• Share
  • Email
  • Embed
  • Like
  • Save
  • Private Content
Ngs 6
 

Ngs 6

on

  • 203 views

 

Statistics

Views

Total Views
203
Views on SlideShare
194
Embed Views
9

Actions

Likes
0
Downloads
1
Comments
0

1 Embed 9

http://bioinformaticsinstitute.ru 9

Accessibility

Categories

Upload Details

Uploaded via as Adobe PDF

Usage Rights

© All Rights Reserved

Report content

Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
  • Full Name Full Name Comment goes here.
    Are you sure you want to
    Your message goes here
    Processing…
Post Comment
Edit your comment

    Ngs 6 Ngs 6 Document Transcript

    • Шестое домашнее задание Граф де Брюйна 2 1. Упрощение графа Используя программу из задания №5, попробуйте две наиболее простые стратегии очистки графа от мусора: ● отбрасывание всех типов (тупиковых ребер с небольшим покрытием и небольшой длиной) ● отбрасывание всех низкопокрытых и коротких ребер Оцените, какой подход лучше, то есть письменно приведите краткое обоснование. 2. Оценка качества ассемблера Оцените полученные вами контиги, используя QUAST (/storage/labnas/NGS/6/ quast/). Тоже хотелось бы краткий отчет своими словами. Данные: Папка: /storage/labnas/NGS/6/ Данные: s_6.first1000.fastq s_6.first10000.fastq s_6.first100000.fastq Соответствующие им геномы: MG1655-K12.first1K.fasta MG1655-K12.first10K.fasta MG1655-K12.first100K.fasta