Pubmed: Guía de uso avanzado vr. 2

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Guía visual para usuarios no expertos de la base de datos bibliográfica de la National Library of Medicine, Pubmed

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Pubmed: Guía de uso avanzado vr. 2

  1. 1. Guía de uso avanzado vr. 2 Duración del tutorial: 29’ 22/06/2013
  2. 2. ¿Qué es? PUBMED permite el acceso gratuito a bases de dades bibliográficas de ciencias de la salud como MEDLINE, de la National Library of Medicine de los Estados Unidos. MEDLINE está formado por unos 19 millones de referencias de artículos de revistas publicadas desde 1946 hasta la actualidad, el 91% en inglés. My NCBI permite personalizar el uso de PUBMED grabando perfiles de interés y agregar alertas a nuestro correo-e para seguir temas actuales. La lista con los resultados de PubMed no incluye el texto completo del artículo. Sin embargo la vista Abstract muestra enlaces al texto completo del editor o el distribuidor de las revistas. El acceso al texto completo puede requerir una subscripción. Algunas revistas se ofrecen en acceso libre.
  3. 3. Recomendamos usar el navegador de Mozilla Firefox para obtener un pleno rendimiento de todas las funciones de la base de datos.
  4. 4. Búsqueda simple
  5. 5. Autocompletado Cuando escribimos en el cuadro de búsqueda el sistema mapea y nos sugiere múltiples propuestas de autoescritura. Elegimos la que más se ajusta con el puntero.
  6. 6. Búsqueda simple de un tema / 1 Introducimos el término o la frase en el cuadro de búsqueda y presionamos el botón SEARCH
  7. 7. Búsqueda simple de un tema / 2 PubMed traducirá de forma automática nuestro planteamiento en los descriptores por los cuales se indizaría formalmente el artículo y en otras etiquetas, en todos los sinónimos asociados (Entry term mappings), los autores, los títulos de las revistas, etc.
  8. 8. Búsqueda simple de un tema / 3 El botón URL nos permite generar un localizador de internet para poder guardarlo y reproducir una búsqueda idéntica en el futuro: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22%5BMeSH%20Terms%5D %20OR%20%22silicosis%22%5BAll%20Fields%5D%29%20AND%20%28%22lung%20neo plasms%22%5BMeSH%20Terms%5D%20OR%20%28%22lung%22%5BAll%20Fields%5D %20AND%20%22neoplasms%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22lung%20neopl asms%22%5BAll%20Fields%5D%20OR%20%28%22lung%22%5BAll%20Fields%5D%20A ND%20%22cancer%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22lung%20cancer%22%5 BAll%20Fields%5D%29&cmd=DetailsSearch
  9. 9. Búsqueda simple de un tema / 4 Podemos usar operadores lógicos (AND, OR, NOT), en mayúsculas siempre, para orientar la búsqueda: percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)
  10. 10. Búsqueda con filtros / 1 PubMed prevé la búsqueda de artículos usando filtros que son muy habituales.
  11. 11. Búsqueda avanzada
  12. 12. Campos de Pubmed Los registros de Pubmed están de forma latente formados por unos campos característicos que son directamente interrogables. Campos característicos de PubMed
  13. 13. Búsqueda avanzada ◘ Búsqueda por autores, revistas, etc. (campos concretos) ◘ Búsqueda a través de los descriptores MeSH (Medical Subject Headings) ◘ Otras fuentes para búsquedas muy orientadas.
  14. 14. Search builder / 1 En la ventana de Search builder podemos obtener con los menús desplegables todos los nombres de los campos y consultar el Index de cada campo.
  15. 15. Search builder / 2
  16. 16. Search builder / 3 El Index se abre por la palabra o frase más aproximada a lo que hemos tecleado en el Search Builder. En 5210 registros aparece la secuencia “vall d’hebron”. Con el cursor podemos marcarla y apretando el botón “Search” conseguiríamos visualizar una lista con los resultados.
  17. 17. Search builder / 4 Mediante el Search Builder y el índice las podemos ir incorporando varios elementos a la ventana de búsqueda y combinarlos. Después el botón Search nos lleva a los resultados.
  18. 18. Medical Subject Headings (MeSH) / 1 Una búsqueda a través de los descriptores MeSH nos permite capturar información de una manera más consistente, más metódica y más rigurosa. El thesaurus de MeSH contiene unos 26.000 términos y se actualiza cada año. Podemos consultar la base de datos de MeSH y los detalles en torno a cada descriptor o bien usar el índice directamente
  19. 19. Medical Subject Headings (MeSH) / 2 Un MeSH Major Topic es un MeSH Term que está marcado con un asterisco (*) y que se considera un tema principal del artículo. En el ejemplo vemos que “Asthma” es un Major Topic y que además lleva el MeSH subheading “Rehabilitation”
  20. 20. Medical Subject Headings (MeSH) / 3 También podemos hacer la misma búsqueda desde MeSH Database
  21. 21. Medical Subject Headings (MeSH) / 4
  22. 22. Visualización de resultados
  23. 23. Visualización de resultados / 1 Artículos de libre acceso (15)
  24. 24. Visualización de resultados / 2 Si nuestro centro de trabajo tiene acceso a determinadas suscripciones o licencias de uso, esa información también nos la puede proporcionar PubMed
  25. 25. Visualización de resultados / 3 Vista “Abstract” Texto completo Captura de registros
  26. 26. My NCBI
  27. 27. ¿Qué es My NCBI? El instrumento My NCBI en PubMed permite registrarse y así retener la información recogida por un usuario y sus preferencias.
  28. 28. Registro en My NCBI / 1 Podemos abrir gratuitamente una cuenta en My NCBI
  29. 29. Registro en My NCBI / 2 Existe la opción de usar nuestra cuenta de Google si no queremos crear una cuenta nueva.
  30. 30. Función Collections / 1 Cuando queremos guardar un conjunto de registros bibliográficos en PubMed podemos hacerlo con la función Clipboard, que solo nos deja retener hasta 500 registros y solo se pierden si estamos inactivos 8 horas seguidas. La función Collections es por el contrario para usuarios que se han registrado a My NCBI y permite conservar indefinidamente una o varias colecciones de registros, y además compartirlos, marcar favoritos, etc. No hay límite de colecciones.
  31. 31. Función Collections / 2 Podemos compartir una colección de registros configurándola como “pública” y proporcionando la URL o enlace directo a colaboradores nuestros. Podemos ver que se puede generar un archivo de texto o de base de datos (csv); también podemos depurar registros, añadir, etc.
  32. 32. Función Save search / 1 Tener una cuenta en My NCBI también nos permite grabar una búsqueda (su estrategia) para poderla ejecutar en el futuro. La función Save Search genera un formulario donde podemos inscribir nuestras preferencias para recibir continuadamente los resultados que se vayan incorporando a PubMed sobre nuestro tema en un correo-e personal.
  33. 33. Función My Bibliography /1 Por último, otra función de My NCBI útil es My Bibliography, diseñada específicamente para guardar registros de un autor y editarlos en listas
  34. 34. Captura de registros
  35. 35. Podemos capturar los resultados de la búsqueda, sea a partir de la lista total, sea haciendo una selección de la lista marcando los botones de selección
  36. 36. Cuando enviamos registros a una dirección de correu-e no podemos enviar más de 200 registros por mensaje, pero se pueden enviar por fracciones, de 200 en 200.
  37. 37. Importar registros a
  38. 38. Zotero y Pubmed / 1 El icono de documento en la barra de las direcciones nos indica que Zotero ha detectado los “metadatos” de un artículo en Pubmed
  39. 39. Zotero y Pubmed / 2 Abrimos Zotero clicando su botón en la barra. En la columna izquierda elegimos la carpeta donde grabaremos un registro. Clicamos el icono que aparece en la barra de direcciones para incorporarlo.
  40. 40. Guía de uso completa de Zotero http://variumhabere.blogspot.com.es/2013/03/zotero-guia-de- uso-vr-2.html
  41. 41. Otras funciones
  42. 42. Enlace permanente a un artículo Una forma de crear un enlace permanente a un registro es con un URL que contenga la expresión http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ y el número PMID. P.e.: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894
  43. 43. Función Images En octubre de 2010 PubMed ha incorporado imágenes en los artículos que pertenecen a las publicaciones de Pubmed Central, de libre acceso
  44. 44. Agregadores RSS PubMed ofrece diversos canales RSS para obtener fácilmente informació continuada sobre un tema, etc.
  45. 45. Elaborado por: Marta-R. Domínguez Senra La propiedad intelectual de esta guía está amparada bajo una licencia SafeCreative *1306285338050

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