Marc Rietveld (UMC Utrecht) - Big Data en Research IT

Seminar Dutch Health Hub 23 november 2011 Marc Rietveld

Kans Dutch Health Hub in onderzoek
Goedkope en flexibele basisvoorziening voor storage en rekencapaciteit
Mits:
Flexibel / hoog serviceniveau
Goedkoop
Snelle netwerkverbindingen!
Samenwerking
Veel aandacht voor beveiliging
Werken aan vertrouwen

Inhoud
Trends in onderzoek
Situatie in UMC Utrecht
Situatie landelijk
Bottlenecks / vragen / issues
Mogelijke bijdrage Dutch Health Hub aan onderzoek

Trends in medisch / farmaceutisch onderzoek
Enorme groei data:
Digitalisering en verbeteringen in meetapparatuur
Digitalisering zorgdata
Alles opslaan, want misschien is het bruikbaar
Koppeling & bewerking bestaande datasets
Prof. Peter van der Spek
“ De hoeveelheid data in research zullen 6 tot 7 keer zo groot worden als in de zorg.”

Ter ilustratie sequencing ‘old style’ vs ‘new style’ Nu: 240 GB / dag 100.000 ACTG per experiment 50.000.000.000 3 uur Tijd per experiment 7 uur 2 jaar Tijd voor humaan genoom 2 weken € 300.000.000 Kosten voor humaan genoom € 3.000

Trends medisch / farmaceutisch onderzoek
Nieuwe mogelijkheden van en voor onderzoek
Patroonherkenning in grote hoeveelheden MRI’s of CT-scans
Statistisch minder evidente causale relaties bij grotere databases
Betere en effectievere bewaking van nieuwe behandelingen en medicijnen door gebruik zorgdata
Concurrentie tussen landen
Nederland scoort vooralsnog hoog wat betreft kwaliteit van onderzoekers en infrastructuur
Maar: Nederland is klein wat betreft bevolking

Situatie UMC Utrecht
Strategiestudie ICT voor Research 2010 – 2011
Observaties
(Digitale) zorggegevens zijn bruikbaar voor onderzoek
Van ‘zelf doen’ naar gebruik van meer centrale dienstverlening
Differentiatie van nieuwe specialismen in onderzoeksondersteuning
Kwaliteit / monitoring onderzoek steeds belangrijker
Plannen .
Integratie gegevensverzameling zorg en onderzoek
Research Data Platform
Ondersteuning en monitoring van onderzoeker via Onderzoeksportaal
Basis infrastructuur: storage, high performance computing, netwerk

Integratie zorg & onderzoek bij dataverzameling Gewenste situatie Geïntegreerde zorg- en onderzoeksinformatie Zorg- / research pad Intake, anamnese en IC Self reporting MyUMC

Research Data Platform Gewenste situatie : RDP als onderdeel UMC-breed datawarehouse OLAP Bronsystemen Data store ETL EZIS SAP BW Lab / medicatie Uitvoer BI portal Rapport xyz Rapport xyz Dataset Samples Beeld Vragenlijsten META DATA Dataset Dataset
Kern ‘Research Data Platform’
Centrale storage voorziening
Standaarden metadatering
Selectie tooling
Catalogus
Doel: data mining vs datakerkhoven

Ondersteuning van gehele onderzoeksproces
Toegang tot relevante expertise en ondersteuning
Toegang tot beveiligde storage omgeving
Delen met onderzoekers wereldwijd
Kwatliteitsmonitoring
Onderzoeksportaal Gewenste situatie

ICT Infrastructuur Gewenste situatie Waardevolle gegevens in een goed beheerd RC Goede/snelle verbindingen binnen UMCU Hoge bandbreedte naar buiten Open access & identity management Storage als basisvoorziening Schaalbare, flexibele storage tegen lage kosten Gedeeltelijk eigen beheer Metadatering om data op langere termijn te beheersen Toegankelijk Rekencapaciteit als basisvoorziening Voldoende voor onderzoek op bijv. beeldmateriaal Flexibel: (externe) voorzieningen / afspraken om pieken in rekenbehoefte op te kunnen vangen Met energie / koeling / beveiliging goed geregeld Hogere eisen aan security / privacy Netwerk Storage Rekenkracht Rekencentrum

Situatie landelijk V eel partijen, veel lijntjes, veel steigers Lifelines SURF SARA NBIC UU UL UvA RUG EUR UM VU UMCU LUMC AMC UMCG AZM VUMC ErasmusMC KUN RadboudMC LSH NFU ZonMW KNAW CTMM BMM PSI BBMRI Industrie RIVM e.a. Programma’s & projecten project project project project project project TI Pharma project … ESFRI IMI OPS PROTECT … FP7 BioShare BioImaging …

Gewenste situatie: samen werken aan toekomstvaste voorzieningen
Samenhangende lokale voorzieningen waar mogelijk, centraal waar nodig
SURF SARA NBIC UU UL UvA RUG EUR UM VU UMCU LUMC AMC UMCG AZM VUMC ErasmusMC KUN RadboudMC NFU ZonMW KNAW Industrie RIVM e.a. Nationale ICT infrastructuur
Van projectgedreven naar instituutsgedreven
DHH?

Issues / bottlenecks / vragen Not invented here! Flexibiliteit & kosten Snelle toegang Beveiliging eigen data Samenwerking?

Mogelijke bijdrage Dutch Health Hub
Centrale voorziening voor storage en High Performance Computing
Aansluiten bij landelijke ontwikkelingen rond standaarden voor semantiek en metadata
Afstemmen met andere soortgelijke initiatieven zoals DANS en TARGET
Randvoorwaarden:
Flexibel / hoog serviceniveau
Goedkoop
Snelle netwerkverbindingen!
Samenwerking
Veel aandacht voor beveiliging

http://www.almeredatacapital.nl	258
http://www.dutchhealthhub.nl	115
http://almeredatacapital.nl	66
http://dutchhealthhub.nl	37

Marc Rietveld (UMC Utrecht) - Big Data en Research IT

by AlmereDataCapital on Nov 24, 2011

Accessibility

Tags

Upload Details

Usage Rights

4 Embeds 476

Statistics

Marc Rietveld (UMC Utrecht) - Big Data en Research IT — Presentation Transcript