MedicalMiner INTEGRACION DE TECNICAS DE MINERIA DE TEXTO Y MINERIA DE DATOS PARA LA CREACION DE HERRAMIENTAS TRASLACIONALE...
Índice <ul><li>Grupos integrantes </li></ul><ul><li>Proyecto y objetivos </li></ul><ul><li>Grado de consecución de objetiv...
Grupos integrantes [1/3] UEM: Sistemas Inteligentes <ul><li>7 investigadores </li></ul><ul><ul><li>5 Profesores Universida...
Grupos integrantes [2/3] UVigo: Sistemas Informáticos de Nueva Generación <ul><li>10 investigadores </li></ul><ul><ul><li>...
Grupos integrantes [3/3] UHU: Laberinto  (Lab. de Recuperación de Información y Minería de Texto y Datos) <ul><li>5 invest...
Proyecto y objetivos [1/5] resumen general <ul><li>Medicina traslacional / “bench-to-bedside” </li></ul><ul><li>Revolución...
Proyecto y objetivos [2/5] descripción del proyecto
Proyecto y objetivos [3/5] objetivos de la propuesta <ul><li>Objetivo general: </li></ul><ul><ul><li>interrelacionar miner...
Proyecto y objetivos [4/5] objetivos de la propuesta <ul><li>O1. Desarrollo de nuevas técnicas de minería de texto bilingü...
Proyecto y objetivos [5/5] presupuesto, personal contratado, becarios FPI <ul><li>UEM </li></ul><ul><ul><li>82.068,00 € </...
Grado de consecución de objetivos [1/2] objetivos alcanzados <ul><li>Situación general </li></ul><ul><ul><li>consecución d...
Grado de consecución de objetivos [2/2] objetivos NO alcanzados <ul><li>O1. Minería de texto </li></ul><ul><ul><li>50% </l...
Resultados [1/8] producción científica UEM <ul><li>1 (+1) journal JCR + 1 congreso CORE </li></ul><ul><li>3 journals ‘B’ +...
Resultados [2/8] producción científica UVigo <ul><li>5 journals JCRs + 0 congresos CORE </li></ul><ul><li>5 journals ‘B’ +...
Resultados [3/8] producción científica UHU <ul><li>2 journals JCRs + 1 congreso CORE </li></ul><ul><li>6 journals ‘B’ + 5 ...
Resultados [4/8] transferencia UEM <ul><li>Contratos de transferencia / Uso de los resultados en la industria </li></ul><u...
Resultados [5/8] transferencia UVigo <ul><li>Patentes y registros de software </li></ul><ul><ul><li>previsto el registro d...
Resultados [6/8] transferencia UHU <ul><li>Contratos de transferencia / Uso de los resultados en la industria </li></ul><u...
Resultados [7/8] formación UEM, UVigo <ul><li>UEM </li></ul><ul><li>[TESIS] Mª Cruz Gaya López (2011)  Síntesis distribuid...
Resultados [8/8] formación UHU <ul><li>UHU </li></ul><ul><li>[TESINA de Máster Oficial] Mariano Crespo Azcárate (2010)  Es...
Colaboración con equipos internacionales [1/2] personas y universidades <ul><li>UEM </li></ul><ul><li>Proyecto Naviga / Me...
Colaboración con equipos internacionales [2/2] proyectos internacionales financiados <ul><li>UEM </li></ul><ul><li>[Eurost...
Coordinación [1/2] evaluación de la coordinación <ul><li>Reuniones: </li></ul><ul><ul><li>7-9 abril 2010 UEM </li></ul></u...
Coordinación [2/2] publicaciones conjuntas <ul><li>M. Buenaga; F. Fdez-Riverola; M. Maña; E. Puertas; D. Glez-Peña; J. Mat...
Previsión de desarrollos futuros <ul><li>Solicitud conjunta de un nuevo proyecto en convocatorias internacionales (Eurosta...
MedicalMiner   más información en http://www.medicalminer.org/ Manuel de Buenaga Florentino Fdez-Riverola Manuel Maña
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Medical Miner: Integración de técnicas de minería de texto y minería de datos para la creación de herramientas traslacionales en medicina

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The project’s overall objective is to explore, experiment and develop new technologies for text and data mining, so intertwined, as a key element in intelligent medical information. We’ll design both types of new techniques, more efficient, interconnected, and better adapted to specific problems in the medical domain.

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  • MB: yo incluiría por ejemplo en la primera diap. un par de comentarios generales sobre la situación del proyecto y en la siguiente un porcentaje aproximado de consecución teniendo presente que estamos justo a la mitad del calendario.
  • MB: La producción científica en JCR ha sido algo baja hasta el momento y creo que necesita una explicación. Creo que en cierta medida una razón principal es que, además del calendario del proyecto, está el calendario más amplio de los integrantes del equipo de investigación, y en este sentido durante la primera mitad del proyecto hemos tenido 2 tesis que estaban en su periodo final (M. Cruz Gaya ya la ha presentado y Enrique Puertas de forma inmediata), y por otra parte 2 tesis doctorales que se han iniciado justamente durante el proyecto (la de Fernando Aparicio en Junio10 y la de Rafael Muñoz en Enero 11). Para la segunda mitad del proyecto se espera que el número de artículos sea mayor. Una estimación para el final en el subproyecto uem sería, con especial relación a las tesis doctorales: 1 (M.Cruz Gaya – publicado) + 1 F.Aparicio (en evaluación y muy probablemente aceptado) + 1 F.Aparicio + 1R.Muñoz + 1 uhu.uvigo.uem + 1 naviga/medicalminer + 1 adicional = 7. En congresos también se pondrá más el foco en varios CORE en meses siguientes.
  • MM: He incluido nuestras publicaciones en la Revista de la SEPLN como ‘Journals B’. Si esto no os parece adecuado, pasaría a 8 internacionales + 6 nacionales. - Nuestro trabajo en el Medical Image Retrieval Task ha quedado el primero, de 64 runs enviados. Además tenemos actualmente 2 artículos en revisión en revistas JCR: V. Pachón; J. Mata; J.L. Domínguez, M.J. Maña. Searching for the most Significant Rules: an Evolutionary Approach for Subgroup Discovery. Information Sciences. IF = 2,833 N.P. Cruz; M.J. Maña; J. Mata. A machine learning approach to negation and speculation detection in clinical texts. Journal of the American Society for Information Science and Technology (JASIST). IF = 2,3
  • MB: NAVIGA es un proyecto europeo con participación de 3 empresas españolas y 2 francesas, financiado en el marco del programa Eurostars. Hay una web en www.euronaviga.com. En el proyecto se desarrolla una plataforma que integra una serie de elementos orientados a facilitar el acceso a la sociedad de la información de dos tipos de usuarios: adultos mayores (ancianos) y personas con limitaciones o discapacitados. El proyecto incluye elementos como interfaces específicos, una red social y (video) juegos. Hemos integrado elementos de medical miner (análisis textual / ontologías) en un módulo que facilita el acceso personalizado a información de salud a adultos mayores. Virtual Cloud Carer es un proyecto Avanza recientemente concedido con participación de tres empresas de base tecnológica y el ayuntamiento de Tres Cantos como usuario. El objetivo del proyecto es “Desarrollar una Plataforma de Servicios altamente personalizados a cada uno de los actores involucrados: dependientes, familiares y los profesionales de atención primaria, hospitales y servicios sociales permitiendo por un lado la sensorización y telemonitorización de la persona dependiente y su entorno, tanto domiciliario como externo, y por otro posibilitando la integración en la Sociedad Digital de aquellas personas con sus capacidades físicas ampliamente mermadas, adaptando los sistemas y el entorno a ellas y no a la inversa”. Se ofrecen servicios a usuarios de diferentes perfiles: personas dependientes, familiares, personal de atención primaria/social y personal de servicios de emergencias. Se incluyen elementos de teleasitencia, computación ubícua, computación en nube (de ahí lo de virtual cloud) y funcionalidades como recomendaciones de información al paciente y a los familiares (medicalminer: minería de texto) y análisis de datos de biosensores para personas dependientes (medicalminer: minería de datos).
  • MM: Esto es la solicitud de un proyecto del que aún no tenemos respuesta. Participan investigadores UHU y Virgen del Rocío. Lo lidera UHU. Está previsto la subcontratación de Tegnos Hitech para el desarrollo de parte del software y su posterior explotación.
  • MB: he actualizado en la diapositiva lo de las universidades del programa Mavir. Con las extranjeras asociadas (y otras) tenemos acciones continuas como invitación a conferenciantes y estancias en ellas (ver www.mavir.net). He destacado la colaboración con Christoph Thuemmler de Edimburgo, porque en una estancia breve en Julio de Diego Gachet y yo mismo, hemos estado trabajando sobre la participación en el programa Eurostars o AAL (y además en la colaboración en un grado en eHealth nuevo que estamos planteando en la uem) MM: - El Dr. Rocha es profesor visitante de nuestro Máster Oficial en Tecnologías Informáticas Avanzadas. Además, hemos solicitado con él una Acción Integrada Hispano-Lusa. En el RIILP hemos tenido de estancia durante este año a los investigadores Noa Cruz (3 meses) y Manuel de la Villa (2 meses). Se han iniciado trabajos que en pocos meses se plasmarán en ponencias en Congresos de calidad y artículos en revistas del JCR.
  • MB: Answaretech (Coordinador-España), Encore (España), Onix (Expaña), Universidad Europea de Madrid (España), Technosens (Francia), MInd Autonomy Research (Francia) e IONAN (Grecia). MM: Lo nuestro es una solicitud de financiación.
  • MB: yo creo que podemos poner algo sobre que estamos en una dinámica progresiva de ir integrando elementos de los tres equipos de investigación (e.g. sobre la plataforma de componentes), que tenemos también la web y que estamos MB: [MM] habría que incluir que *vamos a participar en el TREC* MM: La fecha para entregar los runs es el 13 de septiembre. Es decir, que cuando Floro haga esta presentación todavía ni siquiera habremos enviado nuestros runs.
  • Medical Miner: Integración de técnicas de minería de texto y minería de datos para la creación de herramientas traslacionales en medicina

    1. 1. MedicalMiner INTEGRACION DE TECNICAS DE MINERIA DE TEXTO Y MINERIA DE DATOS PARA LA CREACION DE HERRAMIENTAS TRASLACIONALES EN MEDICINA TIN2009-14057-C03-01 Manuel de Buenaga Florentino Fdez-Riverola Manuel Maña
    2. 2. Índice <ul><li>Grupos integrantes </li></ul><ul><li>Proyecto y objetivos </li></ul><ul><li>Grado de consecución de objetivos </li></ul><ul><li>Resultados </li></ul><ul><ul><li>Producción científica </li></ul></ul><ul><ul><li>Transferencia </li></ul></ul><ul><ul><li>Formación </li></ul></ul><ul><li>Colaboraciones con equipos internacionales </li></ul><ul><li>Coordinación </li></ul><ul><li>Desarrollos futuros (previsión) </li></ul>
    3. 3. Grupos integrantes [1/3] UEM: Sistemas Inteligentes <ul><li>7 investigadores </li></ul><ul><ul><li>5 Profesores Universidad Privada TC Doctores </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>3 Sistemas Informáticos </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>2 Especialidades Médicas </li></ul></ul></ul><ul><ul><li>2 Profesores TC título superior </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>Sistemas Informáticos </li></ul></ul></ul><ul><li>+ 4 incorporaciones </li></ul><ul><ul><li>2010: 1 contratado con cargo al proyecto (20h) </li></ul></ul><ul><ul><li>2011: 2 Profesores Doctores (TC, TP20) Sistemas Informáticos + 1 Contrato docencia/investigación (20/20h) predoctoral </li></ul></ul><ul><li>= 11 (6 doctores TC + 1 TP20 + 4 no doctores) </li></ul>
    4. 4. Grupos integrantes [2/3] UVigo: Sistemas Informáticos de Nueva Generación <ul><li>10 investigadores </li></ul><ul><ul><li>8 doctores </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>3 TU </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>5 CD </li></ul></ul></ul><ul><ul><li>2 asociados TP </li></ul></ul><ul><li>+ 1 incorporación año 2010 </li></ul><ul><ul><li>becario predoctoral (ahora doctor) </li></ul></ul><ul><li>+ 1 contratado con cargo al proyecto </li></ul><ul><ul><li>alumno predoctoral </li></ul></ul><ul><li>= 12 (9 doctores TC + 2 asociados TP + 1 ingeniero) </li></ul>
    5. 5. Grupos integrantes [3/3] UHU: Laberinto (Lab. de Recuperación de Información y Minería de Texto y Datos) <ul><li>5 investigadores </li></ul><ul><ul><li>2 doctores </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>1 TU </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>1 Colaborador Dr. </li></ul></ul></ul><ul><ul><li>3 ingenieros </li></ul></ul><ul><li>+ 2 incorporaciones año 2010 </li></ul><ul><ul><li>1 becario predoctoral Plan Propio de Investig. de UHU </li></ul></ul><ul><ul><li>1 profesor colaborador </li></ul></ul><ul><li>+ 1 contratado con cargo al proyecto (17 h) </li></ul><ul><ul><li>alumno predoctoral </li></ul></ul><ul><li>= 8 (2 doctores + 6 ingenieros) </li></ul>
    6. 6. Proyecto y objetivos [1/5] resumen general <ul><li>Medicina traslacional / “bench-to-bedside” </li></ul><ul><li>Revolución de genómica y bioinformática </li></ul><ul><li>Grandes volúmenes de información </li></ul><ul><ul><li>formato estructurado </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>e.g. biología molecular </li></ul></ul></ul><ul><ul><li>formato de texto </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>e.g. artículos científicos, informes médicos </li></ul></ul></ul><ul><li>Orientación del proyecto: desarrollo de nuevas técnicas de minería de datos y texto integradas adaptadas al dominio </li></ul>
    7. 7. Proyecto y objetivos [2/5] descripción del proyecto
    8. 8. Proyecto y objetivos [3/5] objetivos de la propuesta <ul><li>Objetivo general: </li></ul><ul><ul><li>interrelacionar minería de textos y datos para construir sistemas inteligentes de información médica </li></ul></ul><ul><ul><li>diseñar y desarrollar técnicas más eficientes , interrelacionadas , y mejor adaptadas a problemas específicos del dominio médico </li></ul></ul><ul><ul><li>implementar un sistema inteligente de acceso a la información basado en ellas, que ofrezca interrelacionar la información médica: historiales clínicos y documentación científica </li></ul></ul>
    9. 9. Proyecto y objetivos [4/5] objetivos de la propuesta <ul><li>O1. Desarrollo de nuevas técnicas de minería de texto bilingües adaptadas al dominio médico </li></ul><ul><li>O2. Desarrollo de nuevas técnicas informadas de minería de datos centradas en el análisis de información médica personalizada </li></ul><ul><li>O3. Desarrollo de una plataforma de integración e intercambio de conocimiento entre técnicas de minería de texto y datos </li></ul><ul><li>O4. Diseño de un sistema inteligente de información médica con capacidades de minería de texto y datos </li></ul><ul><li>O5. Evaluación de la eficiencia, la efectividad y la usabilidad en entornos abiertos y cerrados </li></ul>
    10. 10. Proyecto y objetivos [5/5] presupuesto, personal contratado, becarios FPI <ul><li>UEM </li></ul><ul><ul><li>82.068,00 € </li></ul></ul><ul><ul><li>1 ingeniero técnico 20h [2010–2012] </li></ul></ul><ul><li>UVigo </li></ul><ul><ul><li>94.864,00 € </li></ul></ul><ul><ul><li>1 ingeniero técnico [2011-2012] </li></ul></ul><ul><li>UHU </li></ul><ul><ul><li>73.205,00 € </li></ul></ul><ul><ul><li>1 ingeniero técnico 17 h [2010–2012] </li></ul></ul><ul><li> : 250.137,00 € </li></ul>
    11. 11. Grado de consecución de objetivos [1/2] objetivos alcanzados <ul><li>Situación general </li></ul><ul><ul><li>consecución de objetivos y avance general de acuerdo con planificación inicial y calendario del proyecto </li></ul></ul><ul><li>Variaciones: </li></ul><ul><ul><li>esfuerzo mayor del estimado para la integración de componentes en plataforma </li></ul></ul><ul><ul><li>adelanto de evaluación sobre entornos abiertos y cerrados </li></ul></ul><ul><ul><li>adelanto en explotación de resultados / transferencia de tecnología </li></ul></ul>
    12. 12. Grado de consecución de objetivos [2/2] objetivos NO alcanzados <ul><li>O1. Minería de texto </li></ul><ul><ul><li>50% </li></ul></ul><ul><li>O2. Técnicas informadas de minería de datos </li></ul><ul><ul><li>60% </li></ul></ul><ul><li>O3. Desarrollo de plataforma de integración </li></ul><ul><ul><li>35% </li></ul></ul><ul><li>O4. Sistema inteligente de información médica </li></ul><ul><ul><li>50% </li></ul></ul><ul><li>O5. Evaluación de la eficiencia, la efectividad y la usabilidad en </li></ul><ul><ul><li>entornos abiertos 50% </li></ul></ul><ul><ul><li>entornos cerrados 50% </li></ul></ul>
    13. 13. Resultados [1/8] producción científica UEM <ul><li>1 (+1) journal JCR + 1 congreso CORE </li></ul><ul><li>3 journals ‘B’ + 6 congresos internacionales + 3 congresos nacionales </li></ul><ul><li>- M. C. Gaya; J.I. Giráldez (2010) Merging Local Pattern Using an Evolutionary Approach . Knowledge and Information Systems , vol. 27, pp. 1-24, 2010 [IF 2,211] </li></ul><ul><li>- F. Aparicio; M. Buenaga; M. Rubio; A. Hernando (2011) An Intelligent Information Access System assisting a Case Based Learning methodology evaluated in higher education with medical students , Computers & Education . En evaluación [IF 2,617] </li></ul><ul><li>- F. Aparicio; M. Buenaga; D. Gachet; E. Puertas; I. Giráldez; M. Rubio; A. Hernando (2011) TMT Una herramienta para guiar usuarios en la búsqueda de información sobre casos clínicos , Procesamiento del Lenguaje Natural , nº 46, pp. 27-34, 2011 </li></ul><ul><li>- R. Muñoz-Gil; F. Aparicio; M. Buenaga; D. Gachet; E. Puertas; I. Giráldez; M.C. Gaya (2011), Tourist Face: A Contents System Based on Concepts of Freebase for Access to the Cultural-Tourist Information , 16 th International Conference on Applications of Natural Language to Information Systems - NLDB 2011, Alicante, España, June 2011 [CORE C] </li></ul><ul><li>- D. Gachet; M. Buenaga; V. Padrón; F. Aparicio (2010) Integrating Intelligent e-Services and Information Access for Elder People . International Conference Open Doors to ICT for Ageing and eInclusion , Jyvaskyla, Finland, Dec. 2010 </li></ul>
    14. 14. Resultados [2/8] producción científica UVigo <ul><li>5 journals JCRs + 0 congresos CORE </li></ul><ul><li>5 journals ‘B’ + 8 congresos internacionales </li></ul><ul><li>- D. Glez-Peña; M. Reboiro-Jato; P. Maia; M. Rocha; F. Díaz; F. Fdez-Riverola (2010) AIBench: a rapid application development framework for translational research in biomedicine . Computer Methods and Programs in Biomedicine . Volume 98/2, pp. 191-203. [CS:theory_and_methods, 43/92, Q2, IF:1,144] </li></ul><ul><li>- D. Glez-Peña; G. Gómez-López; M. Reboiro-Jato; F. Fdez-Riverola; D.G. Pisano (2011) PileLine: a toolbox to handle genome position information in next-generation sequencing studies . BMC Bioinformatics . 12:31. ISSN: 1471-2105. [Mathematical & Computational Biology, 4/29, Q1, IF:3,428] </li></ul><ul><li>- H. López-Fernández; D. Glez-Peña; M. Reboiro-Jato; G. Gómez-López; D.G. Pisano; F. Fdez-Riverola (2011) PileLineGUI: a desktop environment for handling genome position files in next-generation sequencing studies . Nucleic Acids Research (Web Server issue). W1-W5. [Biochemistry & Molecular Biology, 27/281, Q1, IF:7,479] </li></ul><ul><li>- D. Glez-Peña; H. López-Fernández; M. Reboiro-Jato; J.R. Méndez; F. Fdez-Riverola (2011) A Java application framework for scientific software development . Software: Practice & Experience . Accepted for Publication. [CS:software_engineering, 71/93, Q4, IF:0,667] </li></ul><ul><li>- M. Reboiro-Jato; D. Glez-Peña; F. Díaz; F. Fdez-Riverola (2011) A novel ensemble approach for multicategory classification of DNA microarray data using biological relevant gene sets . International Journal of Data Mining and Bioinformatics . Accepted for Publication. [Mathematical & Computational Biology, 27/29, Q4, IF:0,933] </li></ul>
    15. 15. Resultados [3/8] producción científica UHU <ul><li>2 journals JCRs + 1 congreso CORE </li></ul><ul><li>6 journals ‘B’ + 5 congresos internacionales </li></ul><ul><li>- M.A. Vélez; O. Sánchez; S. Romero; J.M. Andújar (2010) A new methodology to improve interpretability in neuro-fuzzy TSK models . Applied Soft Computing Journal , vol. 10, issue 2, pp. 578 – 591 [CS:interdisciplinary_applications, 11/95, Q1, IF =2,415] </li></ul><ul><li>- V. Pachón; J. Mata (2011) An Evolutionary Algorithm to Discover Quantitative Association Rules from Huge Databases without the need for an a Priori Discretization . Expert Systems With Applications . DOI: 10.1016/j.eswa.2011.07.049. In Press [ CS:artificial_intelligence, 33/108, Q2, IF=1,924] </li></ul><ul><li>- V. Pachón; J. Mata; J.L. Domínguez; M.J. Maña (2011) A Multi-Objective Evolutionary Approach for Subgroup Discovery . Proceedings of the 6th International Conference on Hybrid Artificial Intelligence Systems (HAIS) . Wroclaw (Polonia) [Ranking CORE C] </li></ul><ul><li>- J. Mata; M. Crespo; M.J. Maña (2011) LABERINTO at ImageCLEF 2011 Medical Image Retrieval Task . Proceedings of the Cross Language Evaluation Forum (CLEF) . Ámsterdam (Holanda) [ 1ª posición ] </li></ul><ul><li>- J. Mata; R. Santano; D. Blanco; M. Lucero; M.J. Maña (2011 ) A Machine Learning Approach to Extract Drug – Drug Interactions in an Unbalanced Dataset . Proceedings of the SEPLN Workshop on DDIExtraction2011: First Challenge Task Drug-Drug Interaction Extraction . Huelva </li></ul>
    16. 16. Resultados [4/8] transferencia UEM <ul><li>Contratos de transferencia / Uso de los resultados en la industria </li></ul><ul><ul><li>integración en módulos proyecto Naviga </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>NAVIGA Adaptable Platform for elderly people and persons with disability to access the Information Society. Eurostars Programme (Eureka) (E!4583) / Centro Para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI) Subprograma de Apoyo a la Participación de Empresas en Programas Internacionales de I+D. Duración: 01/07/2009-31/12/2011 </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>entidades participantes: Answaretech (Coordinador-España), Encore (España), Onix (Expaña), Universidad Europea de Madrid (España), Technosens (Francia), MInd Autonomy Research (Francia) e IONAN (Grecia) </li></ul></ul></ul><ul><ul><li>integración en módulos proyecto Virtual Cloud Carer </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>Virtual Cloud Carer. Ministerio de Industria. Turismo y Comercio. Plan Avanza, Subprograma Avanza I+D, Acción Estratégica de Telecomunicaciones y Sociedad de la Información (TSI-020100-2011-83). Duración: 03/10/2011-04/10/2013 </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>entidades participantes: Encore (Coordinador), Cubenube, Eygema, Universidad Europea de Madrid </li></ul></ul></ul>
    17. 17. Resultados [5/8] transferencia UVigo <ul><li>Patentes y registros de software </li></ul><ul><ul><li>previsto el registro de la propiedad intelectual de AIBench al finalizar el proyecto (2012) </li></ul></ul><ul><li>Contratos de transferencia / Uso de los resultados en la industria </li></ul><ul><ul><li>utilización de la plataforma desarrollada en el CHUO ( Complexo Hospitalario Universitario de Ourense ) para la construcción de un sistema inteligente de búsqueda y clasificación de casos de infección nosocomial. InNoCBR - 10TIC305014PR - [2011-2013] </li></ul></ul>
    18. 18. Resultados [6/8] transferencia UHU <ul><li>Contratos de transferencia / Uso de los resultados en la industria </li></ul><ul><ul><li>BIDAMIR: BIomedical DAta Mining and Information Retrieval </li></ul></ul><ul><ul><ul><li>convocatoria 2011 de Proyectos de Investigación de Excelencia de la Consejería de Innovación, Ciencia y Empresa de la Junta de Andalucía </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>participan la Universidad de Huelva y el Hospital Virgen del Rocío de Sevilla </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>se prevé la explotación del software desarrollado a través de la empresa Tegnos Hitech </li></ul></ul></ul>
    19. 19. Resultados [7/8] formación UEM, UVigo <ul><li>UEM </li></ul><ul><li>[TESIS] Mª Cruz Gaya López (2011) Síntesis distribuida de teorías </li></ul><ul><li>[PFC] David Alonso García (2011) Medical Prospector: aplicación web orientada a las búsquedas exahustivas sobre medicina orientada al profesional médico, al estudiante y al paciente </li></ul><ul><li>[PFG] Mª Ángeles Mateos Santos (2011) Modelo de Datos para Personalización de Contenidos Biomédicos </li></ul><ul><li>UVigo </li></ul><ul><li>[TESIS] Miguel Reboiro-Jato (2011) Modelo para la combinación de clasificadores e integración de conocimiento aplicado a datos de tipo genómico </li></ul><ul><li>[PFC] Gerardo Blanco García (2011) WhichModel: servidor web para el análisis de clasificadores mediante la integración de datos y conocimiento ( http://www.whichmodel.org ) </li></ul><ul><li>[PFC] Hugo López Fernández (2011) PileLineGUI: entorno de escritorio para el manejo de ficheros de posiciones genómicas provenientes de estudios de secuenciación de nueva generación ( http://sing.ei.uvigo.es/pileline/ ) </li></ul>
    20. 20. Resultados [8/8] formación UHU <ul><li>UHU </li></ul><ul><li>[TESINA de Máster Oficial] Mariano Crespo Azcárate (2010) Estudio y Uso de Recursos Ontológicos para la Expansión de Consultas en Recuperación de Imágenes </li></ul><ul><li>[PFC] Alejandro Muñoz Moro y Manuel Millán Álvarez (2010) Un Sistema de Recuperación de Información Biomédica en Dispositivos Móviles basado en Agrupamiento </li></ul><ul><li>[PFC] José Mª Bermúdez Peinado (2010) AsGeRe: Asistente de Generación de Resúmenes para Textos Biomédicos </li></ul><ul><li>[PFC] Sebastián García (2011) Ayuda a la Recuperación de Información Biomédica Mediante la Visualización de un Grafo Semántico de Conceptos </li></ul><ul><li>[PFC] Nathán F. Soto Méndez (2011) Desarrollo de una interfaz gráfica para el análisis de reglas de </li></ul><ul><li>asociación numéricas </li></ul>
    21. 21. Colaboración con equipos internacionales [1/2] personas y universidades <ul><li>UEM </li></ul><ul><li>Proyecto Naviga / MedicalMiner (componentes información médica personalizada), con empresas Technosens (Francia) Mind Autonomy (Francia) </li></ul><ul><li>Programa MAVIR (PRICIT S2009/TIC-1542), con ocho grupos de investigación de cinco universidades europeas y tres de EEUU asociadas. http://www.mavir.net </li></ul><ul><li>Prof. Christoph Thuemmler, PhD. Institute for Informatics & Digital Innovation, Edimburgh Napier University. http://www.iidi.napier.ac.uk/c/people/peopleid/12063718 </li></ul><ul><li>UVigo </li></ul><ul><li>Dr. Miguel Rocha, Center of Computing Sciences and Technologies, University of Minho. http://www3.di.uminho.pt/~mpr/ </li></ul><ul><li>Dra. Anália Lourenço, Centre of Biological Engineering ( CEB ), University of Minho. http://biopseg.deb.uminho.pt/AnaliaLourenco/ </li></ul><ul><li>UHU </li></ul><ul><li>Dr. Miguel Rocha, Center of Computing Sciences and Technologies, University of Minho. http://www3.di.uminho.pt/~mpr/ </li></ul><ul><li>Dr. Ruslan Mitkov, Research Institute in Information and Language Processing, University of Wolverhampton. http://www.wlv.ac.uk/Default.aspx?page=7108 </li></ul>
    22. 22. Colaboración con equipos internacionales [2/2] proyectos internacionales financiados <ul><li>UEM </li></ul><ul><li>[Eurostars Programme (Eureka)] E!4583 . NAVIGA Adaptable Platform for elderly people and persons with disability to access the Information Society . [2009 - 2011] </li></ul><ul><li>UVigo </li></ul><ul><li>[Acción Integrada Hispano-Lusa] AIB2010PT-00353 . Desarrollo de técnicas de minería de datos empleando conocimiento biológico para diagnóstico clínico . [2011 - 2012] </li></ul><ul><li>[POCTEP] 0447_TUBERCONTROL_1_E . Observatorio transfronterizo Galaico-Portugués para el control de la tuberculosis . [2011 - 2013] </li></ul><ul><li>UHU </li></ul><ul><li>[Acción Integrada Hispano-Lusa] Computational tools for regulatory model inference using text mining and gene expression data analysis . [2012 - 2013] </li></ul>
    23. 23. Coordinación [1/2] evaluación de la coordinación <ul><li>Reuniones: </li></ul><ul><ul><li>7-9 abril 2010 UEM </li></ul></ul><ul><ul><li>5-7 julio 2010 UHU </li></ul></ul><ul><ul><li>30.nov–2.dic 2010 UVigo </li></ul></ul><ul><ul><li>9-11 mayo 2011 UEM </li></ul></ul><ul><ul><li>14-16 septiembre 2011 Uvigo </li></ul></ul><ul><li>Web proyecto </li></ul><ul><ul><li>http://www.medicalminer.org </li></ul></ul><ul><li>Integración de componentes sobre AIBench </li></ul><ul><li>Participación conjunta (UHU/UEM/UVIGO) en TREC 2011 </li></ul><ul><ul><li>MedicalMiner at TREC 2011 Medical Records Track </li></ul></ul>
    24. 24. Coordinación [2/2] publicaciones conjuntas <ul><li>M. Buenaga; F. Fdez-Riverola; M. Maña; E. Puertas; D. Glez-Peña; J. Mata (2010) Medical-Miner: Integración de conocimiento textual explícito en técnicas de minería de datos para la creación de herramientas traslacionales en medicina . XXV Congreso de la Sociedad Española para el Procesamiento del Lenguaje Natural : SEPLN 2010. Valencia, Spain. 08 – septiembre [UEM/UVIGO/UHU] </li></ul><ul><li>H. López-Fernández; F. Aparicio; D. Glez-Peña; M. Buenaga; F. Fdez-Riverola (2011) Herramienta biomédica de anotación y acceso inteligente a información . III Xornada Galega de Bioinformática : XGB 2011. Vigo, Spain. 16 – septiembre [UVIGO/UEM] </li></ul><ul><li>F. Aparicio; M. de la Villa; M. Buenaga; M. Maña (2012) Medical Concept Recognition and Mind Map Automatic Composition. Bringing health to students and laypersons (en evaluación) International Conference on Health Informatics – HEALTHINF 2012, Vilamoura, Portugal, Feb. 2012 [CORE C] [UEM/UHU] </li></ul><ul><li>J.M. Córdoba; M.J. Maña; N.P. Cruz; J. Mata; F. Aparicio; M. Buenaga; D. Glez-Peña; F. Fdez-Riverola (2011) . Medical-Miner at TREC 2011 Medical Records Track . TREC 2011, Gaithersburg, Md. USA. Nov 2011. </li></ul>
    25. 25. Previsión de desarrollos futuros <ul><li>Solicitud conjunta de un nuevo proyecto en convocatorias internacionales (Eurostars, AAL) </li></ul><ul><ul><li>integración de plataforma MedicalMiner en Web para el acceso, estudio y análisis de casos clínicos </li></ul></ul><ul><li>Aplicación de las técnicas desarrolladas a problemas complejos en el acceso a información biomédica </li></ul><ul><ul><li>competiciones ImageCLEF, DDIExtraction o TREC </li></ul></ul><ul><li>Trasferencia de resultados a las EPOs participantes </li></ul>
    26. 26. MedicalMiner más información en http://www.medicalminer.org/ Manuel de Buenaga Florentino Fdez-Riverola Manuel Maña

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