7. nukleotida dan asam nukleat

2,524 views
2,360 views

Published on

4 pharmacy n from pharmacy4 pharmacy n from pharmacy

Published in: Education
0 Comments
1 Like
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

No Downloads
Views
Total views
2,524
On SlideShare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
3
Actions
Shares
0
Downloads
89
Comments
0
Likes
1
Embeds 0
No embeds

No notes for slide

7. nukleotida dan asam nukleat

  1. 1. Nukleotida dan asam nukleat Slamet Priyanto
  2. 2. Nukleotida
  3. 3.  Merupakan prekursor / dasar untuk asam nukleat, RNA dan DNA Struktur terdiri dari – Basa – Gula – phosphat
  4. 4.  Nukleotida berbeda dengan nukleosida  karena nukleosida tdk mempunyai gugus fosfat Sehingga kita sering menuliskan nukleotida sebagai  – Nukleosida monofosfat – Nukleosida difosfat – Nukleosida trifosfat Tergantung pada jumlah fosfat yg dimiliki Deoksiribonukleotida ditulis dng tambahan “d”  menunjukkan adanya gugus hidroksil pd atom C nomer 2
  5. 5.  Terdiri dari 2 golongan : – Ribonukleotida – Deoksiribonukleotida Jenis nukleotida : – Nama tergantung pada basanya – Jumlah fosfat yang dimiliki Adenin AMP, ADP, ATP, dAMP, dADP, dATP Guanin GMP, GDP, GTP, dGMP, dGDP, dGTP Sitosin CMP, CDP, CTP, dCTP, dCDP, dCTP Timin TMP, TDP, TTP, - Urasil UMP, UDP, UTP, dUMP, dUDP, dUTP
  6. 6.  Nukleotida mengikat basa nitrogennya pada atom C no. 1, dgn ikatan glikosida Gugus fosfat terikat pada gugus hidroksil atom C no. 5 Kedua kondisi diatas, menyebabkan nukleotida mempunyai sifat sifat: – Gugus phosphat  bertindak sbg asam kuat (pKa= 1) – Gugus amina dr basa purin dan pirimidine, dpt di protonasi – Nukleotida mampu menyerap sinar uv  dapat diukur konsentrasinya
  7. 7. Asam nukleat Merupakan bagian organisme hidup yg sangat penting Membawa informasi genetika yang akan diturunkan / ditransfer dr generasi ke generasi. Semua informasi yg ada dlm sel  DNA Ada 2 macam: – Asam deoksiribonukleat : AND / DNA – Asam ribonukleat : ARN / RNA Asam nukleat mrpk polimer nukleotida yg dihubungkan dgn ikatan fosfodiester
  8. 8. DNA (DeoxyriboNucleic Acid ) Dikenal sebagai materi genetik Merupakan komponen kromosom Merupakan polimer deoksiribonukleotida yg dihubungkan dengan ikatan fosfodiester Backbone (rangka) terdiri dr: gugus fosfat dan gula yg saling berseling Memiliki orientasi 5’  3’ jk gugus fosfat dr C5 berikatan dgn OH C3
  9. 9.  Didalam sel  dalam jalin ganda (double helix) Dimana gugus fosfat berada di luar dan basa nitrogennya di dalam Jalin ganda yg terbentuk bersifat anti parallel  ?
  10. 10. Susunan basa nitrogenpada jalin ganda DNA tidak randomGuanin (G) – Sitosin (C)Adenin (A) - Timin (T)Antara basa nitrogen satudengan yang laindihubungkan dengan ikatanhidrogenWatson and Crick :replikasi  sangat mungkinuntuk suatu DNAdiperbanyak dg informasi ygsama
  11. 11.  DNA di dalam sel ditemukan  3 bntk utama – Bentuk B – Bentuk A – Bentuk ZPerbedaanya ?
  12. 12.  seperti halnya protein, asam nukleat juga mempunyai struktur primer, sekunder dan tersier – asam nukleat mempunyai arah sense - Mempunyai individualitas  ditentukan dari urutan basa nitrogennya  disebut sebagai struktur primer - Informasi genetik ada pada struktur primer A C G T C 3’ 3’ 3’ 3’ ACGTC 3’ P P P P P P OH 5’ 5’ 5’ 5’ 5’
  13. 13. Struktur sekunder Double helix – Watson n Crick  menjawab struktur 3D DNA dgn X-ray diffraction pattern : hsl penelitian Rosalind Franklin – Mampu menyimpulkan bahwa :  mempunyai struktur double helix  dengan 10 basa setiap putaran  putaran 360°,  basa Nitrogen A-T , G – C  cekukan mayor and minor  double helix memutar ke kanan  self replication
  14. 14. Semikonservatif pd Replikasi DNAMekanisme pengkopianDNA  melibatkanpembukaan double helixSetiap rantai menjadipola / templat untuk pitabaruSemi konservatif  apabeda dengan konservatifdan dispersive?
  15. 15.  X-ray diffraction : ada 2 macam Yg telah diterjemahkan struktur 3 D nya : B form Bentuk yang umum adalah B form A form  RNA double helix – Gugus OH pd RNA  tidak memungkinkan melipat lebih dekat  membentuk A form yang lebih lebar
  16. 16. Dalam kondisi normal (kondisi fisiologis)  DNArelatif stabilKadang menjadi tidak stabil  krn proses2 replikasi,transkripsi
  17. 17.  Disosiasi double helix DNA  denaturasi – apabila DNA dipanaskan diatas melting temperaturnya (Tm) maka double helix akan terbuka – Tm  tergantung pada rasio (G+C)/ (A+T) – G/C content dapat dihitung dengan (G+C) / (Total Basa N) x 100%
  18. 18. RNAAda 4 mcm Hn RNA mRNA rRNA tRNA snRNA
  19. 19.  hnRNA  heterogeonous nuclear RNA  merupakan hasil transkripsi langsung dr DNA mRNA  – telah mengalami proses posttranskripsi  menghilangkan intron  informasi genetik  dlm btk codon (urutan 3 nukleotida) rRNA  – Komponen ribosom dimana translasi berlangsung tRNA  – Menerjemahkan kode genetik – Menghubungkan antara asam nukleat dengan asam amino  protein snRNA  – Small nuclear RNA  membantu proses splicing dalam post transkripsi proses
  20. 20. Transfer RNA (tRNA) composed of  a nucleic acid and a specific amino acid  provide the link between the nucleic acid sequence of mRNA and the amino acid sequence it codes for. An anticodon  a sequence of 3 nucleotides in a tRNA that is complementary to aStructure of tRNAs codon of mRNA
  21. 21. Fungsi biologis DNA sebagai pembawa informasi genetik – DNA  komponen dr kromosom Fungsi yang lain: – Nukleotida sbg pembawa energi – Nukleotida sebagi koensim – enzim

×