2º Encuentro de Estudiantes de Historia de la Ciencia
FES Acatlán
15 al 18 de octubre de 2013

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Contenido
Introducción
Diversidad mexicana
Herramientas informáticas
Plataforma Dspace
El Sistema de Información Ciencias ...
Introducción
• México: mega diverso

• Taxonomía
• Descripción de nuevas
especies
• Publicaciones
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• Descritas
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• Avance del cómputo
• Modificación de la práctica taxonómica tradicional
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Repositorio Institucional:
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a los...
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Preservar
Clasificar
Compartir en acceso abierto

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• Metadatos: 15
descriptores básicos

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• Es difícil la recuperación
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Acceso abierto
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Resultados
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Numero de publicaciones por año en la colección Nuevas Especies Mexicanas

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Etiqueta del metadato
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Definición
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Registro sobre nueva
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Ciencias, UNAM

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Conclusiones
• Las colecciones bibliográficas representan una de las
herramientas más completas, sofisticadas y útiles par...
Diana Ramírez Alvarez
dianara@ciencias.unam.mx
Dra. Layla Michán
laylamichan@ciencias.unam.mx

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La Colección Nuevas Especies Mexicanas para la historia de la biología en México

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El avance y la sofisticación del cómputo actual ha modificado profundamente la práctica taxonómica, en este caso proponemos el uso de una colección digital para el estudio de las publicaciones sobre nuevas especies en México: su descubrimiento y descripción. Esta aplicación electrónica ofrece una plataforma idónea para archivar, preservar, clasificar y compartir en acceso abierto, documentos y sus metadatos asociados disponibles para todos los usuarios interesados, en biología o historia de la biología en México.
En el presente trabajo se presenta una colección de los registros bibliográficos sobre nuevas especies en México (http://repositorio.fciencias.unam.mx:8080/xmlui/handle/11154/139839) albergada en el Sistema de Información Ciencias, de la Facultad de Ciencias UNAM (http://repositorio.fciencias.unam.mx:8080/xmlui), la colección abarca descripciones a partir de la publicación del sistema de clasificación binomial linneano de 1758 hasta el año 2012, este recurso es un poderoso aliado para el registro de documentos, además que permite el manejo de gran cantidad de metadatos bibliográficos y taxonómicos relacionados con los documentos. Al sistematizar esta información en una base de datos, se tendrá siempre una referencia, en cuanto a la nomenclatura y la clasificación de los organismos; y también sobre la distribución, la taxonomía y la cronología de las especies descritas.
Estos metadatos están en el esquema utilizado mundialmente para estandarizar objetos digitales (Dublin Core), y en muchos de los casos se asocian al documento en texto completo con acceso abierto al que se refieren. Además, este tipo de sistema hace que sea posible extraer toda la información en acceso abierto porque es interoperable y contiene herramientas para manejo de la literatura de la Web 2.0 lo que facilita la investigación historiográfica y permite el uso de métodos cuantitativos para realizar análisis cienciométricos que facilitan la visualización de la información.
Si se toma en cuenta que el número de especies descritas para México es cercano a las 108, 000 especies y el estimado total tiende a las 220, 000 especies, sistematizar la información referente a la descripción de nuevas especies con una temporalidad amplia, nos da la oportunidad de obtener una visión histórica del comportamiento de la biología con respecto a este tema, además que nos permite ofrecer tendencias y nuevas perspectivas en el estudio de la historia de la ciencia mexicana.

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La Colección Nuevas Especies Mexicanas para la historia de la biología en México

  1. 1. 2º Encuentro de Estudiantes de Historia de la Ciencia FES Acatlán 15 al 18 de octubre de 2013 La Colección Nuevas Especies Mexicanas para la historia de la biología en México Presentan: Diana Ramírez Alvarez Layla Michán Laboratorio de Cienciometría, Información e Informática Biológica (CIIB) Facultad de Ciencias, UNAM 1
  2. 2. Contenido Introducción Diversidad mexicana Herramientas informáticas Plataforma Dspace El Sistema de Información Ciencias de la Facultad de Ciencias, UNAM Material y Método Elección de la plataforma Dspace Descriptores de la información. Dublin Core Colecciones utilizadas Resultados Conclusiones 2
  3. 3. Introducción • México: mega diverso • Taxonomía • Descripción de nuevas especies • Publicaciones taxonómicas • Descritas especies 108, 000 • Estiman especies 220, 000 3
  4. 4. • Avance del cómputo • Modificación de la práctica taxonómica tradicional • Objetos digitales • Repositorios/Sistemas de Información resguardar manejar distribuir preservar 4
  5. 5. Repositorio Institucional: Deposito de objetos electrónicos alojado en un servidor, que sistematiza, da acceso libre a los trabajos de una institución y preserva estos recursos digitales a largo plazo. ¿Por qué usar DSpace? http://www.dspace.org/whos-using-dspace 1, 536 Repositorios a nivel mundial usan DSpace • • • • Interfaz abierta Robusta Interoperable Amigable 5
  6. 6. • • • • Archivar Preservar Clasificar Compartir en acceso abierto • Documentos • Metadatos: 15 descriptores básicos 6
  7. 7. • Publicaciones dispersas en tiempo y espacio • Es difícil la recuperación • Pocos están disponibles para consulta • Localizar , reunir, sistematizar y difundir • Enriquecer el acervo taxonómico • Herramienta para el estudio de la historia de la ciencia mexicana Primera etapa de diseño y prueba de la colección de registros bibliográficos sobre nuevas especies en México Establecer estructura y características de datos y metadatos Posibilidad del sistema para el estudio de la descripción de nuevas especies en México a través del tiempo http://repositorio.fciencias.unam.mx:8080/xmlui/handle/11154/139839 7
  8. 8. Método Accesible Consistente Interoperable Eficiente Fácil Acceso abierto Interoperable Web 2.0 Intercambio de información Literatura académica Revista Entidad académica Multi-idioma 1. 2. 3. Revista de la Sociedad Mexicana de Historia Natural Nuevas especies descritas por investigadores del Instituto de Biología, UNAM Sinopsis de la Herpetofauna de México de H. Smith 8
  9. 9. Resultados • 1, 372 registros sistematizados • Temporalidad 1758 – 2011 • 26 metadatos que describen a cada uno de los registros • 17 son metadatos bibliográficos • 9 son metadatos taxonómicos • 15 formas diferentes de referirse a una nueva especie en una descripción dentro de la literatura 9
  10. 10. n=1, 372 Numero de publicaciones por año en la colección Nuevas Especies Mexicanas 10
  11. 11. Campo Etiqueta del metadato Título dc.title Título del documento Ejemplo: A morphologically distinct new species of Pseudoeurycea (Caudata  Plethodontidae) from the Sierra Madre Oriental of Puebla, : Mexico. dc.contributor.author Nombre del investigador o investigadores que realizaron el estudio. Ejemplo: Parra-Olea, G. dc.date.issued Año en que se publicó el documento Ejemplo: 2004 dc.relation.journal Título de la revista en la que se publicó Ejemplo: Herpetológica el artículo dc.souce.novolpages Volumen y número del ejemplar de la revista donde está publicado el Ejemplo: 60, 478–484 artículo. Numero de paginas ISSN dc.identifier.issn Estándar internacional para revistas Ejemplo: 1938-5099 DOI dc.identifier.doi Identificador de Objetos Digitales Ejemplo: 10.1655/03-76 Pequeña reseña que abarca todo el contenido del estudio. Ejemplo: A new species of Pseudoeurycea is described from cloud forests of the Sierra Madre Oriental of Puebla, México. The new species is distinguished from all other Pseudoeurycea by its small size, stout body, short tail, large nostrils, presence of characteristic glandular convergent ridges on the pelvic region and the tail, and by its distinctive limb structure, with very small hands and feet that are extensively webbed and bear prominent but short and pointy middle digits. The only apparent close relative of this species is P. praecellens, from which it differs by the position and distribution of the dorsal and caudal glands, body proportions, nostril size and coloration. All specimens of the new species were found in cloud forest, under a canopy of Liquidambar, Quercus, and arborescent ferns, as well as in a coffee grove. The elevational range for the species is narrow, between 905 and 1400 m, unusually low elevations for Pseudoeurycea. Autor (es) Año Revista Volumen, número, páginas Resumen dc.description.abstract Definición Categorías y ejemplos 11 Ejemplo de metadatos bibliográficos de los registros de la colección Nuevas Especies Mexicanas
  12. 12. Campo Disciplina Etiqueta del metadato dc.coverage.thematic Definición Disciplina a la que se refiere el taxón estudiado Categorías y ejemplos Categorías: Zoología, Botánica, Micología Ejemplo: Zoología Cantidad de especies dc.description.sp descritas Número de especies descritas o Ejemplo: 1 analizadas en el artículo Categoría dc.description.taxon taxonómica Taxón de estudio Ejemplo: Animalia|Chordata|Amphibia|Caudata|Plethodontidae|Pseudoeuryc ea|Pseudoeurycea quetzalanensis Localidad dc.description.taxonloc Localidad donde fue ubicado el Ejemplo: Xocoyolo, 1400 msnm, Municipio de Cuetzalan del Progreso holotipo Latitud dc.description.taxonlat Coordenadas geográficas. Latitud Ejemplo: 19.9667 Longitud dc.description.taxonlon Coordenadas geográficas. Longitud Ejemplo: -97.5333 Estado de la República Mexicana en que se realizó el estudio Categorías: Aguascalientes, Baja California, Baja California Sur, Campeche, Chiapas, Chihuahua, Coahuila, Colima, Distrito Federal, Durango, Estado de México, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, Michoacán, Morelos, Nayarit, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro, Quintana Roo, San Luis Potosí, Sinaloa, Sonora, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz, Yucatán, Zacatecas. Ejemplo: Puebla Estado de la República dc.description.taxonstate Mexicana País del estudio dc.coverage.spatial País en el que se realizó el estudio Ejemplo: México Colección dc.description.index Base de Datos en la que se encuentra el artículo Ejemplo: UNIBIO Instituto de Biología, UNAM 12 Ejemplo de metadatos taxonómicos de los registros de la colección Nuevas Especies Mexicanas
  13. 13. Nube con las variables usadas para la descripción de nuevas especies mexicanas dentro de las publicaciones de la colección 13
  14. 14. Registro sobre nueva especie dentro de la plataforma del Sistema de Información Ciencias, UNAM 14
  15. 15. Conclusiones • Las colecciones bibliográficas representan una de las herramientas más completas, sofisticadas y útiles para el manejo de información y textos en la actualidad, la información sobre biodiversidad. • La información sobre la descripción de nuevas especies es estratégica y representa un material indispensable para reconstruir la historia de la biología de nuestro país. • La inclusión de estas tecnologías ofrece grandes posibilidades a los historiadores de la ciencia, este es uno de los propósitos de la colección de Nuevas Especies Mexicanas del Sistema de Información Ciencias, de la Facultad de Ciencias UNAM. 15
  16. 16. Diana Ramírez Alvarez dianara@ciencias.unam.mx Dra. Layla Michán laylamichan@ciencias.unam.mx This work is licensed under a Creative Commons AttributionNonCommercial-ShareAlike 3.0 Unported License. 16

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