Support de formation, guide, manuel, tutoriel. Présentation de10 outils de gestion de références bibliographiques : Bibme, Bisonomy, Bibus, citavi free, Colwiz, Docear, Endnote basic, Jabref, Mendeley, Wikindx.

1. OUTILS DE GESTION DES
RÉFÉRENCES
ATELIER
B i b l i o t h è q u eSeptembre2015
Avertissement
L’enssib alerte sur le fait que les outils
présentés ici sont susceptibles de ne
pas garantir la sécurité informatique ni la
confidentialité des données de l’usager.

2. Pour choisir un outil, il faut déterminer ses besoins et sa méthodologie de travail. Par exemple :
• Est-ce que je trouve les fonctions que je cherche ?
• Est-ce que mes réservoirs et mes sources préférées sont accessibles ?
• Avec quels programmes, systèmes d’exploitation, navigateurs fonctionne-t-il ?
• Trouverais-je l’aide dont j’ai besoin, dans une langue que je comprends ?
• Est-ce que je travaille toujours sur le même poste informatique ou pas ? Est-ce qu’il existe une
version mobile ?
Sélection de dix logiciels gratuits de gestion de références.
Langue Licence Utilisation Collecte de
références
Bibliographie
Bibme Anglais Commerciale.
Version gratuite
Web BDD
Manuelle
En partie (copier-coller
des références une par
une)
Bibsonomy Anglais Gratuit
(Universités de
Cassel et de
Würzburg)
Web
(inscription)
Web
Manuelle
En partie (seulement
les publications, pas
les signets)
Bibus Français Open Source Local BDD
Manuelle
Oui
Citavi free Français Commerciale.
Version gratuite
Local Web
BDD
Manuelle
Oui
Colwiz Anglais Gratuit (société
commerciale)
Web
(inscription)
Local
WEB
BDD
Oui
Docear Anglais Gratuit
(Université de
Constance)
Local BDD (interne)
Manuel
Oui
Endnote
basic
Anglais Commerciale.
Version gratuite
Web
(inscription)
BDD
Manuelle
Jabref Français Open Source Local BDD
Manuelle
Oui avec Latex
Mendeley Anglais Commerciale.
Version gratuite
Web
(inscription)
Local
BDD
Web
Manuelle
Oui
Wikindx Français Open Source Web
(inscription)
Local
Manuelle Oui (en ligne
notamment)
BDD= bases de données (interne et/ou externes)

3. BIBME
http://www.bibme.org/
La version gratuite est très simple d’utilisation puisque les fonctionnalités offertes se limitent à la recherche
de références dans les bases de données partenaires ou à la création manuelle de références. On obtient
ainsi une citation qui peut être copiée-collée. Aucune sauvegarde des références n’est proposée.
TRAITEMENT DE TEXTE
Tous, par copier-coller, sans lien avec Bibme.
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Aucune
PARTAGE
Aucun
COMMENTAIRE
Les versions payantes proposent la gestion des références et le téléchargement des bibliographies.
Parmi les bases de données, on trouve Amazon, FindArticles, Yahoo !News, CiteULike et Academic
Papers.
DOCUMENTATION
• Tutoriel vidéo 2’57’’ : https://www.youtube.com/watch?v=8LikOn0xgb0
• Tutoriel viodéo 7’44’’ : https://www.youtube.com/watch?v=U9m3nyAjKck
BIBSONOMY
http://www.bibsonomy.org/
Cet outil collaboratif de social bookmarking académique permet de collecter des signets. La création des
bibliographies n’est possible qu’à partir des références « publications » (pas de bibliographie des signets).
Elle se fait titre par titre. L’inscription est requise.

4. TRAITEMENT DE TEXTE
Tous, par copier-coller, sans lien avec Bibsonomy.
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Oui, par le biais de la base de données interne créée par le réseau social de Bisonomy.
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
Bibsonomy propose un plugin pour Mozilla Firefox. Les boutons ainsi installés dans la barre de menu
permettent de collecter des signets au cours d’une navigation sur le Web.
PARTAGE
Oui. Les références sont publiques ou privées. Il est possible de créer des groupes.
COMMENTAIRE
Bibsonony permet de collecter des références, de gérer sa bibliothèque et de partager ses recherches
avec un réseau académique.
DOCUMENTATION
• Présentation : http://inf6107.wikispaces.com/Bibsonomy
• Tutoriel viodéo 5’21’’ : https://www.youtube.com/watch?v=075uOzAkhEs

5. BIBUS
http://bibus-biblio.sourceforge.net/wiki/index.php/Main_Page
Bibus permet de chercher, d'éditer et d'organiser les références bibliographiques. Outre sa propre base de
données confectionnée avec les références des utilisateurs, Bibus donne un accès direct aux bases de
données PubMed et eTblast. Il est possible de de créer des nouveaux styles de citations ou d’en importer.
TRAITEMENT DE TEXTE
LibreOffice.org, OpenOffice.org et Microsoft Word
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Oui. Bibus peut importer des bases de données bibliographiques aux formats : txt, Medline, MedlineXML,
Refer, Refer (EndNote), RIS, BibTex, ISI, EndNoteXML.
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
L’outil doit être installé sur un poste informatique.
PARTAGE
Oui, avec les utilisateurs de Bibus.
COMMENTAIRE
Outil idéal pour les étudiants et chercheurs en sciences de la santé.
DOCUMENTATION
• Présentation : https://www.projet-plume.org/fiche/bibus
http://bibus-biblio.sourceforge.net/wiki/index.php/Base_de_donn%C3%A9es_bibliographiques_Bibus
• Mode d’emploi : http://doccitanist.lirmm.fr/IMG/pdf/Maire-Bibus-23-11-07.pdf
http://gf3.myriapyle.net/gcde/data/Bibliographie-avec-Openoffice.pdf

6. CITAVI FREE
https://www.citavi.com/fr/index.html
Citavi permet d’importer, créer, traiter et exporter des références. La version gratuite propose les mêmes
fonctionnalités que l’abonnement payant, mais la sauvegarde est limitée à 100 titres. La personnalisation
des styles de citation est permise.
TRAITEMENT DE TEXTE
Tous, mais particulièrement Microsoft Word (extension)
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Oui, notamment en cours de navigation Web, manuellement, par ISBN etc.
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
Citavi doit être téléchargé, ainsi que le plugin Word et le bouton « Picker » qui permet de collecter des
pages Web (Firefox, Internet Explorer, Chrome). L’outil doit être installé sur un poste informatique.
PARTAGE
Oui, par courriel.
COMMENTAIRE
Citavi permet également l’intégration de PDF et d’autres documents. L’outil inclut un planificateur de tâches
pour un travail en équipe.
DOCUMENTATION
Manuel : https://www.citavi.com/sub/manual5/en/index.html
https://www.citavi.com/service/en/docs/Citavi_5_Getting_started.pdf

7. COLWIZ
https://www.colwiz.com/
Conçu par des chercheurs de l'Université d'Oxford, Colwiz intègre la recherche et la gestion des
références, des outils de collaboration et de réseautage.
TRAITEMENT DE TEXTE
LibreOffice.org, OpenOffice.org et Microsoft Word
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Oui. Import de fichiers enregistrés au format BibTeX, EndNote XML ou RIS.
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
L’outil doit être installé sur un poste informatique mais est aussi accessible en ligne. Des plugins sont aussi
à installer pour Word et OpenOffice et les différents moteurs de recherche .
PARTAGE
Oui, par courriel et constitution de groupes.

8. COMMENTAIRE
Outil conçu pour la recherche disponible aussi en version mobile (IOS, Android). Il permet aussi
l’intégration de PDF.
DOCUMENTATION
• Présentation : http://libguides.bodleian.ox.ac.uk/content.php?pid=294548&sid=2427490
• Mode d’emploi : https://colwiz.desk.com/customer/portal/topics/341695-getting-started/articles
• Tutoriels vidéo : https://www.youtube.com/user/ColwizResearch
DOCEAR
http://www.docear.org/
Docear propose la gestion des références et des annotations. C’est un outil spécialement conçu pour gérer
ses travaux de recherche.

9. TRAITEMENT DE TEXTE
Microsoft Word (extension)
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Non
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
Oui, sur un poste informatique.
PARTAGE
Non
COMMENTAIRE
Docear utilise le mind mapping pour la présentation des travaux de recherche. Il propose aussi un système
de recommandation de lecture. C’est un outil complexe.
DOCUMENTATION
• Manuel : http://www.docear.org/software/details/
• Tutoriel vidéo 6’27’’ : https://www.youtube.com/watch?v=UrBH_biOv2I
ENDNOTE BASIC
http://endnote.com/product-details/basic
Basic est la version gratuite de l’outil Endnote. Les fonctionnalités sont réduites par rapport aux versions
payantes, mais le stockage, l’organisation des références et la confection de bibliographies sont possibles.
TRAITEMENT DE TEXTE
Microsoft Word
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Oui
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
Pas d’installation locale pour Basic, mais plugin pour collecter des signets dans Internet Explorer.
PARTAGE
Oui, mais de références seulement, pas de bibliothèques entières. Constitution de groupes.
COMMENTAIRE
La recherche est limitée aux bases de données en ligne.

10. DOCUMENTATION
• Tutoriels vidéo : https://www.youtube.com/user/EndNoteTraining
• Présentation : http://guides.ucsf.edu/c.php?g=101034&p=654993#s-lg-box-1945614
JABREF
http://jabref.sourceforge.net/
JabRef est un logiciel de gestion de références bibliographiques, en format BibTeX (format standard de la
bibliographie sous LaTeX). Il permet de créer des bases de données : stockage des données, mise en
forme et export lors de la rédaction de documents, recherche en ligne vers certaines bases (Medline, Citer,
IEEE, Google Scholar etc.), importation de références de bases de données (Inspec, Current Contents,
SciFinder, Web of Sciences, etc.).

11. TRAITEMENT DE TEXTE
Microsoft Word, Open Office
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Oui
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
L’application elle-même doit être téléchargée sur un poste informatique et beaucoup d’autres programmes
doivent être installés pour que toutes les fonctionnalités puissent être déployées (notamment pour utiliser
les traitements de texte).
PARTAGE
Non
COMMENTAIRE
Outil assez complexe, plutôt adaptés aux travaux de recherche longs.
DOCUMENTATION
• Présentation :http://www.mshs.univ-poitiers.fr/migrinter/e-
migrinter/200903/emigrinter2009_03_58.pdf
• Manuel : http://pbil.univ-lyon1.fr/members/mbailly/Comm_Scientifique/M1/jabref.pdf
http://stephlefevre.free.fr/logiciels/JabRef.php
https://princessjumper.wordpress.com/2013/08/25/jabref-la-bibliographie-pour-les-nuls/
• BibTex/LaTex : http://www.polymtl.ca/biblio/utiliser/guide_bibtex.pdf
https://fr.wikipedia.org/wiki/BibTeX
http://www.tuteurs.ens.fr/logiciels/latex/bibtex.html
http://www.polymtl.ca/biblio/utiliser/guide_bibtex.pdf
https://www.projet-plume.org/files/BibTeX_AlainCoulais090320_0.pdf
www.bibtex.org/
https://www.ljll.math.upmc.fr/~privat/documents/manuelLatex.pdf
MENDELEY
https://www.mendeley.com/dashboard/
Mendeley est un logiciel de gestion bibliographique, destiné à la gestion et au partage de travaux de
recherche grâce à un réseau Web. Il gère notamment les PDF, les citations, et les références
bibliographiques.

12. TRAITEMENT DE TEXTE
LibreOffice.org, OpenOffice.org et Microsoft Word
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Oui
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
Installation du logiciel en local, d’un bookmarklet pour la recherche dans quelques bases de données
(PubMed, EBSCO, Google Scholar ou WorldCat), le plugin pour les traitements de texte et le bouton
d’import à partir d’un navigateur.
PARTAGE
Oui, par courriel.
COMMENTAIRE
Il existe une version mobile (IOS et Android). Acheté par Elsevier en 2013.
DOCUMENTATION
• Présentation : https://fr.wikipedia.org/wiki/Mendeley
http://guides.ucsf.edu/c.php?g=101034&p=655031
• Tutoriels vidéo 5’08’’: https://www.youtube.com/watch?v=GqWn5XIGB-Y
• Manuel : http://biblio.math.univ-montp2.fr/nvbibli/images/PDF/Mendeley-manuel%20dutilisation.pdf
http://fr.slideshare.net/natachaleclercq/tutoriel-mendeley-16
http://www.bibliotheques.uqam.ca/sites/default/files/bibliotheques/sciences/Procedures_Mendeley.pdf
http://urfist.univ-lyon1.fr/medias/fichier/mendeley-gestion-references-bibliographiquesv2-
2011_1320915247108.pdf
WIKINDX
http://wikindx.sourceforge.net/
http://sourceforge.net/projects/wikindx/
WIKINDX se présente comme une plate-forme bibliographique « full web », permettant à plusieurs
contributeurs de gérer un nombre illimité de notices dans une logique « wiki » : les utilisateurs peuvent ou
non s’enregistrer librement sur la plate-forme pour contribuer selon le paramétrage choisi.

13. TRAITEMENT DE TEXTE
LibreOffice.org, OpenOffice.org et Microsoft Word (par export .RTF).
IMPORTATION DE RÉFÉRENCES
Oui, au format BibTex
TÉLÉCHARGEMENT ET PLUGIN
Oui. Plugin pour quelques bases de données (PubMed , Amazonet) et MS Word.
PARTAGE
Oui

14. COMMENTAIRE
Après être resté longtemps sans maintenance, une nouvelle version est testée depuis août 2014.
L’installation est compliquée.
DOCUMENTATION
• Présentation : http://www.wikindx.com/wikindx4/
https://www.projet-plume.org/fiche/wikindx
• Manuel : http://facepress.net/pdf/818.pdf
RECOMMANDATIONS POUR LA RÉDACTION D’UNE BIBLIOGRAPHIE
http://www.univ-montp3.fr/infocom/wp-content/RES-redaction-bibliographie-2015.pdf
https://fr.wikipedia.org/wiki/ISO_690
https://bu.univ-lorraine.fr/formations/rediger-une-bibliographie
DOCUMENTATION GÉNÉRALE
Universitätsbibliothek der Technischen Universität München. Comparaison de logiciels de gestion de
références. 2015. En ligne : http://mediatum.ub.tum.de/doc/1272837/1272837.pdf