 2008 y julio de 2010, se han obtenido 25 Aplicaciones, 26 Pilotos y 12 Grupos de Soporte – 28 Aplicaciones / pilotos han rellenado la Información en el Wiki. – 35 Constituyen nuevos proyectos de e-Ciencia que no se habían iniciado anteriormente. 3 1 Biomedicina/Salud 10 5 Astrofísica/Astronomía 5 Física de Altas Energías 6 Química Computacional Ingeniería Ciencias de la Tierra 10 6 TIC 5 Fusión Archivos 44
  • La Física de Altas Energías – El Large Hadron ColliderUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia • The Compact Muon Solenoid • International Linear Collider (ILC) Experiment (CMS) – Instituto de Física de Cantabria. – Port d’Informació Científica. • Lattice QCD (LQCD) – Instituto de Física de Cantabria. – Physics Institute of Cantabria. – CIEMAT. – Univ. Autónoma de Madrid. – Univ. Autónoma de Madrid . – Univ. deZaragoza – Univ. of Oviedo. • Evaluación de sectores observables del • Large Hadron Collider beauty bosón de Higgs (FeynHiggs) experiment (LHCb) – Instituto de Física de Cantabria. – Univ. de Barcelona. – Univ. de Santiago de Compostela. – Port d’Innovació Científica. • A Toroidal LHC ApparatuS (ATLAS) – Instituto de Física Corpuscular (IFIC). – Instituto de Física de Altas Energías (IFAE). – Univ. Autónoma de Madrid. – Port d’Informació Científica (PIC). 45
  • VPH (Virtual Physiological Human)Usuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia • Iniciativa internacional financiada en el FP7 Ayla-Red (BSC) con más de 200 M€ – Orientada hacia la simulación integral de sistemas, órganos y enfermedades. – Gran necesidad computacional (alianzas con DEISA, PRACE, MAPPER, EGI, etc.) – Participación española en 15/36 proyectos VPH de las últimas 4 llamadas del FP7 • MOSAIC, AIRPROM, EUCOGIII, NEOMARK, DISCI PULUS, PREDICT, SYNERGY-COPD, P- E-IMRT (CESGA) MEDICINE, VPH- SHARE, INBIOMEDVISION, INTEGRATE, MYSPINE, EUHEART y ACTION-GRID • Importante historia previa en el FP6, con proyectos como @neurist, ACGT, etc. 46
  • Ciencias de la VidaUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia • Gran impacto en el análisis genómico y proteómico y la simulación bioquímica – Colaboración en la iniciativa WISDOM (Wide in Silico Docking in Malaria) • 80 años de CPU en 6 semanas. • Clave en la Bioinformática moderna WISDOM – P.e. ELIXIR ESFRI • Compuesto por actores clave en el análisis de datos (CNIO, CRG, CIPF, IRB, UMA, BSC, CNB, IM IM, UPF, CNAG) • Interés en el desarrollo y transferencia a la comunidad de servicios de alto nivel MoDEL, CellBase, CentrosomeDB, ABS, H cellBase / genomemaps - CIPF 47 CAD, etc. y en el alojamiento del
  • Química ComputacionalUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia • La comunidad Virtual “compchem” supone el 5% de toda la actividad no LHC de EGI (con 13.000M de horas normalizadas SI2K). – 7% se ha ejecutado en España y Portugal. • Grid Empowered Molecular Simulator (GEMS) – Toolkit desarrollado en la EHU, con un uso sostenido de 5M de horas anuales. • Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousand of Atoms (SIESTA) – Método y código para resolver numéricamente las ecuaciones mecanocuánticas que gobiernan el comportamiento de los electrones. – Diseñado para explotar recursos HPC. – The SIESTA method for ab initio order-N materials simulation (3608 citas) 48
  • Ingeniería - MecánicaUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia • Modelado de flujos • Simulación del campo electromagnético de gran turbulentos escala – Base de datos de – PRACE Award 2009 – “High Turbulencia de la UPM. scalability multipole method. • Aplicaciones aerospaciales Solving half billion of unknowns”. y en motores. • CESGA – UEX – UVIGO. • Simulación de inyección en • Análisis estático y dinámico en la simulación de motores diesel (CMT) estructuras de edificación – OpenFOAM, openWAN. – Integración en un código existente (Architrave) de servicios Grid y cloud: – En 2D, 98% tiempo de • Reducción en 25 veces del tiempo de proceso. cálculo es la química. • Decremento del coste constructivo. – Innovación: • Se transfiere el servicio a una plataforma cloud pública • Un análisis completo supone un coste de 3.38 €. 49
  • FusiónUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia • Liderado por el CIEMAT. 7000000 • Numerosos códigos portados a Grid y HPC 6000000 5000000 – Pioneros del Grid en investigación en Fusión. 4000000 – Plasma-Wall Intercation and Edge Physics 3000000 (EIRENE, BIT1). 2000000 1000000 – Transporte (ISDEP, DKES, GEM, ASTRA). 0 2007 2008 2009 2010 2011 2012 – Calentamiento (MaRaTra, FAFNER). – Equilibrio y MHD (VMEC, Helena). • Necesidad de entornos heterogéneos para adaptar los diferentes tipos de requisitos – Workflows HPC – Grid. • >60 publicaciones indexadas desde 2007. 50
  • Y otras muchas másUsuarios Españoles de infraestructuras de e-Ciencia 51
  • Conclusiones • España se encuentra excelentemente posicionada en la e- Ciencia a nivel internacional tanto en infraestructuras como en aplicaciones – Existe una gran comunidad de técnicos y usuarios dispuestos a apoyar a nuevos usuarios. • El acceso está abierto en todos los casos – Convocatorias RES y propias de los centros de Supercomputación Autonómicos. – A través de ES-NGI. – A través de PRACE. • El acceso a infraestructuras internacionales es una oportunidad para el desarrollo especialmente en la situación actual. 52
  • Muchos más 53
  • Y más 54
  • ¿Preguntas? La e-Investigación en España Ignacio Blanquer - iblanque@dsic.upv.es Universidad Politécnica de Valencia 55