Microarreglos de DNA

MICROARREGLOS DE DNA UNA HERRAMIENTA PARA DETECCIÓN Y DIAGNÓSTICO

Que es un microarreglo??

Uso principal de los GlucosaMicroarreglos de DNA 2 hr + Glucosa 2 hr + Etanol RNA total RNA total Cy3 Cy5 cDNA cDNA

Cy3 Alexa555 Cy5Síntesis de cDNAIncorporación Alexa647indirecta de marca fluorescente

PREHIBRIDIZACIÓNAISLAMIENTODE RNA TOTAL SÍNTESIS Y MARCADO HIBRIDIZACIÓN DE cDNA LAVADO LECTURA

Cy3 + Cy5

http://www.genome.ad.jp/kegg/kegg2.html

GENE EXPRESSION PATTERNS OF BREAST CARCINOMASDISTINGUISH TUMOR SUBCLASSES WITH CLINICAL IMPLICATIONSTherese Sørliea, et al.PNAS September 11, 2001 vol. 98 no. 19 10869–10874

Arreglo para genes específicos

Ejemplo de hibridización de un chipdiagnóstico para clasificar pacientespor su firma genética para una patología

MICROARREGLOS DE DNA PARA DETECCIÓN DE PATÓGENOS

Diseño de sondas DNA genómico E. coli5´ 3´ sonda DNA genómico C. jeyuni5´ 3´ sonda DNA genómico L. monocitogenes5´ 3´ sonda DNA genómico Salmonella spp5´ 3´ sonda

Obtención de DNA marcado DNA genómico E. coli5´ 3´ DNA genómico C. jeyuni5´ 3´ DNA genómico L. monocitogenes5´ 3´ DNA genómico Salmonella spp5´ 3´ Hibridización

Ejemplo de hibridización de chip diagnóstico para clasificar bacterias por su firma genética Formato de chip de 16 retículas

MICROARREGLOS DE DNA PARA DETECCIÓN DE OGMs

ORGANISMO TRANSGEN ORGANISMO BAJA Exploración – tamizaje Especificidad del blanco(determinar si el promotor o el terminador están presentes) Blanco específico del Gen Construcción específica (no importa la combinación de primers hay que asegurar que esta la construcción) Blanco específico (hay que asegurar que el evento esta inserto en la planta de acuerdo a los expedientes de los desarrolladores, las secuencias que ellos proporcionan) ALTA

ORGANISMO TRANSGEN ORGANISMOOrganismo y/o Evento 01Organismo y/o Evento 02Organismo y/o Evento 03Organismo y/o Evento 04Organismo y/o Evento 05 2.5 mmOrganismo y/o Evento 06Organismo y/o Evento 07Organismo y/o Evento 08Organismo y/o Evento 09Organismo y/o Evento 10 2.5 mm PRUEBA DUPLICADO

Maíz-Control Maíz-MON863-5 O P A Tg Tr O P A Tg TrMaíz, MON-00810-6 B. thuringensis s. kur-cry1ABMaíz, MON-00603-6 Agrobacterium sp-CP4 cp4Maíz, MON-00863-5 B. thuringensis s. kum-cry3Bb1Maíz, MON-00863-5 E. coli-ntpIIMaíz, DAS-01507-1 B. thuringensis v. Aiz-cry1FMaíz, DAS-01507-1 S. viridochromognes-patSoya, MON-04032-6 Agrobacterium sp-5eno3PSoya, MON-04032-6 E. coli-ntpIISoya, DP-356043-5 B. licheniformis-gat4601Soya, DP-356043-5 Glycine max-gm-hra PRUEBA DUPLICADO

Hasta 1000 sondas por arreglo16 muestras individualesIdénticas condiciones de: Hibridización Lavado LecturaDesventajas; se deben procesarlas 16 muestras al mismo tiempo

Prototipo visual para la distribución de sondasen microarreglos para detección y diagnóstico

Formatos de chip múltiple, para la prueba simultanea de muestras1000 sondas16 muestras individuales 1000 sondas 96 muestras individuales

UNIDAD DE MICROARREGLOS DE DNA UNAM INSTITUTO DE FISIOLOGÍA CELULAR Ciudad Universitaria D.F. AP70242. CP04510 Tel. 56225753 FAX 56225630 e-mail jramirez@ifc.unam.mx http://microarrays.ifc.unam.mx/

http://ciber-genetica.blogspot.com	989
http://ciber-genetica.blogspot.mx	46
http://ciber-genetica.blogspot.com.es	6
http://www.ciber-genetica.blogspot.com	4
http://ciber-genetica.blogspot.com.ar	3
http://www.blogger.com	2

Microarreglos de DNA

by CiberGeneticaUNAM on Jan 28, 2012

Accessibility

Categories

Tags

Upload Details

Usage Rights

6 Embeds 1,050

Statistics

Microarreglos de DNA — Presentation Transcript