• Save
Enzymen 4e deel
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×
 

Enzymen 4e deel

on

  • 1,612 views

 

Statistics

Views

Total Views
1,612
Views on SlideShare
1,612
Embed Views
0

Actions

Likes
0
Downloads
0
Comments
0

0 Embeds 0

No embeds

Accessibility

Categories

Upload Details

Uploaded via as Microsoft PowerPoint

Usage Rights

© All Rights Reserved

Report content

Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
  • Full Name Full Name Comment goes here.
    Are you sure you want to
    Your message goes here
    Processing…
Post Comment
Edit your comment
  • NH groups of Glycine stabilizes the negative O- by H-bonds

Enzymen 4e deel Enzymen 4e deel Presentation Transcript

  • Ser 195 is een onderdeel van Catalytic triade: Asp102; His57 en Ser195. Serine 195 wordt omgezet in een nucleofiel. Hoe zorgt de rangschikking van de drie residuen in de triade tot een hoge reactiviteit van ser 195.
  • Peptide hydrolyse door chymotrypsine
  • catalytic strategies
  • catalytic strategies Uiteenvallen van tetraëder Het proton van het positief geladen His wordt overgedragen aan de aminogroep die gevormd is door verbreking van de peptide binding.
  •  
  • catalytic strategies Deacylering:
  • catalytic strategies
  • catalytic strategies
  • catalytic strategies
  • catalytic strategies
  • Active site results in substrate specificity and stereospecificity 1 3 2
  • 7 5 6 4
  • Specificiteit van proteases
    • Chymotrypsine knipt peptidebinding na residuen met een aromatische of lange hydrofobe keten
    • Tripsine knipt peptidebinding na residuen met een lange positief geladen zijketen (arg;lys)
    • Elastase knipt peptidebinding na residuen met een kleine zijketen (alanine; serine)
  • catalytic strategies Chymotrypsin binding pocket Een diepe relatieve hydrofobe pocket, S1 pocked.
  • Meer complexe specificiteit van protease enzymen
  • S1 pocket van chymotrypsine, trypsine en elastase.
  • De katalytische triade en oxyanion hole van subtilisin Subtilisin een protease in bacterien. Bevat de katalytische traide en oxyanion hole.
  • Site directe mutagenese van triade aminozuren in subtilisin
  • Andere proteases. Strategie: Genereer een nucleofiel die carbonyl groep van peptide binding aanvalt.
  • HIS Cys
  • HIV protease.
  • Bespreking 4 klasse van enzymen
    • Serine proteases (chymotrypsine)
    • Carbonic anhydrase
    • Restriction endonucleases
    • Nucleoside monophosphate kinases
  • Carbonic Anhydrase. CO 2 is eindproduct van metabolisme. Het wordt afgegeven aan het bloed en getransporteerd maar longen. In rode bloedcellen reageert CO 2 met water.
  • Carbonic anhydrases maakt een snelle reactie veel sneller.
  • Het enzym carbonic anhydrase bevat een gebonden zink-ion.
  • Enzym Carbonic Anhydrase.
    • Zink is aanwezig in biologische systemen uitsluitend in de +2 toestand
    • Zink is gebonden aan 4 of meer liganden.
    • In carbonic anhydrase zijn drie coördinaten bezet door de imidazole-ringen van drie histidine-residuen en de andere coördinaat is bezet door water.
  • Effect pH op activiteit van carbonic anhydrase
  • Welke invloed heeft het zinkcomplex op CO 2 -hydratatie De binding van een watermolecuul aan het positief geladen zinkcentrum verlaagt de pK A van water van 15,7 tot 7.
  • Mechanisme van carbonic anhydrase