Your SlideShare is downloading. ×
  • Like
  • Save
Prof. Ard den Heeten (LRCB) - Brondata: kennis uit ruwe data
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×

Thanks for flagging this SlideShare!

Oops! An error has occurred.

×

Now you can save presentations on your phone or tablet

Available for both IPhone and Android

Text the download link to your phone

Standard text messaging rates apply

Prof. Ard den Heeten (LRCB) - Brondata: kennis uit ruwe data

  • 1,777 views
Published

De presentatie van Prof. Ard den Heeten (LRCB) tijdens de conferentie 'Big Data in de Zorg' van 23 november 2011 in Almere. Op deze conferentie werd het officiële startschot gegeven voor Almere …

De presentatie van Prof. Ard den Heeten (LRCB) tijdens de conferentie 'Big Data in de Zorg' van 23 november 2011 in Almere. Op deze conferentie werd het officiële startschot gegeven voor Almere DataCapital en de Dutch Health Hub.

Published in Health & Medicine
  • Full Name Full Name Comment goes here.
    Are you sure you want to
    Your message goes here
    Be the first to comment
    Be the first to like this
No Downloads

Views

Total Views
1,777
On SlideShare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
2

Actions

Shares
Downloads
0
Comments
0
Likes
0

Embeds 0

No embeds

Report content

Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
    No notes for slide

Transcript

  • 1. Digitaal Mammografisch Bevolkingsonderzoek naar Borstkanker in Nederland.Prof. Dr.G.J. Den HeetenDirecteur LRCB Nijmegen
  • 2. Kennis halen uit (ruwe)big data? ,
  • 3. Inhoud• Wat doen we en waarom?• Wat is het probleem?• Hoe kunnen we dit oplossen?• Wat gaan we dan doen?
  • 4. Wat doen we en waarom?
  • 5. H E A L T H A F F A I R S ~ V o l u m e 2 0 , N u m b e r 5 2001
  • 6. H E A L T H A F F A I R S ~ V o l u m e 2 0 , N u m b e r 5 2001 No 5 mammografie
  • 7. Incidence&Mortality
  • 8. Dutch Screening Act Preamble (preambule)• “To protect the inhabitants of the Netherlands from screening activities that might endanger the health of the individuals to be examined. “• Permit system
  • 9. Mammographic service Mammographic opportunistic screeningscreening Off the shelf Utility Supply (commodity)
  • 10. 10 000 1 200 000Mammographic servicescreening 960 000 1800 19 200 940 000 5280 Utility Supply
  • 11. 1971 New York 1975 Nijmegen / Utrecht 1984 Lancet National Evaluation of breast cancer screening in the Netherlands 1990- 1989 start Dutch program 50-69 2007. ( LETB XII ) WWW.LRCB.NL> 50000 screen 1997 Dutch program fully implementeddetected breast 1998 Extension to 70-74cancers 2007 Evaluation No XI NETB 2008 Digitization
  • 12. 2010-30,5
  • 13. Need to improve ? 2003 1989
  • 14. The rise of the incidence ofbreast cancer is real and wehave not seen the end of it.Dr. M.J. LouwmanThesis Erasmus Universiteit6 juni 2007
  • 15. Wat is het probleem?
  • 16. PACSDensity100%
  • 17. Hospitals• 120 Locations of Hospitals• 105 PACS’s• Survey: 45 responses• 7 Vendors• 28 different releases!
  • 18. Save light path Breast Cancer Screening Internet
  • 19. 65 Mammographic Units8 fixed locations57 mobile units5000 cliënts per day
  • 20. Digital traffic month•3000 (3 Tb) gigabyte per month (data 2011)•200 Tb first contract horizon.
  • 21. http://www.docubackup.com/about.htm
  • 22. Probleem 1
  • 23. Document Registry Document Repository 2824-11-2011 PHIT 28
  • 24. Interne workflow iSite  Alle data online en Realtime kopie van alle images (in iSyntax) formaat  Dicom Processor:  Dicom for presentation naar de isite processing. – Functie: omzetten naar iSyntax formaat (vergelijkbaar met Working Storage in eigen.iSyntax formaat).  Archief. in iSyntax formaat. Niet in DICOM formaat24-11-2011 PHIT 29
  • 25. Probleem 2
  • 26. The Digital Test• Digital Mammography
  • 27. Pixel =Picture element =
  • 28. 50-100 μm spot size and 12 or 16 bits
  • 29. information isstored as analog to digitalunits (ADU) For processing
  • 30. Raw Data
  • 31. Local contrast optimizationFor For displayprocessing
  • 32. Loss of information XCADQuality ControlDensityDisplay Etc
  • 33. Internal Philips Report Philips Restricted• A fundamental shortcoming in the DigiBob approach is that processed images are stored, rather than raw images.
  • 34. Hoe gaan we het oplossen?
  • 35. Onafhankelijke opslag brondata
  • 36. Onafhankelijke opslag brondata• Open standaarden (DI-COM, HL7 etc.)• Architectuur gericht op wetenschap en innovatieve projecten en monitoring kwaliteit.• Benchmarking• Anominisatie en synonimisatie• Toegankelijk volgens juiste juridische procedure voor alle onderzoekers (afsprakenstelsel).
  • 37. Wat gaan we dan doen?
  • 38. NETB interim report 2007
  • 39. Computer Aided Detection
  • 40. Detection of Masses: Effect of Training 0.81 Effect of training sample size • 940 cancer regions 0.8 and 38,000 normalMean Case Sensitivity 0.79 0.78 regions in training 0.77 set 0.76 0.75 • 5 fold cross 0.74 validation 0.73 0.72 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 Percentage of regions used for training
  • 41. Problems influencing the balance? Sensitivity Mammography 400% 50%Breast Density Related RiskOn Breast Cancer I II III IV BI-RADS DENSITY SCALE
  • 42. 1 200 000 Mammo Density Grid 975 000
  • 43. Digital Screening• Maximaliseren LeeftijdHoog risisco groepen Borstdichtheid familie
  • 44. Digitaal Screenen• Minimaliseren LeeftijdLaag Risico Groepen Borstdichtheid familie
  • 45. DIGIBOBBiomarker database: Breast Density, Genomics, Proteonomics, DCIS Biobank etc.Internet questionaires1. CBS - Statistics Netherlands2. IKC - Comprehensive Cancer Centres3. IBOB - Screening Information System4. GBA – Basic Information Municipalities5. PALGA – Pathology Reports EPR hospitals Research Infrastructuur ?
  • 46. http://www.oplus.nu
  • 47. Conclusie• Wat doen we en waarom?• Bijna 1 miljoen vrouwen per jaar. Sterfte reductie• Wat is het probleem?• Opslag van brongegevens• Hoe kunnen we dit oplossen?• Leverancier neutrale opslag van de brondata• Wat gaan we dan doen?• Optmalisatie van huidige systeem en naar meer individuele screening.