SCOP - Structural Classification
Of Proteins
• Организована в соответствии со
структурными семействами белков.
• Иерархиче...
NCBI - Entrez
• Entrez - поисковая машина для баз NCBI.
• Поиск начинается с выбора адекватной области для
поикса (Nucleot...
NCBI - Entrez
Ограничения:
SRS (Sequence Retrieval System).
• Исталлирована на множестве серверов.
• Имеет связи со многими базами данных.
• Предоста...
SRS
Рабочая среда
Выбор базы
данных
Заполнение
формы
запроса
Страница
результатов
Текстовый поиск
Общие принципы:
1. Все главные базы предоставляют удобные
средства для тектового поиска.
2. Поиск по ключе...
Эффективность поиска
Эффективность: время и адекватные результаты!
Проект ENCODE
http://genome.ucsc.edu/
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×

Biodb 2011-03

95

Published on

0 Comments
0 Likes
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

No Downloads
Views
Total Views
95
On Slideshare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
2
Actions
Shares
0
Downloads
1
Comments
0
Likes
0
Embeds 0
No embeds

No notes for slide

Biodb 2011-03

  1. 1. SCOP - Structural Classification Of Proteins • Организована в соответствии со структурными семействами белков. • Иерархическая система.
  2. 2. NCBI - Entrez • Entrez - поисковая машина для баз NCBI. • Поиск начинается с выбора адекватной области для поикса (Nucleotide, белки). • Можно использовать определители полей, логические операторы, условия и т.д.
  3. 3. NCBI - Entrez Ограничения:
  4. 4. SRS (Sequence Retrieval System). • Исталлирована на множестве серверов. • Имеет связи со многими базами данных. • Предоставляет множество инструментов и служб для анализа. • Позволяет сохранить результаты работы и анализа и продолжить работу локально.
  5. 5. SRS Рабочая среда Выбор базы данных Заполнение формы запроса Страница результатов
  6. 6. Текстовый поиск Общие принципы: 1. Все главные базы предоставляют удобные средства для тектового поиска. 2. Поиск по ключевым словам или полям. 3. Одновременный поиск в нескольких базах. 4. Дополнительные условия (дата, длина и т.д.).
  7. 7. Эффективность поиска Эффективность: время и адекватные результаты!
  8. 8. Проект ENCODE http://genome.ucsc.edu/
  1. A particular slide catching your eye?

    Clipping is a handy way to collect important slides you want to go back to later.

×