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Centro Universitário - UNIBRASIL
PCR
Reação em Cadeia de
Polimerase
Professora: Lyia
Alunas: Aldiny Paula
Kamelyn Casagrande
4BMAD
PCR – consiste em fazer cópias de DNA “in vitro”,
usando os elementos básicos do processo de
replicação natural do DNA.
PCR alcançou objetivos bem mais amplos que os
propostos inicialmente. PCR é comparada em
importância à definição da estrutura do DNA.
1984 - PCR foi apresentada pela primeira em
um encontro científico
Publicação:
Mullis and Faloona, 1987
Saiki at al. 1988
1976: Thomas D. Brock descobriu a DNA polimerase
termoestável de Thermus aquaticus.
1988: Esta DNA polimerase foi usada por Saiki para
fazer PCR.
PCR requer 7 componentes essenciais:
- DNA polimerase termoestável
- Um par de oligonucleotídeos para iniciar a síntese
de DNA
- Deoxinucleotídeos trifosfato (dNTPs)
- Cátion divalente: toda DNA pol. requer cátion
divalente, usualmente Mg2+
- Tampão para manter o pH
-Cátions monovalentes, usualmente K+ (KCl)
- Template de DNA
Considerações
-Validade dos reagentes
-Número de congelamentos e
descongelamentos
-Contaminação (cabelos, pele...)
-Pureza (1,8 valor de referência,
espectrofotômetro)
-Quantidade de material genético
–Pouco: pouca amplificação
–Muito: pouca amplificação
Abs 260
P= ________
Abs 280
PCR é um processo iterativo, consistindo de
três elementos:
1- Desnaturação da template por aquecimento
2- Pareamento dos iniciadores à sequência alvo fita
única
3- Extensão dos iniciadores pela DNA polimerase
termoestável
Cada uma das novas fitas de DNA estendidas a partir
dos “primers” serve como template para síntese de
uma nova fita. Os “primers” presentes na reação
fazem o pareamento com as novas fitas, na região de
complementariedade antiparalela entre “primer”-
“template”. Isso garante a aumento exponencial do
número de novas fitas.
Todas as fitas de DNA sintetizadas durante a PCR
têm a sequência de um dos primers na extremidade 5’
e a sequência complementar ao outro primer na
extremidade 3’
Fases da PCR:
1ª Fase: Aquecimento a mais
de 90ºC para a separação da
dupla fita
Separa tanto a Fita de DNA original quanto os
produtos de amplificação
2ª Fase: Anelamento dos primers
Hibridização
Temperatura varia entre 40 a 70ºC conforme o par de
primers
Determina a especificidade da ligação
3ª Fase: Extensão dos primers - duplicação do DNA
Temperatura ótima em torno de 72ºC
Ao final da reação, a quantidade de DNA amplificado
em relação ao DNA inicial é igual a 2n, sendo que n=
número de ciclos da PCR
Exemplo: PCR de 29 ciclos: 229= 536.870.912 cópias
para cada fita original
1989 - DNA Thermal Cycler, primeiro termociclador
automático
Efeito Plateau: desvio da quantidade teórica
>>Perda da atividade da Polimerase
>>Acúmulo de inibidores
>>Limitação dos componentes
>>Competição entre produtos
>>Pareamento Produto x Molde
>>Competição com anelamento do primer
Tipos de PCR e Variações da técnica
PCR que ocorre dentro de uma célula em lâmina.
Pode ser realizada em células ou tecidos fixados.
Variação da PCR
Convencional, na qual são
utilizados 2 pares de
primers (ao invés de um
par), para amplificar um
mesmo fragmento.
2 Pares para amplificar
um mesmo fragmento
PCR com 2 ou mais conjuntos de primers para
amplificar diferentes fragmentos de uma mesma
amostra.
Amplificar diferentes
fragmentos de uma
mesma amostra
Real Time – PCR
-Detecção, amplificação e quantificação numa única
etapa (agilidade na obtenção de resultados)
-É uma ótima técnica quantitativa e muito utilizada
atualmente
-Utiliza Mix comerciais como reagente
Metodologia da PCR
+
Detecção de sinais
fluorescentes
PCR: Aplicabilidade
- diagnóstico médico (Polimorfismos)
- mapeamento genético
- detecção de doenças hereditárias
- clonagem de genes
- testes de paternidade
-criação de organismos transgênicos
-Genética forense
Real Time – PCR:
-Todas as aplicações da PCR tradicional
-Quantificação de Carga Viral
-Quantificação de Expressão gênica
-Testes de Eficiência terapêutica
-Detecção de Agentes Infecciosos
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Doença de Alzheimer
-Genes da proteína β- amilóide
(PPA,cromossomo 21) e
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(APOE, cromossomo 19) >> PSEN1, PSEN2, TNF-a,
o PSEN1 e o CYP46
Referencias utilizadas:
BOTELHO, Ingrid Thaís Beltrame .Reação em cadeia da Polimerase.
UFSC. Disponível em:<http://proto.ufsc.br/files/2012/03/PCR.pdf> .Acesso
em:26/10/2015
VIEIRA, Daniel Perez. Técnicas de PCR: Aplicações e Padronização de
Reações. Disponível em:< http://etallcorp.xpg.uol.com.br/aula3.pdf>.
Acesso em:27/10/2015
Obrigada!!

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PCR - Reação em cadeia de polimerase: princípios, aplicações e variações da técnica

  • 1. Centro Universitário - UNIBRASIL PCR Reação em Cadeia de Polimerase Professora: Lyia Alunas: Aldiny Paula Kamelyn Casagrande 4BMAD
  • 2. PCR – consiste em fazer cópias de DNA “in vitro”, usando os elementos básicos do processo de replicação natural do DNA. PCR alcançou objetivos bem mais amplos que os propostos inicialmente. PCR é comparada em importância à definição da estrutura do DNA.
  • 3. 1984 - PCR foi apresentada pela primeira em um encontro científico Publicação: Mullis and Faloona, 1987 Saiki at al. 1988 1976: Thomas D. Brock descobriu a DNA polimerase termoestável de Thermus aquaticus. 1988: Esta DNA polimerase foi usada por Saiki para fazer PCR.
  • 4. PCR requer 7 componentes essenciais: - DNA polimerase termoestável - Um par de oligonucleotídeos para iniciar a síntese de DNA - Deoxinucleotídeos trifosfato (dNTPs) - Cátion divalente: toda DNA pol. requer cátion divalente, usualmente Mg2+ - Tampão para manter o pH -Cátions monovalentes, usualmente K+ (KCl) - Template de DNA
  • 5.
  • 6. Considerações -Validade dos reagentes -Número de congelamentos e descongelamentos -Contaminação (cabelos, pele...) -Pureza (1,8 valor de referência, espectrofotômetro) -Quantidade de material genético –Pouco: pouca amplificação –Muito: pouca amplificação Abs 260 P= ________ Abs 280
  • 7. PCR é um processo iterativo, consistindo de três elementos: 1- Desnaturação da template por aquecimento 2- Pareamento dos iniciadores à sequência alvo fita única 3- Extensão dos iniciadores pela DNA polimerase termoestável
  • 8. Cada uma das novas fitas de DNA estendidas a partir dos “primers” serve como template para síntese de uma nova fita. Os “primers” presentes na reação fazem o pareamento com as novas fitas, na região de complementariedade antiparalela entre “primer”- “template”. Isso garante a aumento exponencial do número de novas fitas. Todas as fitas de DNA sintetizadas durante a PCR têm a sequência de um dos primers na extremidade 5’ e a sequência complementar ao outro primer na extremidade 3’
  • 9.
  • 10.
  • 11. Fases da PCR: 1ª Fase: Aquecimento a mais de 90ºC para a separação da dupla fita Separa tanto a Fita de DNA original quanto os produtos de amplificação 2ª Fase: Anelamento dos primers Hibridização Temperatura varia entre 40 a 70ºC conforme o par de primers Determina a especificidade da ligação
  • 12. 3ª Fase: Extensão dos primers - duplicação do DNA Temperatura ótima em torno de 72ºC Ao final da reação, a quantidade de DNA amplificado em relação ao DNA inicial é igual a 2n, sendo que n= número de ciclos da PCR Exemplo: PCR de 29 ciclos: 229= 536.870.912 cópias para cada fita original
  • 13. 1989 - DNA Thermal Cycler, primeiro termociclador automático
  • 14.
  • 15. Efeito Plateau: desvio da quantidade teórica >>Perda da atividade da Polimerase >>Acúmulo de inibidores >>Limitação dos componentes >>Competição entre produtos >>Pareamento Produto x Molde >>Competição com anelamento do primer
  • 16. Tipos de PCR e Variações da técnica
  • 17. PCR que ocorre dentro de uma célula em lâmina. Pode ser realizada em células ou tecidos fixados.
  • 18. Variação da PCR Convencional, na qual são utilizados 2 pares de primers (ao invés de um par), para amplificar um mesmo fragmento. 2 Pares para amplificar um mesmo fragmento
  • 19. PCR com 2 ou mais conjuntos de primers para amplificar diferentes fragmentos de uma mesma amostra. Amplificar diferentes fragmentos de uma mesma amostra
  • 20. Real Time – PCR -Detecção, amplificação e quantificação numa única etapa (agilidade na obtenção de resultados) -É uma ótima técnica quantitativa e muito utilizada atualmente -Utiliza Mix comerciais como reagente Metodologia da PCR + Detecção de sinais fluorescentes
  • 21.
  • 22. PCR: Aplicabilidade - diagnóstico médico (Polimorfismos) - mapeamento genético - detecção de doenças hereditárias - clonagem de genes - testes de paternidade -criação de organismos transgênicos -Genética forense
  • 23. Real Time – PCR: -Todas as aplicações da PCR tradicional -Quantificação de Carga Viral -Quantificação de Expressão gênica -Testes de Eficiência terapêutica -Detecção de Agentes Infecciosos -Caracterização de Agentes (Genotipagem)
  • 24. Doença de Alzheimer -Genes da proteína β- amilóide (PPA,cromossomo 21) e -Da proteína apolipoproteína E (APOE, cromossomo 19) >> PSEN1, PSEN2, TNF-a, o PSEN1 e o CYP46
  • 25. Referencias utilizadas: BOTELHO, Ingrid Thaís Beltrame .Reação em cadeia da Polimerase. UFSC. Disponível em:<http://proto.ufsc.br/files/2012/03/PCR.pdf> .Acesso em:26/10/2015 VIEIRA, Daniel Perez. Técnicas de PCR: Aplicações e Padronização de Reações. Disponível em:< http://etallcorp.xpg.uol.com.br/aula3.pdf>. Acesso em:27/10/2015